Levels and distribution of genetic diversity of coconut (Cocos nucifera L., var. Typica form typica) from Sri Lanka assessed by microsatellite markers

The coconut variety Typica, form typica, commonly known as Sri Lanka tall coconuts is the most widely exploited and grown variety in Sri Lanka. Under the coconut bio-diversity conservation programme, several Typica populations have been collected by island-wide surveys and planted ex situ. Thirty-three coconut populations were subjected to microsatellite assay with eight coconut-specific microsatellite primer pairs in order to study the levels and distribution of genetic variation of the collected materials for formulating future collection strategies and selecting parents for the breeding programme. A total of 56 alleles were detected ranging from 3 to 10 alleles per primer pair with an average of 7 alleles per locus. Overall a very high level of genetic diversity was detected (0.999) for all the populations studied ranging from 0.526 for population Debarayaya to 0.683 for population Dickwella. Only four introduced coconut populations, i.e. Clovis, Margeret, Dickwella, Mirishena and an embryo-cultured population were clearly separated from the resulting dendrogram. A very high level of within population variation (99%) accounted for native populations suggests a common history and a restricted genetic base for native Sri Lankan tall coconuts. Categorization of alleles into different classes according to their frequency and distribution confirmed the results of the dedrogram and concluded the adequacy of single large collection from the entire target area to represent the total genetic diversity in Sri Lanka. This study discusses useful information regarding conservation and breeding of coconut in Sri Lanka.

Isolation and characterization of an AINTEGUMENTA-like gene in different coconut (Cocos nucifera L.) varieties from Sri Lanka

Development of an efficient tissue culture protocol in coconut is hampered by numerous technical constraints. Thus a greater understanding of the fundamental aspects of embryogenesis is essential. The role of AINTEGUMENTA-like genes in embryogenesis has been elucidated not only in model plants but also in economically important crops. A coconut gene, CnANT, that encodes two APETALA2 (AP2) domains and a conserved linker region similar to those of the BABY BOOM transcription factor was cloned, characterized, and its tissue specific expression was examined. The full-length cDNA of 1,780 bp contains a 1,425-bp open reading frame that encodes a putative peptide of 474 amino acids. The genomic DNA sequence includes 2,317 bp and consists of nine exons interrupted by eight introns. The exon/intron organization of CnANT is similar to that of homologous genes in other plant species. Analysis of differential tissue expression by real-time polymerase chain reaction indicated that CnANT is expressed more highly in in vitro grown tissues than in other vegetative tissues. Sequence comparison of the genomic sequence of CnANT in different coconut varieties revealed one single nucleotide polymorphism and one indel in the first exon and first intron, respectively, which differentiate the Tall group of trees from Dwarfs. The indel sequence, which can be considered a simple sequence repeats marker, was successfully used to distinguish the Tall and Dwarf groups as well as to develop a marker system, which may be of value in the identification of parental varieties that are used in coconut breeding programs in Sri Lanka.

Transcriptome analysis for discovering candidate genes involve in embryogenesis in coconut (Cocos nucifera L.) through 454 pyrosequencing

Coconut, Cocos nucifera L. is a major plantation crop, which ensures income for millions of people in the tropical region. Detailed molecular studies on zygotic embryo development would provide valuable clues for the identification of molecular markers to improve somatic embryogenesis. Since there is no ongoing genome project for this species, coconut expressed sequence tags (EST) would be an interesting technique to identify important coconut embryo specific genes as well as other functional genes in different biochemical pathways. The goal of this study was to analyse the ESTs by examining the transcriptome data of the different embryo tissue types together with one somatic tissue. Here, four cDNA libraries from immature embryo, mature embryo, microspore derived embryo and mature leaves were constructed. cDNA was sequenced by the Roche-454 GS-FLX system and assembled into 32621 putative unigenes and 155017 singletons. Of these unigenes, 18651 had significant sequence similarities to non-redundant protein database, from which 16153 were assigned to one or more gene ontology categories. Homologue genes, which are responsible for embryo development such as chitinase, beta-1,3-glucanase, ATP synthase CF0 subunit, thaumatin-like protein and metallothionein-like protein were identified among the embryo EST collection. Of the unigenes, 6694 were mapped into 139 KEGG pathways including carbohydrate metabolism, energy metabolism, lipid metabolism, amino acid metabolism and nucleotide metabolism. This collection of 454-derived EST data generated from different tissue types provides a significant resource for genome wide studies and gene discovery of coconut, a non-model species.

