982 resultados para Clinical analysis laboratory


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Glanzmann's thrombasthenia (GT) arises from a qualitative or quantitative defect in the GPIIb-IIIa complex (integrin alphaIIbbeta3), the mediator of platelet aggregation. We describe a patient in whom clinical and laboratory findings typical of type I GT were found together with a second pathology involving neurological and other complications symptomatic of tuberous sclerosis. Analysis of platelet proteins by Western blotting revealed trace amounts of normally migrating GPIIb and equally small amounts of GPIIIa of slightly slower than normal migration. Flow cytometry confirmed a much decreased binding to platelets of monoclonal antibodies to GPIIb, GPIIIa or GPIIb-IIIa, and an antibody to the alphav subunit also showed decreased binding. Nonradioactive PCR single-strand conformation polymorphism analysis followed by direct sequencing of PCR-amplified DNA fragments showed a homozygous point mutation (T to C) at nucleotide 1722 of GPIIIa cDNA and which led to a Cys542-->Arg substitution in the GPIIIa protein. The mutation gave rise to a HinP1 I restriction site in exon 11 of the GPIIIa gene and allele-specific restriction enzyme analysis of family members confirmed that a single mutated allele was inherited from each parent. This amino acid substitution presumably changes the capacity for disulphide bond formation within the cysteine-rich core region of GPIIIa and its study will provide new information on GPIIb-IIIa and alphavbeta3 structure and biosynthesis.

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BACKGROUND: Knowledge of the number of recent HIV infections is important for epidemiologic surveillance. Over the past decade approaches have been developed to estimate this number by testing HIV-seropositive specimens with assays that discriminate the lower concentration and avidity of HIV antibodies in early infection. We have investigated whether this "recency" information can also be gained from an HIV confirmatory assay. METHODS AND FINDINGS: The ability of a line immunoassay (INNO-LIA HIV I/II Score, Innogenetics) to distinguish recent from older HIV-1 infection was evaluated in comparison with the Calypte HIV-1 BED Incidence enzyme immunoassay (BED-EIA). Both tests were conducted prospectively in all HIV infections newly diagnosed in Switzerland from July 2005 to June 2006. Clinical and laboratory information indicative of recent or older infection was obtained from physicians at the time of HIV diagnosis and used as the reference standard. BED-EIA and various recency algorithms utilizing the antibody reaction to INNO-LIA's five HIV-1 antigen bands were evaluated by logistic regression analysis. A total of 765 HIV-1 infections, 748 (97.8%) with complete test results, were newly diagnosed during the study. A negative or indeterminate HIV antibody assay at diagnosis, symptoms of primary HIV infection, or a negative HIV test during the past 12 mo classified 195 infections (26.1%) as recent (< or = 12 mo). Symptoms of CDC stages B or C classified 161 infections as older (21.5%), and 392 patients with no symptoms remained unclassified. BED-EIA ruled 65% of the 195 recent infections as recent and 80% of the 161 older infections as older. Two INNO-LIA algorithms showed 50% and 40% sensitivity combined with 95% and 99% specificity, respectively. Estimation of recent infection in the entire study population, based on actual results of the three tests and adjusted for a test's sensitivity and specificity, yielded 37% for BED-EIA compared to 35% and 33% for the two INNO-LIA algorithms. Window-based estimation with BED-EIA yielded 41% (95% confidence interval 36%-46%). CONCLUSIONS: Recency information can be extracted from INNO-LIA-based confirmatory testing at no additional costs. This method should improve epidemiologic surveillance in countries that routinely use INNO-LIA for HIV confirmation.

