Reorganization of terminator DNA upon binding replication terminator protein: Implications for the functional replication fork arrest complex

Termination of DNA replication in Bacillus subtilis involves the polar arrest of replication forks by a specific complex formed between the replication terminator protein (RTP) and DNA terminator sites. While determination of the crystal structure of RTP has facilitated our understanding of how a single RTP dimer interacts with terminator DNA, additional information is required in order to understand the assembly of a functional fork arrest complex, which requires an interaction between two RTP dimers and the terminator site. In this study, we show that the conformation of the major B. subtilis DNA terminator, Terl, becomes considerably distorted upon binding RTP. Binding of the first dimer of RTP to the B site of Terl causes the DNA to become slightly unwound and bent by similar to 40 degrees. Binding of a second dimer of RTP to the A site causes the bend angle to increase to similar to 60 degrees. We have used this new data to construct two plausible models that might explain how the ternary terminator complex can block DNA replication in a polar manner, in the first model, polarity of action is a consequence of the two RTP-DNA half-sites having different conformations. These different conformations result from different RTP-DNA contacts at each half-site (due to the intrinsic asymmetry at the terminator DNA), as well as interactions (direct or indirect) between the RTP dimers on the DNA. In the second model, polar fork arrest activity is a consequence of the different affinities of RTP for the A and B sites of the terminator DNA, modulated significantly by direct or indirect interactions between the RTP dimers.

Control of Aedes vectors of dengue in three provinces of Vietnam by use of Mesocyclops (Copepoda) and community-based methods validated by entomologic, clinical, and serological surveillance

We describe remarkable success in controlling dengue vectors, Aedes aegypti (L.) and Aedes albopictus (Skuse), in 6 communes with 11,675 households and 49,647 people in the northern provinces of Haiphong, Hung Yen, and Nam Dinh in Vietnam. The communes were selected for high-frequency use of large outdoor concrete tanks and wells. These were found to be the source of 49.6-98.4% of Ae. aegypti larvae, which were amenable to treatment with local Mesocyclops, mainly M. woutersi Van der Velde, M. aspericornis (Daday) and M. thermocyclopoides Harada. Knowledge, attitude, and practice surveys were performed to determine whether the communities viewed dengue and dengue hemorrhagic fever as a serious health threat; to determine their knowledge of the etiology, attitudes, and practices regarding control methods including Mesocyclops; and to determine their receptivity to various information methods. On the basis of the knowledge, attitude, and practice data, the community-based dengue control program comprised a system of local leaders, health volunteer teachers, and schoolchildren, supported by health professionals. Recycling of discards for economic gain was enhanced, where appropriate, and this, plus 37 clean-up campaigns, removed small containers unsuitable for Mesocyclops treatment. A previously successful eradication at Phan Boi village (Hung Yen province) was extended to 7 other villages forming Di Su commune (1,750 households) in the current study. Complete control was also achieved in Nghia Hiep (Hung Yen province) and in Xuan Phong (Nam Dinh province); control efficacy was greater than or equal to 99.7% in the other 3 communes (Lac Vien in Haiphong, Nghia Dong, and Xuan Kien in Nam Dinh). Although tanks and wells were the key container types of Ae. aegypti productivity, discarded materials were the source of 51% of the standing crop of Ae. albopictus. Aedes albopictus larvae were eliminated from the 3 Nam Dinh communes, and 86-98% control was achieved in the other 3 communes. Variable dengue attack rates made the clinical and serological comparison of control and untreated communes problematic, but these data indicate that clinical surveillance by itself is inadequate to monitor dengue transmission.

