Recombinant human tumor necrosis factor: an efficient agent for cancer treatment.

Recombinant human TNF (rhTNF) has a selective effect on endothelial cells in tumour angiogenic vessels. Its clinical use has been limited because of its property to induce vascular collapsus. TNF administration through isolated limb perfusion (ILP) for regionally advanced melanomas and soft tissue sarcomas of the limbs was shown to be safe and efficient. When combined to the alkylating agent melphalan, a single ILP produces a very high objective response rate. ILP with TNF and melphalan provided the proof of concept that a vasculotoxic strategy combined to chemotherapy may produce a strong anti-tumour effect. The registered indication of TNF-based ILP is a regional therapy for regionally spread tumours. In soft tissue sarcomas, it is a limb sparing neoadjuvant treatment and, in melanoma in-transit metastases, a curative treatment. Despite its demonstrated regional efficiency TNF-based ILP is unlikely to have any impact on survival. High TNF dosages induce endothelial cells apoptosis, leading to vascular destruction. However, lower TNF dosage produces a very strong effect that is to increase the drug penetration into the tumour, presumably by decreasing the intratumoural hypertension resulting in better tumour uptake. TNF-ILP allowed the identification of the role of alphaVbeta3 integrin deactivation as an important mechanism of antiangiogenesis. Several recent studies have shown that TNF targeting is possible, paving the way to a new opportunity to administer TNF systemically for improving cancer drug penetration. TNF was the first agent registered for the treatment of cancer that improves drug penetration in tumours and selectively destroys angiogenic vessels.

Efficient targeted transcript discovery via array-based normalization of RACE libraries.

Rapid amplification of cDNA ends (RACE) is a widely used approach for transcript identification. Random clone selection from the RACE mixture, however, is an ineffective sampling strategy if the dynamic range of transcript abundances is large. To improve sampling efficiency of human transcripts, we hybridized the products of the RACE reaction onto tiling arrays and used the detected exons to delineate a series of reverse-transcriptase (RT)-PCRs, through which the original RACE transcript population was segregated into simpler transcript populations. We independently cloned the products and sequenced randomly selected clones. This approach, RACEarray, is superior to direct cloning and sequencing of RACE products because it specifically targets new transcripts and often results in overall normalization of transcript abundance. We show theoretically and experimentally that this strategy leads indeed to efficient sampling of new transcripts, and we investigated multiplexing the strategy by pooling RACE reactions from multiple interrogated loci before hybridization.

Oscillations, phase-of-firing coding, and spike timing-dependent plasticity: an efficient learning scheme

Recent experiments have established that information can be encoded in the spike times of neurons relative to the phase of a background oscillation in the local field potential—a phenomenon referred to as “phase-of-firing coding” (PoFC). These firing phase preferences could result from combining an oscillation in the input current with a stimulus-dependent static component that would produce the variations in preferred phase, but it remains unclear whether these phases are an epiphenomenon or really affect neuronal interactions—only then could they have a functional role. Here we show that PoFC has a major impact on downstream learning and decoding with the now well established spike timing-dependent plasticity (STDP). To be precise, we demonstrate with simulations how a single neuron equipped with STDP robustly detects a pattern of input currents automatically encoded in the phases of a subset of its afferents, and repeating at random intervals. Remarkably, learning is possible even when only a small fraction of the afferents (~10%) exhibits PoFC. The ability of STDP to detect repeating patterns had been noted before in continuous activity, but it turns out that oscillations greatly facilitate learning. A benchmark with more conventional rate-based codes demonstrates the superiority of oscillations and PoFC for both STDP-based learning and the speed of decoding: the oscillation partially formats the input spike times, so that they mainly depend on the current input currents, and can be efficiently learned by STDP and then recognized in just one oscillation cycle. This suggests a major functional role for oscillatory brain activity that has been widely reported experimentally.

Exploring the space of histidine containing dipeptides in search of novel efficient RCS sequestering agents.

The study reports a set of forty proteinogenic histidine-containing dipeptides as potential carbonyl quenchers. The peptides were chosen to cover as exhaustively as possible the accessible chemical space, and their quenching activities toward 4-hydroxy-2-nonenal (HNE) and pyridoxal were evaluated by HPLC analyses. The peptides were capped at the C-terminus as methyl esters or amides to favor their resistance to proteolysis and diastereoisomeric pairs were considered to reveal the influence of configuration on quenching. On average, the examined dipeptides are less active than the parent compound carnosine (βAla + His) thus emphasizing the unfavorable effect of the shortening of the βAla residue as confirmed by the control dipeptide Gly-His. Nevertheless, some peptides show promising activities toward HNE combined with a remarkable selectivity. The results emphasize the beneficial role of aromatic and positively charged residues, while negatively charged and H-bonding side chains show a detrimental effect on quenching. As a trend, ester derivatives are slightly more active than amides while heterochiral peptides are more active than their homochiral diastereoisomer. Overall, the results reveal that quenching activity strongly depends on conformational effects and vicinal residues (as evidenced by the reported QSAR analysis), offering insightful clues for the design of improved carbonyl quenchers and to rationalize the specific reactivity of histidine residues within proteins.

