Transcrição cooperativa de genes ribossomais em Escherichia coli usando um modelo estocástico e dependente de sequência

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Análise do transcriptoma de folhas de cana-de-açúcar submetidas à prolongada limitação hídrica usando RNA-Seq

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Efeitos do exercício intenso e do condicionamento aeróbio associado a suplementação com cromo ou carnitina sobre a microbiota fecal de potras

Pós-graduação em Microbiologia Agropecuária - FCAV

Estado da arte do sequenciamento genômico na pecuária

There has been a lot of advance in genomics since 1975 when the possibility to determine the nucleotide sequence of a genome was described. In the 90’s the human genome sequencing was started and it was greatly favored by advances in computer technologies. In the last ten years the development of next generation sequencing technologies allowed the sequencing of millions of bases at low cost and in a shorter time compared to the previous technologies. After the conclusion of the human genome project, several initiatives to sequence the genome of domestic animal species were taken, resulting in a large amount of data that is redirecting the goals of genetic studies in domestic animals. The aim of this review was to describe the present situation of the sequencing initiatives on the main domestic animal species of economical interest as well as to list the most important tools available to access the genomic information.

Algoritmos de aprendizado semi-supervisionado baseados em grafos aplicados na bioinformática

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Estrutura populacional e análise de variabilidade genética em rebanhos ovinos brasileiros

Pós-graduação em Ciência e Tecnologia Animal - FEIS

Organização cromossômica e molecular do DNAr 5S em duas espécies de gafanhotos do gênero Abracris (Acrididae/Ommatolampidinae)

Os DNAs repetitivos compõem grande porção dos genomas eucariotos e estão organizados em distintos grupos, essencialmente DNAs satélite, microsatélites, minisatélites, elementos de transposição (transposons e retrotransposons) e famílias multigênicas. Estas sequências têm sido úteis nas análises cromossômicas com enfoque em estudos de diversificação cariotípica e de estrutura e evolução dos genomas. Os gafanhotos da família Acrididae representam o grupo com maior diversidade da ordem Orthoptera e apresentam do ponto de vista cromossômico ampla conservação com 2n=23,X0 (macho) na maioria das espécies estudadas. Análises enfocando o entendimento da estrutura das sequências de DNAs repetitivos neste grupo são escassas, e em geral restritas ao mapeamento de algumas famílias multigênicas. Outras sequências repetitivas, tais como DNAs satélites, genes de histonas e DNAr 5S foram realizadas principalmente em espécies de Acridídeos ocorrentes na Europa. No presente trabalho foram isolados e caracterizados do ponto de vista cromossômico e molecular o gene de DNAr 5S e seu espaçador não transcrito (NTS) nas espécies de acridídeos (Ommatolampidinae) Abracris flavolineata e Abracris dilecta. Estas análises permitiram um aprofundamento no conhecimento da estrutura/evolução desta sequência de DNA repetitivo entre as duas espécies, testando-se os possíveis modelos de evolução para esta sequência, que incluem evolução em concerto, nascimento e morte ou modelo misto

Ocorrência de fungos negros em ambientes domésticos

Black fungi are able to adapt to extreme environmental conditions, such as: high temperatures, the presence of toxic chemical substances and lack of nutrients. Besides, they are also potential pathogens to humans. The natural environment of many black fungi is still unknown and some studies are being conducted to evaluate the biodiversity of this group and their different habitats. This study aimed to isolate black fungi in domestic environments and facilities, such as toothbrushes, fridge sealing rubbers, bathroom strainers and divisions, windows, wall tiles and bath sponge. For the collection, material surfaces were scratched with a scalpel and the resulting fragments were sewed in Mycosel agar (DifcoTM), supplemented with actidione to inhibit the growth of highly-sporulating fungi. Plates were incubated at 25ºC for three weeks. The 46 isolated fungi were maintained on MA2% slants at 8ºC and cryopreserved at -80ºC. Fungal identification was performed through the analysis of macro and microscopic features and ITS rDNA sequencing. The following black fungi taxa were found: Ascomycota sp., Cladosporium spp., Dothideomycete sp., Exophiala alcalophila, Ochroconis mirabilis and Rhinocladiella atrovirens. Non-melanized fungi were also found, such as Geosmithia sp., Penicillium sp. and Rhodotorula mucilaginosa. The temperature tests showed that isolated black fungi were not able to grow at 37°C, however, this temperature proved to be fungistatic to 43% of them. According to literature, all black fungi isolated in this study are opportunistic pathogens and additional studies are necessary to evaluate the risk that these micro-organisms offer to health, once they were isolated from domestic environments

