Frequency of CCR5delta32 in Brazilian populations

A sample of 103 randomly chosen healthy individuals from Alegrete, RS, Brazil, was tested for the CCR5delta32 allele, which is known to influence susceptibility to HIV-1 infection. The CCR5delta32 allele was identified by PCR amplification using specific primers flanking the region of deletion, followed by electrophoresis on a 3% agarose gel. The data obtained were compared to those reported for other populations and interpreted in terms of Brazilian history. The individuals studied came from a highly admixed population. Most of them were identified as white (N = 59), while blacks and browns (mulattoes) were N = 13 and N = 31, respectively. The observed frequencies, considering the white, black and brown samples (6.8, 3.8, and 6.4%, respectively), suggest an important European parental contribution, even in populations identified as black and brown. However, in Brazil as a whole, this allele shows gradients indicating a relatively good correlation with the classification based on skin color and other physical traits, used here to define major Brazilian population groups.

Description des pratiques vaccinales d’infirmières en situation de refus parental avant et après une formation interactive

Malgré les succès spectaculaires de l’immunisation comme mesure de santé publique, certains parents continuent de refuser de vacciner leurs enfants (Diekema, 2005). C’est pourquoi qu’au cours des dernières décennies, des éclosions de maladies évitables par la vaccination comme la rougeole et la coqueluche ont été observées au Canada, surtout chez la population non vaccinée (Hinman, 2000). Au Québec, depuis l’entrée en vigueur de la loi 90 en 2003, les infirmières peuvent procéder à la vaccination sans ordonnance individuelle ou collective conformément au Protocole d’Immunisation du Québec (PIQ). Les infirmières québécoises peuvent alors influencer positivement la couverture vaccinale (Sauvageau & al, 2005). Le but de cette étude est d’évaluer les retombées de la formation VIP (Vaccination par les Infirmières/Infirmiers-Prévention) sur les pratiques vaccinales rapportées par les infirmières (N=12) de CSSS, auprès des parents d’enfants de 0-5 ans lors d’un refus parental. En premier lieu, nous avons identifié et décrit treize pratiques vaccinales en réponse à un refus parental. Par la suite, nous avons identifié des modifications dans certaines des treize pratiques rapportées tel qu’une augmentation dans la description des pratiques de correction des fausses croyances des parents, une amélioration de la justesse des pratiques d’explication et une personnalisation des pratiques décrites. En conclusion, la formation offerte aux infirmières doit permettre à celles-ci d’identifier les préoccupations parentales et d’y répondre adéquatement en utilisant une information juste et individualisée.

Seroprevalence of orthopoxvirus in an Amazonian rural village, Acre, Brazil

Vaccinia virus strains from the family Poxviridae have been frequently isolated in Brazil and associated with outbreaks of exanthematic disease affecting cows and humans. An ELISA IgG was applied to evaluate the seroprevalence of orthopoxviruses in a community located in a rural settlement in the Amazon region, where no orthopoxvirus outbreaks have yet been reported. An overall seroprevalence of 27.89% was found, and it was 23.38% in the non-vaccinated population (smallpox vaccination). These results strongly suggest that orthopoxviruses circulate in this population, and it is the first finding of seropositivity for orthopoxviruses in a population without any previously reported outbreaks.

Trypanosoma cruzi MSH2: Functional analyses on different parasite strains provide evidences for a role on the oxidative stress response

Components of the DNA mismatch repair (MMR) pathway are major players in processes known to generate genetic diversity, such as mutagenesis and DNA recombination. Trypanosoma cruzi, the protozoan parasite that causes Chagas disease has a highly heterogeneous population, composed of a pool of strains with distinct characteristics. Studies with a number of molecular markers identified up to six groups in the T. cruzi population, which showed distinct levels of genetic variability. To investigate the molecular basis for such differences, we analyzed the T. cruzi MSH2 gene, which encodes a key component of MMR, and showed the existence of distinct isoforms of this protein. Here we compared cell survival rates after exposure to genotoxic agents and levels of oxidative stress-induced DNA in different parasite strains. Analyses of msh2 mutants in both T. cruzi and T. brucei were also used to investigate the role of Tcmsh2 in the response to various DNA damaging agents. The results suggest that the distinct MSH2 isoforms have differences in their activity. More importantly, they also indicate that, in addition to its role in MMR, TcMSH2 acts in the parasite response to oxidative stress through a novel mitochondrial function that may be conserved in T. brucei. (C) 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.

