Identification of 23 new prostate cancer susceptibility loci using the iCOGS custom genotyping

Prostate cancer is the most frequently diagnosed cancer in males in developed countries. To identify common prostate cancer susceptibility alleles, we genotyped 211,155 SNPs on a custom Illumina array (iCOGS) in blood DNA from 25,074 prostate cancer cases and 24,272 controls from the international PRACTICAL Consortium. Twenty-three new prostate cancer susceptibility loci were identified at genome-wide significance (P < 5 × 10−8). More than 70 prostate cancer susceptibility loci, explaining ~30% of the familial risk for this disease, have now been identified. On the basis of combined risks conferred by the new and previously known risk loci, the top 1% of the risk distribution has a 4.7-fold higher risk than the average of the population being profiled. These results will facilitate population risk stratification for clinical studies.

Fine-mapping identifies multiple prostate cancer risk loci on 5p15 some associating with TERT expression

Associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) at 5p15 and multiple cancer types have been reported. We have previously shown evidence for a strong association between prostate cancer (PrCa) risk and rs2242652 at 5p15, intronic in the telomerase reverse transcriptase (TERT) gene that encodes TERT. To comprehensively evaluate the association between genetic variation across this region and PrCa, we performed a fine-mapping analysis by genotyping 134 SNPs using a custom Illumina iSelect array or Sequenom MassArray iPlex, followed by imputation of 1094 SNPs in 22 301 PrCa cases and 22 320 controls in The PRACTICAL consortium. Multiple stepwise logistic regression analysis identified four signals in the promoter or intronic regions of TERT that independently associated with PrCa risk. Gene expression analysis of normal prostate tissue showed evidence that SNPs within one of these regions also associated with TERT expression, providing a potential mechanism for predisposition to disease.

Fine-mapping the HOXB region detects common variants tagging a rare coding allele : evidence for synthetic association in prostate cancer

The HOXB13 gene has been implicated in prostate cancer (PrCa) susceptibility. We performed a high resolution fine-mapping analysis to comprehensively evaluate the association between common genetic variation across the HOXB genetic locus at 17q21 and PrCa risk. This involved genotyping 700 SNPs using a custom Illumina iSelect array (iCOGS) followed by imputation of 3195 SNPs in 20,440 PrCa cases and 21,469 controls in The PRACTICAL consortium. We identified a cluster of highly correlated common variants situated within or closely upstream of HOXB13 that were significantly associated with PrCa risk, described by rs117576373 (OR 1.30, P = 2.62×10(-14)). Additional genotyping, conditional regression and haplotype analyses indicated that the newly identified common variants tag a rare, partially correlated coding variant in the HOXB13 gene (G84E, rs138213197), which has been identified recently as a moderate penetrance PrCa susceptibility allele. The potential for GWAS associations detected through common SNPs to be driven by rare causal variants with higher relative risks has long been proposed; however, to our knowledge this is the first experimental evidence for this phenomenon of synthetic association contributing to cancer susceptibility.

A meta-analysis of 87,040 individuals identifies 23 new susceptibility loci for prostate cancer

Genome-wide association studies (GWAS) have identified 76 variants associated with prostate cancer risk predominantly in populations of European ancestry. To identify additional susceptibility loci for this common cancer, we conducted a meta-analysis of > 10 million SNPs in 43,303 prostate cancer cases and 43,737 controls from studies in populations of European, African, Japanese and Latino ancestry. Twenty-three new susceptibility loci were identified at association P < 5 × 10(-8); 15 variants were identified among men of European ancestry, 7 were identified in multi-ancestry analyses and 1 was associated with early-onset prostate cancer. These 23 variants, in combination with known prostate cancer risk variants, explain 33% of the familial risk for this disease in European-ancestry populations. These findings provide new regions for investigation into the pathogenesis of prostate cancer and demonstrate the usefulness of combining ancestrally diverse populations to discover risk loci for disease.

