956 resultados para Spatial Point Pattern analysis


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A porosidade do solo é de extrema importância à produtividade agrícola, uma vez que, em condições adversas, pode dificultar a penetração das raízes e, consequentemente, limitar o adequado aproveitamento dos nutrientes e da água disponível. Na Fazenda Bonança, em Pereira Barreto - SP, em 2005, foi analisada a produtividade de forragem do milho (MSF), a macroporosidade (MA), a microporosidade (MI) e a porosidade total (PT) de um Latossolo Vermelho distrófico (Acrustox Háplico), sob plantio direto, em três profundidades. O objetivo foi estudar as correlações lineares e espaciais entre os atributos da planta e do solo, na tentativa de selecionar, entre os do solo, um indicador da sua qualidade física de boa representatividade para a produtividade da forragem. Foi instalada a malha geoestatística para a coleta dos dados do solo e da planta, contendo 125 pontos amostrais numa área de 2.500 m². Os atributos estudados apresentaram variabilidade entre baixa e muito alta. Também, seguiram padrões espaciais claramente definidos, com alcances da dependência espacial entre 6,6 e 31,1 m. Apesar da correlação linear simples entre a MSF e a MI na profundidade de 0,10-0,20 m ter sido baixa, foi extremamente significativa. Contudo, do ponto de vista espacial, houve elevada correlação inversa entre tais variáveis. Assim, a MI2 apresentou-se como satisfatório indicador da qualidade física do solo de Pereira Barreto - SP, quando destinado à produtividade de forragem do milho.

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To identify genes specifically or predominantly expressed in the stigmas/styles and to establish their possible function in the reproductive process of plants, a tobacco stigma/style cDNA library was constructed and differentially screened, resulting in the isolation of several cDNA clones. The molecular characterization of one of these clones is described here. After sequencing the cDNA and the isolated genomic clone, it was determined that the corresponding gene encodes a protein containing an ATP-binding cassette, characteristic of ABC transporters. This gene, designated as NtWBC1 (Nicotiana tabacum ABC transporter of the White-Brown Complex subfamily), encodes a protein that contains the typical structure of the 'half-transporters' of the White subfamily. To establish the spatial expression pattern of the NtWBC1 gene, northern blot and real-time RT-PCR analyses with total RNA from roots, stems, leaves, sepals, petals, stamens, stigmas/styles, ovaries, and seeds were performed. The result revealed a transcript of 2.5 kb present at high levels in stigmas and styles and a smaller transcript (2.3 kb) present at a lower level in stamens. NtWBC1 expression is developmentally regulated in stigmas/styles, with mRNA accumulation increasing toward anthesis. In situ hybridization experiments demonstrated that NtWBC1 is expressed in the stigmatic secretory zone and in anthers, at the stomium region and at the vascular bundle. NtWBC1 is the first ABC transporter gene with specific expression in plant reproductive organs to be identified and its expression pattern suggests important role(s) in the reproductive process.

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The aim of this study was to know the yeast biodiversity from fresh olive (Olea europaea L.) fruits, olive paste (crush olives) and olive pomace (solid waste) from Arbequina and Cornicabra varieties. Yeasts were isolated from fruits randomly harvested at various olive groves in the region of Castilla La Mancha (Spain). Olive paste and pomace, a byproduct of the processing of this raw material, were also collected in sterile flasks from different oil mills. Molecular identification methodology used included comparison of polymerase chain reaction (PCR) amplicons of their 5.8S rRNA gene and internal transcribed spacers ITS1 and ITS2 followed by restriction pattern analysis (RFLP). For some species, sequence analysis of the 5.8S rDNA gene was necessary. The results were compared to sequences held in public databases (BLAST). These techniques allowed to identify fourteen different species of yeasts, belonging to seven different genera (Zygosaccharomyces, Pichia, Lachancea, Kluyveromyces, Saccharomyces, Candida, Torulaspora) from the 108 yeast isolates. Species diversity was thus considerable: Pichia caribbica, Zygosaccharomyces fermentati (Lachancea fermentati) and Pichia holstii (Nakazawaea holstii) were the most commonly isolated species, followed by Pichia mississippiensis, Lachancea sp., Kluyveromyces thermotolerans and Saccharomyces rosinii. The biotechnological properties of these isolates, was also studied. For this purpose, the activity of various enzymes (beta-glucosidase, beta-glucanase, carboxymethylcellulase, polygalacturonase, peroxidase and lipase) was evaluated. It was important that none of species showed lipase activity, a few had cellulase and polygalacturonase activities and the majority of them presented beta-glucanase, beta-glucosidase and peroxidase activities. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

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An uncommon disseminated Mycobacterium tuberculosis infection is described in a 12-year-old female dog presenting with fever, dyspnea, cough, weight loss, lymphadenopathy, melena, epistaxis, and emesis. The dog had a history of close contact with its owner, who died of pulmonary tuberculosis. Radiographic examination revealed diffuse radio-opaque images in both lung lobes, diffuse visible masses in abdominal organs, and hilar and mesenteric lymphadenopathy. Bronchial washing samples and feces were negative for acid-fast organisms. Polymerase chain reaction (PCR)-based species identification of bronchial washing samples, feces, and urine revealed M. tuberculosis using PCR-restriction enzyme pattern analysis-PRA. Because of public health concerns, which were worsened by the physical condition of the dog, euthanasia of the animal was recommended. Rough and tough colonies suggestive of M. tuberculosis were observed after microbiological culture of lung, liver, spleen, heart, and lymph node fragments in Löwenstein-Jensen and Stonebrink media. The PRA analysis enabled diagnosis of M. tuberculosis strains isolated from organs. Copyright © 2013 by The American Society of Tropical Medicine and Hygiene.

