中国明对虾病原检测新方法及酚氧化酶通路相关基因的研究

对虾病害在世界范围内肆虐，给水产养殖和沿海农村经济造成了重大损失。在水产养殖的实践中快速检测水产动物的病害并及时采取隔离等措施对于控制病害尤为重要，其中关键的环节就是快速检测出病害，并在对虾免疫机制上寻找对虾疾病防治的有效方法。研究表明当对虾等甲壳动物受到外界病原刺激时，极微量的微生物多糖就可以激活proPO系统。激活过程中涉及和产生一系列活性物质，如黑色素、酚氧化酶原激活因子（PPA）、模式识别蛋白（BGBP、PGBP、LGBP、LBP）及其膜上受体和A2巨球蛋白等，它们可通过多种方式参与防御反应，包括提供调理素，促进血细胞吞噬作用，形成结节或包囊以及介导凝集和凝固，产生杀菌物质并且黑色素化。黑色素常常在节肢动物的体表形成黑色斑点，形成的色素沉着对机体起到保护作用。所以，酚氧化酶原激活的级联反应是节肢动物免疫的关键因素。本论文研究开发了以环等温介导技术（LAMP）为基础的检测对虾白斑病毒（WSSV）和鳗弧菌（V. anguillarum）的快速检测方法。并从对虾对病害的免疫机制为切入点，从中国明对虾体内克隆了酚氧化酶原（PrpPO）和丝氨酸蛋白酶FcSP3这两个免疫系统中重要的基因，分析了它们的分子结构特征，组织分布及应答鳗弧菌病原刺激的表达变化模式。 建立的对虾常见病害对虾白班病毒（WSSV）和鳗弧菌（V. anguillarum）的LAMP检测方法，经过实验比对和Blast检索，发现本研究中使用的引物，比已经报导的LAMP方法或者PCR方法具有更宽的检测范围（更低的假阴性）。检测WSSV的LAMP方法使用病毒的VP28基因设计引物，而鳗弧菌的检测方法使用empA基因设计引物。在方法中，首次提出加入UNG酶和dUTP的措施来预防污染，在实际检测中非常有效。LAMP方法与PCR检测方法的灵敏性比较也进行了研究，二者灵敏性相当。 依据中国明对虾血液cDNA文库提供的部分片段信息，结合SMART-RACE技术，克隆了酚氧化酶原（PrpPO）基因，通过序列比对分析发现，PrpPO基因cDNA全长为3040 bp，其中开放阅读框2061 bp，编码686个氨基酸，其中推测的信号肽为12个氨基酸。推测的序列与斑节对虾（P. monodon）同源性为93%,与短钩对虾（P. semisulcatus.）同源性为92%。real time RT-PCR实验结果表明， ProPO在血细胞中的相对表达量最高，肝胰脏中表达量最低。弧菌刺激实验中注射弧菌，刺激了血细胞和淋巴器官中的ProPO mRNA显著增加，说明在血细胞和淋巴器官中存在快速反应的ProPO通路。而ProPO mRNA量在淋巴器官中在时间上早于血液中升至最高，说明该动物在在病原刚开始入侵的时候先有淋巴器官发挥主要的免疫作用，随着时间推移血细胞便变成主要的免疫器官。 根据中国明对虾肝胰脏cDNA文库提供EST信息，经过SMART-RACE克隆了一个丝氨酸蛋白酶FcSP3基因，通过序列比对分析发现，该丝氨酸蛋白酶基因cDNA全长为1622 bp，其中开放阅读框1431 bp，编码477个氨基酸，其中推测的信号肽为22个氨基酸。推测的序列与疟蚊的丝氨酸蛋白酶（A. gambiae）同源性为33%,与丽蝇蛹集金小蜂的酚氧化酶原激活因子（N. vitripennis）同源性为32%，与东北大黑鳃金龟的酚氧化酶原激活因子（H. diomphalia）同源性为34%。淋巴器官中PPAⅡ表达量约为血液中表达量的47560倍，肝胰脏中的FCSP3表达量为血细胞表达量的6226倍。鳗弧菌注射对虾后，淋巴器官中刺激组和对照组FcSP3的mRNA量在刺激后6小时显著降低，但是刺激组的表达量明显高于对照组。刺激组的血细胞与肝胰脏中FcSP3 mRNA的相对表达量增高。而病原刺激后的血液与肝胰脏中的FcSP3 mRNA的增长趋势也在时间上先与ProPO mRNA。这说明FcSP3对ProPO有正调控的作用，但这个调控有一个时间差，并且在不同组织中有不同的调控效率。