Caracterização da diversidade genética de Stryphnodendron adstringens (Mart.) Coville por marcador molecular AFLP e transferência de microssatélites

Pós-graduação em Agronomia (Horticultura) - FCA

Proteção imunológica contra raiva em população rural exposta à epidemia em 2005

No mês de maio de 2005, no município de Augusto Correa, nordeste do Estado do Pará, foi diagnosticado um surto de raiva paralítica transmitida por morcegos hematófagos que resultou em 15 casos confirmados da doença. A população exposta recebeu vacinação anti-rábica em regime de pré e pós-exposição, sendo atendidas aproximadamente 3500 pessoas. O presente estudo verificou a persistência de anticorpos neutralizantes antivírus rábico, em amostra da população de Augusto Correa, vacinada com vacina de cultivo celular (Verorab®) por ocasião do surto. Foram coletadas e analisadas 505 amostras de moradores de quatro comunidades de Augusto Correa (Arai, Porto do Campo, Cachoeira e Nova Olinda) em junho de 2007. Os níveis de anticorpos neutralizantes foram dosados através da técnica de Favoretto e relacionados com dados demográficos, com história prévia de malária, novas agressões por animais e com o esquema vacinal recebido. Após dois anos da campanha vacinal, os resultados revelaram a persistência de anticorpos neutralizantes em níveis adequados em 90.5% da população vacinada, em esquemas de pré e pós-exposição, mesmo naqueles que receberam tratamento incompleto. Os níveis de anticorpos neutralizantes não foram reduzidos em função das variáveis analisadas.

Genetic diversity of Metrodorea nigra (Rutaceae) from a small forest remnant in Brazil assessed with microsatellite markers

Metrodorea nigra (Rutaceae) is an endemic Brazilian tree of great ecological importance, frequently found in the submontane regions of ombrophilous dense and semideciduous forests. This tree is useful for reforesting degraded areas and the wood can be employed in construction. We developed 12 microsatellite markers from a genomic library enriched for GA/CA repeats, for this species. Polymorphisms were assessed in 40 trees of a highly fragmented population found in Cravinhos, State of Sao Paulo, in southeastern Brazil. Among the 12 loci, 8 were polymorphic and only one had fixed alleles in this population. The number of alleles per locus and expected heterozygosity ranged from 2 to 11 and from 0.190 to 0.889, respectively. These results revealed moderate levels of genetic variation in M. nigra population when compared to other tropical species. Additionally, transferability of the 12 primers was tested in seven other Brazilian Rutaceae tree species (endemics: M. stipularis, Galipea jasminiflora, Esenbeckia leiocarpa and non-endemics: E. febrifuga, E. grandiflora, Balfourodendron riedelianum, Zanthoxylum riedelianum). Transferability ranged among species, but at least 8 loci (similar to 67%) amplified in M. stipularis, demonstrating a high potential for transferring microsatellite markers between species of the same genus in the Rutaceae family.

Interethnic diversity of NAT2 polymorphisms in Brazilian admixed populations

Abstract Background N-acetyltransferase type 2 (Nat2) is a phase II drug- metabolizing enzyme that plays a key role in the bioactivation of aromatic and heterocyclic amines. Its relevance in drug metabolism and disease susceptibility remains a central theme for pharmacogenetic research, mainly because of its genetic variability among human populations. In fact, the evolutionary and ethnic-specific SNPs on the NAT2 gene remain a focus for the potential discoveries in personalized drug therapy and genetic markers of diseases. Despite the wide characterization of NAT2 SNPs frequency in established ethnic groups, little data are available for highly admixed populations. In this context, five common NAT2 SNPs (G191A, C481T, G590A, A803G and G857A) were investigated in a highly admixed population comprised of Afro-Brazilians, Whites, and Amerindians in northeastern Brazil. Thus, we sought to determine whether the distribution of NAT2 polymorphism is different among these three ethnic groups. Results Overall, there were no statistically significant differences in the distribution of NAT2 polymorphism when Afro-Brazilian and White groups were compared. Even the allele frequency of 191A, relatively common in African descendents, was not different between the Afro-Brazilian and White groups. However, allele and genotype frequencies of G590A were significantly higher in the Amerindian group than either in the Afro-Brazilian or White groups. Interestingly, a haplotype block between G590A and A803G was verified exclusively among Amerindians. Conclusions Our results indicate that ethnic admixture might contribute to a particular pattern of genetic diversity in the NAT2 gene and also offer new insights for the investigation of possible new NAT2 gene-environment effects in admixed populations.

