Polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism analysis of the ITS2 region for differatiation of Brazilian Biomphalaria intermediate hosts of the Schistosoma mansoni

We sequenced the internal transcribed spacer 2 of the ribosomal DNA (ITS2-DNAr) from the three Schistosoma mansoni intermediate hosts in Brazil: Biomphalaria glabrata, Biomphalaria tenagophila and Biomphalaria straminea. Analysis of a restriction map from those sequences allowed us to select putative restriction enzymes able to identify the snail species under study. Four restriction enzymes were used and HpaII provided simple species-specific profiles easily visualized in polyacrylamide gels. The use of ITS2 is advantageous as it provides a small fragment of 460 bp which may be easily amplified by PCR. In the current work, we showed that the amplification of ITS2-DNAr together with HpaII enzyme restriction is an auxiliary molecular tool for the morphological identification of such snails as well as for taxonomic and phylogenetic studies of neotropical planorbids.

Esquistossomose mansoni em duas mesorregiões do Estado de Alagoas

No Brasil, índices elevados da esquistossomose mansônica correspondem, na grande maioria dos casos, à presença da espécie Biomphalaria glabrata, principal transmissora do Schistosoma mansoni, nas localidades endêmicas. Foi realizado estudo em 40 municípios endêmicos do Estado de Alagoas, com o objetivo de verificar a existência da espécie e sua importância na manutenção da esquistossomose nesse Estado. Desses municípios, 28 são pertencentes à mesorregião do leste Alagoano e 12 à mesorregião do Agreste Alagoano. Os moluscos procederam de diversos tipos de criadouros: riachos, córregos, valas, açudes, brejos e poços. As coletas foram realizadas no período de fevereiro de 1996 a dezembro de 1998. Para a identificação de Biomphalaria glabrata, foi efetuado o exame anatômico das partes moles, após remoção das conchas. A detecção de cercárias do Schistosoma mansoni foi realizada através da técnica de esmagamento, calculando-se o percentual de infecção. Em 32 (80%) dos municípios estudados foi encontrada Biomphalaria glabrata, seis deles apresentando moluscos infectados com cercárias do parasita. Penedo apresentou a maior (6,6%) taxa de infecção, seguindo-se Ibateguara (5,6%). Taxas menores foram observadas em Chã Preta (2,7%), em Murici (2,5%), Porto Real do Colégio (0,1%) e Igreja Nova (0,1%). O inquérito copro-parasitológico efetuado pela Fundação Nacional de Saúde em 1997, 1998/1999 e 2000, confirmou a importância da endemia nessas regiões do Estado.

Distribuição geográfica das espécies dos caramujos transmissores de Schistosoma mansoni no Estado de São Paulo

Os conhecimentos sobre a distribuição geográfica das espécies dos caramujos transmissores de Schistosoma mansoni são importantes para o controle e vigilância epidemiológica da esquistossomose mansônica. O estudo da situação no Estado de São Paulo, Brasil, demandou o exame dos caramujos de 8.771 lotes com amostras do gênero Biomphalaria, preservados em coleção de moluscos da Superintendência de Controle de Endemias. Os exames revelaram espécies dos caramujos transmissores da endemia em 3.712 lotes com 108.244 exemplares. As proporções foram de 225 (6%) lotes de Biomphalaria glabrata (Say, 1818), 3.402 (91,7%) de Biomphalaria tenagophila (d'Orbigny, 1835) e 85 (2,3%) de Biomphalaria straminea (Dunker, 1848), cada espécie respectivamente com 8.002 (7,4%), 88.068 (81,4%) e 12.174 (11,2%) exemplares. A distribuição geográfica de B. glabrata e B. tenagophila apresenta criadouros muito agregados. No caso de B. tenagophila, a maior compactação de criadouros coincide em regiões com elevados níveis de urbanização, muito conurbadas e poluídas. Já B. straminea, encontrada em criadouros das áreas de drenagem de todas as bacias hidrográficas, mostra uma disseminação mais rarefeita. Presume-se que devido às maiores facilidades do contato parasita/hospedeiros, os agregados de criadouros de B. glabrata e B. tenagophila sejam propícios à preservação das áreas endêmicas de S. mansoni em São Paulo.

