Classification of cellular malignancy associated changes in cervical cancer

Cervical cancer is the leading cause of death and disease from malignant neoplasms among women in developing countries. Even though the Pap smear has significantly decreased the number of deaths from cervical cancer in the past years, it has its limitations. Researchers have developed an automated screening machine which can potentially detect abnormal cases that are overlooked by conventional screening. The goal of quantitative cytology is to classify the patient's tissue sample based on quantitative measurements of the individual cells. It is also much cheaper and potentially can take less time. One of the major challenges of collecting cells with a cytobrush is the possibility of not sampling any existing dysplastic cells on the cervix. Being able to correctly classify patients who have disease without the presence of dysplastic cells could improve the accuracy of quantitative cytology algorithms. Subtle morphologic changes in normal-appearing tissues adjacent to or distant from malignant tumors have been shown to exist, but a comparison of various statistical methods, including many recent advances in the statistical learning field, has not previously been done. The objective of this thesis is to use different classification methods applied to quantitative cytology data for the detection of malignancy associated changes (MACs). In this thesis, Elastic Net is the best algorithm. When we applied the Elastic Net algorithm to the test set, we combined the training set and validation set as "training" set and used 5-fold cross validation to choose the parameter for Elastic Net. It has a sensitivity of 47% at 80% specificity, an AUC 0.52, and a partial AUC 0.10 (95% CI 0.09-0.11).^

Evaluación de la involución, salud uterina y retorno de la actividad ovárica con la adición de zeolita 2% en la dieta basal de vacas lecheras

El objetivo de esta investigación fue evaluar el efecto de zeolita (Clinoptilolita) adicionado en la dieta basal de vacas lecheras durante 105 días, 60 días pre-parto (dap) y 45 días post-parto (dpp) y su influencia en la involución (IU) y salud uterina (SU), el retorno de la actividad ovárica (AO) y la condición corporal (CC). El proyecto se realizó en tres ganaderías de la comunidad de Soldados del Cantón Cuenca – Azuay, en 50 vacas secas, con una CC ≥ 3,5, entre 2 a 5 partos, clínicamente sanas y todas en las mismas condiciones sanitarias y de manejo; fueron divididas en un grupo control (n1=25), alimentadas con dieta basal y un experimental (n2=25), con dieta basal + 2% de Zeolita del consumo de materia (CMS). Se evaluó retorno de AO considerando folículos ≥ 10 mm de diámetro a los 15, 22, 35 y 45 dpp por Ultrasonografía transrectal, SU (>10 PMN) a los 35 dpp por cytobrush, IU considerando posición del útero con respecto a la pelvis (PU), simetría de los cuernos (SCU), y diámetro del cérvix (DC), a los 22 y 45 dpp por palpación rectal, y finalmente la CC a los 15 dap, parto y 45 dpp. Se usó un diseño completamente al azar (DCA) y los resultados fueron analizados con el programa estadístico SPSS versión 22.0, posteriormente fueron aplicados los estadísticos de “U de Mann Withney y Kruscall Wallis”. Se obtuvo eficacia en el GE con mayor porcentaje de vacas que retornaron su AO (respectivamente, para GC y GE fueron: 35 dpp 29,6% vs. 70,4%; 45 dpp 44,4% vs. 55,6%; p<0,05). La IU fue a los 45 dpp, los valores obtenido para GC y GE fueron: respectivamente, PU 40,0% vs. 76,0%, SCU 32,0% vs. 76,0% y DC 28,0% vs. 68,0%, (p<0,05). Y en SU también mostró eficacia en el GE obteniendo un 3,4% vs. 22,2% de PMN en comparación con el GC, (p<0,05). Finalmente, se comprobó diferencias significativas (p<0,05) en la CC al parto y 45 dpp con eficacia atribuida al GE. En conclusión, la adición de zeolita al 2% en la dieta basal mostró eficacia en la involución y salud uterina, retorno de la actividad ovárica y la condición corporal en vacas en transición, recomendando su uso en las ganaderías lecheras