Expressão de fatores miogênicos e de microRNAs no músculo esqueléticos de ratos submetidos a estímulo atrófico e recuperação por treinamento físico

Pós-graduação em Biologia Geral e Aplicada - IBB

Filogeografia do tubarão martelo Sphyrna zygaena (Chondrichthyes, Sphyrnidae) do Atlântico utilizando marcadores moleculares

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Análise de diversidade e expressão de retrotransposons ativos em espécies de Coffea

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Avaliação visceral da técnica sorológica para Leishmaniose visceral e doença de Chagas em animais silvestres e identificação molecular

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Estrutura populacional e análise de variabilidade genética em rebanhos ovinos brasileiros

Pós-graduação em Ciência e Tecnologia Animal - FEIS

Organização cromossômica e molecular do DNAr 5S em duas espécies de gafanhotos do gênero Abracris (Acrididae/Ommatolampidinae)

Os DNAs repetitivos compõem grande porção dos genomas eucariotos e estão organizados em distintos grupos, essencialmente DNAs satélite, microsatélites, minisatélites, elementos de transposição (transposons e retrotransposons) e famílias multigênicas. Estas sequências têm sido úteis nas análises cromossômicas com enfoque em estudos de diversificação cariotípica e de estrutura e evolução dos genomas. Os gafanhotos da família Acrididae representam o grupo com maior diversidade da ordem Orthoptera e apresentam do ponto de vista cromossômico ampla conservação com 2n=23,X0 (macho) na maioria das espécies estudadas. Análises enfocando o entendimento da estrutura das sequências de DNAs repetitivos neste grupo são escassas, e em geral restritas ao mapeamento de algumas famílias multigênicas. Outras sequências repetitivas, tais como DNAs satélites, genes de histonas e DNAr 5S foram realizadas principalmente em espécies de Acridídeos ocorrentes na Europa. No presente trabalho foram isolados e caracterizados do ponto de vista cromossômico e molecular o gene de DNAr 5S e seu espaçador não transcrito (NTS) nas espécies de acridídeos (Ommatolampidinae) Abracris flavolineata e Abracris dilecta. Estas análises permitiram um aprofundamento no conhecimento da estrutura/evolução desta sequência de DNA repetitivo entre as duas espécies, testando-se os possíveis modelos de evolução para esta sequência, que incluem evolução em concerto, nascimento e morte ou modelo misto

Ocorrência de fungos negros em ambientes domésticos

Black fungi are able to adapt to extreme environmental conditions, such as: high temperatures, the presence of toxic chemical substances and lack of nutrients. Besides, they are also potential pathogens to humans. The natural environment of many black fungi is still unknown and some studies are being conducted to evaluate the biodiversity of this group and their different habitats. This study aimed to isolate black fungi in domestic environments and facilities, such as toothbrushes, fridge sealing rubbers, bathroom strainers and divisions, windows, wall tiles and bath sponge. For the collection, material surfaces were scratched with a scalpel and the resulting fragments were sewed in Mycosel agar (DifcoTM), supplemented with actidione to inhibit the growth of highly-sporulating fungi. Plates were incubated at 25ºC for three weeks. The 46 isolated fungi were maintained on MA2% slants at 8ºC and cryopreserved at -80ºC. Fungal identification was performed through the analysis of macro and microscopic features and ITS rDNA sequencing. The following black fungi taxa were found: Ascomycota sp., Cladosporium spp., Dothideomycete sp., Exophiala alcalophila, Ochroconis mirabilis and Rhinocladiella atrovirens. Non-melanized fungi were also found, such as Geosmithia sp., Penicillium sp. and Rhodotorula mucilaginosa. The temperature tests showed that isolated black fungi were not able to grow at 37°C, however, this temperature proved to be fungistatic to 43% of them. According to literature, all black fungi isolated in this study are opportunistic pathogens and additional studies are necessary to evaluate the risk that these micro-organisms offer to health, once they were isolated from domestic environments