Use of heterologously-expressed cytochomre P450 and glutathione transferase enzymes in toxicity assays

Our groups have had a long-term interest in utilizing bacterial systems in the characterization of bioactivation and detoxication reactions catalyzed by cytochrome P450 (P450) and glutathione transferase (GST) enzymes. Bacterial systems remain the first choice for initial screens with new chemicals and have advantages, including high-throughput capability. Most human P450s of interest in toxicology have been readily expressed in Escherichia coli with only minor sequence modification. These enzymes can be readily purified and used in assays of activation of chemicals. Bicistronic systems have been developed in order to provide the auxiliary NADPH-P450 reductase. Alternative systems involve these enzymes expressed together within bacteria. In one approach, a lac selection system is used with E. coli and has been applied to the characterization of inhibitors of P450s 1A2 and 1131, as well as in basic studies involving random mutagenesis. Another approach utilizes induction of the SOS (umu) response in Salmonella typhimurium, and systems have now been developed with human P450s 1A1, 1A2, 1B1, 2C9, 2D6, 2E1, and 3A4, which have been used to report responses from heterocyclic amines. S. typhimurium his reporter systems have also been used with GSTs, first to demonstrate the role of rat GST 5-5 in the activation of dihalomethanes. These systems have been used to compare these GSTs with regard to activation of dihaloalkanes and potential toxicity. (C) 2002 Elsevier Science Ireland Ltd. All rights reserved.

Physiological responses to repeated bouts of high-intensity ultraendurance cycling - a field study case report

The present study aimed to 1) examine the relationship between laboratory-based measures and high-intensity ultraendurance (HIU) performance during an intermittent 24-h relay ultraendurance mountain bike race (similar to20 min cycling, similar to60min recovery), and 2) examine physiological and performance based changes throughout the HIU event. Prior to the HIU event, four highly-trained male cyclists (age = 24.0 +/- 2.1 yr; mass = 75.0 +/- 2.7 kg; (V)over dot O-2peak = 70 +/- 3 ml.kg(-1).min(-1)) performed 1) a progressive exercise test to determine peak Volume of oxygen uptake ((V)over dot O-2peak), peak power output (PPO), and ventilatory threshold (T-vent), 2) time-to-fatigue tests at 100% (TF100) and 150% of PPO (TF150), and 3) a laboratory simulated 40-km time trial (TT40). Blood lactate (Lac(-)), haematocrit and haemoglobin were measured at 6-h intervals throughout the HIU event, while heart rate (HR) was recorded continuously. Intermittent HIU performance, performance HR, recovery HR, and Lac declined (P < 0.05), while plasma volume expanded (P < 0.05) during the HIU event. TF100 was related to the decline in lap time (r = -0.96; P < 0.05), and a trend (P = 0.081) was found between TF150 and average intermittent HIU speed (r = 0.92). However, other measures (V)over dot O-2peak, PPO, T-vent, and TT40) were not related to HIU performance. Measures of high-intensity endurance performance (TF100, TF150) were better predictors of intermittent HIU performance than traditional laboratory-based measures of aerobic capacity.

Efeitos do isolamento social neonatal, da fluoxetina e do lactato desódio sobre o pânico experimental induzido por cianeto de potássio ou estimulação da matéria cinzenta periaquedutal em ratos