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BACKGROUND: Patients with chemotherapy-related neutropenia and fever are usually hospitalized and treated on empirical intravenous broad-spectrum antibiotic regimens. Early diagnosis of sepsis in children with febrile neutropenia remains difficult due to non-specific clinical and laboratory signs of infection. We aimed to analyze whether IL-6 and IL-8 could define a group of patients at low risk of septicemia. METHODS: A prospective study was performed to assess the potential value of IL-6, IL-8 and C-reactive protein serum levels to predict severe bacterial infection or bacteremia in febrile neutropenic children with cancer during chemotherapy. Statistical test used: Friedman test, Wilcoxon-Test, Kruskal-Wallis H test, Mann-Whitney U-Test and Receiver Operating Characteristics. RESULTS: The analysis of cytokine levels measured at the onset of fever indicated that IL-6 and IL-8 are useful to define a possible group of patients with low risk of sepsis. In predicting bacteremia or severe bacterial infection, IL-6 was the best predictor with the optimum IL-6 cut-off level of 42 pg/ml showing a high sensitivity (90%) and specificity (85%). CONCLUSION: These findings may have clinical implications for risk-based antimicrobial treatment strategies.

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BACKGROUND: Influenza-associated myositis (IAM) is an infrequent and poorly known complication of influenza virus infection in children. The aim of this study was to describe five cases of IAM and to review the literature on IAM in children. PATIENTS AND METHODS: We conducted a retrospective analysis of cases of IAM diagnosed at two university children's hospitals in Switzerland during two consecutive influenza seasons. Findings were compared with 39 individual case reports and five publications summarizing an additional 272 cases identified by a medical online library (MEDLINE) search. RESULTS: Overall, 316 cases were analyzed. IAM typically occurred in school-aged children with a 2:1 male predominance. Influenza B and A viruses were identified in 76% and 24% of cases, respectively. The median interval between onset of influenza and onset of IAM was 3 days (range 0-18). The calf muscles were involved alone or together with other muscle groups in 69% and 31% of cases, respectively. Blood creatine phosphokinase (CPK) concentration was invariably elevated. Median duration to clinical recovery was 3 days (range 1-30). Rhabdomyolysis occurred in ten of 316 patients (3%), was more common in girls (80%), more often associated with influenza A (86%), and led to renal failure in eight patients (80%). CONCLUSION: Clinical and laboratory findings of IAM are highly characteristic and allow a rapid diagnosis during the influenza season.

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OBJECTIVES To assess prevalence of anemia and its correlation with NYHA-class in patients with congestive heart failure. BACKGROUND Recently, it was reported that anemia in congestive heart failure patients is common and correlated with the severity of disease. In these patients with anemia, treatment with erythropoietin and intravenous iron improved cardiac function significantly. METHODS 193 patients from a tertiary heart failure outpatient clinic (mean age 54 years) were included in a retrospective analysis. Fourteen patients were in NYHA-class I, 69 class II, 79 class III, and 31 class IV. All patients had clinical and laboratory evaluation, echocardiography and coronary angiography. Patients with secondary anemia or on hemodialysis were excluded. Etiology of heart failure was ischemic in 41%. RESULTS Anemia (hemoglobin<120 g/l) was present in 28 of 193 patients (15%). There was an inverse relationship between NYHA-class and left ventricular ejection fraction (NYHA-class I 45%, class II 32%, class III 25%, class IV 25%). Serum creatinine increased with NYHA-class. Hemoglobin levels were similar in all four NYHA-classes but there were significantly more patients with anemia in NYHA-class III and IV (19%) compared with class I and II (8%, P<0.05). Hemoglobin was similar in surviving patients (mean 140 g/l) and those who died or were transplanted (mean 136 g/l, ns). CONCLUSIONS The prevalence of anemia in our heart failure service is 15% (compared with 56% in the literature) and is correlated to NYHA-class.