中国明对虾在胁迫条件下肝胰脏的差异蛋白质组学研究

对虾养殖业的发展面临着病害严重和环境恶化的严重挑战。对虾细菌和病毒性疾病的频发已给对虾的养殖业造成了严重损失。养殖环境恶化造成的环境胁迫，不但影响对虾的生长性状，而且导致对虾的抵抗力下降，更容易引发病害的发生。研究对虾在外界胁迫（环境胁迫、病原感染）后蛋白表达模式的变化有助于弄清对虾的抗病抗逆机理，为抗病抗逆对虾的培育提供理论依据。 肝胰脏是对虾的重要器官，参与各种重要的生理活动包括消化、吸收、储存和代谢，并且在启动对虾免疫反应起重要作用，其蛋白质表达的变化与对虾的健康状况密切相关。 本研究运用蛋白质组学技术平台（双向电泳、串联质谱、数据库搜索），对中国明对虾肝胰脏蛋白进行研究，获得了一些重要进展，结果如下： 1.初步构建了覆盖范围广、分辨率高、重复性好的中国明对虾肝胰脏双向电泳参考图谱，并利用质谱分析和多种数据库搜索方法成功鉴定了122个（68种）蛋白质点，包括14个（9种）能量代谢蛋白、15个（9种）氨基酸代谢蛋白、10个（5种）碳水化合物代谢蛋白、2个（1种）多聚糖代谢蛋白、11个（5种）辅酶和维生素代谢蛋白、1个（1种）脂类代谢蛋白、5个（3种）核酸代谢蛋白、7个（3种）消化酶、3个（1种）细胞骨架蛋白、14个（8种）免疫相关蛋白、9个（6种）抗氧化蛋白、19个（7种）伴侣蛋白、4个（3种）信号转导蛋白、3个（3种）翻译功能蛋白和5个（4种）未分组蛋白。 2.在参考图谱的基础上，研究了缺氧胁迫下中国明对虾肝胰脏蛋白质表达模式的变化，成功鉴定了52个（15个上调、37个下调）差异表达的蛋白，包括11个能量产生相关蛋白、13个免疫相关蛋白、11个代谢相关蛋白、6个抗氧化蛋白、7个分子伴侣、2个细胞骨架蛋白和2个未分类蛋白，利用实时定量PCR技术，研究了缺氧胁迫下10个差异蛋白的基因在转录水平上的变化；同时研究了金属镉胁迫后中国明对虾肝胰脏蛋白质表达模式的变化，成功鉴定了29个（4个上调、25个下调）差异表达的蛋白，包括9个能量产生相关蛋白、3个免疫相关蛋白、9个代谢相关蛋白、5个抗氧化蛋白、2个分子伴侣和1个未分类蛋白。 3.分别进行了灭活鳗弧菌和WSSV感染后中国明对虾肝胰脏的差异蛋白质组学研究。灭活鳗弧菌刺激后，45个差异表达的蛋白质（4个上调、41个下调）被成功鉴定出，包括6个能量产生相关蛋白、4个免疫相关蛋白、22个代谢相关蛋白、4个抗氧化蛋白、7个分子伴侣、1个翻译相关蛋白和2个未分类蛋白；WSSV感染后， 48个差异表达的蛋白质（11个上调、37个下调）被成功鉴定出，包括7个能量产生相关蛋白、9个免疫相关蛋白、20个代谢相关蛋白、5个抗氧化蛋白和7个分子伴侣。 通过对上述实验数据的分析，初步探讨了中国明对虾对虾对环境胁迫和病原感染的应答机理。为下一步筛选中国明对虾环境胁迫及免疫应答关键蛋白并研究其功能奠定了基础。

