Genetic diversity and epidemiology of antimicrobial resistant Streptococcus pneumoniae isolates

Dissertation presented to obtain a Ph.D. degree in Biology, speciality in Microbiology, by Universidade Nova de Lisboa, Faculdade de Ciências e Tecnologia

Sorotipos de Streptococcus pneumoniae isolados de líquido cefalorraquidiano no período de 1977-1988 na cidade de São Paulo, Brasil

Desde 1977, o Instituto Adolfo Lutz (IAL) vem promovendo a sorotipagem do S. pneumoniae ou pneumococo de infecções causadas por esta bacteria. As cepas isoladas têm sido encaminhadas ao WHO Pneumococcal Reference Center, Pensilvania, E.U.A.. De 1977 a 1988, 1.000 cepas de pneumococo isoladas de LCR foram sorotipadas, de acordo com a nomenclatura dinamarquesa, e 60 sorotipos foram identificados. A maior freqüência foi do sorotipo 1, secundado por 6B, 18C, 14, 5, 3, 6A, 23F, 19F e 38. Estes sorotipos distribuídos segundo faixas etárias demonstraram incidência variável, notando-se uma certa peculiaridade, ou seja, a predominância do sorotipo 6B na faixa de zero a menos de dois anos; do sorotipo 1 na faixa de 2 até 50 anos e do sorotipo 3 no grupo acima de 50 anos. Nos 12 anos considerados, 25 sorotipos apresentaram uma certa uniformidade na freqüência e o mesmo foi observado com relação às estações climáticas, apenas com um número maior de infecções meníngeas nos meses mais frios. Considerando a gravidade das infecções pneumocócicas notadamente as meningites, e a pouca informação relativa aos sorotipos pneumocócicos que ocorrem na região, julgamos importante essa informação relativa aos sorotipos, uma vez que tem sido usadas, com sucesso, vacinas polissacarídicas na prevenção dessas infecções.

Resistance of Streptococcus pneumoniae to antimicrobials in São Paulo, Brazil: clinical features and serotypes

To study resistance to antimicrobials, serotypes and clinical features of S. pneumoniae in S. Paulo, Brazil, 50 patients with a positive culture were evaluated: 7 were considered carriers and 43 had pneumococcal infections. Pneumonia and meningitis were the most commom infections. Mortality was 34% and underlying diseases were present in 70%. Relative resistance to penicillin occurred in 24% and complete resistance was not detected. Resistance to tetracycline was 32% and to sulfamethoxazole/trimethoprim 32%; one strain had intermediate susceptibility to erythromycin; no resistance was present for chloramphenicol, rifampin or vancomycin. Resistance to at least one of the drugs tested occurred in 62%. Results by the E-test for penicillin were similar to those by the agar dilution method. There were 24 different serotypes and 74% of the strains belonged to the 23-valent vaccine including all the penicillin-resistant strains. In this study S. pneumoniae caused severe infections and presented a high resistance rate to commonly used antimicrobials. Routine surveillance of resistance and the use of vaccination, as well as the restriction of inappropriate use of antimicrobials, are recommended in São Paulo, Brazil.

Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae as etiological agents of conjunctivitis outbreaks in the region of Ribeirão Preto, SP, Brazil

In the study of conjunctivitis outbreaks occurring from September 1994 to September 1996 in the region of Ribeirão Preto, conjunctival exudates of 92 patients were cultivated in Instituto Adolfo Lutz Laboratory I, Ribeirão Preto. Most cases occurred in the age range 2-7 years. The etiological agents which were most frequently isolated from the analyzed cases were: Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae, in 40.22% and 21.74%, respectively. 51.35% of the S. pneumoniae isolated strains were not typable. The oxacillin-resistant S. pneumoniae strains were submitted to the minimum inhibitory concentration test (MIC) and three of them presented intermediate resistance, whereas only one was highly resistant to penicillin.