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Background: Very few mitochondrial myopathies have been described in horses. Objective: To examine the ultrastructure of muscle mitochondria in equine cases of myopathy of unknown origin. Materials & methods: Biopsies of vastus lateralis of the Musculus quadriceps femoris were taken predominantly immediately post mortem and processed for transmission electron microscopy. As a result, electron micrographs of 90 horses in total were available for analysis comprising 4 control horses, 16 horses suffering from myopathy and 70 otherwise diseased horses. Results: Following a thorough clinical and laboratory work-up, four out of five patients that did not fit into the usual algorithm to detect known causes of myopathy showed ultrastructural mitochondrial alterations. Small mitochondria with zones with complete disruption of cristae associated with lactic acidemia were detected in a 17-year-old pony mare, extremely long and slender mitochondria with longitudinal cristae in a 5-year-old Quarter horse stallion, a mixture of irregular extremely large mitochondria (measuring 2500 by 800 nm) next to smaller ones in an 8-year-old Hanoverian mare and round mitochondria with only few cristae in a 11-year-old pony gelding. It remains uncertain whether the subsarcolemmal mitochondrial accumulations observed in the fifth patient have any pathological significance. Conclusions: Ultrastructural alterations in mitochondria were detected in at least four horses. To conclude that these are due to mitochondrial dysfuntions, biochemical tests should be performed. Practical applications: The possibility of a mitochondrial myopathy should be included in the differential diagnosis of muscle weakness.

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OBJECTIVES The aim of this case series was to introduce a complete digital workflow for the production of monolithic implant crowns. MATERIAL AND METHODS Six patients were treated with implant-supported crowns made of resin nano ceramic (RNC). Starting with an intraoral optical scan (IOS), and following a CAD/CAM process, the monolithic crowns were bonded either to a novel prefabricated titanium abutment base (group A) or to a CAD/CAM-generated individualized titanium abutment (group B) in premolar or molar sites on a soft tissue level dental implant. Economic analyses included clinical and laboratory steps. An esthetic evaluation was performed to compare the two abutment-crown combinations. RESULTS None of the digitally constructed RNC crowns required any clinical adaptation. Overall mean work time calculations revealed obvious differences for group A (65.3 min) compared with group B (86.5 min). Esthetic analysis demonstrated a more favorable outcome for the prefabricated bonding bases. CONCLUSIONS Prefabricated or individualized abutments on monolithic RNC crowns using CAD/CAM technology in a model-free workflow seem to provide a feasible and streamlined treatment approach for single-edentulous space rehabilitation in the posterior region. However, RNC as full-contour material has to be considered experimental, and further large-scale clinical investigations with long-term follow-up observation are necessary.

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Post-traumatic sleep-wake disturbances are common after acute traumatic brain injury. Increased sleep need per 24 h and excessive daytime sleepiness are among the most prevalent post-traumatic sleep disorders and impair quality of life of trauma patients. Nevertheless, the relation between traumatic brain injury and sleep outcome, but also the link between post-traumatic sleep problems and clinical measures in the acute phase after traumatic brain injury has so far not been addressed in a controlled and prospective approach. We therefore performed a prospective controlled clinical study to examine (i) sleep-wake outcome after traumatic brain injury; and (ii) to screen for clinical and laboratory predictors of poor sleep-wake outcome after acute traumatic brain injury. Forty-two of 60 included patients with first-ever traumatic brain injury were available for follow-up examinations. Six months after trauma, the average sleep need per 24 h as assessed by actigraphy was markedly increased in patients as compared to controls (8.3 ± 1.1 h versus 7.1 ± 0.8 h, P < 0.0001). Objective daytime sleepiness was found in 57% of trauma patients and 19% of healthy subjects, and the average sleep latency in patients was reduced to 8.7 ± 4.6 min (12.1 ± 4.7 min in controls, P = 0.0009). Patients, but not controls, markedly underestimated both excessive sleep need and excessive daytime sleepiness when assessed only by subjective means, emphasizing the unreliability of self-assessment of increased sleep propensity in traumatic brain injury patients. At polysomnography, slow wave sleep after traumatic brain injury was more consolidated. The most important risk factor for developing increased sleep need after traumatic brain injury was the presence of an intracranial haemorrhage. In conclusion, we provide controlled and objective evidence for a direct relation between sleep-wake disturbances and traumatic brain injury, and for clinically significant underestimation of post-traumatic sleep-wake disturbances by trauma patients.