Development of a heavy metal sorption system through the P=S functionalization of coconut (Cocos nucifera) fibers

Lignocellulosic residues are interesting materials for the production of heavy metal adsorbents for aquatic systems. Whole fibers taken from coconut (Cocos nucifera) husks were functionalized with the thiophosphoryl (P=S) group by means of the direct reaction with CI(3)P=S, (CH(3)O)(2)CIP=S or (CH(3)CH(2)O)(2)CIP=S in order to obtain an adsorptive system for `soft` metal ions, particularly Cd(2+). These functionalized fibers (FFs) were characterized by means of elemental analysis, infrared spectroscopy, thermal analysis and acid-base titration. Adsorption isotherms for Cd(2+) fitted the Langmuir model, with binding capacities of 0.2-5 mmol g(-1) of FF at 25 degrees C. (C) 2009 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Caracterização biométrica de frutos de coqueiro, Vocos nucifera L. variedade anã-verde, em diferentes estádios de desenvolvimento

Objetivou-se determinar a curva de crescimento da massa do fruto e diâmetros externos longitudinal e transversal, bem como os acúmulos do albúmen sólido (polpa) e albúmen líquido (água-de-coco) e sua caracterização sensorial em diferentes estádios. Frutos de coqueiro-anão-verde (Cocos nucifera L.) foram avaliados em 26 épocas, durante o período de sua formação, em intervalos quinzenais, de abril de 2004 a maio de 2005, no município de Bebedouro - SP. Foram aplicados aos dados modelos de regressão logística e logística combinada com exponencial quadrática, obtendo-se elevados graus de ajustes. O diâmetro externo longitudinal alcançou a média máxima de 20,12 cm aos 375 dias após a abertura da inflorescência (d.a.a.i.), enquanto o diâmetro externo transversal alcançou 14,57 cm, aos 345 (d.a.a.i.). Os frutos apresentaram maior massa no período entre 255 e 315 (d.a.a.i.), não havendo diferença estatística significativa neste período. O albúmen sólido teve início de formação aos 225 (d.a.a.i.), chegando aos 375 dias com a massa média de 214,78 gramas. O maior volume médio de albúmen líquido foi verificado em frutos com 8,5 meses de idade com adequado sabor. Esses dados são importantes indicativos do ponto ideal de colheita dos frutos de coqueiro-anão-verde, na região de Bebedouro - SP, para o consumo in natura da água-de-coco.

Produção de biodiesel a partir de óleo de coco (Cocos nucifera L

The production of biodiesel has become an important and attractive process for the production of alternative fuels. This work presents a study of the biodiesel production from coconut oil (Cocos nucifera L.), by two routes: direct transesterification using NaOH as catalyst and esterification (with H2SO4) followed by basic transesterification. The reactor was built in pirex with 1L of capacity and was equipped with a jacket coupled with a thermostatic bath to temperature control, a mecanical stirring is also present in the reactor. The analysis of oil composition was carried out by gas chromatography and esters compounds were identified. The parameters of molar ratio oil/alcohol, reaction time and temperature were studied and their influence on the conversion products was evaluated using experimental planning (23). The molar ratio was the most significant variable by the statistical planning analysis. Conversions up to 85.3% where achived in the esterification/transesterification, with molar ratio 1:6 at 60ºC and 90 minutes of reaction. For the direct transesterification, route conversions up 87.4% eas obtained using 1:6.5 molar ratio at 80ºC and 60 minutes of reaction. The Coconut oil was characterized by their physic chemical properties and key constituents of the oil. The lauric acid was the main constituint and the oil showed high acidity. The biodiesel produced was characterized by its main physicochemical properties, indicating satisfactory results when compared to standard values of National Petroleum Agency. The work was supplemented with a preliminary assessment of the reaction kinetic

Incidence of tarsonemid mites on Cocos nucifera L. (Arecaceae) from Oman with description of a new species of Nasutitarsonemus Beer and Nucifora (Acari: Tarsonemidae)

Coconut is an important crop grown in the coastal plain of the Dhofar region, south-eastern Oman, on the edge of the Arabian Peninsula desert. It holds a particular place in the landscaping of the region and is also of great interest for the production of coconut drinking water. One of the main pests of coconut in this region is the coconut mite (Aceria guerreronis Keifer). In surveys conducted to understand the dynamics of that mite and its association with other arthropods, the incidence of tarsonemid mites was determined. Steneotarsonemus furcatus de Leon was the most commonly found tarsonemid on fruits as well as on growing tips of coconut seedlings, always at low levels. A few representatives of an undescribed tarsonemid species were also found. That new species is here described as Nasutitarsonemus omani Lofego and Moraes, sp. nov. A key to the species of this little-known genus is provided.

Adubação com NPK em coqueiro-anão-verde (Cocos nucifera L.) rendimento e qualidade de frutos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Recomendação de adubação e calagem para coqueiro (Cocos nucifera L.) no Estado de São Paulo - 1ª. aproximação

O objetivo deste trabalho foi apresentar a 1ª. aproximação da recomendação de adubação e calagem para coqueiro no Estado de São Paulo, visando à produção de água. O cultivo de coqueiro nesta região é recente, carecendo de recomendações técnicas. Esta recomendação foi elaborada a partir de resultados experimentais obtidos em campo e de informações disponíveis na literatura. A recomendação de adubação segue os padrões do Boletim Técnico 100 do Instituto Agronômico (SP). Nas tabelas apresentadas, as doses de fertilizantes são obtidas com base nos teores de P e K disponíveis no solo, na idade das plantas durante a formação do coqueiral (até 5 anos) e, posteriormente (fase de produção), na produtividade esperada.