Mycoplasma pneumoniae and Chlamydia pneumoniae in calcified nodules of aortic stenotic valves

Aortic Valve Stenosis (AVS) has been explained as an atherosclerotic process of the valve as they often exhibit inflammatory changes with infiltration of macrophages, T lymphocytes and lipid infiltration. The present study investigated whether the bacteria Chlamydia pneumoniae (CP) and Mycoplasma pneumoniae (MP), detected previously in atherosclerotic plaques, are also present in AVS. Ten valves surgically removed from patients with AVS were analyzed by immunohistochemistry, in situ hybridization, and electron microscopy. The mean and standard deviation of the percentage areas occupied by CP antigens and MP - DNA were respectively 6.21 +/- 5.41 and 2.27 +/- 2.06 in calcified foci; 2.8 +/- 3.33 and 1.78+/- 3.63 in surrounding fibrotic areas, and 0.21 +/- 0.17 and 0.12 +/- 0.13 in less injured parts of the valve. There was higher amount of CP and MP in the calcified foci and in the surrounded fibrosis than in more preserved valvular regions. In conclusion, the fact that there were greater amounts of CP and MP in calcification foci of AVS favors the hypothesis that AS is not an inevitable degenerative process due to aging, but rather that it may be a response to the presence of these bacteria, similarly to the morphology detected in atherosclerosis damage.

Understanding the relationship between central metabolism and virulence in the human pathogen Streptococcus pneumoniae

Dissertation presented to obtain the Ph.D. degree in Biochemistry

Epidemiological studies of Streptococcus pneumoniae carriage in the post-vaccination era among two risk groups: children and the elderly

Dissertation presented to obtain the Ph.D. degree in Biology/ Molecular Biology

Participação do Mycoplasma pneumoniae na etiologia de infecções respiratórias agudas em Ribeirão Preto, São Paulo, Brasil

Para avaliar a participação etiológica do Mycoplasma pneumoniae em infecções respiratórias agudas, o isolamento dessa bactéria foi tentado em secreções do aparelho respiratório de 64 pacientes (média 24 anos) com quadro respiratório aguda Foi realizada, também, a pesquisa de anticorpos específicos anti-M. pneumoniae através da reação de fixação do complemento (FC) e da reação de contra-imunoeletroforese (CIE). O M. pneumoniae não foi isolado. O diagnóstico presuntivo de infecção pelo M. pneumoniae foi feito pela FC em 3,1% (2/64) e pela CIE em 1,6% (1/64) dos pacientes. Paralelamente, em 200 indivíduos sadios, os mesmos testes sorológicos foram realizados, sendo o índice de positividade de 4% (8/200) pela CIE e de 1% (2/200) pela FC. Apesar das aiscrepâncias observadas entre os dois métodos sorológicos, a FC parece ser indicada para diagnóstico da infecção, sendo a CIE recomendada nas avaliações soroepidemiológicas. Com base nos dados do nosso estudo, a prevalência das infecções respiratórias pelo M. pneumoniae parece ser baixa em nosso meio.

Studies of the assembly of the Streptococcus pneumoniae capsular polysaccharide

Dissertation presented to obtain the Ph.D degree in Biology.

Insights into the epidemiology of drug-resistant Streptococcus pneumoniae and closely-related streptococci in the era of conjugate vaccines

In Portugal, the introduction of the seven-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV7) has led to significant changes in the population structure of Streptococcus pneumoniae. However, the levels of antimicrobial resistance have not decreased and have been a matter of concern. (...)

Rational manipulation of mRNA folding free energy allows rheostat control of pneumolysin production by Streptococcus pneumoniae

Rational manipulation of mRNA folding free energy allows rheostat control of pneumolysin production by Streptococcus pneumoniae

Pneumomediastino espontâneo como apresentação de infecção por Mycoplasma pneumoniae

Introdução: O pneumomediastino espontâneo (PE) define-se pela presença de ar livre no mediastino, sem causa traumática. É raro em idade pediátrica e exige elevada suspeição diagnóstica. Caso Clínico: Adolescente de 17 anos, longilíneo, fumador ocasional, sem história traumática nem patologia pulmonar, observado na Urgência por dor retrosternal intensa acompanhada por dispneia ligeira. Referência a acessos de tosse seca violenta horas antes. O diagnóstico de PE suspeitou-se pela palpação de enfisema subcutâneo supraclavicular e confirmou-se por telerradiografia do tórax mostrando ar livre mediastínico. A investigação revelou infeção por Mycoplasma pneumoniae pelo que foi medicado com macrólido para além do repouso e analgesia propostos para o PE, evoluindo favoravelmente. Discussão/Conclusôes: O PE é um diagnóstico a não esquecer perante dor torácica aguda no adolescente. A presença de sintomas, por vezes, frustres e a evolução habitualmente benigna contribuem para um provável subdiagnóstico. O tabagismo é um fator predisponente. A associação a infeção por Mycoplasma pneumoniae só raramente foi descrita.