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Background: Mycobacterium spp. is one of the most important species of zoonotic pathogens that can be transmitted from cattle to humans. The presence of these opportunistic, pathogenic bacteria in bovine milk has emerged as a public-health concern, especially among individuals who consume raw milk and related dairy products. To address this concern, the Brazilian control and eradication program focusing on bovine tuberculosis, was established in 2001. However, bovine tuberculosis continues to afflict approximately 1,3 percent of the cattle in Brazil. In the present study, 300 samples of milk from bovine herds, obtained from both individual and collective bulk tanks and informal points of sale, were cultured on Löwenstein-Jensen and Stonebrink media. Polymerase chain reaction (PCR)-based tests and restriction-enzyme pattern analysis were then performed on the colonies exhibiting phenotypes suggestive of Mycobacterium spp., which were characterized as acid-fast bacilli.Results: Of the 300 bovine milk samples that were processed, 24 were positively identified as Mycobacterium spp.Molecular identification detected 15 unique mycobacterial species: Mycobacterium bovis, M. gordonae, M. fortuitum, M. intracellulare, M. flavescens, M. duvalii, M. haemophilum, M. immunogenum, M. lentiflavum, M. mucogenicum, M. novocastrense, M. parafortuitum, M. smegmatis, M. terrae and M. vaccae. The isolation of bacteria from the various locations occurred in the following proportions: 9 percent of the individual bulk-tank samples, 7 percent of the collective bulk-tank samples and 8 percent of the informal-trade samples. No statistically significant difference was observed between the presence of Mycobacterium spp. in the three types of samples collected, the milk production profiles, the presence of veterinary assistance and the reported concerns about bovine tuberculosis prevention in the herds.Conclusion: The microbiological cultures associated with PCR-based identification tests are possible tools for the investigation of the presence of Mycobacterium spp. in milk samples. Using these methods, we found that the Brazilian population may be regularly exposed to mycobacteria by consuming raw bovine milk and related dairy products. These evidences reinforces the need to optimize quality programs of dairy products, to intensify the sanitary inspection of these products and the necessity of further studies on the presence of Mycobacterium spp. in milk and milk-based products. © 2013 Franco et al.; licensee BioMed Central Ltd.

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Pós-graduação em Agronomia - FEIS

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Apesar da existência de diversos trabalhos acadêmicos sobre o processo de transformação socioeconômica das cidades da região, pouco dessa literatura ofereceu interpretações que considerassem a configuração espacial como análise. Este artigo procura mostrar a origem e a evolução de uma cidade como Marabá que serve de contraponto à concepção do “urbanismo rural” que gestou as cidades de “beira de estrada”, caso de Medicilândia e dos núcleos que hoje compõem a cidade de Marabá. Por último, foi lançado um olhar sobre a explícita especulação imobiliária em curso na Cidade Nova, terceiro e mais recente arranjo urbanístico instalado em Marabá.

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O presente trabalho tem por objetivo central demonstrar a variabilidade existente na floresta no que tange aos estoques de biomassa e carbono florestal acima do solo, a partir da identificação e caracterização, com base em técnicas de sensoriamento remoto, de unidades de paisagem em uma área situada no município de Belterra, região oeste do Estado do Pará, a partir da matriz teórico-conceitual da abordagem Ecologia da Paisagem. Para o alcance de tal proposição, a metodologia empregada partiu da revisão da literatura sobre o tema, aquisição de dados cartográficos e orbitais, uso de técnicas de sensoriamento remoto, coleta de dados em campo, tratamento e análise estatística. O trabalho está dividido em quatro capítulos, seguidos pelas considerações gerais da obra. Partindo da matriz teórico-metodológica da Ecologia da Paisagem, analisa-se a dinâmica socioambiental do município de Belterra, que atualmente experimenta a expansão das atividades agrícolas, com destaque para a agricultura mecanizada da soja. A partir da análise multitemporal de imagens Landsat do município pôde-se avaliar a distribuição da cobertura florestal existente no mesmo, bem como o padrão espacial de distribuição das principais unidades de paisagem identificadas. Considerando esse recorte, realizou-se a coleta de dados em campo via inventário florestal em quatro tipologias florestais (floresta de alto platô, floresta de baixo platô, vegetação secundária e tensão ecológica) para obtenção de parâmetros morfométricos da vegetação e posterior quantificação dos estoques de biomassa e carbono contidos em cada unidade, bem como observar o comportamento estrutural da floresta nas mesmas. A adoção da paisagem como escala espacial de análise mostrou-se bastante satisfatória na quantificação dos estoques de biomassa e carbono florestal ao permitir considerar a influência da dinâmica socioeconômica na redução desses estoques. Além disso, possibilitou constatar que o reconhecimento da heterogeneidade da cobertura florestal é um elemento fundamental para a obtenção de estimativas de carbono de acordo com as características estruturais da vegetação, que varia de acordo com a topografia do terreno, com as espécies existentes e com as características geográficas, o que envolve a tipologia climática, as características geomorfológicas, pedológicas e geológicas da área.