中国明对虾重要分子伴侣蛋白基因的克隆及表达研究

对虾养殖业的可持续发展面临着种质退化、病害严重和养殖环境恶化等问题的严重挑战。养殖环境恶化造成的环境胁迫，不但影响对虾的生长性状，而且导致对虾的抵抗力下降，更容易引发病害的发生。养殖环境恶化已经严重影响了对虾养殖业的健康可持续发展。本论文针对环境恶化造成的环境胁迫对对虾影响的分子机理进行了研究。 克隆了中国明对虾对环境胁迫应答的重要伴侣蛋白基因，包括钙网蛋白（FcCRT）、葡萄糖调节蛋白78 （FcGrp78）、热休克蛋白70（FcHsp70）和热休克蛋白90（FcHsp90）的全长cDNA，研究了这些基因的组织表达特征，并对这些基因在不同胁迫条件下的转录表达特征进行了分析。 钙网蛋白是一种多功能的内质网钙结合蛋白，负责蛋白折叠和糖蛋白修饰。本论文首次在中国明对虾报道了钙网蛋白FcCRT基因的全长cDNA序列，编码406个氨基酸，具有保守的N-，P-和C-功能域，以及信号肽和保守的HDEL内质网回收标签。FcCRT基因与其它物种的钙网蛋白具有高度的相似性，系统进化分析表明，FcCRT在亲缘关系上更接近昆虫的钙网蛋白。Northern blot和原位杂交结果显示，FcCRT基因在中国明对虾各组织中均有表达，且在卵巢中发育早起的卵母细胞中表达量最高，说明FcCRT很可能参与了卵母细胞的成熟。FcCRT基因在不同胁迫条件下，其转录表达均呈现明显的变化。在WSSV感染实验中，中国明对虾肝胰脏和淋巴器官中FcCRT转录表达均明显上调；热休克、重金属处理均可引起FcCRT基因转录表达的变化，但不同重金属处理引起FcCRT转录表达变化的模式不同。铜离子处理6小时，会引起FcCRT基因的下调表达，但在12小时之后出现明显上调；镉离子处理12小时后引起FcCRT基因的下调表达，但在24小时又出现明显的上调表达。 葡萄糖调节蛋白78（GRP78）是内质网重要的伴侣蛋白。中国明对虾的Grp78基因（FcGrp78）的cDNA全长为2325bp，编码665个氨基酸。FcGrp78具有三个Hsp70蛋白家族标签，并含有KDEL内质网回收标签。FcGrp78基因与中国明对虾已有的Hsc70和Hsp70具有高度相似性。Northern blot杂交结果显示FcGrp78基因在中国明对虾各组织中均有表达。FcGrp78基因在WSSV感染的中国明对虾肝胰脏中呈上调表达，在血细胞中下调表达，说明FcGrp78可能与对虾的免疫应答有关。热休克处理会诱导FcGrp78基因转录的上调。不同重金属离子胁迫引起的FcGrp78转录表达有所不同：铜离子处理可以诱导FcGrp78基因在处理后24小时的上调表达；镉离子的处理导致FcGrp78基因处理后12小时的下调以及处理后24小时的上调表达变化。短期低氧胁迫则抑制对虾FcGrp78基因的转录表达。 本论文报道的中国明对虾FcHsp90基因 cDNA全长2552bp，编码726个氨基酸，具有保守的N端功能域、中间功能域和C端功能域，具有五个保守的Hsp90蛋白家族标签，序列上与其他物种Hsp90相似性高。Real-time RT-PCR结果显示FcHsp90基因在发育的卵巢中表达量较高，说明Hsp90可能参与了对虾卵母细胞成熟过程中的蛋白合成和卵黄蛋白原的分泌。WSSV感染引起中国明对虾肝胰脏的FcHsp90的转录表达明显上调，说明FcHsp90很可能与对虾的免疫相关。热休克处理诱导FcHsp90基因转录表达的迅速上调。铜离子处理也可诱导FcHsp90基因转录的上调表达，而镉离子处理首先引起FcHsp90基因的下调表达，24小时后开始上调。低氧胁迫也会抑制FcHsp90基因在对虾体内的转录表达。 诱导型FcHsp70基因cDNA全长2511bp，编码629个氨基酸，具有三个保守的Hsp70蛋白家族标签和C末端EEVD序列。与其他物种的Hsp70蛋白具有高度的相似性。FcHsp70基因转录表达对于热休克处理和铜离子的处理非常敏感：热休克处理2小时后FcHsp70基因的转录水平是对照组的80倍；铜离子处理12小时FcHsp70基因转录表达达到对照组的15倍。而镉离子处理后没有诱导FcHsp70显著的上调表达。 以上研究结果为阐明对虾对环境胁迫应答的机制奠定了重要基础，并可为抗逆对虾的培育提供依据。

