MAPfastR : quantitative trait loci mapping in outbred line crosses

MAPfastR is a software package developed to analyze QTL data from inbred and outbred line-crosses. The package includes a number of modules for fast and accurate QTL analyses. It has been developed in the R language for fast and comprehensive analyses of large datasets. MAPfastR is freely available at: http://www.computationalgenetics.se/?page_id=7.

Heritability estimation in early generations of two-way crosses in soybean

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Suckling behaviour of Nelore, Gir and Caracu calves and their crosses

It is reasonable to assume that the knowledge of suckling behaviour contributes to optimal management and selection of beef cattle. However, there is little information about suckling behaviour of some beef cattle breeds. The aim of this study was to describe the suckling behaviour of two zebu (Bos indicus) and one criollo (Bos taurus) breeds, analysing the potential effects of breed and some environmental factors on suckling frequency and duration. Forty cows, 17 Nelore, 14 Gir (both zebu) and 9 Caracu (criollo) were bred in a diallelic crossing design. The cows and resulting calves were kept on pasture from birth to weaning. Their behaviour was recorded weekly during daylight. Three behavioural traits were considered: number of suckling meals (NSM), duration of each suckling meal (DSM) and total suckling duration (TSD). Allosuckling was not observed. The calves suckled at any time during the daylight and the overall means were: NSM = 2.57 +/- 0.05 meals/12 h (from back transformed data), DSM = 9.25 +/- 0.11 min/suckling meal and TSD = 23.76 +/- 0.47 min/12 h. There was an effect of dam's breed on NSM and DSM; the calf's genetic group within breed of cow influenced NSM and TSD when the dams were from the Nelore breed. The age of calf had significant effects on all traits. Males averaged higher NSM and TSD (2.60 +/- 0.03 meals and 25.05 +/- 1.37 min/12 h, respectively) than females (2.12 +/- 0.04 meals and 21.51 +/- 1.55 min/12 h, respectively). The differences in suckling behaviour seem to be produced by a complex combination of genetic and environmental factors, which result in a particular behavioural relationship within mother-offspring pairs. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

Candidate SNPs for carcass and meat traits in Nelore animals and in their crosses with Bos taurus

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Effect of single nucleotide polymorphisms of CAPN1 and CAST genes on meat traits in Nellore beef cattle (Bos indicus) and in their crosses with Bos taurus

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Intraspecific crosses resulting in the first occurrence of eight and nine B chromosomes in Prochilodus lineatus (Characiformes, Prochilodontidae)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Diallel analysis of maize resistance to Phaeosphaeria maydis

Em programas de melhoramento visando resistência genética a doenças, a estimativa de parâmetros genéticos que governam a resistência permite direcionar a introdução de resistência em germoplasmas. O objetivo deste trabalho foi estimar os efeitos heteróticos, a capacidade geral (CGC) e específica (CEC) de combinação, utilizando-se de dois métodos de avaliação da resistência, à Phaeosphaeria maydis através da análise dialélica de 36 híbridos F1 e de suas nove linhagens genitoras, em experimentos conduzidos em três ambientes. Foi utilizado um delineamento experimental em blocos casualizados com três repetições e a parcela experimental foi representada por uma fileira de 5 m. As diferenças entre as estimativas da capacidade de combinação, em diferentes ambientes e para os dois métodos de avaliação, apresentaram efeitos significativos (P < 0.01) para ambientes (E), CGC e CGC x E. O efeito de CEC e a interação CEC x E não foi significativa para os dois métodos de avaliação. Os efeitos de CGC foram mais importantes que CEC nesse conjunto de linhagens, sugerindo que efeitos genéticos aditivos são mais importantes como fonte de variação para resistência a esta doença. Efeitos heteróticos para resistência foram estimados, sendo possível identificar combinações híbridas específicas entre linhagens com alto potencial para o controle genético deste patógeno. Resultados para os dois métodos de avaliação foram praticamente idênticos, embora o método PI seja de maior praticidade de uso.

Study of the length of the mouthparts of Africanized, Caucasian and Africanized/Caucasian honey bee crosses, and relationships between glossa sizeand food gathering behavior

Os comprimentos das peças que constituem o aparelho bucal, glossa, paraglossa, estipite, gálea, palpo labial, palpo maxilar, cardo, lorum, mento e pré-mento foram estudados a nível unidimensional em abelhas caucasianas, africanizadas e nos descendentes F1. Somente a paraglossa, estipite, gálea, palpo maxilar, mento e pré-mento mostraram ser diferentes entre esses 2 tipos de abelhas. Essas 6 variáveis foram estudadas nos descendentes F1, tendo sido utilizados 2 tipos de cruzamentos: rainhas caucasianas x machos africanizados (cruzamento 1) e rainhas africanizadas x machos caucasianos (cruzamento 2). Análises multidimensionais também foram realizadas, tendo sido obtidas as distâncias generalizadas de Mahalanobis (D2) entre os parentais e os descendentes F1. Tanto nas análises unidimensionais como nas multidimensionais houve aparente dominância das abelhas africanizadas, mas o número de genes não pôde ser conhecido porque só havia a geração F1 e não houve controle da heterozigosidade das 2 colônias parentais. Os cálculos dos coeficientes de correlações de Spearman mostraram que as abelhas com glossae mais longas coletaram mais xarope de açúcar e voaram mais lentamente da colônia para a fonte de alimento.

Capacidade de combinação de características de produção de ovos de linhagens de matrizes de frango de corte, usando análise de componentes principais

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

PRODUCTIVITY IN MASS CROSSES OF DROSOPHILA-STURTEVANTI - A COMPARATIVE-STUDY OF LABORATORY STOCKS AND RECENTLY COLLECTED FLIES

Drosophila sturtevanti from several geographic origins were analyzed for their capacity to intercross and to yield progeny. Mass intercrosses involving laboratory stocks and recently collected strains were fertile, which suggests that the genetic differentiation among these geographically isolated populations did not affect their reproductive patterns sufficiently to lead to reproductive isolation. Analysis of the number of progeny (productivity) in intracrosses and intercrosses was informative as to the amount of variation this feature exhibits in the laboratory stocks and in the recently collected strains. Also laboratory stocks and recently collected flies shared a positive correlation in that the greater the control productivity of a strain the greater the number of its intercrosses which exhibited reduced productivity.