Differentiation of Candida species obtained from nosocomial candidemia using RAPD-PCR technique

Thirteen strains of the genus Candida were isolated from catheter, urine and surgical wounds from individual patients of the Santa Casa de Misericórdia, Belo Horizonte, MG, Brazil. Ten strains were characterized as Candida albicans, two as Candida glabrata, and one as Candida parapsilosis. Isolates were evaluated for molecular relatedness by random amplified polymorphic DNA technique using 15 primers. The analysis of the genomic DNA obtained revealed a low intraspecific polymorphism and did not allow for the differentiation between strains of the same species obtained from distinct clinical sources (catheter, urine and surgical wounds). The RAPD profiles generated were able to differentiate among the species of Candida albicans, Candida parapsilosis and Candida glabrata strains isolated in this study.

Identification and differentiation of Candida species from pediatric patients by random amplified polymorphic DNA

Thirty-four Candida isolates were analyzed by random amplified polymorphic DNA using the primer OPG-10:24 Candida albicans; 4 Candida tropicalis; 2 Candida parapsilosis; 2 Candida dubliniensis; 1 Candida glabrata and 1 Candida krusei. The UPGMA-Pearson correlation coefficient was used to calculate the genetic distance between the different Candida groupings. Samples were classified as identical (correlation of 100%); highly related samples (90%); moderately related samples (80%) and unrelated samples (< 70%). The results showed that the RAPD proposed was capable of classifying the isolates coherently (such that same species were in the same dendrogram), except for two isolates of Candida parapsilosis and the positive control (Netherlands, 1973), probably because they are now recognized as three different species. Concerning the only fluconazole-resistant Candida tropicalis isolate with a genotype that was different to the others, the data were insufficient to affirm that the only difference was the sensitivity to fluconazole. We concluded that the Random Amplified Polymorphic DNA proposed might be used to confirm Candida species identified by microbiological methods.

Candidemia em um hospital terciário brasileiro: incidência, freqüência das diferentes espécies, fatores de risco e suscetibilidade aos antifúngicos

São apresentados os resultados de estudo transversal e observacional sobre candidemia realizado no Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Paraná. No período de janeiro de 2001 a dezembro de 2004, foram analisados 100 episódios de candidemia. A incidência foi de 1,27 por 1.000 internações, sendo Candida spp o oitavo agente mais isolado nas infecções da corrente sanguínea. A idade variou de 5 dias a 89 anos com uma média de 32 anos, 60% dos casos ocorreram em adultos (66% > 50 anos) e 40% em crianças (52% < 1 ano). Cinqüenta e nove pacientes estavam internados em enfermarias e 41 em unidade de terapia intensiva. Candida albicans foi a espécie mais (59%) freqüente, seguida por Candida tropicalis (15%), Candida parapsilosis (9%). As condições associadas mais (97%) freqüentes foram uso de antibióticos, cateter venoso central (77%), bloqueador H2 (57%), nutrição parenteral total (49%) internamento em unidade de terapia intensiva (41%). Dos 51 isolados testados, 3 de Candida glabrata apresentaram suscetibilidade dose-dependente ao fluconazol e eram resistentes ao itraconazol. Uma amostra de Candida krusei apresentou suscetibilidade dose-dependente ao fluconazol, e uma de Candida pelliculosa suscetibilidade dose-dependente ao itraconazol. Na população de estudo, 68% receberam tratamento antifúngico, no entanto a mortalidade foi de 56%.

Criadouros de Biomphalaria, temporários e permanentes, em Jaboatão dos Guararapes, PE

Realizou-se um inquérito malacológico em criadouros, permanentes e temporários, no bairro de Piedade, Jaboatão dos Guararapes, Pernambuco, entre novembro de 2006 e novembro de 2007 com o objetivo de conhecer a fauna malacológica dessa localidade, bem como o potencial de transmissão da esquistossomose mansoni. Além de Biomphalaria glabrata (Say, 1818), foram coletados moluscos Drepanotrema cimex (Moricand, 1837), Pomacea sp e Melanoides tuberculatus (Muller, 1774). Do total de Biomphalaria glabrata coletado, 1.490 exemplares encontraram-se vivos, sendo que 74 (5%) estavam positivos para Schistosoma mansoni. O maior número de moluscos capturados e todos aqueles positivos para Schistosoma mansoni foram coletados na estação anual das chuvas. Foi observada também a presença de outras larvas de trematódeos infectando os moluscos Biomphalaria glabrata. Pertencentes às famílias Strigeidae e Diplostomatidae, apresentam, a primeira vista, morfologia que pode levar a confusão com as cercárias do Schistosoma mansoni, tornando-se indispensável seu conhecimento para o diagnóstico diferencial do agente causador da esquistossomose.