Relationship between Vitamin D Receptor gene polymorphisms and the components of metabolic syndrome

Abstract Background The Vitamin D Receptor gene (VDR) is expressed in many tissues and modulates the expression of several other genes. The purpose of this study was to investigate the association between metabolic syndrome (MetSyn) with the presence of VDR 2228570 C > T and VDR 1544410 A > G polymorphisms in Brazilian adults. Methods Two hundred forty three (243) individuals were included in a cross-sectional study. MetSyn was classified using the criteria proposed by National Cholesterol Educational Program - Adult Treatment Panel III. Insulin resistance and β cell secretion were estimated by the mathematical models of HOMA IR and β, respectively. The VDR 2228570 C > T and VDR 1544410 A > G polymorphisms were detected by enzymatic digestion and confirmed by allele specific PCR or amplification of refractory mutation. Results Individuals with MetSyn and heterozygosis for VDR 2228570 C > T have higher concentrations of iPTH and HOMA β than those without this polymorphism, and subjects with recessive homozygosis for the same polymorphisms presented higher insulin resistance than those with the heterozygous genotype. There is no association among VDR 1544410 A > G and components of MetSyn, HOMA IR and β, serum vitamin D (25(OH)D3) and intact parathormone (iPTH) levels in patients with MetSyn. A significant lower concentration of 25(OH)D3 was observed only in individuals without MetSyn in the VDR 1544410 A > G genotype. Additionally, individuals without MetSyn and heterozygosis for VDR 2228570 C > T presented higher concentration of triglycerides and lower HDL than those without this polymorphism. Conclusions Using two common VDR polymorphism data suggests they may influence insulin secretion, insulin resistance an serum HDL-cholesterol in our highly heterogeneous population. Whether VDR polymorphism may influence the severity of MetSyn component disorder, warrants examination in larger cohorts used for genome-wide association studies.

CYP2E1 genotype and isoniazid-induced hepatotoxicity in patients treated for latent tuberculosis

OBJECTIVE: To determine whether pharmacogenetic tests such as N-acetyltransferase 2 (NAT2) and cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) genotyping are useful in identifying patients prone to antituberculosis drug-induced hepatotoxicity in a cosmopolite population. METHODS: In a prospective study we genotyped 89 patients treated with isoniazid (INH) for latent tuberculosis. INH-induced hepatitis (INH-H) or elevated liver enzymes including hepatitis (INH-ELE) was diagnosed based on the clinical diagnostic scale (CDS) designed for routine clinical practice. NAT2 genotypes were assessed by fluorescence resonance energy transfer probe after PCR analysis, and CYP2E1 genotypes were determined by PCR with restriction fragment length polymorphism analysis. RESULTS: Twenty-six patients (29%) had INH-ELE, while eight (9%) presented with INH-H leading to INH treatment interruption. We report no significant influence of NAT2 polymorphism, but we did find a significant association between the CYP2E1 *1A/*1A genotype and INH-ELE (OR: 3.4; 95% CI:1.1-12; p = 0.02) and a non significant trend for INH-H (OR: 5.9; 95% CI: 0.69-270; p = 0.13) compared with other CYP2E1 genotypes. This test for predicting INH-ELE had a positive predictive value (PPV) of 39% (95% CI: 26-54%) and a negative predictive value (NPV) of 84% (95% CI: 69-94%). CONCLUSION: The genotyping of CYP2E1 polymorphisms may be a useful predictive tool in the common setting of a highly heterogeneous population for predicting isoniazid-induced hepatic toxicity. Larger prospective randomized trials are needed to confirm these results.