中国对虾人工诱导雌核发育的研究

本文研究了365nm波长紫外线辐射中国对虾精子对其顶体反应和受精能力的影响。结果表明，低剂量紫外线辐射促进精子发生顶体反应，大剂量辐射使精子丧失发生顶体反应的生理机能并死亡。人工诱导雌核发育的过程中，紫外线辐射精液稀释液5－8秒，可获得遗传物质失活的精子（激活源）。经透射电镜观察分析，紫外线对精子遗传物质的损伤是一种使染色质变性的化学作用。

软甲纲动物和星虫动物线粒体基因组特征及分子进化研究

在过去的几十年间，利用线粒体基因组序列探讨后生动物深层次的系统发育关系已取得初步进展。这主要得益于，线粒体基因组与其它分子标记相比具备诸多优势。迄今为止，超过1,200个后生动物的线粒体基因组已被测定，然而所获得的数据分布极不均衡。 软甲纲历来是甲壳动物分类学和系统发育学研究的重要类群，在形态学特征和分子生物学各方面取得广泛的发展。尽管软甲纲本身作为单系群已得到大多数甲壳动物学家认可，但是软甲纲内部各个类群之间的系统发育关系迄今仍颇有争议。本文报道了凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei、中国明对虾Fenneropenaeus chinensis、脊尾白虾Exopalaemon carinicauda、太平洋磷虾Euphausia pacifica和采自南极普里兹湾南极磷虾Euphausia superba的线粒体基因组，其长度分别为15,989 bp、16,004 bp、15,730 bp、16,898 bp和15,498 bp以上（部分非编码区没有测定）。 本研究发现凡纳滨对虾、中国明对虾、脊尾白虾和太平洋磷虾的线粒体基因组包含后生动物线粒体基因组典型的基因组成（13个蛋白质编码基因、22个转运RNA、2个核糖体RNA和一个非编码的AT富含区）；然而，南极磷虾与后生动物线粒体基因组典型的基因组成相比，存在1个trnN基因的重复。与泛甲壳动物线粒体基因组的原始排列相比，凡纳滨对虾和中国明对虾线粒体基因组的基因排列完全一致；脊尾白虾的线粒体基因组发生罕见的trnP和trnH易位，从而说明在真虾下目中线粒体基因组的基因排列并不保守；太平洋磷虾线粒体基因组的基因排列出现3个转运RNA的重排 （trnL1、trnL2和trnW）；南极磷虾线粒体基因组的基因排列除了出现太平洋磷虾具有的这3个转运RNA重排之外，还有1个trnN的重复和1个trnI基因的重排。另外，在太平洋磷虾线粒体基因组最大的非编码区中存在一个154 bp×4.7的串连重复区域，如此大片段的串联重复区域（>150 bp）在软甲纲动物线粒体基因组中是首次报道。 目前所获得的线粒体基因组数据强有力地支持口足目、对虾科、真虾下目和短尾下目为单系群。通过比较基因排列及蛋白质编码基因核苷酸和氨基酸序列的系统发育分析得知真虾类和龙虾类为腹胚亚目的原始类群，并支持“（（Penaeus＋Fenneropenaeus）＋Litopenaeus）＋Marsupenaeus”的系统发育关系。此外，线粒体基因组的数据也强有力地支持磷虾目为单系群。但对于磷虾目在软甲纲中的分类地位及与其它类群的系统发育关系存在一些分歧：基于蛋白质编码基因核苷酸和氨基酸数据的贝叶斯分析强有力地支持磷虾目和十足目近缘，这个结果和传统的分类系统完全一致；然而，基于核苷酸序列的邻接法、氨基酸序列的邻接法和最大似然法均强有力地支持磷虾类和对虾类亲缘关系较近，从而破坏了十足目的单系性，与传统的认识并不一致，但由于自展值的支持率非常高，所以深层次的分析需要进一步加强。 星虫动物属于海洋生物中的一个小门类，自1555年被记载以来，其在后生动物中的分类地位就备受争议。本研究测定了星虫动物门的第一条线粒体基因组：革囊星虫Phascolosoma esculenta的线粒体基因组，全长为15,494 bp，包含13个蛋白质编码基因、22个转运RNA、2个核糖体RNA和1个非编码的AT富含区，所有37个基因在同一条链上编码。与后生动物线粒体基因组的典型组成相比，存在一个trnR基因的缺失和一个trnM基因的重复。比较星虫动物和其它后生动物的线粒体基因组，可以得到以下结论：1）星虫动物和环节动物（包括螠虫动物）的线粒体基因组有相近的基因排列，而且所有基因都在同一链上编码；2）基于蛋白质编码基因的系统发育分析强有力地支持星虫动物和环节动物（包括螠虫动物）组成一个单系群，而将软体动物排除在外。因此，本研究认为以前许多星虫动物和软体动物“共享”的特征，包括发育特征和缺乏分节等，需要重新考虑。