Risk analysis of prostate cancer in PRACTICAL, a multinational consortium, using 25 known prostate cancer susceptibility loci

Background Genome-wide association studies have identified multiple genetic variants associated with prostate cancer risk which explain a substantial proportion of familial relative risk. These variants can be used to stratify individuals by their risk of prostate cancer. Methods We genotyped 25 prostate cancer susceptibility loci in 40,414 individuals and derived a polygenic risk score (PRS).We estimated empirical odds ratios (OR) for prostate cancer associated with different risk strata defined by PRS and derived agespecific absolute risks of developing prostate cancer by PRS stratum and family history. Results The prostate cancer risk for men in the top 1% of the PRS distribution was 30.6 (95% CI, 16.4-57.3) fold compared with men in the bottom 1%, and 4.2 (95% CI, 3.2-5.5) fold compared with the median risk. The absolute risk of prostate cancer by age of 85 years was 65.8% for a man with family history in the top 1% of the PRS distribution, compared with 3.7% for a man in the bottom 1%. The PRS was only weakly correlated with serum PSA level (correlation = 0.09). Conclusions Risk profiling can identify men at substantially increased or reduced risk of prostate cancer. The effect size, measured by OR per unit PRS, was higher in men at younger ages and in men with family history of prostate cancer. Incorporating additional newly identified loci into a PRS should improve the predictive value of risk profiles. Impact:We demonstrate that the risk profiling based on SNPs can identify men at substantially increased or reduced risk that could have useful implications for targeted prevention and screening programs.

Generalizability of established prostate cancer risk variants in men of African ancestry

Genome-wide association studies have identified more than 80 risk variants for prostate cancer, mainly in European or Asian populations. The generalizability of these variants in other racial/ethnic populations needs to be understood before the loci can be used widely in risk modeling. In our study, we examined 82 previously reported risk variants in 4,853 prostate cancer cases and 4,678 controls of African ancestry. We performed association testing for each variant using logistic regression adjusted for age, study and global ancestry. Of the 82 known risk variants, 68 (83%) had effects that were directionally consistent in their association with prostate cancer risk and 30 (37%) were significantly associated with risk at p < 0.05, with the most statistically significant variants being rs116041037 (p = 3.7 × 10(-26) ) and rs6983561 (p = 1.1 × 10(-16) ) at 8q24, as well as rs7210100 (p = 5.4 × 10(-8) ) at 17q21. By exploring each locus in search of better markers, the number of variants that captured risk in men of African ancestry (p < 0.05) increased from 30 (37%) to 44 (54%). An aggregate score comprised of these 44 markers was strongly associated with prostate cancer risk [per-allele odds ratio (OR) = 1.12, p = 7.3 × 10(-98) ]. In summary, the consistent directions of effects for the vast majority of variants in men of African ancestry indicate common functional alleles that are shared across populations. Further exploration of these susceptibility loci is needed to identify the underlying biologically relevant variants to improve prostate cancer risk modeling in populations of African ancestry.

Evaluación del rendimiento de veinticinco líneas de sorgo (Sorghum bicolor L. Moench) bajo dos niveles de fertilización en el municipio de San Isidro-Matagalpa (2004)