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OBJECTIVE The aim of this study was to elucidate the relationship between the echogenicity of carotid artery plaques and the following risk factors: circulating oxLDL, hsCRP, the metabolic syndrome (MetS), and several of the traditional cardiovascular (CV) risk factors. MATERIAL AND METHODS A cross-sectional population-based study of 513 sixty-one-year-old men. The levels of circulating oxLDL were determined in plasma samples by sandwich ELISA utilizing a specific murine monoclonal antibody (mAb-4E6). High-sensitivity CRP was measured in plasma by ELISA. Plaque occurrence, size and echogenicity were evaluated from B-mode ultrasound registrations in the carotid arteries. Plaque echogenicity was assessed based on a four-graded classification scale. RESULTS A higher frequency of echolucent carotid plaques was observed with increasing levels of oxLDL and systolic blood pressure (p = 0.008 and p = 0.041, respectively). Subjects with the MetS had a significantly higher frequency of echogenic plaques than subjects without the MetS (p = 0.009). In a multiple logistic regression analysis, oxLDL turned out to be independently associated with echolucent carotid plaques. CONCLUSIONS The occurrence of echolucent carotid plaques was associated with oxLDL and systolic blood pressure, and oxLDL was associated with echolucent carotid plaques independently of systolic blood pressure.

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Inpatient hyperglycemia has been shown to be associated with higher morbidity and mortality. Treatment of inpatient hyperglycemia reduces morbidity and mortality at least in the intensive care unit. Burden and severity of hyperglycemia in an inpatient population of a cancer center is not known. The study is a secondary analysis of the primary study 'Prevalence of Diabetes in cancer inpatient'. Finger-stick glucose concentration and pharmacy data were collected prospectively for all hospitalizations to a large cancer center. Demographic, clinical and laboratory data were collected in a retrospective fashion. Between May 1 and July 31, 2006; 3,940 patients were admitted 5,489 times. Prior to their first admissions, 920(23.4%) of the 3940 patients had unrecognized or recognized hyperglycemia. Glucose was never tested during 1714 (31.8%) hospitalizations, including 170 (12%) of the 1414 admissions of the 920 patients with previous hyperglycemia, and, 109 (58%) of 188 patients who were not tested for glucose prior to their index admissions. Overall, sustained significant hyperglycemia (>= 200 mg/dL on two separate days) was present in 765 (13.9%). Antidiabetic treatment was dispensed in 1168 (21.3%), though 627 (53.7%) of these received only short/rapid acting insulin, and, 951 (17.3%)diabetes code before and in another 80 (1.5%) during stay in hospital, out of total 5489 admissions. Therefore diabetes mellitus or hyperglycemia affected 1525 (27.8%) out of all admissions and coding alone as a criterion for diagnosis of hyperglycemia would have underreported it by 32%. Hyperglycemia occurred more commonly during hospitalization of patients with older age, males, ethnic minorities, advanced malignancies, and those receiving glucocorticoids, parenteral nutrition, and those who had a past history of coding for diabetes or past hyperglycemia, but not in those with the cancers reported to be associated with diabetes mellitus. Of the recognized diabetics half had sustained significant hyperglycemia and 10% had three quarters glucoses tested above 180 mg/dL. To conclude, diabetes affects at least 27.8% of inpatients at our cancer center. Coding for diabetes significantly underreports the burden of the disease. Significant sustained hyperglycemia of >=200 mg/dL among inpatients at a cancer center is common, under-recognized, and either untreated or inadequately treated with suboptimal glycemic control. The implications of hyperglycemia in cancer inpatient populations need further investigations. Fasting serum or plasma glucose should be checked routinely for every patient admitted to a cancer hospital, to recognize and treat hyperglycemia as clinically appropriate.^