中国对虾不同群体的遗传差异与抗病群体选育的研究

为更好地管理和开发中国对虾的遗传资源,建立完善的中国对虾优良(抗病)品种的选育计划,该文对中国对虾自然群体和养殖群体进行了遗传多样性评估,并对一个养殖群体进行了抗病性状的遗传育种试验.从CS<,201>筛选个体大、活力强的对虾进行育种试验.CS<,202>和CS<,203>分别为感染WSSV爆发性流行病后存活的第二代和第三代群体.设计口饲毒饵法对CS<,203>进行人工感染,以确定连续选育的中国对虾的抗病能力.利用AFLP(Amplifiedfragmentlengthpolymorphisms)技术分析连续3代群体CS<,201>、CS<,202>、CS<,203>的遗传多样性和遗传标记.RAPD和同工酶的调查结果表明,中国对虾种群的遗传多样性水平低,群体内和群体间的2种分子标记都表现较高的稳定性.群体间比较分析,KP的遗传多样性最高,YB次之,CS<,1>最低.在用同工酶分析的4个群体中,CS<,201>的多态位点比例和杂合度等指标高于其它3个群体.从群体的分化指标来看,中国对虾种群的各群体间有一定的遗传分化.

中国明对虾三倍体性腺发育机理的初步研究

三倍体培育是水产动物遗传改良的重要途径之一，它在提高养殖产量、改良品质方面发挥着重要作用。对虾三倍体在性腺发育和性别比率方面与二倍体之间存在明显差异。本论文对三倍体性腺发育的分子机理进行了初步探讨，为阐明甲壳动物的性腺发育和性别控制机理提供重要依据。本论文取得的主要进展如下： 利用联会复合体的分析技术，比较分析了雄性二倍体和三倍体中精母细胞的减数分裂行为。二倍体对虾具有典型的真核生物联会复合体的形态，联会复合体在二价体联会处沿同源染色体长轴分布；未见明显的异型性别染色体；三倍体对虾精母细胞的联会行为复杂，可见二价体、单价体、非同源联会的三价体、同源转换和同源区完全配对的双联会复合体等不同形态；三倍体对虾在晚粗线期普遍表现为三价体同源区完全配对的双联会复合体形态，这种联会行为可能是导致其产生 3n 倍性精子的关键原因。 利用抑制性消减杂交技术，建立了对虾二倍体和三倍体卵巢间的2个消减文库；在正向消减文库（以三倍体卵巢作为实验组，二倍体卵巢作为驱动组）中，鉴定到54个基因；在反向消减文库（以二倍体卵巢为实验组，三倍体卵巢为驱动组）中，鉴定到16个基因；选取11个差异表达的基因，利用半定量RT-PCR的方法对其在二倍体和三倍体卵巢间的表达进行了检测，均能很好地与消减结果相吻合；这些差异基因编码多种功能的蛋白，分析表明染色体的三倍化使三倍体卵巢中的基因调控网络受到了影响；为深入揭示维持卵巢正常发育的关键分子调控事件奠定了基础。 为进一步分析特定基因对对虾性腺发育的调控机制，选取了在对虾三倍体和二倍体卵巢中差异表达显著的 3 个不同基因，PCNA （proliferating cell nuclear antigen）、CAS/CSE1 （cellular apoptosis susceptibility protein/chromosome segregation 1）和 SSRF （spermatogonial stem-cell renewal factor），进行了相关研究分析，为深入探讨特定基因对对虾性腺发育的调控机制以及三倍体中的基因表达调控机制奠定了基础； 中国明对虾PCNA基因在增殖旺盛的性腺组织及造血组织中表达量最高；在二倍体卵巢中的表达水平显著高于三倍体卵巢；在不同病原刺激下的造血组织中的表达模式不同，与对虾对抗不同病原刺激的免疫反应相关；PCNA在序列上的高度保守性，提示了其功能的保守性；利用PCNA基因可以指示细胞的增殖活性的特点，将辅助我们在对虾发育生物学和二倍体、三倍体对虾比较发育生物学的研究； 中国明对虾CAS/CSE1基因在二倍体卵巢中高表达；在卵母细胞中，其mRNA大量分布于细胞质及细胞核周围；是早期胚胎发育的母源性因子；在其氨基酸序列的N端具有importin-β 家族蛋白的保守结构，提示其可能通过参与核质运输在发育过程中发挥重要作用；利用原核表达系统成功地对其进行了体外重组表达，为进一步在蛋白水平上的功能研究提供了条件； 中国明对虾SSRF（暂时命名）基因在三倍体卵巢中高表达；在正常二倍体对虾的神经组织中表达量最高，提示该基因在神经发育中可能发挥重要作用；在氨基酸序列上与胸苷磷酸化酶（TP）具有最高的相似性；利用原核表达系统成功地对其进行了体外重组表达，为进一步在蛋白水平上的功能研究奠定了基础；对对虾SSRF活性蛋白的酶活及功能验证亟待进行。