The role of deregulated E2F1 expression in brain tumors

Mutations disabling the retinoblastoma (Rb) pathway are among the most common in human cancers, including brain cancer. These mutations promote tumor development through deregulated control of the E2F family of transcription factors. E2F1 belongs to a class of E2F's identified as transcriptional activators and involved in the G1/S phase transition of the cell. However, E2F-1 presents with a paradox as it is considered to have membership in two gene classes, functioning as both an oncogene and a tumor suppressor. This unusual trait generates a degree of uncertainty on the role that E2F1 plays in the development or maintenance of any given tumor. Here we show that E2F1 functions as an oncogene in brain tumors through the generation of mice engineered to overexpress E2F1 specifically within glial cells and neuronal progenitors as directed by the GFAP promoter. Mice carrying the transgene develop with high penetrance a phenotype characterized by neurological deficits including paresia, ataxia, head tilt and seizures. MRI imagining of the tgE2F1 mice reveals a low incidence of mild hydrocephalus, and most notably, histological analysis demonstrates that 25% of tgE2F1 mice present with the spontaneous formation of malignant brain tumors. Overall these neoplasms show histological features from a wide range of aggressive brain cancers including medulloblastoma, choroid plexus carcinoma, primary neuroectodermic tumor and malignant gliomas. Isolation and characterization of astrocytes from the tgE2F1 animal reveals a highly proliferative population of cells with 55% ± 2.5 of the tgE2F1astrocytes, 35% ± 3.4 normal mouse astrocytes in S-phase and the acquired capacity to grow in anchorage independent conditions. Additionally tgE2F1 astrocytes show an aberrant phenotype with random chromosomal fusions and nearly all cells demonstrating polyploidy. Taken together, this model forces a comparison to human brain tumor formation. Mouse age as related to tumoral mimics the human scenario with juvenile tgE2F1 mice presenting embryonal tumors typically identified in children, and older tgE2F1 mice demonstrating gliomas. In this regard, this study suggests a global role for E2F1 in the formation and maintenance of multilineage brain tumors, irrefutably establishing E2F1 as an oncogene in the brain. ^

Mortality and perinatal infectious complications following home birth in Washington State: 2003-2013

Thesis (Master's)--University of Washington, 2016-06

Le profil des récidivistes en matière de conduite avec capacités affaiblies par l’alcool : une étude des caractéristiques neuropsychologiques et psychologiques des contrevenants selon leur sexe