Identificação por PCR e sensibilidade a antifúngicos de isolados clínicos vaginais de Candida sp

INTRODUÇÃO: A candidíase vaginal é uma condição que afeta um grande número de mulheres em idade fértil. Candida albicans é a espécie mais frequentemente isolada de secreção vaginal, entretanto, outras espécies mais resistentes às drogas antifúngicas podem ser isoladas de amostras clínicas vaginais. MÉTODOS: Foram identificadas as espécies de 30 isolados vaginais de Candida sp por PCR utilizando o primer universal ITS4 e primers espécie-específicos para C. albicans, C. glabrata, C. tropicalis e C. krusei. A sensibilidade destes isolados frente à anfotericina B, fluconazol e voriconazol foi determinada pelo método de macrodiluição M27-A2 do CLSI. RESULTADOS: Através dos ensaios de PCR, 28 isolados foram caracterizados como C. albicans e 2 isolados apresentaram amplificação para os primers específicos de C. albicans e C. glabrata. A concentração inibitória mínima para anfotericina B variou de 0,03µg/mL a 0,25µg/mL, para o fluconazol de 0,125µg/mL a 16µg/mL e para o voriconazol de 0,03µg/mL a 0,25µg/mL. CONCLUSÕES: A identificação de Candida ao nível de espécie através de ensaios de PCR deve ser relevante para o gerenciamento clínico destas infecções.

Aspectos micológicos e suscetibilidade in vitro de leveduras do gênero Candida em pacientes HIV-positivos provenientes do Estado de Mato Grosso

INTRODUÇÃO: A candidíase é uma das infecções fúngicas mais frequentes entre os pacientes infectados pelo vírus da imunodeficiência humana. O presente estudo objetivou a caracterização das leveduras do gênero Candida de distintas amostras clínicas, provenientes de pacientes HIV - positivos, assim como a determinação do perfil de suscetibilidade in vitro a cinco drogas antifúngicas. MÉTODOS: A caracterização dos isolados de Candida sp foi realizada através da metodologia clássica, testes bioquímicos (zimograma e auxanograma) e morfológicos (prova do tubo germinativo e microcultivo em lâmina). Também, foram realizadas a técnica genotípica (PCR) e identificação pelo método comercial API 20C AUX (BioMeriéux). Para a determinação do perfil de suscetibilidade in vitro, foram utilizadas cinco drogas antifúngicas (cetoconazol, fluconazol, itraconazol, voriconazol e anfotericina B), através do método comercialmente disponível - Etest. RESULTADOS: Foram identificados 105 isolados de leveduras do gênero Candida provenientes de 102 pacientes infectados pelo vírus HIV. Destes, foram caracterizadas 82 (78,1%) Candida albicans, 8 (7,6%) Candida parapsilosis, 8 (7,6%) Candida tropicalis, 4 (3,8%) Candida krusei, 2 (1,9%) Candida glabrata e 1 (1%) Candida guilliermondii. CONCLUSÕES: Considerando o perfil geral de sensibilidade, 60% dos isolados foram suscetíveis a todos os antifúngicos testados, porém as espécies C. tropicalis e C. krusei demonstraram uma tendência a valores mais elevados de CIMs para os azóis do que os encontrados paraC. albicans, sugerindo resistência.