El estudio se realizó en la Finca el Nancite ubicada en la comarca El Bocón del municipio de San Isidro _ Matagalpa, en la época de postrera (agosto _ diciembre) del año 2004. Elobjetivo de esta investigación fue evaluar veinticinco líneas de sorgo (Sorghum bicolor L. Moench), bajo dos niveles de fertilización (37.43 kg N ha-1 y 0 kg N ha-1). Los materiales evaluados son líneas puras y pertenecen al programa ICRISAT/LASIP; ICSVLM, que significa en ingles Sorghum Variety Latín American Program. El diseño que se utilizó para el experimento fue un diseño de bloques completos al azar (BCA). Cada una de las repeticiones estaba constituida por veinticinco parcelas en donde se sembraron las líneas a evaluar. Cada parcela contenía seis surcos de los cuales tres se fertilizaron aplicándosele completo (10-30-10) al momento de la siembra y fertilizante nitrogenado urea al 46% aplicado en forma fraccionada un 50% a los 30 (dds) y el otro 50% a los 45 días después de la siembra (dds), los otros tres surco no recibieron aporte de fertilización química sintética de forma aplicada. Las variables a evaluar en el desarrollo del cultivo fueron: Altura de planta (cm), diámetro del tallo (mm) y número de hojas por planta, estas se evaluaron en tres momentos (45, 60, 75dds). Al momento de la cosecha se evaluaron: Longitud de la panoja (cm.), longitud del raquis (cm), biomasa seca producida (kg ha-1), porcentaje de nitrógeno en la biomasa (%), porcentaje de nitrógeno en el grano (%), rendimiento de grano (kg ha-1), acumulación de nitrógeno en el grano (kg ha-1 ), acumulación de nitrógeno en la biomasa (kg ha-1), eficiencia fisiológica (%), incremento del rendimiento de grano por kg de nitrógeno aplicado (%), eficiencia de uso de nitrógeno por el grano (%). Los resultados obtenidos de las variables evaluadas se procesaron en el paquete estadístico FUALNM (versión 0.5) y separación de medias por Tukey al 95% de confiabilidad (α= 0.05), los resultados obtenidos de acuerdo al análisis, para las variables de desarrollo (altura, numero de hojas y diámetro), para largo de panoja y largo de raquis fueron altamente significativo para ambos factores (A: Líneas, B: Fertilización), en los diferentes momentos evaluados, exceptuando para la variable numero de hojas a los 75 dds para el factor B que fue significativo y para el diámetro del tallo a los 60 dds el factor B que no hubo significancia, todas estas variables mencionadas mostraron diferencias mínimas numéricamente. Para la biomasa seca producida y rendimiento de grano mostraron ser altamente significativo para los dos factoresA y B, obteniendo las líneas ICSVLM-89527, ICSVLM-89551 promedios de 5664 y 4912 kg.ha-1, siendo estos los mayores rendimientos de biomasa de todas las líneas. El rendimiento del grano, los mayores valores lo obtuvieron las líneas ICSVLM-89527 y ICSVLM-89551 con 1526.5 y 1271.8 kg. ha-1. En el incremento de rendimiento por kg. de N aplicado las líneas con mayores resultados fueron la ICSVLM-90538 con 14.7 % y las ICSVLM-93079 con 12.8%. Las líneas que hicieron un mejor uso eficiente de nitrógeno por la biomasa y el grano fueron la JOCORO y el testigo PINOLERO.

La noción de alma que propone Edith Stein en “La estructura de la persona humana” : continuidad y novedad

Resumen: Algunos capítulos del último curso de antropología dictado por la filósofa Edith Stein, antes de su entrada a la vida contemplativa en el Carmelo, permiten relevar continuidades y novedades con respecto a Aristóteles y a Santo Tomás de Aquino en torno a la noción de alma y a su función integradora. Se enumeran en primer lugar algunas coincidencias entre los tres filósofos, para mostrar después los enfoques característicos de cada uno, destacando la independencia de criterio y la originalidad de Tomás sobre Aristóteles y de Edith Stein sobre ambos. Se repasan las diferentes maneras de entender el alma como acto y como forma y su modo de vinculación con el cuerpo, mostrando que la herencia de un vocabulario que puede tender al dualismo, no invalida la tesis de la unidad substancial del viviente.

El léxico de las ciencias de la salud en la prensa no especializada, su adecuación

La labor divulgativa que ejercen los medios de comunicación en todos los ámbitos, se extiende, ¡cómo no!, también al de las ciencias de la salud. La televisión, la radio y la prensa han ido introduciendo en la lengua estándar una serie de términos que conservan la fascinación y el prestigio de una lengua de especialización técnica y, que la mayoría de los usuarios de la lengua engullen como si se tratara de algo normal, sin pararse a reflexionar sobre la comprensión del mensaje que acaban de oír o de leer. En muchas ocasiones, el vocabulario científico no es desconocido para los hablantes de una lengua porque se ha ido formando a partir de palabras de la lengua estándar a las que se dota de un significado especializado. En otras ocasiones, no es que se produzca un cambio de significado de los términos cuando su uso se populariza, sino que se convierten en desusados o arcaicos en el ámbito de la ciencia y terminan desapareciendo, pero siguen vivos en el habla cotidiana. Son los casos de calentura, paperas, piedras… que habiendo sido términos propios de la medicina en su tiempo, en la actualidad son palabras corrientes y, poco empleadas en el mundo científico e incluso en la prensa no especializada. Se puede hablar de distintos tipos de relación entre el léxico científico y el estándar. Hay voces que pertenecen a un léxico especializado que son utilizadas por cualquier hablante de la lengua como productores de mensajes y que no conllevan dificultad alguna para la codificación o descodifación de los mensajes. Otras veces, manejamos el léxico especializado como usuarios: Me tratan con antidiuréticos, me han prohibido la riboflavina, tengo muy alto el GTP. Por otro lado, todos conocemos un léxico especializado básico que hemos adquirido en la escuela: hematíe, leucocito, sistema linfático… Existe, asimismo, un uso ultraespecializado de uso exclusivo entre los profesionales en situaciones que se refieren a su propia área de especialización. Teniendo, pues, en cuenta los diversos tipos de relación entre el lenguaje común y el científico, en este artículo se estudia si los lectores de prensa no especializada entienden el vocabulario científico referido a las ciencias de la salud y si están familiarizados o no con esos términos. Para comprobar el conocimiento del sentido de algunas voces se realizó un vaciado de los términos marcados con la abreviatura Med. ‘Medicina y Ciencias de la Salud’ en el Diccionario de español actual. Con los términos que recoge este diccionario, y que consideramos, por su frecuencia de aparición en el Banco de Datos CREA (Corpus de Referencia del Español Actual) de la RAE y en las bases documentales de algunos medios de comunicación, como de uso frecuente, se elaboró un cuestionario con el que recogemos la opinión de un grupo de alumnos de la UPV/EHU de las licenciaturas de Periodismo, Publicidad y Relaciones Públicas, Comunicación Audiovisual y Traducción e Interpretación. El análisis de los datos permite un mejor conocimiento de la relación entre el lenguaje científico de las Ciencias de la Salud, que utilizan los medios de comunicación en sus informaciones y el dominio de la lengua que manifiestan los hablantes universitarios que han elegido profesiones en las que la lengua es una herramienta básica en su quehacer diario.