Spiral CT aortography: an efficient technique for the diagnosis of traumatic aortic injury.

The objective of this study was to assess the efficiency of spiral CT (SCT) aortography for diagnosing acute aortic lesions in blunt thoracic trauma patients. Between October 1992 and June 1997, 487 SCT scans of the chest were performed on blunt thoracic trauma patients. To assess aortic injury, the following SCT criteria were considered: hemomediastinum, peri-aortic hematoma, irregular aspect of the aortic wall, aortic pseudodiverticulum, intimal flap and traumatic dissection. Aortic injury was diagnosed on 14 SCT examinations (2.9 %), five of the patients having had an additional digital aortography that confirmed the aortic trauma. Twelve subjects underwent surgical repair of the thoracic aorta, which in all but one case confirmed the aortic injury. Two patients died before surgery from severe brain lesions. The aortic blunt lesions were confirmed at autopsy. According to the follow-up of the other 473 patients, we are aware of no false-negative SCT examination. Our limited series shows a sensitivity of 100 % and specificity of 99.8 % of SCT aortography in the diagnosis of aortic injury. It is concluded that SCT aortagraphy is an accurate diagnostic method for the assessment of aortic injury in blunt thoracic trauma patients.

Efficient self-synchronised blind audio watermarking system based on time domain and FFT amplitude modification

Many audio watermarking schemes divide the audio signal into several blocks such that part of the watermark is embedded into each of them. One of the key issues in these block-oriented watermarking schemes is to preserve the synchronisation, i.e. to recover the exact position of each block in the mark recovery process. In this paper, a novel time domain synchronisation technique is presented together with a new blind watermarking scheme which works in the Discrete Fourier Transform (DFT or FFT) domain. The combined scheme provides excellent imperceptibility results whilst achieving robustness against typical attacks. Furthermore, the execution of the scheme is fast enough to be used in real-time applications. The excellent transparency of the embedding algorithm makes it particularly useful for professional applications, such as the embedding of monitoring information in broadcast signals. The scheme is also compared with some recent results of the literature.

Hiiliteräspalkin kuitulaserhitsaus

Hitsaavassa teollisuudessa kilpailukyvyn säilyttäminen ja mahdollinen parantaminen edellyttää hitsauksen tehokkuuden nostoa. Laserhitsauksen nopeus, tarkkuus, tasainen laatu ja aikaansaatava syvä tunkeuma ovatkin vakiinnuttaneet menetelmän vankan aseman tehokkaana valmistusmenetelmänä. Sähkön ja heliumin hinnan nousu ovat pakottaneet teollisuuden miettimään entistä tehokkaampien ja ympäristöystävällisempien laserlähteiden hankkimista. Kuitulaserin korkea hyötysuhde, hyvä säteenlaatu, suuri teho ja matalat käyttökustannukset ovat herättäneet kiinnostusta laserhitsaavassa teollisuudessa. Diplomityössä keskityttiin kuitulaserhitsauksen soveltamiseen. Työn tavoitteena oli parantaa kuitulaserhitsausmenetelmän ymmärrystä ja saada käsitys siitä, miten valitaan hitsausparametrien arvot, ja soveltuuko kuitulaser teolliseen tuotantoon. Tutkimuksessa pyrittiin löytämään peruskokeilla optimaaliset hitsausparametrit, joilla syntyy hyvin tunkeutunut, vähän huokosia sisältävä, ja ulkoisesti laadukas hitsi, sekä optimaalinen hitsin tunkeumaprofiili. Lopuksi hitsausparametreja testattiin tuotteen hitsauksessa. Kuitulaser soveltuu erinomaisesti hiiliteräksen hitsaukseen ja hyvin erikoislujien terästen hitsaukseen, kun teräksen hiili- ja rikkipitoisuudet ovat matalia. Sillä on laaja parametrialue. Yleisimmät hitsausvirheet ovat vajaa hitsautumissyvyys ja huokoset. Tässä diplomityössä keskityttiin etsimään yhdelle valmistettavalle tuotteelle optimaaliset kuitulaserhitsausparametrit. Kuitulaserin laser- ja prosessiparametrien vaikutusta hitsiin ei ole juurikaan tutkittu. Diplomityön kokeiden perusteella olisi hyvä tehdä eri materiaalien jatkotutkimusta railonvalmistuksen, kuten liitoksen oksidikerroksen ja ilmaraon sekä suojakaasun, vaikutuksesta hitsiin. Kuitulaserin hyvä säteenlaatu ja muut laser-parametrit ovat tuoneet mukanaan prosessiin uusia ilmiöitä, joita on syytä tutkia lisää.