Os ataques de pânico (AP) podem ser precipitados pela inalação de dióxido de carbono (CO2 5%) ou pela infusão de lactato de sódio 0,5 mol/L (LAC) em pacientes predispostos, mas não nos indivíduos sadios ou pacientes com outros transtornos psiquiátricos. Estas e outras observações sugeriram que os AP sejam "alarmes falsos de sufocamento". O TP também caracteriza-se pela alta comorbidade com ansiedade de separação da infância (ASI). De fato, a ASI tem sido considerada como um fator predisponente tanto do pânico como da resistência aos panicolíticos. Estudos pré-clínicos do nosso laboratório mostraram, por outro lado, que a fluoxetina (FLX) atenua o pânico experimental à estimulação elétrica da matéria cinzenta periaquedutal dorsal (MCPAd) e à injeção de cianeto de potássio (KCN) em doses e regimes similares aos empregados na clínica. Adicionalmente, estes estudos mostraram que o isolamento social neonatal (ISN), um modelo de ASI, abole os efeitos panicolíticos da fluoxetina (1-2 mg.kg-1.dia-1, 21 dias) no modelo de pânico por estimulação da MCPAd. Portanto, o presente trabalho avaliou os efeitos da administração de 4 mg/kg de FLX (Estudo-1) e da infusão de uma solução 0,5 mol/L de LAC (Estudo-2) sobre as respostas de pânico à estimulação da MCPAd ou à injeção de KCN, respectivamente, em ratos submetidos ao isolamento social neonatal tanto efetivo (ISN) quanto fictício (ISF). No Estudo-1, ratos Wistar machos adultos submetidos ao ISN (3 h diárias) ou ao ISF (somente manipulação), ao longo da lactação, foram implantados com eletrodos na MCPAd e tratados com salina (0,9%, SAL) ou FLX (4 mg.kg-1.dia-1) ao longo de 21 dias. Nos ratos tratados com SAL, enquanto os limiares das respostas de pânico mantiveram-se praticamente inalterados no grupo ISF, eles foram progressivamente aumentados no grupo ISN. Os ratos tratados com FLX4 apresentaram limiares mais elevados que aqueles dos ratos tratados com SAL. A comparação aos limiares basais mostrou que a FLX4 teve efeitos diferenciados nos grupos ISF e ISN, aumentando ou reduzindo seus limiares, respectivamente. Embora não tenhamos observado diferenças dos efeitos da FLX4 sobre os limiares de pânico dos grupos ISN e ISF, as variações percentuais em relação à sessão de triagem indicam que a FLX4 teve efeitos até mesmo facilitadores. Estes resultados estendem observações anteriores da ausência de efeitos de doses menores de FLX nos ratos submetidos ao ISN. Por sua vez, o Estudo-2 mostrou que a infusão endovenosa de uma concentração clinicamente eficaz de LAC (0,5 mol/L) não tem efeito algum sobre o pânico induzido pelo KCN em ratos tanto virgens quanto submetidos ao ISF ou ISN. Embora os últimos resultados sugiram que os AP ao KCN (em ratos) e LAC (em humanos) envolvam mecanismos distintos, a conclusão definitiva requer experimentos adicionais com concentrações maiores de LAC.

India, Latin America, and the Caribbean during the Cold War

In this period, the key to the relationship between India and Latin America and the Caribbean (LAC) was based in the political nature of this liaison: it was a "uni-multilateral" relationship, centered in India, where LAC countries operated as a group of autonomous entities (an "island chain" structure), and not as a unit of a supranational character with unified international conduct (an island structure). As we will see, faced with uniform and consistent Indian policies, LAC had national policies which make it impossible to discuss a regional policy towards India. The goal of this work is to form a general characterization of the bilateral policies during the period of the Cold War with the intent of identifying the key explanatory factors of the process. While this may be a limited objective, it addresses the non-existence of an academic debate surrounding the topic. We intend to contribute an analysis which in this phase is primarily descriptive.

Espetroscopia (1H) por ressonância magnética do disco intervertebral lombar no adulto e sua aplicação na rotina imagiológica