Sangre y vino en el juramento de Lisístrata (vv. 181-239)

(ES) En el presente artículo trata de poner de relieve los mecanismos utilizados por Aristófanes en Lisístrata para presentar de forma paródica el sacrificio juratorio con el que las mujeres sellan el pacto para obligar a sus maridos a que firmen la paz. Se analiza en este trabajo la utilización del vocabulario específico y la organización básica de este ritual, que Aristófanes conserva intacto, en contraste con la sustitución operada en cuanto a la persona que realiza el sacrificio y a la víctima sacrificial, una jarra de vino de Tasos. Esta elección entronca con el motivo cómico del amor de las mujeres al vino, al que se dedica la segunda parte de este trabajo.

Normandya Reparaciones SL.Plan de marketing

CASTELLANO: El proyecto realizado es un plan de marketing para la empresa Normandya reparaciones S.L.. El plan de marketing es la herramienta básica de gestión que debe utilizar toda empresa orientada al mercado que quiera ser competitiva. En su puesta en marcha quedarán fijadas las diferentes actuaciones que deben realizarse en el área del marketing, para alcanzar los objetivos establecidos tras haber realizado un análisis previo de la situación en la que se encuentra la empresa.

Leitura virtual em língua espanhola: a intervenção dos elementos linguísticos presentes em blogs de professores

Esta dissertação tem como objetivo analisar a intervenção de elementos linguísticos no processo leitor em espanhol como língua estrangeira (E/LE) ,em ambiente virtual, de docente desse idioma. A partir desse objetivo macro, estabelecemos um recorte e nos focamos na análise de como/se elementos linguísticos mais característicos de uma linguagem coloquial podem afetar mais a leitura de um docente de E/LE que teve na sua formação e na sua atividade profissional um contato maior com a língua formal. Nesse contexto, escolhemos o blog como o suporte virtual dos textos a serem lidos pelo sujeito por apresentar uma linguagem mais coloquial. No que se refere ao aporte teórico, esta pesquisa tem com principais bases a Linguística Textual (KOCH, 2009, 2002, 2007; KOCH ; TRAVAGLIA, 1996, 2000) e a leitura sócio-interacional (KATO, 1986, 2007; KLEIMAN, 1993, 1996, 2008; NUNES, 2005; VERGNANO-JUNGER, 2009). Também utilizamos alguns elementos da Análise do Discurso de base enunciativa em pontos nos quais ela dialoga com a perspectiva sócio-interacional, como, por exemplo, na noção de gênero do discurso (MAINGUENEAU, 1996, 2003; BAKTHIN, 2003). A Sociolinguística (MORENO FERNANDÉZ, 1996; ALKMIN, 2001) contribuiu para estabelecer os parâmetros da língua coloquial e formal. Quanto à leitura em ambiente virtual, seguimos Ribeiro (2005), Marcuschi (2007), Santaella (2008) e Vergnano-Junger (2009). Para a elaboração deste trabalho, utilizamos uma metodologia híbrida composta de uma parte documental e de um estudo de caso. A fase documental teve como metas classificar os blogs de docentes de E/LE e selecionar dois para a elaboração de atividades de leitura guiada. O estudo de caso realizado com um docente de E/LE, por sua vez, teve como etapas uma leitura livre, duas guiadas e uma entrevista. Objetivou observar e discutir o perfil e o processo leitor do sujeito, com foco na intervenção de elementos linguísticos. Dos resultados obtidos, podemos destacar uma proposta de classificação dos blogs de professores de E/LE. Com base no estudo de caso, duas considerações merecem destaque: (a) uma maior dificuldade de leitura do texto coloquial, ao que tudo indica, gerada pela variedade lexical e (b) uma tendência do sujeito à leitura linear em ambiente virtual, com atenção voltada, frequentemente, para os aspectos de vocabulário e como esses afetavam a compreensão, demonstrando uma tendência à leitura decodificadora