中国明对虾Toll样受体基因的克隆与表达分析

对虾病害在世界范围内的广泛传播，给水产养殖和沿海农村经济造成了重大损失。自1993 年对虾白斑病暴发以来，中国明对虾的养殖一直一蹶不振。引起对虾大规模死亡的原因是多方面的，其主要原因是养殖环境恶化、对虾种质退化和抗病力下降。因此，深入开展对虾免疫机制研究，并在此基础上寻找对虾疾病防治的有效方法，改良种质和培育抗病品系，已成为对虾养殖业走可持续发展之路的当务之急。 Toll 样受体（Toll-like receptors, TLRs）家族是进化保守的哺乳动物模式识别蛋白（pattern recognition receptors, PRR），在先天免疫系统中起着非常重要的作用。本研究采用同源克隆和RACE（rapid amplification of cDNA ends）技术从中国明对虾中克隆到Toll 样受体同源基因，并将其命名为FcToll。它全长4115 bp，3’UTR 包含16 个poly A 尾巴，开放阅读框编码931 个氨基酸的多肽。预测的该多肽包含典型的Toll 样受体结构，分为胞外区、跨膜区和胞内区。其中胞外区有信号肽，有16 个富含亮氨酸的重复序列eucine-rich repeats, LRR），并含有2个LRR-C 末端基序和2 个LRR-N 末端基序；跨膜区是23 个氨基酸的一次跨膜结构域；胞内区是含有139 个氨基酸的TIR 结构域（Toll/Interleukin-1R）。克隆 发现FcToll 的基因组结构包含5 个外显子和4 个内含子。系统发生分析揭示FcToll归属于“昆虫型”的无脊椎动物Toll 样受体家族。组织分布研究发现FcToll 在中国明对虾中是组成型表达的，在淋巴器官中表达量较显著。分别利用不同病原体刺激健康的中国明对虾，Real-time PCR 发现该基因在刺激后表达水平呈现不同的表达谱：灭活鳗弧菌（Vibrio anguillarum）注射后5 小时，该基因表达显著 上调；而WSSV（white spot syndrome virus）注射后该基因表达则迅速下调，感染后23 小时内其表达水平均低于对应时间点的对照组。这就表明FcToll 可能参与中国明对虾的先天免疫防御，尤其可能参与入侵弧菌的免疫应答。

Two trichodinid ectoparasites from marine molluscs in the Yellow Sea, off China, with the description of Trichodina caecellae n. sp (Protozoa : Ciliophora : Peritrichia)

The morphology and infraciliature of two ectoparasitic ciliates, Trichodina caecellae n. sp. and T. ruditapicis Xu, Song & Warren, 2000, parasitising the gills of marine molluscs from the Shandong coast of the Yellow Sea, China, were investigated following wet silver nitrate and protargol impregnation. T. caecellae was found on the small marine sand clam Caecella chinensis Deshayes and is distinguished mainly by the acute triangle-like blade, the very delicate central part and the needle-shaped ray. T. ruditapicis was studied based on four populations from three clams: two populations from Ruditapes philippinarum (Adams) and one each from Saxidomus purpuratus (Sowerby) and Solen grandis Dunker. All four populations fell within the range of morphometry and agreed closely in the overall appearance of the adhesive disc. However, variability was found in the denticle structure, especially in populations from different host clams. Our observations suggest that denticle morphology may be more or less variable between and within populations, and that such minor differences should not be overestimated. It should be emphasised that, except for the denticle morphology, the bright granules or circles in the centre of the adhesive disc represent another important feature facilitating the identification of this trichodinid species.

