Molecular dynamics studies of the STAT3 homodimer:DNA complex: relationships between STAT3 mutations and protein-DNA recognition.

Signal Transducers and Activators of Transcription (STAT) proteins are a group of latent cytoplasmic transcription factors involved in cytokine signaling. STAT3 is a member of the STAT family and is expressed at elevated levels in a large number of diverse human cancers and is now a validated target for anticancer drug discovery.. Understanding the dynamics of the STAT3 dimer interface, accounting for both protein-DNA and protein-protein interactions, with respect to the dynamics of the latent unphosphorylated STAT3 monomer, is important for designing potential small-molecule inhibitors of the activated dimer. Molecular dynamics (MD) simulations have been used to study the activated STAT3 homodimer:DNA complex and the latent unphosphorylated STAT3 monomer in an explicit water environment. Analysis of the data obtained from MD simulations over a 50 ns time frame has suggested how the transcription factor interacts with DNA, the nature of the conformational changes, and ways in which function may be affected. Examination of the dimer interface, focusing on the protein-DNA interactions, including involvement of water molecules, has revealed the key residues contributing to the recognition events involved in STAT3 protein-DNA interactions. This has shown that the majority of mutations in the DNA-binding domain are found at the protein-DNA interface. These mutations have been mapped in detail and related to specific protein-DNA contacts. Their structural stability is described, together with an analysis of the model as a starting-point for the discovery of novel small-molecule STAT3 inhibitors.

Self-disclosure decision making based on intimacy and privacy

Autonomous agents may encapsulate their principals' personal data attributes. These attributes may be disclosed to other agents during agent interactions, producing a loss of privacy. Thus, agents need self-disclosure decision-making mechanisms to autonomously decide whether disclosing personal data attributes to other agents is acceptable or not. Current self-disclosure decision-making mechanisms consider the direct benefit and the privacy loss of disclosing an attribute. However, there are many situations in which the direct benefit of disclosing an attribute is a priori unknown. This is the case in human relationships, where the disclosure of personal data attributes plays a crucial role in their development. In this paper, we present self-disclosure decision-making mechanisms based on psychological findings regarding how humans disclose personal information in the building of their relationships. We experimentally demonstrate that, in most situations, agents following these decision-making mechanisms lose less privacy than agents that do not use them. (C) 2012 Elsevier Inc. All rights reserved.

Swarm scheduling approaches for work-flow applications with security constraints in distributed data-intensive computing environments

The scheduling problem in distributed data-intensive computing environments has become an active research topic due to the tremendous growth in grid and cloud computing environments. As an innovative distributed intelligent paradigm, swarm intelligence provides a novel approach to solving these potentially intractable problems. In this paper, we formulate the scheduling problem for work-flow applications with security constraints in distributed data-intensive computing environments and present a novel security constraint model. Several meta-heuristic adaptations to the particle swarm optimization algorithm are introduced to deal with the formulation of efficient schedules. A variable neighborhood particle swarm optimization algorithm is compared with a multi-start particle swarm optimization and multi-start genetic algorithm. Experimental results illustrate that population based meta-heuristics approaches usually provide a good balance between global exploration and local exploitation and their feasibility and effectiveness for scheduling work-flow applications. © 2010 Elsevier Inc. All rights reserved.

Impact of the number of users on error probabilities in multiuser diversity systems

Multiuser diversity gain has been investigated well in terms of a system capacity formulation in the literature. In practice, however, designs on multiuser systems with nonzero error rates require a relationship between the error rates and the number of users within a cell. Considering a best-user scheduling, where the user with the best channel condition is scheduled to transmit per scheduling interval, our focus is on the uplink. We assume that each user communicates with the base station through a single-input multiple-output channel. We derive a closed-form expression for the average BER, and analyze how the average BER goes to zero asymptotically as the number of users increases for a given SNR. Note that the analysis of average BER even in SI SO multiuser diversity systems has not been done with respect to the number of users for a given SNR. Our analysis can be applied to multiuser diversity systems with any number of antennas.