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Dental caries is the most common chronic disease worldwide. It is characterized by the demineralization of tooth enamel caused by acid produced by cariogenic dental bacteria growing on tooth surfaces, termed bacterial biofilms. Cariogenesis is a complex biological process that is influence by multiple factors and is not attributed to a sole causative agent. Instead, caries is associated with multispecies microbial biofilm communities composed of some bacterial species that directly influence the development of a caries lesion and other species that are seemingly benign but must contribute to the community in an uncharacterized way. Clinical analysis of dental caries and its microbial populations is challenging due to many factors including low sensitivity of clinical measurement tools, variability in saliva chemistry, and variation in the microbiota. Our laboratory has developed an in vitro anaerobic biofilm model for dental carries to facilitate both clinical and basic research-based analyses of the multispecies dynamics and individual factors that contribute to cariogenicity. The rational for development of this system was to improve upon the current models that lack key elements. This model places an emphasis on physiological relevance and ease of maintenance and reproducibility. The uniqueness of the model is based on integrating four critical elements: 1) a biofilm community composed of four distinct and representative species typically associated with dental caries, 2) a semi-defined synthetic growth medium designed to mimic saliva, 3) physiologically relevant biofilm growth substrates, and 4) a novel biofilm reactor device designed to facilitate the maintenance and analysis. Specifically, human tooth sections or hydroxyapatite discs embedded into poly(methyl methacrylate) (PMMA) discs are incubated for an initial 24 hr in a static inverted removable substrate (SIRS) biofilm reactor at 37°C under anaerobic conditions in artificial saliva (CAMM) without sucrose in the presence of 1 X 106 cells/ml of each Actinomyces odontolyticus, Fusobacterium nucleatum, Streptococcus mutans, and Veillonella dispar. During days 2 and 3 the samples are maintained continually in CAMM with various exposures to 0.2% sucrose; all of the discs are transferred into fresh medium every 24 hr. To validate that this model is an appropriate in vitro representation of a caries-associated multispecies biofilm, research aims were designed to test the following overarching hypothesis: an in vitro anaerobic biofilm composed of four species (S. mutans, V. dispar, A. odontolyticus, and F. nucleatum) will form a stable biofilm with a community profile that changes in response to environmental conditions and exhibits a cariogenic potential. For these experiments the biofilms as described above were exposed on days 2 and 3 to either CAMM lacking sucrose (no sucrose), CAMM with 0.2% sucrose (constant sucrose), or were transferred twice a day for 1 hr each time into 0.2% sucrose (intermittent sucrose). Four types of analysis were performed: 1) fluorescence microscopy of biofilms stained with Syto 9 and hexidium idodine to determine the biofilm architecture, 2) quantitative PCR (qPCR) to determine the cell number of each species per cm2, 3) vertical scanning interferometry (VSI) to determine the cariogenic potential of the biofilms, and 4) tomographic pH imaging using radiometric fluorescence microscopy after exposure to pH sensitive nanoparticles to measure the micro-environmental pH. The qualitative and quantitative results reveal the expected dynamics of the community profile when exposed to different sucrose conditions and the cariogenic potential of this in vitro four-species anaerobic biofilm model, thus confirming its usefulness for future analysis of primary and secondary dental caries.

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Ceruloplasmin is an abundant alpha 2-serum glycoprotein that contains 95% of the copper found in the plasma of vertebrate species. We report here on the identification of a genetic defect in the ceruloplasmin gene in a patient previously noted to have a total absence of circulating serum ceruloplasmin in association with late-onset retinal and basal ganglia degeneration. In this patient T2 (transverse relaxation time)-weighted magnetic resonance imaging of the brain revealed basal ganglia densities consistent with iron deposition, and liver biopsy confirmed the presence of excess iron. Although Southern blot analysis of the patient's DNA was normal, PCR amplification of 18 of the 19 exons composing the human ceruloplasmin gene revealed a distinct size difference in exon 7. DNA sequence analysis of this exon revealed a 5-bp insertion at amino acid 410, resulting in a frame-shift mutation and a truncated open reading frame. The validity of this mutation was confirmed by analysis of DNA from the patient's daughter, which revealed heterozygosity for this same 5-bp insertion. The presence of this mutation in conjunction with the clinical and pathologic findings demonstrates an essential role for ceruloplasmin in human biology and identifies aceruloplasminemia as an autosomal recessive disorder of iron metabolism. These findings support previous studies that identified ceruloplasmin as a ferroxidase and are remarkably consistent with recent studies on the essential role of a homologous copper oxidase in iron metabolism in yeast. The clinical and laboratory findings suggest that additional patients with movement disorders and nonclassical Wilson disease should be examined for ceruloplasmin gene mutations.