The manganese superoxide dismutase gene in bay scallop Argopecten irradians: Cloning, 3D modelling and mRNA expression

A novel manganese superoxide dismutase (MnSOD) was cloned from bay scallop Argopecten irradians by 3' and 5' rapid amplification of cDNA ends (RACE) PCR. The full-length cDNA of MnSOD was of 1207 bp with a 678 bp open reading frame encoding 226 amino acids. The deduced amino acid sequence contained a putative signal peptide of 26 amino acids. Sequence comparison showed that the MnSOD of A. irradians shared high identity with MnSOD in invertebrates and vertebrates, such as MnSOD from abalone Haliotis discus discus (ABG88843) and frog Xenopus laevis (AAQ63483). Furthermore, the 3D structure of bay scallop MnSOD was predicted by SWISS-MODEL Protein Modelling Server and compared with those of other MnSODs. The overall structure of bay scallop MnSOD was similar to those of zebrafish Danio rerio, fruit fly Drosophila melanogaster, Chinese shrimp Fenneropenaeus chinensis, human Homo sapiens, and had the highest similarity to scallop Mizuhopecten yessoensis and abalone H. discus discus. A quantitative real-time PCR (qRT-PCR) assay was developed to detect the mRNA expression of MnSOD in different tissues and the temporal expression in haemocytes following challenge with the bacterium Vibrio anguillarum. A higher-level of mRNA expression of MnSOD was detected in gill and mantle. The expression of MnSOD reached the highest level at 3 h post-injection with V. anguillarum and then slightly recovered from 6 to 48 h. The results indicated that bay scallop MnSOD was a constitutive and inducible protein and thus could play an important role in the immune responses against V anguillarum infection. (c) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Residues of enrofloxacin, furazolidone and their metabolites in Nile tilapia (Oreochromis niloticus)

The residues of enrofloxacin and its metabolite in Nile tilapia (Oreochromis niloticus) were studied after oral dose of 50 mg/kg for 7 days. To find the differences between Nile tilapia and Chinese shrimp (Penaeus chinensis), the residues of enrofloxacin in P chinensis were also studied under the same conditions. The results showed that enrofloxacin metabolized into ciprofloxacin in both Nile tilapia and P chinensis, the maximal concentration of enrofloxacin in muscle, liver and plasma of Nile tilapia were 3.61 mu g/g, 5.96 mu g/g, 1.25 mu g/ml respectively, and ciprofloxacin in muscle was 0.22 mu g/g. The maximal concentration of enrofloxacin and ciprofloxacin in P chinensis were 1.68 mu g/g and 0.07 mu g/g respectively. The predicted withdrawal time for Nile tilapia was 22 days, and P. chinensis was 12 days under our experiment conditions. The residues of fitrazolidone [3-(5-nitrofurfurylidenamino)-2-oxazolidinone] and its main metabolite 3-amina-2-oxazolidinone (AOZ) in Nile tilapia were first determined by HPLC/MS. Results showed that after oral dose of 30 mg/kg for 7 days, the maximum concentration of farazolidone in Nile tilapia was 413 mu g/kg after 6 h, whereas AOZ residue reached its maximum (31 mu g/kg) right after stopping treatment. In contrast to the high metabolic rate of furazolidone, AOZ was very difficult to eliminate in vivo, thus the withdrawal time of furazolidone in Nile tilapia was 22 days at least. (c) 2005 Elsevier B.V. All rights reserved.

Berberine as a natural source inhibitor for mild steel in 1 M H2SO4

Berberine was abstracted from coptis chinensis and its inhibition efficiency on corrosion of mild steel in 1 M H2SO4 was investigated through weight loss experiment, electrochemical techniques and scanning electronic microscope (SEM) with energy disperse spectrometer (EDS). The weight loss results showed that berbefine is an excellent corrosion inhibitor for mild steel immersed in 1M H2SO4. Potentiodynamic curves suggested that berbefine suppressed both cathodic and anodic processes for its concentrations higher than 1.0 x 10(-4) M and mainly cathodic reaction was suppressed for lower concentrations. The Nyquist diagrams of impedance for mild steel in 1 M H2SO4 containing berbefine with different concentrations showed one capacitive loop, and the polarization resistance increased with the inhibitor concentration rising. A good fit to Flory-Huggins isotherm was obtained between surface coverage degree and inhibitor concentration. The surface morphology and EDS analysis for mild steel specimens in sulfuric acid in the absence and presence of the inhibitor also proved the results obtained by the weight loss and electrochemical experiments. The correlation of inhibition effect and molecular structure of berberine was then discussed by quantum chemistry study. (c) 2005 Elsevier B.V. All rights reserved.