Field performance of new cowpea cultivars inoculated with efficient nitrogen-fixing rhizobial strains in the Brazilian Semiarid

The objective of this work was to evaluate the contribution of efficient nitrogen-fixing rhizobial strains to grain yield of new cowpea cultivars, indicated for cultivation in the Brazilian Semiarid region, in the sub-medium of the São Francisco River Valley. Two experiments were set up at the irrigated perimeters of Mandacaru (Juazeiro, state of Bahia) and Bebedouro (Petrolina, state of Pernambuco). The treatments consisted of single inoculation of five rhizobial strains - BR 3267, BR 3262, INPA 03-11B, UFLA 03-84 (Bradyrhizobiumsp.), and BR 3299T(Microvirga vignae) -, besides a treatment with nitrogen and a control without inoculation or N application. The following cowpea cultivars were evaluated: BRS Pujante, BRS Tapaihum, BRS Carijó, and BRS Acauã. A randomized complete block design, with four replicates, was used. Inoculated plants showed similar grain yield to the one observed with plants fertilized with 80 kg ha-1 N. The cultivars BRS Tapaihum and BRS Pujante stood out in grain yield and protein contents when inoculated, showing their potential for cultivation in the sub-medium of the São Francisco River Valley.

Hitsauksen mekanisointi laivan runkorakenteiden valmistuksessa

Hitsauksen mekanisoinnilla ja erityisesti kevytmekanisoinnilla saavutetaan melko pienin kustannuksin suuria etuja tuottavuudessa, laadussa ja työergonomiassa. Mekanisoinnin avulla voidaan saavuttaa soveltuvissa kohteissa hitsauksen kaariaikasuhteen kaksinkertaistuminen esim. 10 %:sta 20 %:iin. Tämä voi tarkoittaa kohteen kokonaishitsaustyöajan puolittumista. Mekanisoinnin tehokas hyödyntäminen edellyttää kuitenkin, että laitteet ovat helppokäyttöisiä ja haluttuja hitsauksen apuvälineitä. Genesis-projekti, jonka on määrä valmistua syksyllä 2009, tuo uuden haasteen Aker Yardsin Turun telakalle. Aluksen aikaisempia laivoja suurempi koko aiheuttaa haasteita tilankäytölle ja kapasiteetin riittävyydelle. Lisäksi käytettävät rakenteet aiheuttavat tuotantoon erityisiä ongelmia, joihin tämän diplomityön puitteissa on etsitty soveltuvia mekanisointiratkaisuja. Diplomityössä mekanisointilaitehankinnoilla lisättiin telakan laitekantaa ja korvattiin vanhentuneita laitteita. Laitteiden käyttöönotossa tarkasteltiin laitteiden puutteita ja pyrittiin löytämään käytettävyyttä parantavia ratkaisuja. Tässä työssä esitellyillä parannuksilla käytössä oleviin laitteisiin ja työmenetelmiin hitsauksen mekanisoinnin käyttöä voitaisiin lisätä vielä merkittävästi.

Tuotannon ohjattavuuden kehittäminen asiakasohjautuvassa tuotannossa

Työssä selvitettiin tuotannon ohjattavuuden parantamisen mahdollisuuksia keskisuuressa yrityksessä. Työn pyrkimyksenä on laatia pohja täysipainoisen tuotannonohjausjärjestelmän kehittämiselle. Työn teoriaosassa käsitellään tuotannon, tuottavuuden ja tuotannonohjauksen peruskäsitteitä. Lisäksi selvitetään hitsaavan tuotannon kehittämisen keinoja sekä yleisiä hitsaukseen liittyviä käsitteitä. Näiden ohella teoriaosuudessa kerrotaan hieman työn käytännön osaa sivuavista aiheista kuten investointilaskelmista. Käytännön osa jakautuu nykytilan selvittämiseen ja kehityskohteiden laatimiseen. Nykytilaa selvitettiin omilla havainnoilla, haastatteluilla sekä tilaus-toimitusketjun tarkasteluilla. Kehittämisen keinoja olivat pääasiassayrityksen laatutoimintaan liittyvät asiat kuten dokumentointi kaikillaosa-alueilla. Yksittäisiä tuotannon tehokkuutta parantavia toimenpiteitä ovat mm. robottihitsauksen kiinnittimien kehitystoimenpiteet, tuotteiden modulointi ja laserleikkauksen monipuolisempi hyväksikäyttö.