Objetivos – Demonstrar o potencial da espetroscopia (1H) por ressonância magnética na doença degenerativa discal lombar e defender a integração desta técnica na rotina clínico‑imagiológica para a precisa classificação da involução vs degenerescência dos discos L4‑L5 e L5‑S1 em doentes com lombalgia não relacionável com causa mecânica. Material e métodos – O estudo incluiu 102 discos intervertebrais lombares de 123 doentes. Foram estudados 61 discos de L4‑L5, 41 discos de L5‑S1 e 34 discos de D12‑L1. Utilizou‑se um sistema de ressonância magnética de 1,5 T e técnica monovoxel. Obtiveram‑se os rácios [Lac/Nacetyl] e [Nacetyl/(Lac+Lípidos)] e aplicou‑se a ressonância de lípidos para avaliar a bioquímica do disco com o fim de conhecer o estado de involução vs degenerescência que o suscetibilizam para a instabilidade e sobrecarga. Avaliou‑se o comportamento dos rácios e do teor lipídico dos discos L4‑L5‑S1 e as diferenças apresentadas em relação a D12‑L1. Foi também realizada a comparação entre os discos L4‑L5, L5‑S1 e D12‑L1 na ponderação T2 (T2W), segundo a classificação ajustada (1‑4) de Pfirrmann. Resultados – Verificou‑se que os rácios e o valor dos lípidos dos discos L4‑L5‑S1 apresentaram diferenças estatisticamente significativas quando relacionados com os discos D12‑L1. O rácio [Lac/Nacetyl] em L4‑L5‑S1 mostrou‑se aumentado em relação a D12‑L1 (p=0,033 para os discos com grau de involução [1+2] e p=0,004 para os discos com grau [3+4]). Estes resultados sugerem que a involução vs degenerescência dos discos nos graus mais elevados condiciona um decréscimo do pico do Lactato. O rácio [Nacetyl/(Lac+Lip)] discrimina os graus de involução [1+2] do [3+4] no nível L4‑L5, apresentando os valores dos rácios (média 0,65 e 0,5 respetivamente com p=0,04). O rácio médio de [Nacetyl/(Lac+Lip)] dos discos L4‑L5 foi 1,8 vezes mais elevado do que em D12‑L1. O espetro lipídico em L4‑L5‑S1 nos graus mais elevados não mostrou ter uma prevalência constante quanto às frequências de ressonância. Conclusão – A espetroscopia (1H) dos discos intervertebrais poderá ter aplicação na discriminação dos graus de involução vs degenerescência e representar um contributo semiológico importante em suplemento à ponderação T2 convencional. As ressonâncias de lípidos dos discos L4‑L5 e L5‑S1, involuídos ou degenerados, devem ser avaliadas em relação a D12‑L1, utilizando este valor como referência, pois este último é o nível considerado estável e com baixa probabilidade de degenerescência.

An interdisciplinary approach to the study of colour in portuguese manuscript illuminations

Dissertação apresentada para obtenção do Grau de Doutor em Conservação e Restauro, especialidade Teoria, História e Técnicas, pela Universidade Nova de Lisboa, Faculdade de Ciências e Tecnologia

The discovery of three lost ‘Salting’ carpets: science as a tool for revealing their history

Thesis presented at the Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa, to obtain a Master degree in Conservation and Restoration,Specialization in Textiles

Regulación de la respuesta inmune

El proyecto se subdividirá en varios subproyectos tendientes a continuar con el análisis de los mecanismos que regulan la respuesta autoinmune y de los mecanismos efectores que conducen al daño tisular en los órganos blanco. Durante el primer año se caracterizarán células presentadoras de antígeno involucradas en la supresión o potenciación de la respuesta autoinmune y se estudiará la inducción de la respuesta autoinmune utilizando GA-liposomas como adyuvante. Se caracterizarán fenotípica y funcionalmente las células de exudado peritoneal (CP) involucradas en la captación y/o presentación del autoantígeno asociado a liposomas. Se estudiará además los efectos del estrés sobre la inmunidad innata, ya que ésta es la base de la defensa de los microorganismos multucelulares y es el resultado de la actividad de diversas células (macrófagos, neutrófilos, natural killer), proteínas séricas (sistema del complemento, proteínas de la fase aguda) y citoquinas. Por otra parte se identificarán el o los autoantígenos responsables de la autoinmunidad debido a que los anticuerpos autoinmunes no cumplen los requisitos para rastrear la librería de cDNA de próstata porque no reconocen proteínas desnaturalizadas; se prevé purificar por inmunoafinidad la proteína autoantigénica y obtener con ella un antisuero heterólogo que sirva para dichos fines. Por otra parte se trabajará con células mononucleares de bazo totales (CmbT) y con células peritoneales (CP) obtenidas de ratas Wistar normales. Se obtendrán a partir de ellas por adherencia a distintos soportes poblacionales enriquecidas en linfocitos T, linfocitos B y macrófagos. En estas poblaciones se evaluará la presencia de la lectina S-lac utilizando técnicas inmunoquímicas e inmunocitoquímicas así como los estímulos que regulan su modulación.