An evidential fusion approach for gender profiling

CCTV (Closed-Circuit TeleVision) systems are broadly deployed in the present world. To ensure in-time reaction for intelligent surveillance, it is a fundamental task for real-world applications to determine the gender of people of interest. However, normal video algorithms for gender profiling (usually face profiling) have three drawbacks. First, the profiling result is always uncertain. Second, the profiling result is not stable. The degree of certainty usually varies over time, sometimes even to the extent that a male is classified as a female, and vice versa. Third, for a robust profiling result in cases that a person’s face is not visible, other features, such as body shape, are required. These algorithms may provide different recognition results - at the very least, they will provide different degrees of certainties. To overcome these problems, in this paper, we introduce an Dempster-Shafer (DS) evidential approach that makes use of profiling results from multiple algorithms over a period of time, in particular, Denoeux’s cautious rule is applied for fusing mass functions through time lines. Experiments show that this approach does provide better results than single profiling results and classic fusion results. Furthermore, it is found that if severe mis-classification has occurred at the beginning of the time line, the combination can yield undesirable results. To remedy this weakness, we further propose three extensions to the evidential approach proposed above incorporating notions of time-window, time-attenuation, and time-discounting, respectively. These extensions also applies Denoeux’s rule along with time lines and take the DS approach as a special case. Experiments show that these three extensions do provide better results than their predecessor when mis-classifications occur.

Analyse des pratiques de lecture sur livres électroniques chez les étudiants universitaires

La lecture numérique prend de plus en plus de place dans l'espace global de la lecture des étudiants. Bien que les premiers systèmes de lecture numérique, communément appelés livres électroniques, datent déjà de plusieurs années, les opinions quant à leur potentiel divergent encore. Une variété de contenus universitaires numériques s’offre aujourd’hui aux étudiants, entraînant par le fait même une multiplication d'usages ainsi qu'une variété de modes de lecture. Les systèmes de lecture numérique font maintenant partie intégrante de l’environnement électronique auquel les étudiants ont accès et méritent d’être étudiés plus en profondeur. Maintes expérimentations ont été menées dans des bibliothèques publiques et dans des bibliothèques universitaires sur les livres électroniques. Des recherches ont été conduites sur leur utilisabilité et sur le degré de satisfaction des lecteurs dans le but d’en améliorer le design. Cependant, très peu d’études ont porté sur les pratiques de lecture proprement dites des universitaires (notamment les étudiants) et sur leurs perceptions de ces nouveaux systèmes de lecture. Notre recherche s’intéresse à ces aspects en étudiant deux systèmes de lecture numérique, une Tablet PC (dispositif nomade) et un système de livres-Web, NetLibrary (interface de lecture intégrée à un navigateur Web). Notre recherche étudie les pratiques de lecture des étudiants sur ces systèmes de lecture numérique. Elle est guidée par trois questions de recherche qui s’articulent autour (1) des stratégies de lecture employées par des étudiants (avant, pendant et après la lecture), (2) des éléments du système de lecture qui influencent (positivement ou négativement) le processus de lecture et (3) des perceptions des étudiants vis-à-vis la technologie du livre électronique et son apport à leur travail universitaire. Pour mener cette recherche, une approche méthodologique mixte a été retenue, utilisant trois modes de collecte de données : un questionnaire, des entrevues semi-structurées avec les étudiants ayant utilisé l’un ou l’autre des systèmes étudiés, et le prélèvement des traces de lecture laissées par les étudiants dans les systèmes, après usage. Les répondants (n=46) étaient des étudiants de l’Université de Montréal, provenant de trois départements (Bibliothéconomie & sciences de l’information, Communication et Linguistique & traduction). Près de la moitié d’entre eux (n=21) ont été interviewés. Parallèlement, les traces de lecture laissées dans les systèmes de lecture par les étudiants (annotations, surlignages, etc.) ont été prélevées et analysées. Les données des entrevues et des réponses aux questions ouvertes du questionnaire ont fait l'objet d'une analyse de contenu et un traitement statistique a été réservé aux données des questions fermées du questionnaire et des traces de lecture. Les résultats obtenus montrent que, d’une façon générale, l’objectif de lecture, la nouveauté du contenu, les habitudes de lecture de l’étudiant de même que les possibilités du système de lecture sont les éléments qui orientent le choix et l’application des stratégies de lecture. Des aides et des obstacles à la lecture ont été identifiés pour chacun des systèmes de lecture étudiés. Les aides consistent en la présence de certains éléments de la métaphore du livre papier dans le système de lecture numérique (notion de page délimitée, pagination, etc.), le dictionnaire intégré au système, et le fait que les systèmes de lecture étudiés facilitent la lecture en diagonale. Pour les obstacles, l’instrumentation de la lecture a rendu l’appropriation du texte par le lecteur difficile. De plus, la lecture numérique (donc « sur écran ») a entraîné un manque de concentration et une fatigue visuelle notamment avec NetLibrary. La Tablet PC, tout comme NetLibrary, a été perçue comme facile à utiliser mais pas toujours confortable, l’inconfort étant davantage manifeste dans NetLibrary. Les étudiants considèrent les deux systèmes de lecture comme des outils pratiques pour le travail universitaire, mais pour des raisons différentes, spécifiques à chaque système. L’évaluation globale de l’expérience de lecture numérique des répondants s’est avérée, dans l’ensemble, positive pour la Tablet PC et plutôt mitigée pour NetLibrary. Cette recherche contribue à enrichir les connaissances sur (1) la lecture numérique, notamment celle du lectorat universitaire étudiant, et (2) l’impact d’un système de lecture sur l’efficacité de la lecture, sur les lecteurs, sur l’atteinte de l’objectif de lecture, et sur les stratégies de lecture utilisées. Outre les limites de l’étude, des pistes pour des recherches futures sont présentées.