Should EFL Teachers Present Vocabulary in Semantically Related Sets?

[EN] Teaching vocabulary in semantically related sets is common practice among EFL teachers. The present study tests the effectiveness of this method by comparing it to the alternative technique: presenting vocabulary in an unrelated way. In the study two intact classes of Spanish learners of English in high-school were presented with a set of unrelated and related words and were then asked to complete a post-test to measure the impact of both techniques on learning. The results indicate that, while both techniques successfully help the learners to acquire new words, presenting words in unrelated sets seems to be more effective.

Editor de textos con corrector ortográfico para textos médicos

El principal objetivo de este proyecto es el desarrollo de un software capaz de detectar errores ortográficos y sugerir una lista de posibles soluciones. Dicha lista no deberá ser muy extensa y mostrará las palabras que presenten una mayor probabilidad de ser la palabra correcta deseada por el usuario. Este corrector se ubicará dentro de una aplicación comúnmente conocida como editor de textos que permitirá al usuario la creación, corrección, impresión y guardado de archivos de texto plano. En esencia, se trata de la clásica herramienta de edición y manipulación de texto plano en la que prima la funcionalidad sobre la apariencia. Algunas de las funciones por las que se conoce a estos editores son: marcar región, búsqueda y reemplazo, copiar, cortar y pegar, deshacer y rehacer, importar… El aspecto más importante de la aplicación es el desarrollo de un corrector específico para lenguaje perteneciente al área médica y sanitaria. Incluyendo un vocabulario confeccionado especialmente para la herramienta, así como un sistema de detección y corrección de errores implementado únicamente para este proyecto. Para el desarrollo de este proyecto se utilizará una arquitectura Modelo-Vista-Controlador. La herramienta desarrollada se trata de una aplicación de escritorio, la cual hace uso de una parte gráfica que es la denominada Vista. Esta parte visual es aquella que el usuario visualiza y manipula. La parte gráfica necesita de una parte lógica, denominada Modelo, la cual se encarga de realizar los procesos necesarios para la corrección y creación de sugerencias de las palabras erróneas, así como la corrección automática de textos. Para poder coordinar el funcionamiento de ambas partes es necesaria la creación de un tercer componente encargado de mantener la vista y el controlador independientes entre sí actuando él como intermediario entre ambas. De esta manera la parte visual permanece en todo momento separada de la parte lógica.

Brand image and lexicographic analysis: an application to shopping malls

[EN] The concept of image in its different aspects is very important in today s society as well as in the business management field. Some authors reports that most of the studies that measure image do not take into account neither previous theoretical and conceptual models nor other possible empirical evidence alternatives. Given this need, a research regarding the concept of brand image applied to shopping malls was conducted based on the conceptual model of the consumer cognitive response in order to empirically explore and contrast it. For this reason, a survey was applied to 420 consumers in five shopping malls in Bogotá, achieving a database of 3.749 cases. The results show attribute-shopping mall associations expressed in unique, differentiated, and notorious vocabulary obtained applying lexicometric and multivariate analysis techniques. Attribute-shopping mall associations such as spacious , good location , good variety of stores , and the existence of movie theaters . Finally, this research aims to potentially improve the management of shopping malls and increase their attractiveness and customer loyalty by applying the development of service quality systems, integral communication, segmentation, and positioning.