Prevalência da esquistossomose num povoado do Município de Tutóia, Estado do Maranhão

INTRODUÇÃO: A esquistossomose mansônica é uma patologia endêmica dos países subdesenvolvidos ou em desenvolvimento. O objetivo deste trabalho foi definir a prevalência da esquistossomose no povoado de Bom Gosto em Tutóia, Maranhão em 2008 e detectar a ocorrência do hospedeiro intermediário. MÉTODOS: Foi realizado um levantamento dos dados das amostras de fezes analisadas pela Secretaria de Saúde Municipal e Fundação Nacional de Saúde. Em seguida, foram coletados e analisados 60 caramujos. A análise dos moluscos foi feita pelo processo de esmagamento. Quanto aos sedimentos fecais, usou-se o método de Kato-Katz. RESULTADOS: De acordo com dados da Secretaria de Saúde Municipal e FUNASA, a prevalência da esquistossomose mansônica no povoado é de 3,2%. Os 60 caramujos são da espécie Biomphalaria glabrata, e cinco (8,3%) encontravam-se parasitados por Schistosoma mansoni. CONCLUSÕES: O povoado Bom Gosto é uma região de baixa prevalência da esquistossomose mansônica. A área investigada tem todos os componentes da cadeia epidemiológica de S. mansoni, explicando a ocorrência da doença na região.

Malacological survey of Biomphalaria snails in municipalities along the Estrada Real in the southeast of the State of Minas Gerais, Brazil

INTRODUCTION: The increasing practice of ecotourism and rural tourism in the State of Minas Gerais, Brazil, highlights the importance of studies concerning the occurrence of potential intermediate hosts of Schistosoma mansoni. This study aimed to identify species of Biomphalaria snails in municipalities along the Estrada Real, an important Brazilian tourism project. METHODS: The specimens were collected in different water collections of 36 municipalities along the Estrada Real in the southeast of the State of Minas Gerais. Biomphalaria species were characterized using both morphological and molecular approaches. The research was conducted between August 2005 and September 2009 and all the sites visited were georeferenced using GPS. RESULTS: Six Biomphalaria species were found in 30 of the 36 municipalities studied: glabrata, tenagophila, straminea, peregrina, occidentalis and schrammi. The first three species of Biomphalaria, recognized as intermediate hosts of S. mansoni, were present in 33.3%, 47.2% and 8.3% of the municipalities studied, respectively. The mollusks were found in different types of water collections and no infection by S. mansoni was detected. The highest occurrence of Biomphalaria concentration was verified in the area covered by the Caminho Novo route (Diamantina/MG to Rio de Janeiro/RJ). CONCLUSIONS: Considering the occurrence of schistosomiasis in the State of Minas Gerais and the socioeconomic repercussions involved in the Estrada Real Project, this work focuses on the vulnerability of water collections due to the presence of Biomphalaria mollusks and emphasizes the need for epidemiological surveillance and sanitary and educational measures integrated with the local community and tourism sectors.

Species distribution and in vitro fluconazole susceptibility of clinical Candida isolates in a Brazilian tertiary-care hospital over a 3-year period

INTRODUCTION: In this study, we aimed at identifying Candida isolates obtained from blood, urine, tracheal secretion, and nail/skin lesions from cases attended at the Hospital Universitário de Londrina over a 3-year period and at evaluating fluconazole susceptibilities of the isolates. METHODS: Candida isolates were identified by polymerase chain reaction (PCR) using species-specific forward primers. The in vitro fluconazole susceptibility test was performed according to EUCAST-AFST reference procedure. RESULTS: Isolates were obtained from urine (53.4%), blood cultures (19.2%), tracheal secretion (17.8%), and nail/skin lesions (9.6%). When urine samples were considered, prevalence was similar in women (45.5%) and in men (54.5%) and was high in the age group >61 years than that in younger ones. For blood samples, prevalence was high in neonates (35%) and advanced ages (22.5%). For nail and skin samples, prevalence was higher in women (71.4%) than in men (28.6%). Candida albicans was the most frequently isolated in the hospital, but Candida species other than C. albicans accounted for 64% of isolates, including predominantly Candida tropicalis (33.2%) and Candida parapsilosis (19.2%). The trend for non-albicans Candida as the predominant species was noted from all clinical specimens, except from urine samples. All Candida isolates were considered susceptible in vitro to fluconazole with the exception of isolates belonging to the intrinsically less-susceptible species C. glabrata. CONCLUSIONS: Non-albicans Candida species were more frequently isolated in the hospital. Fluconazole resistance was a rare finding in our study.