A characterization of fuzzy trees

In this paper some properties of fuzzy bridges are studied.A characterization of fuzzy trees is obtained using these concepts.

Zerrissen - zernagt - zerfallen

Das schriftliche Kulturgut zu bewahren ist eine der wichtigsten Aufgaben der Bibliotheken. Aus den jährlich zugewiesenen Mitteln können sie diese Aufgabe aber nicht allein finanzieren. Deshalb versuchen die Bibliotheken über verschiedene Maßnahmen, die Öffentlichkeit über diese Situation zu informieren. Die Sparkassen-Kulturstiftung Hessen-Thüringen hatte sich dieses Themas 2004 angenommen und unter dem Thema "Zerrissen, zernagt, zerfallen" Bestandsschäden in hessischen Bibliotheken in einer zentralen Ausstellung vorgestellt. Nun will die Universitätsbibliothek Kassel in einer eigenen Ausstellung auf die lokalen Probleme von Restaurierung und Konservierung ihrer Altbestände aus der Landesbibliothek und Murhardsche Bibliothek der Stadt Kassel in den Räumen der Kasseler Sparkasse in der Wolfsschlucht hinweisen. Nach einer Erhebung von 2004 sind 42 % des Buchbestandes der hessischen Bibliotheken durch saures Papier oder Verschleiß geschädigt. Die Landesbibliothek Kassel hat als Archivbibliothek für Nordhessen eine Erhaltungspflicht für die in Nordhessen gedruckten Bücher. Bei einem Bestand von gut 450.000 Büchern ist die Anzahl der restaurierungsbedürftigen Bücher ein Massenproblem, das die Bibliothek finanziell völlig überfordert. Während sich für die attraktiven Stücke der Handschriftensammlung relativ leicht ein Sponsor für Restaurierungsarbeiten findet, ist das eigentliche Problem der Bibliothek aber die Erhaltung des normalen Bestandes, nämlich der Massen an Archivexemplaren, die oft äußerlich recht unattraktiv, aber für die Forschung zur hessischen Geschichte und Landeskunde unverzichtbar sind. Das besonders Schlimme an den Säureschäden in den Büchers ist, das sich im Laufe des Zersetzungsprozesses von selbst immer mehr Säure bildet, so daß sich der Zerfallsprozeß immer mehr beschleunigt.