Métodos para identificar o limiar anaeróbio em indivíduos com diabete tipo 2 e em indivíduos não-diabéticos

FUNDAMENTO: Apesar de o limiar anaeróbio (LAn) ser utilizado na avaliação funcional de diferentes populações, estudos comparando métodos para sua identificação em diabéticos tipo-2 tem sido pouco realizados. OBJETIVO: Comparar protocolos de identificação do LAn em indivíduos diabéticos tipo 2 e em não-diabéticos, e analisar respostas relacionadas ao equilíbrio ácido-básico em intensidades relativas ao LAn. MÉTODOS: Diabéticos tipo 2 (n=10; 54,5±9,5 anos; 30,1±5,0 kg/m²) e jovens não-diabéticos (n=10; 36,6±12,8 anos; 23,9±5,0 kg/m²) realizaram teste incremental (TI) em ciclo ergômetro. O aumento desproporcional no equivalente ventilatório de oxigênio (VE/VO2) e lactatemia ([lac]) identificaram intensidades (Watts-W) correspondentes aos limiares ventilatório (LV) e de lactato (LL), respectivamente. A intensidade correspondente à menor glicemia ([glic]) foi considerada limiar glicêmico individual (LGI). O LAn também foi determinado por ajuste polinomial das razões VE/Watts (LV VE/W) e [lac]/Watts (LL[lac]/W), as quais identificaram intensidades acima das quais um aumento desproporcional na VE e [lac] ocorreram. RESULTADOS: Não foram observadas diferenças entre LL, LV, LG, LL[lac]/W e LV VE/W em diabéticos (85,0±32,1; 88,0±31,7; 86,0±33,8; 82,0±20,9 e 90,2±22,2W) e não-diabéticos (139,0±39,0; 133,0±42,7; 140,8±36,4; 122,7±44,3 e 133,0±39,1W). Contudo os valores de LAn diferiram significativamente entre grupos (p<0.001). A técnica de Bland-Altman confirmou concordância entre os protocolos. Reduções significativas no pH e pCO2 em paralelo a um aumento na [lac], pO2 e VE foram observadas em intensidades supra limiares. CONCLUSÃO: Os protocolos apresentaram, para ambos os grupos estudados, concordância na identificação do LAn, que se mostrou como uma intensidade de exercício acima da qual ocorre perda de equilíbrio ácido-básico.

Tolerância ao esforço em ratos com estenose aórtica e disfunção ventricular diastólica e/ou sistólica