Durant les dernières décennies, les différences intersexes en matière de conduite avec les capacités affaiblies par l’alcool (CCAA) ont suscité l’attention, alors que le comportement est en augmentation chez les femmes tandis qu’il diminue chez les hommes. Les données suggèrent que, chez les femmes, la CCAA s’associe à des caractéristiques psychologiques différentes de celles qui se retrouvent chez les contrevenants masculins (c.-à-d. davantage de problèmes liés à l’alcool et aux drogues et de psychopathologies, mais moins de recherche de sensations et de comportements délinquants). Malgré ce profil différentiel, les femmes contrevenantes de la CCAA demeurent une population hautement méconnue, particulièrement en ce qui a trait au profil des récidivistes. Alors que chez les hommes, des données émergentes indiquent que des limitations cognitives sont présentes chez les récidivistes et qu’elles constituent potentiellement un mécanisme sous-jacent au comportement, le profil cognitif des femmes récidivistes demeure inexploré. Des données exploratoires obtenues chez les contrevenantes et la documentation de champs de recherche connexes suggèrent que les femmes se distinguent notamment en ce qui concerne leur fonctionnement exécutif qui pourrait être préservé, alors que leur fonctionnement visuospatial serait déficitaire en comparaison de leurs vis-à-vis masculins. L’objectif de la présente thèse est d’approfondir les connaissances sur les caractéristiques des femmes récidivistes, ce qui permettra de mieux comprendre l’hétérogénéité de cette population et de générer des hypothèses au regard des mécanismes cognitifs sous-jacents à la répétition du comportement de CCAA. Plus spécifiquement, la thèse a pour objectif premier d’étudier les différences entre les sexes en matière de fonctionnement visuospatial et de mémoire visuelle, d’attention et de fonctionnement exécutif (c.-à-d. flexibilité cognitive, abstraction, inhibition). L’objectif secondaire consiste à comparer ces contrevenants au regard de leurs caractéristiques psychologiques (problèmes liés à l’alcool et aux drogues, impulsivité, recherche de sensations, traits antisociaux, anxiété et dépression). L’hypothèse examinée soutient que les femmes et les hommes récidivistes de la CCAA performent moins bien que les femmes et les hommes non-contrevenants en termes de fonctionnement visuospatial, attentionnel et exécutif. En outre, il est attendu que les femmes récidivistes présentent des performances inférieures à celles des hommes récidivistes en ce qui a trait aux fonctions visuospatiales. Par ailleurs, l’hypothèse prévoit que les hommes récidivistes aient des performances inférieures à celles des femmes récidivistes sur le plan exécutif et attentionnel. En matière de caractéristiques psychologiques, il est attendu que les femmes et les hommes récidivistes présentent significativement plus de problèmes liés à l’alcool et aux drogues, d’impulsivité, de recherche de sensations et d’indices de psychopathologies (tendance antisociale, dépression, anxiété) que les non-contrevenants. En outre, il est attendu que les femmes récidivistes présentent plus de problèmes liés à l’alcool et aux drogues et d’indices de dépression et d’anxiété que les hommes récidivistes. Enfin, il est attendu que les hommes récidivistes présentent significativement plus d’impulsivité, de recherche de sensations et de traits antisociaux que les femmes récidivistes. Ces hypothèses se confirment partiellement, alors que les hommes récidivistes (n = 39) présentent des performances inférieures à celles des hommes non-contrevenants (n = 20) et des femmes récidivistes (n = 20) sur le plan attentionnel et exécutifs. Toutefois, les femmes récidivistes ne se distinguent pas des femmes non-contrevenantes (n = 20) en matière de fonctionnement neuropsychologique. En ce qui a trait aux caractéristiques psychologiques, les résultats soutiennent partiellement les hypothèses. La discussion met en lumière que les femmes et des hommes récidivistes présentent des caractéristiques similaires, hormis en ce qui a trait au fonctionnement attentionnel et exécutif qui semble jouer un rôle dans la récidive au masculin, alors que cela n’apparaît pas être le cas chez les femmes chez qui le comportement pourrait être davantage situationnel. La nécessité que des études futures soient réalisées au moyen de devis expérimentaux, de même que les difficultés inhérentes au recrutement des femmes récidivistes sont discutées.

Reproductive competition triggers mass eviction in cooperative banded mongooses.

In many vertebrate societies, forced eviction of group members is an important determinant of population structure, but little is known about what triggers eviction. Three main explanations are: (i) the reproductive competition hypothesis, (ii) the coercion of cooperation hypothesis, and (iii) the adaptive forced dispersal hypothesis. The last hypothesis proposes that dominant individuals use eviction as an adaptive strategy to propagate copies of their alleles through a highly structured population. We tested these hypotheses as explanations for eviction in cooperatively breeding banded mongooses (Mungos mungo), using a 16-year dataset on life history, behaviour and relatedness. In this species, groups of females, or mixed-sex groups, are periodically evicted en masse. Our evidence suggests that reproductive competition is the main ultimate trigger for eviction for both sexes. We find little evidence that mass eviction is used to coerce helping, or as a mechanism to force dispersal of relatives into the population. Eviction of females changes the landscape of reproductive competition for remaining males, which may explain why males are evicted alongside females. Our results show that the consequences of resolving within-group conflict resonate through groups and populations to affect population structure, with important implications for social evolution.