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Riassunto La spettrometria di massa (MS) nata negli anni ’70 trova oggi, grazie alla tecnologia Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight (MALDI-TOF), importanti applicazioni in diversi settori: biotecnologico (per la caratterizzazione ed il controllo di qualità di proteine ricombinanti ed altre macromolecole), medico–clinico (per la diagnosi di laboratorio di malattie e per lo sviluppo di nuovi trattamenti terapeutici mirati), alimentare ed ambientale. Negli ultimi anni, questa tecnologia è diventata un potente strumento anche per la diagnosi di laboratorio in microbiologia clinica, rivoluzionando il flusso di lavoro per una rapida identificazione di batteri e funghi, sostituendo l’identificazione fenotipica convenzionale basata su saggi biochimici. Attualmente mediante MALDI-TOF MS sono possibili due diversi approcci per la caratterizzazione dei microrganismi: (1) confronto degli spettri (“mass spectra”) con banche dati contenenti profili di riferimento (“database fingerprints”) e (2) “matching” di bio-marcatori con banche dati proteomiche (“proteome database”). Recentemente, la tecnologia MALDI-TOF, oltre alla sua applicazione classica nell’identificazione di microrganismi, è stata utilizzata per individuare, indirettamente, meccanismi di resistenza agli antibiotici. Primo scopo di questo studio è stato verificare e dimostrare l’efficacia identificativa della metodica MALDI-TOF MS mediante approccio di comparazione degli spettri di differenti microrganismi di interesse medico per i quali l’identificazione risultava impossibile a causa della completa assenza o presenza limitata, di spettri di riferimento all’interno della banca dati commerciale associata allo strumento. In particolare, tale scopo è stato raggiunto per i batteri appartenenti a spirochete del genere Borrelia e Leptospira, a miceti filamentosi (dermatofiti) e protozoi (Trichomonas vaginalis). Secondo scopo di questo studio è stato valutare il secondo approccio identificativo basato sulla ricerca di specifici marcatori per differenziare parassiti intestinali di interesse medico per i quali non è disponibile una banca dati commerciale di riferimento e la sua creazione risulterebbe particolarmente difficile e complessa, a causa della complessità del materiale biologico di partenza analizzato e del terreno di coltura nei quali questi protozoi sono isolati. Terzo ed ultimo scopo di questo studio è stata la valutazione dell’applicabilità della spettrometria di massa con tecnologia MALDI-TOF per lo studio delle resistenze batteriche ai carbapenemi. In particolare, è stato messo a punto un saggio di idrolisi dei carbapenemi rilevata mediante MALDI-TOF MS in grado di determinare indirettamente la produzione di carbapenemasi in Enterobacteriaceae. L’efficacia identificativa della metodica MALDI-TOF mediante l’approccio di comparazione degli spettri è stata dimostrata in primo luogo per batteri appartenenti al genere Borrelia. La banca dati commerciale dello strumento MALDI-TOF MS in uso presso il nostro laboratorio includeva solo 3 spettri di riferimento appartenenti alle specie B. burgdorferi ss, B. spielmani e B. garinii. L’implementazione del “database” con specie diverse da quelle già presenti ha permesso di colmare le lacune identificative dovute alla mancanza di spettri di riferimento di alcune tra le specie di Borrelia più diffuse in Europa (B. afzelii) e nel mondo (come ad esempio B. hermsii, e B. japonica). Inoltre l’implementazione con spettri derivanti da ceppi di riferimento di specie già presenti nel “database” ha ulteriormente migliorato l’efficacia identificativa del sistema. Come atteso, il ceppo di isolamento clinico di B. lusitaniae (specie non presente nel “database”) è stato identificato solo a livello di genere corroborando, grazie all’assenza di mis-identificazione, la robustezza della “nuova” banca dati. I risultati ottenuti analizzando i profili proteici di ceppi di Borrelia spp. di isolamento clinico, dopo integrazione del “database” commerciale, indicano che la tecnologia MALDI-TOF potrebbe essere utilizzata come rapida, economica