Acute schistosomiasis diagnosis: a new tool for the diagnosis of schistosomiasis in a group of travelers recently infected in a new focus of Schistosoma mansoni

IntroductionThe diagnosis of schistosomiasis mansoni on early stages of infection is important to prevent late morbidity. A simple, cheap, sensitive and specific assay for routine diagnosis of schistosome infection based on the detection of specific IgG for schistosomula tegument antigens (ELISA-SmTeg) was developed by our group.MethodsWe describe here an acute outbreak involving a travel group of 80 individuals from a non-endemic area of the State of Minas Gerais, Brazil. These individuals were in contact with a freshwater pool where Biomphalaria glabrata was found. Results obtained from our new methodology were compared to IgG antibody titers against soluble worm antigenic preparation (SWAP) by ELISA and, also to parasitological examination, nuclear magnetic resonance and clinical findings.ResultsELISA-SmTeg was capable of detecting 64 positive cases among the 80 individuals participating at the survey with a positivity ratio of 80% and a higher sensitivity than ELISA-SWAP that was only sensitive for 56% of positive cases. Besides, a significant correlation was found for the severity of the infection and the specific IgG titers against SmTeg.ConclusionsOur data showed that ELISA-SmTeg might serve as the initial diagnostic tool for acute stages of the infection in community-based helminth control programs or for the surveillance of individuals from non-endemic areas.

Antifungal susceptibility and distribution of Candida spp. isolates from the University Hospital in the municipality of Dourados, State of Mato Grosso do Sul, Brazil

Introduction Hospital infections caused by Candida spp. are a leading cause of morbidity and mortality in hospitalized patients, particularly those that are critically ill or immunocompromised. In this study, the distribution of Candida species in isolates from the University Hospital of the Federal University at Grande Dourados and their in vitro susceptibility to antifungal drugs were analyzed. Methods Yeasts were phenotypically identified using classical methodologies. Antifungal susceptibility tests to amphotericin B and fluconazole were performed using the broth microdilution technique. Results A total of 50 Candida isolates were obtained from hospitalized patients during the study period. We analyzed yeast isolates from urine (n=31; 62%), blood (n=12; 24%), and tracheal secretions (n=7; 14%). The following Candida species were identified: C. tropicalis (n=21; 42%), C. albicans (n=18; 36%), C. glabrata (n=10; 20%), and C. krusei (n=1; 2%). Antifungal susceptibility tests demonstrated that C. albicans was susceptible to both antifungal agents. However, 31.2% of the non-C. albicans Candida isolates displayed dose-dependent susceptibility to fluconazole, and 3.1% were resistant to amphotericin B. Conclusions In contrast to previous reports, our results indicated that C. tropicalis was the most commonly isolated yeast species among the hospital patients. The predominance of non-C. albicans Candida infections confirms the importance of species-level identification for implementing appropriate antifungal therapies.

The Pampulha reservoir remains a potential urban focus of schistosomiasis mansoni in Brazil: changes in the occurrence patterns of Biomphalaria species and a new record of the parasite

Introduction The Pampulha reservoir has long been a focus of schistosomiasis transmission in Belo Horizonte, State of Minas Gerais, Brazil. The last malacological study conducted in this urban reservoir was more than two decades ago, and thus, an update on the distribution of the species of Biomphalaria as well as new data on the presence of Schistosoma mansoni in this water body are required. Methods The current distribution of Biomphalaria spp. in the Pampulha reservoir and their infection with S. mansoni was evaluated during 55 malacological surveys conducted between 2009 and 2012. Results Biomphalaria straminea displayed a high population density and distribution, and 13.7% (2,233/16,235) of the specimens collected were infected with larval trematodes other than Schistosoma mansoni. Biomphalaria tenagophila and Biomphalaria glabrata, species currently presenting a restricted distribution and small populations, displayed trematode infection rates of 15.2% (98/644) and 13% (83/640), respectively. Thirteen (2%) specimens of B. glabrata were found to be infected with S. mansoni. In addition, a historical review based on previous and new data on the occurrence patterns of Biomphalaria species in this reservoir is presented. Conclusions The results indicate that the Pampulha reservoir remains a potential focus of urban schistosomiasis in Brazil, and significant changes in the occurrence patterns of Biomphalaria species were verified.