Erfahrungsbericht: Praktische Umsetzung des Informationsmanagements

Das Handling digitaler Informationen und ihre Integration in bestehende Bibliotheksdienstleistungen sind heutzutage eine der wichtigsten Aufgaben von Bibliotheken. Am Beispiel der Bibliothek der Gesamthochschule Kassel wird gezeigt, wie die entwickelten Lösungen von den organisatorischen, funktionalen und baulichen Gegebenheiten beeinflußt worden sind. Beschrieben werden zudem die technische Plattformen sowie das Zusammenwirken unterschiedlicher Dienste bis hin zum Aufbau eines eigenen Verlages für elektronische Publikationen.

Das Projekt "MultiMediaThek" (MMT) an der Gesamthochschulbibliothek Kassel

Im Informationszeitalter erhalten die Neuen Medien eine immer größer werdende Bedeutung. Lange Zeit galten gedruckte Informationen – häufig in Form von Büchern und Zeitschriften – als eigentliche Informationsquelle in den Bibliotheken. Mehr und mehr nehmen jedoch mittlerweile auch multimediale Anwendungen breiteren Raum ein, gilt es doch, sich den veränderten Lese- und insbesondere Informationsgewohnheiten anzupassen. Insbesondere sollen elektronische Informationsquellen und digitale Literatur erschlossen und bereitgestellt werden. Im Zuge dieser Entwicklung wurde durch die hessische Ministerin für Wissenschaft und Kunst am 11.11.1998 in der Gesamthochschulbibliothek Kassel eine neugeschaffene Multi-Media-Thek (MMT) eröffnet. In dieser Multimediathek sollen die Bibliotheksbenutzer die Möglichkeit erhalten, die Neuen Medien zu erkunden und gewinnbringend für ihre Fragestellungen einzusetzen. Neben den mittlerweile weiter verbreiteten Internetarbeitsplätzen haben die Benutzer Gelegenheit, an speziell ausgestatteten Arbeitsplätzen Audio- und Videoanwendungen zu testen. Die zur Verfügung stehenden Arbeitsplätze sind plattformübergreifend gestaltet, neben Windows NT-Rechnern können Macintosh-, Java- und Linux-Rechner benutzt werden. Alle PC-Systeme verfügen über hochauflösende Grafik- und Soundkarten, allerdings müssen zum Abhören von Audio-Medien, DVD’s oder Multimedia-CD’s entsprechende Kopfhörer aufgesetzt werden. Über WinCenter können auch auf Linux- und Macintosh-Rechnern CD-Applikationen aus dem GHB-internen CD-Server angewählt werden. Zur Auswahl stehen derzeit 140 Datenbanken, die zudem ergänzt werden durch entsprechende Datenbankzugriffe auf den Silverplatter-Server der GHB. In separaten Klein-Arbeitsräumen können Audio-Cassetten und Video-Bänder benutzt werden. Natürlich lassen sich auch herkömmliche Dias und Microfiches in den Räumen der MMT betrachten und Ausdrucke über den Reader-Printer bzw. über das Bibliotheksnetz auf einen zentralen Benutzer-Drucker (OCE-Drucksystem mit Entgeldregelung) machen. Als Auslegestelle für DIN-Normen kann im DIN-Katalog über Internet recherchiert und das Ergebnis der Recherche direkt im DIN-Bestand angesehen werden. In einem speziell eingerichteten Macintosh-Pool sind mittels Scanner, Grafikbearbeitungssoftware und OCR-Möglichkeit weitere Bedingungen für multimediales Arbeiten geschaffen. Sie sollen bei entsprechendem Bedarf um digitale Bildbearbeitung (Photo, Video) gegebenenfalls ergänzt werden. Die Bibliothek bietet in den Räumen der Multimediathek entsprechende Schulungen zur effektiven Nutzung der Rechnerausstattung an.