ed affidabile alternativa ai metodi attualmente utilizzati per identificare ceppi appartenenti a questo genere. Analogamente, per il genere Leptospira dopo la creazione ex-novo della banca dati “home-made”, costruita con i 20 spettri derivati dai 20 ceppi di riferimento utilizzati, è stata ottenuta una corretta identificazione a livello di specie degli stessi ceppi ri-analizzati in un esperimento indipendente condotto in doppio cieco. Il dendrogramma costruito con i 20 MSP-Spectra implementati nella banca dati è formato da due rami principali: il primo formato dalla specie non patogena L. biflexa e dalla specie a patogenicità intermedia L. fainei ed il secondo che raggruppa insieme le specie patogene L. interrogans, L. kirschneri, L. noguchii e L. borgpetersenii. Il secondo gruppo è ulteriormente suddiviso in due rami, contenenti rispettivamente L. borgpetersenii in uno e L. interrogans, L. kirschneri e L. noguchii nell’altro. Quest’ultimo, a sua volta, è suddiviso in due rami ulteriori: il primo comprendente la sola specie L. noguchii, il secondo le specie L. interrogans e L. kirshneri non separabili tra loro. Inoltre, il dendrogramma costruito con gli MSP-Spectra dei ceppi appartenenti ai generi Borrelia e Leptospira acquisiti in questo studio, e appartenenti al genere Brachyspira (implementati in un lavoro precedentemente condotto) mostra tre gruppi principali separati tra loro, uno per ogni genere, escludendo possibili mis-identificazioni tra i 3 differenti generi di spirochete. Un’analisi più approfondita dei profili proteici ottenuti dall’analisi ha mostrato piccole differenze per ceppi della stessa specie probabilmente dovute ai diversi pattern proteici dei distinti sierotipi, come confermato dalla successiva analisi statistica, che ha evidenziato picchi sierotipo-specifici. È stato, infatti, possibile mediante la creazione di un modello statistico dedicato ottenere un “pattern” di picchi discriminanti in grado di differenziare a livello di sierotipo sia i ceppi di L. interrogans sia i ceppi di L. borgpetersenii saggiati, rispettivamente. Tuttavia, non possiamo concludere che i picchi discriminanti da noi riportati siano universalmente in grado di identificare il sierotipo dei ceppi di L. interrogans ed L. borgpetersenii; i picchi trovati, infatti, sono il risultato di un’analisi condotta su uno specifico pannello di sierotipi. È stato quindi dimostrato che attuando piccoli cambiamenti nei parametri standardizzati come l’utilizzo di un modello statistico e di un programma dedicato applicato nella routine diagnostica è possibile utilizzare la spettrometria di massa MALDI-TOF per una rapida ed economica identificazione anche a livello di sierotipo. Questo può significativamente migliorare gli approcci correntemente utilizzati per monitorare l’insorgenza di focolai epidemici e per la sorveglianza degli agenti patogeni. Analogamente a quanto dimostrato per Borrelia e Leptospira, l’implementazione della banca dati dello spettrometro di massa con spettri di riferimento di miceti filamentosi (dermatofiti) si è rilevata di particolare importanza non solo per l’identificazione di tutte le specie circolanti nella nostra area ma anche per l’identificazione di specie la cui frequenza nel nostro Paese è in aumento a causa dei flussi migratori dalla zone endemiche (M. audouinii, T. violaceum e T. sudanense). Inoltre, l’aggiornamento del “database” ha consentito di superare la mis-identificazione dei ceppi appartenenti al complesso T. mentagrophytes (T. interdigitale e T. mentagrophytes) con T. tonsurans, riscontrata prima dell’implementazione della banca dati commerciale. Il dendrogramma ottenuto dai 24 spettri implementati appartenenti a 13 specie di dermatofiti ha rivelato raggruppamenti che riflettono quelli costruiti su base filogenetica. Sulla base dei risultati ottenuti mediante sequenziamento della porzione della regione ITS del genoma fungino non è stato possibile distinguere T. interdigitale e T. mentagrophytes, conseguentemente anche gli spettri di queste due specie presentavano picchi dello stesso peso molecoalre. Da sottolineare che il dendrogramma costruito