FUNDAMENTO: A Tolerância ao Esforço Físico (TEF) é uma medida de condicionamento cardiorrespiratório. A capacidade aeróbica é reduzida na Insuficiência Cardíaca (IC), embora não haja dados disponíveis sobre esse parâmetro em animais com disfunção ventricular e sem sinais de IC. OBJETIVO: Avaliar a TEF em ratos com disfunção ventricular diastólica isolada ou associada com disfunção sistólica induzida pela Estenose da Aorta ascendente (EAo). MÉTODOS: Ratos Wistar machos jovens (20-30 dias de idade) foram divididos em Grupo Controle (GC, n = 11) e Grupo EAo (n = 12). Os animais foram avaliados em 6 e 18 semanas após a cirurgia para EAo. O teste ergométrico foi feito até a exaustão e foram avaliadas a velocidade da esteira e a concentração de lactato [LAC] no limiar de lactato, velocidade da esteira e [LAC] na exaustão, e tempo total do teste. RESULTADOS: Dados ecocardiográficos revelaram remodelação do átrio esquerdo e hipertrofia concêntrica ventricular esquerda em 6 e 18 semanas. A fração de encurtamento endocárdico mostrou-se maior no grupo EAo do que no GC em 6 e 18 semanas. A fração de encurtamento da parede média mostrou-se maior no grupo EAo do que no GC em 6 semanas. O índice cardíaco mostrou-se semelhante no GC e no grupo EAo em 6 e 18 semanas, tendo diminuído entre 6-18 semanas em ambos os grupos. A razão entre a onda E a onda A foi maior no GC do que no grupo EAo em ambos os períodos e não se alterou em ambos os grupos entre a semana 6 e a semana 18. Os parâmetros do teste de esforço na esteira foram semelhantes nos dois grupos tanto na semana 6 quanto na semana 18. CONCLUSÃO: Embora a EAo promova a disfunção diastólica isolada ou associada à disfunção sistólica, em 6 ou 18 semanas, ela não é suficiente para alterar a tolerância ao esforço físico.

Teores de aminoácidos e fenóis em plântulas de algodoeiro (Gossypium hirsutum L. cv. 'IAC-17') sob ação de reguladores vegetais

Verificaram-se os efeitos da aplicação de reguladores de crescimento na porcentagem de materia seca, aminoácidos livres totais e compostos fenólicos nas folhas de algodoeiro 'lAC-l7'. Para se estudar a ação dos fitoreguladores, sementes de algodoeiro foram imersas durante 22 horas em soluções aquosas de cloreto (2-cloroetil) trimetilamônio (CCC) na concentração de 2000 ppm, ácido succínico-2,2-dimetilhidrazida 4000 ppm, ácido giberélico 100 ppm, ácido indolilacético (IAA) 100 ppm e água como controle. Plântulas com 33 dias de idade foram coletadas, sendo em seguida realizada a amostragem de folhas em laboratório, para efetuar-se a extração dos compostos. Observou-se que CCC 2000 ppm promoveu aumento no peso seco das folhas de algodoeiro. Esse retardador de crescimento aumentou o conteúdo de aminoácidos livres totais nas folhas estudadas. IAA 100 ppm reduziu a concentração de aminoácidos, nas plantas tratadas. O teor de fenóis totais nas folhas de Gossypium hirsutum foi aumentado por efeito do CCC com relação ao controle.

Lymnaea columella: two new Brazilian localities in the states of Amazonas and Bahia

The occurrence of Lymnaea columella is recorded in Tefé, Amazonas state, where it was found together with Drepanotrema anatinum, Physa marmorata and pomacea sp. L. columella was also collected in Salvador, Bahia state, at the dique do Tororó, an urban lake formely mentioned (as "lac Baril") by Moricand (1853) as a breeding-place of Biomphalaria glabrata, Drepanotrema cimex, D. depressissimum, Pomacea lineata, P. decussata and Ancylus moricandi. The four first-mentioned species, as well as physa cubensis and Hemisinus brasiliensis, were also collected now. This is the first record of a lymnaeid in the Northeastern region of Brazil.

Labor supply response to international migration and remittances in the Republic of Haiti

The Republic of Haiti is the prime international remittances recipient country in the Latin American and Caribbean (LAC) region relative to its gross domestic product (GDP). The downside of this observation may be that this country is also the first exporter of skilled workers in the world by population size. The present research uses a zero-altered negative binomial (with logit inflation) to model households' international migration decision process, and endogenous regressors' Amemiya Generalized Least Squares method (instrumental variable Tobit, IV-Tobit) to account for selectivity and endogeneity issues in assessing the impact of remittances on labor market outcomes. Results are in line with what has been found so far in this literature in terms of a decline of labor supply in the presence of remittances. However, the impact of international remittances does not seem to be important in determining recipient households' labor participation behavior, particularly for women.