Utilização de alinhamento estrutural de proteínas no estudo de Interface Forming Residues de proteína-quinases com inibidores protéicos.

Alinhamento estrutural de proteínas e análise de interação proteína-inibidor. As proteínas-quinases (PK) como alvo biológico. Três grupos de estruturas diferentes no domínio catalítico de PK. Superposição dos dados obtidos no alinhamento sequencial e estrutural.

Inibidores de germinacao em frutos e sementes de pequi.

Utilizando frutos de pequi, coletados na regiao de Sete Lagoas-MG, em 1986, foi avaliada a presenca de inibidores de germinacao nas sementes e nas partes do fruto que envolvem (polpa, espinhos e endocarpo). A extracao foi a 5ºC por 24 horas, utilizando dois solventes: agua e metanol a 80%. Para testar a presenca de inibidores, foram utilizadas sementes de alface (Lactuca sativa L.), cultivar repolhuda, com 88,5% de germinacao. Os extratos aquoso e metanolico do endocarpo e dos espinhos e o extrato metanolico da polpa diminuiram, significativamente, tanto a velocidade como a porcentagem de germinacao. O extrato aquoso da polpa não afetou o numero de sementes germinadas, porem diminuiu a velocidade de germinacao. Os extratos aquosos e metanolicos da semente não apresentaram qualquer efeito de inibicao da germinacao.

Via de sinalização mTOR e efeito dos seus inibidores no tratamento do cancro

Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências Farmacêuticas

Inibidores da renina

Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências Farmacêuticas

Pesquisa computacional de inibidores de fatores de virulência de bacillus anthracifs

Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências Farmacêuticas

Inibidores do co-transportador renal de sódio-glicose 2

Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências Farmacêuticas

Inibidores PCSK9

Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências Farmacêuticas

Conservation, duplication, and loss of the Tor signaling pathway in the fungal kingdom.

BACKGROUND: The nutrient-sensing Tor pathway governs cell growth and is conserved in nearly all eukaryotic organisms from unicellular yeasts to multicellular organisms, including humans. Tor is the target of the immunosuppressive drug rapamycin, which in complex with the prolyl isomerase FKBP12 inhibits Tor functions. Rapamycin is a gold standard drug for organ transplant recipients that was approved by the FDA in 1999 and is finding additional clinical indications as a chemotherapeutic and antiproliferative agent. Capitalizing on the plethora of recently sequenced genomes we have conducted comparative genomic studies to annotate the Tor pathway throughout the fungal kingdom and related unicellular opisthokonts, including Monosiga brevicollis, Salpingoeca rosetta, and Capsaspora owczarzaki. RESULTS: Interestingly, the Tor signaling cascade is absent in three microsporidian species with available genome sequences, the only known instance of a eukaryotic group lacking this conserved pathway. The microsporidia are obligate intracellular pathogens with highly reduced genomes, and we hypothesize that they lost the Tor pathway as they adapted and streamlined their genomes for intracellular growth in a nutrient-rich environment. Two TOR paralogs are present in several fungal species as a result of either a whole genome duplication or independent gene/segmental duplication events. One such event was identified in the amphibian pathogen Batrachochytrium dendrobatidis, a chytrid responsible for worldwide global amphibian declines and extinctions. CONCLUSIONS: The repeated independent duplications of the TOR gene in the fungal kingdom might reflect selective pressure acting upon this kinase that populates two proteinaceous complexes with different cellular roles. These comparative genomic analyses illustrate the evolutionary trajectory of a central nutrient-sensing cascade that enables diverse eukaryotic organisms to respond to their natural environments.

Novas fontes de antioxidantes e inibidores de enzimas relevantes para o tratamento da diabetes mellitus tipo 2 e doença de Alzheimer

Dissertação de mest., Engenharia Biológica, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2009

A farmacogenómica no tratamento da depressão major com inibidores selectivos da recaptação da 5-hidroxitriptamina

Dissertação de mest., Ciências Farmacêuticas, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Univ. do Algarve, 2011

Patofisiologia de osteonecrose induzida por bisfosfonatos e inibidores de RANK-L

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Loss of wobble uridine modification in tRNA anticodons interferes with TOR pathway signaling

Previous work in yeast has suggested that modification of tRNAs, in particular uridine bases in the anticodon wobble position (U34), is linked to TOR (target of rapamycin) signaling. Hence, U34 modification mutants were found to be hypersensitive to TOR inhibition by rapamycin. To study whether this involves inappropriate TOR signaling, we examined interaction between mutations in TOR pathway genes (tip41Δ, sap190Δ, ppm1Δ, rrd1Δ) and U34 modification defects (elp3Δ, kti12Δ, urm1Δ, ncs2Δ) and found the rapamycin hypersensitivity in the latter is epistatic to drug resistance of the former. Epistasis, however, is abolished in tandem with a gln3Δ deletion, which inactivates transcription factor Gln3 required for TOR-sensitive activation of NCR (nitrogen catabolite repression) genes. In line with nuclear import of Gln3 being under control of TOR and dephosphorylation by the Sit4 phosphatase, we identify novel TOR-sensitive sit4 mutations that confer rapamycin resistance and importantly, mislocalise Gln3 when TOR is inhibited. This is similar to gln3Δ cells, which abolish the rapamycin hypersensitivity of U34 modification mutants, and suggests TOR deregulation due to tRNA undermodification operates through Gln3. In line with this, loss of U34 modifications (elp3Δ, urm1Δ) enhances nuclear import of and NCR gene activation (MEP2, GAP1) by Gln3 when TOR activity is low. Strikingly, this stimulatory effect onto Gln3 is suppressed by overexpression of tRNAs that usually carry the U34 modifications. Collectively, our data suggest that proper TOR signaling requires intact tRNA modifications and that loss of U34 modifications impinges on the TORsensitive NCR branch via Gln3 misregulation.

Tor: the second generation onion router

This is the original Dingledine et al's Tor paper. Please consider it required reading.

Building incentives into Tor

This is the paper introducing the Tor's gold star incentive mechanism. It is optional reading

INFO6003 (2013) Tor: the second generation onion router -- Paper

This is the original Dingledine et al's Tor paper. Please consider it required reading.