Le profil des récidivistes en matière de conduite avec capacités affaiblies par l’alcool : une étude des caractéristiques neuropsychologiques et psychologiques des contrevenants selon leur sexe

Durant les dernières décennies, les différences intersexes en matière de conduite avec les capacités affaiblies par l’alcool (CCAA) ont suscité l’attention, alors que le comportement est en augmentation chez les femmes tandis qu’il diminue chez les hommes. Les données suggèrent que, chez les femmes, la CCAA s’associe à des caractéristiques psychologiques différentes de celles qui se retrouvent chez les contrevenants masculins (c.-à-d. davantage de problèmes liés à l’alcool et aux drogues et de psychopathologies, mais moins de recherche de sensations et de comportements délinquants). Malgré ce profil différentiel, les femmes contrevenantes de la CCAA demeurent une population hautement méconnue, particulièrement en ce qui a trait au profil des récidivistes. Alors que chez les hommes, des données émergentes indiquent que des limitations cognitives sont présentes chez les récidivistes et qu’elles constituent potentiellement un mécanisme sous-jacent au comportement, le profil cognitif des femmes récidivistes demeure inexploré. Des données exploratoires obtenues chez les contrevenantes et la documentation de champs de recherche connexes suggèrent que les femmes se distinguent notamment en ce qui concerne leur fonctionnement exécutif qui pourrait être préservé, alors que leur fonctionnement visuospatial serait déficitaire en comparaison de leurs vis-à-vis masculins. L’objectif de la présente thèse est d’approfondir les connaissances sur les caractéristiques des femmes récidivistes, ce qui permettra de mieux comprendre l’hétérogénéité de cette population et de générer des hypothèses au regard des mécanismes cognitifs sous-jacents à la répétition du comportement de CCAA. Plus spécifiquement, la thèse a pour objectif premier d’étudier les différences entre les sexes en matière de fonctionnement visuospatial et de mémoire visuelle, d’attention et de fonctionnement exécutif (c.-à-d. flexibilité cognitive, abstraction, inhibition). L’objectif secondaire consiste à comparer ces contrevenants au regard de leurs caractéristiques psychologiques (problèmes liés à l’alcool et aux drogues, impulsivité, recherche de sensations, traits antisociaux, anxiété et dépression). L’hypothèse examinée soutient que les femmes et les hommes récidivistes de la CCAA performent moins bien que les femmes et les hommes non-contrevenants en termes de fonctionnement visuospatial, attentionnel et exécutif. En outre, il est attendu que les femmes récidivistes présentent des performances inférieures à celles des hommes récidivistes en ce qui a trait aux fonctions visuospatiales. Par ailleurs, l’hypothèse prévoit que les hommes récidivistes aient des performances inférieures à celles des femmes récidivistes sur le plan exécutif et attentionnel. En matière de caractéristiques psychologiques, il est attendu que les femmes et les hommes récidivistes présentent significativement plus de problèmes liés à l’alcool et aux drogues, d’impulsivité, de recherche de sensations et d’indices de psychopathologies (tendance antisociale, dépression, anxiété) que les non-contrevenants. En outre, il est attendu que les femmes récidivistes présentent plus de problèmes liés à l’alcool et aux drogues et d’indices de dépression et d’anxiété que les hommes récidivistes. Enfin, il est attendu que les hommes récidivistes présentent significativement plus d’impulsivité, de recherche de sensations et de traits antisociaux que les femmes récidivistes. Ces hypothèses se confirment partiellement, alors que les hommes récidivistes (n = 39) présentent des performances inférieures à celles des hommes non-contrevenants (n = 20) et des femmes récidivistes (n = 20) sur le plan attentionnel et exécutifs. Toutefois, les femmes récidivistes ne se distinguent pas des femmes non-contrevenantes (n = 20) en matière de fonctionnement neuropsychologique. En ce qui a trait aux caractéristiques psychologiques, les résultats soutiennent partiellement les hypothèses. La discussion met en lumière que les femmes et des hommes récidivistes présentent des caractéristiques similaires, hormis en ce qui a trait au fonctionnement attentionnel et exécutif qui semble jouer un rôle dans la récidive au masculin, alors que cela n’apparaît pas être le cas chez les femmes chez qui le comportement pourrait être davantage situationnel. La nécessité que des études futures soient réalisées au moyen de devis expérimentaux, de même que les difficultés inhérentes au recrutement des femmes récidivistes sont discutées.