Avaliação de uma solução de água de coco (cocos nucifera) suplementada na produção in vitro de embriões bovinos

O capítulo 1 inclui a revisão da literatura da produção in vitro de embriões bovinos e da água de coco como meio de preservação e cultivo celular em biotecnologias reprodutiva. O capítulo 2 inclui a avaliação de uma solução de água de coco a 75% suplementada com mio-inositol, tri-citrato de sódio e aminoácidos durante a maturação oocitária e/ou cultivo de embriões bovinos in vitro. Os capítulos 3 e 4 tratam a avaliação química da água de coco in natura em comparação com o meio 199 e a avaliação de uma solução de água de coco a 20% no cultivo de células do cumulus oophorus bovino. O capítulo 5 inclui a avaliação de uma solução de água de coco a 20% suplementada com mio-inositol, tri-citrato de sódio e aminoácidos na maturação oocitária, fecundação e cultivo de embriões bovinos in vitro

Avaliação do valor nutritivo da torta de coco (Cocos nucifera L.) para suplementação alimentar de ruminantes na Amazônia Oriental

Foram avaliados os efeitos que a inclusão de níveis de torta de coco (Cocos nucifera L.), O,4%; 0,8% e 1,2%PV, sobre os consumos e as digestibilidades aparentes da matéria seca (DAMS); matéria orgânica (DAMO); proteína bruta (DAPB); extrato etéreo (DAEE); energia bruta (DAEB); fibra em detergente neutro (DAFDN); fibra em detergente ácida (DAFDA). O volumoso foi o capim quicuio-daamazônia (Brachiaria humidicola). Foi realizado um ensaio metabólico, utilizando 16 ovinos inteiros, com média de peso vivo de 28 kg, distribuídos em quatro tratamentos em delineamento inteiramente casualizado. Houve um período adaptativo de 14 dias com 7 dias de coleta de dados, onde se monitorou o fornecimento da dieta e a coleta total de fezes. As digestibilidades aparentes DAMS; DAMO; DAEB e DAFDA tiveram efeitos lineares crescentes no intervalo de inclusão 0,4% até 1,2%PV. A DAPB apresentou efeito quadrático, com melhor nível de inclusão para PB, 0,66%PV e DAPB máxima 62,9%. A DAFDN, também, se apresentou de modo quadrático, onde o melhor nível de inclusão ocorreu quando se incluiu 0,89% PV e DAFDN máxima de 59,39%. O teor de EE na dieta afetou a DAMS segundo a equação y = 17,85 - 28,92x; R² = 0,38, onde o aumento na inclusão afetou negativamente a digestão da DAMS. Conclui-se que a torta de coco (Cocos nucifera L.) é uma excelente fonte de proteína e energia para ruminantes, e pode contribuir no atendimento das demandas nutricionais para produção de carne e leite na Amazônia Oriental, com baixo custo.

Valor nutritivo do farelo de coco (Cocos nucifera) na alimentação de ovinos

O trabalho foi realizado na Universidade Federal Rural da Amazônia com o objetivo de avaliar o consumo voluntário e digestibilidade aparente de ovinos, alimentados com dietas contendo diferentes níveis de inclusão de farelo de coco (0, 25, 50 e 75%) no concentrado. Foram utilizados 16 ovinos, sendo 7 machos e 9 fêmeas, da raça Santa Inês, com idade média de 3 meses e peso aproximado de 19 kg distribuídos em um delineamento em blocos ao acaso, com quatro tratamentos e quatro repetições. O período experimental teve duração de 19 dias, sendo 14 de adaptação e cinco dias de coleta de dados e amostras. O volumoso utilizado foi a silagem de capim elefante, na relação volumoso:concentrado de 40:60. Os animais foram alojados em gaiolas metabólicas, alimentados duas vezes ao dia. Os consumos de matéria seca (MS) em g e percentagem do peso vivo, proteína bruta (PB) e carboidratos não fibrosos (CNF), apresentaram resposta linear decrescente, com o aumento no nível de farelo de coco nas dietas. O consumo de extrato etéreo (EE) em gramas, Fibra em detergente ácido (FDN) e Fibra em detergente neutro (FDA) em g e percentagem do peso vivo, não diferiram (P>0,05) quanto aos níveis de farelo de coco na dieta. Já o consumo de EE em percentagem do peso vivo apresentou comportamento quadrático, com maior consumo das dietas com 25 e 50% de farelo de coco. Observou-se resposta linear decrescente para a digestibilidade aparente da MS, FDN e CNF de acordo com aumento dos níveis de farelo coco na dieta e resposta linear crescente para a digestibilidade do EE, onde a maior digestibilidade ocorreu na dieta com nível de inclusão de 75% de farelo de coco. A digestibilidade da PB e da FDA não diferiram (P>0.05) quantos aos níveis de farelo de coco no concentrado. Concluiu-se que o farelo de coco não pode ser utilizado em níveis elevados na dieta de ovinos, comprometendo o consumo e o desempenho dos animais.