Seasonal and interannual variation in water vapor and energy exchange over a typical steppe in Inner Mongolia, China

In this study, we conducted eddy covariance (EC) measurements of water vapor exchange over a typical steppe in a semi-arid area of the Inner Mongolia Plateau, China. Measurement sites were located within a 25-year-old enclosure with a relatively low leaf area index (similar to 1. 5 m(2) m(-2)) and dominated by Leymus chinensis. Energy balance closure was (H + LE) = 17.09 + 0.69 x (Rn - G) (W/m(2); r(2) = 0.95, n = 6596). Precipitation during the two growing seasons of the study period was similar to the long-term average. The peak evapotranspiration in 2004 was 4 mm d(-1), and 3.5 mm d(-1) in 2003. The maximum latent heat flux was higher than the sensible heat flux, and the sensible heat flux dominated the energy budget at midday during the entire growing season in 2003; latent heat flux was the main consumption component for net radiation during the 2004 growing season. During periods of frozen soil in 2003 and 2004, the sensible heat flux was the primary consumption component for net radiation. The soil heat flux component was similar in 2003 and 2004. The decoupling coefficient (between 0.5 and 0.1) indicates that evapotranspiration was strongly controlled by saturation water vapor pressure deficit (VPD) in this grassland. The results of this research suggest that energy exchange and evapotranspiration were controlled by the phenology of the vegetation and soil water content. In addition, the amount and frequency of rainfall significantly affect energy exchange and evapotranspiration upon the Inner Mongolia plateau. (c) 2007 Published by Elsevier B.V.

Effects of forage composition and growing season on methane emission from sheep in the Inner Mongolia steppe of China

Understanding the effects of dietary composition on methane (CH4) production of sheep can help us to understand grassland degradation resulting in an increase of CH4 emission from ruminant livestock and its resulting significance affecting CH4 source/sink in the grazing ecosystem. The objective of this study was to investigate the effect of forage composition in the diet of sheep in July and August on CH4 production by sheep in the Inner Mongolia steppe. The four diet treatments were: (1) Leymus chinensis and Cleistogenes squarrosa (LC), (2) Leymus chinensis, Cleistogenes squarrosa and concentrate supplementation (LCC), (3) Artemisia frigida and Cleistogenes squarrosa (AC), and (4) Artemisia frigida, Cleistogenes squarrosa and concentrate supplementation (ACC). CH4 production was significantly lower in July than in August (31.4 and 36.2 g per sheep-unit per day, respectively). The daily average CH4 production per unit of digestive dry matter (DM), organic matter (OM) and neutral detergent fiber (NDF) increased by 10.9, 11.2 and 42.1% for the AC diet compared with the LC diet, respectively. Although concentrate supplementation in both the AC and LC diets increased total CH4 production per sheep per day, it improved sheep productivity and decreased CH4 production by 14.8, 12.5 and 14.8% per unit of DM, OM and NDF digested by the sheep, respectively. Our results suggested that in degraded grassland CH4 emission from sheep was increased and concentrate supplementation increased diet use efficiency. Sheep-grazing ecosystem seems to be a source of CH4 when the stocking rate is over 0.5 sheep-units ha(-1) during the growing season in the Inner Mongolia steppe.

Geographic variation in the leaf essential oils of Juniperus sabina L. and J-sablina var. arenaria (E.H. Wilson) Farjon

The composition of the leaf oils from seven populations of J. sabina L., one population of Juniperus sabina var. arenaria (E. H. Wilson) Farjon were examined for their geographic variation. In addition, the leaf oils of J. chinensis L. and J. davurica Pall. were compared to J. sabina. Juniperus sabina var. arenarla, the sand loving juniper, oil was found to be very similar to that of J. davurica, Mongolia, and J. sabina, on sand dunes in Mongolia. This suggests that J. sabina var. arenaria might be conspecific with J. davurica. Farjon's move (2001) of J. sabina var. arenaria out of J. chinensis is supported. Considerable differentiation was found in populations of J. sabina from the Iberian peninsula. Cedrol, citronellol, safrole, trans-sabinyl acetate, terpinen-4-ol and beta-thujone were found to be polymorphic in several populations.