con i 12 profili proteici già inclusi nel database commerciale e con i 24 inseriti nel nuovo database non riproduce l’albero filogenetico per alcune specie del genere Tricophyton: gli spettri MSP già presenti nel database e quelli aggiunti delle specie T. interdigitale e T. mentagrophytes raggruppano separatamente. Questo potrebbe spiegare le mis-identificazioni di T. interdigitale e T. mentagrophytes con T. tonsurans ottenute prima dell’implementazione del database. L’efficacia del sistema identificativo MALDI-TOF è stata anche dimostrata per microrganismi diversi da batteri e funghi per i quali la metodica originale è stata sviluppata. Sebbene tale sistema identificativo sia stato applicato con successo a Trichomonas vaginalis è stato necessario apportare modifiche nei parametri standard previsti per l’identificazione di batteri e funghi. Le interferenze riscontrate tra i profili proteici ottenuti per i due terreni utilizzati per la coltura di questo protozoo e per i ceppi di T. vaginalis hanno, infatti, reso necessario l’utilizzo di nuovi parametri per la creazione degli spettri di riferimento (MSP-Spectra). L’importanza dello sviluppo del nuovo metodo risiede nel fatto che è possibile identificare sulla base del profilo proteico (e non sulla base di singoli marcatori) microorganismi cresciuti su terreni complessi che potrebbero presentare picchi nell'intervallo di peso molecolare utilizzato a scopo identificativo: metaboliti, pigmenti e nutrienti presenti nel terreno possono interferire con il processo di cristallizzazione e portare ad un basso punteggio identificativo. Per T. vaginalis, in particolare, la “sottrazione” di picchi dovuti a molecole riconducibili al terreno di crescita utilizzato, è stata ottenuta escludendo dall'identificazione l'intervallo di peso molecolare compreso tra 3-6 kDa, permettendo la corretta identificazione di ceppi di isolamento clinico sulla base del profilo proteico. Tuttavia, l’elevata concentrazione di parassita richiesta (105 trofozoiti/ml) per una corretta identificazione, difficilmente ottenibile in vivo, ha impedito l’identificazione di ceppi di T. vaginalis direttamente in campioni clinici. L’approccio identificativo mediante individuazione di specifici marcatori proteici (secondo approccio identificativo) è stato provato ed adottato in questo studio per l’identificazione e la differenziazione di ceppi di Entamoeba histolytica (ameba patogena) ed Entamoeba dispar (ameba non patogena), specie morfologiacamente identiche e distinguibili solo mediante saggi molecolari (PCR) aventi come bersaglio il DNA-18S, che codifica per l’RNA della subunità ribosomiale minore. Lo sviluppo di tale applicazione ha consentito di superare l’impossibilità della creazione di una banca dati dedicata, a causa della complessità del materiale fecale di partenza e del terreno di coltura impiagato per l’isolamento, e di identificare 5 picchi proteici in grado di differenziare E. histolytica da E. dispar. In particolare, l’analisi statistica ha mostrato 2 picchi specifici per E. histolytica e 3 picchi specifici per E. dispar. L’assenza dei 5 picchi discriminanti trovati per E. histolytica e E. dispar nei profili dei 3 differenti terreni di coltura utilizzati in questo studio (terreno axenico LYI-S-2 e terreno di Robinson con e senza E. coli) permettono di considerare questi picchi buoni marcatori in grado di differenziare le due specie. La corrispondenza dei picchi con il PM di due specifiche proteine di E. histolytica depositate in letteratura (Amoebapore A e un “unknown putative protein” di E. histolytica ceppo di riferimento HM-1:IMSS-A) conferma la specificità dei picchi di E. histolytica identificati mediante analisi MALDI-TOF MS. Lo stesso riscontro non è stato possibile per i picchi di E. dispar in quanto nessuna proteina del PM di interesse è presente in GenBank. Tuttavia, va ricordato che non tutte le proteine E. dispar sono state ad oggi caratterizzate e depositate in letteratura. I 5 marcatori hanno permesso di differenziare 12 dei 13 ceppi isolati da campioni di feci e cresciuti in terreno di Robinson confermando i risultati ottenuti mediante saggio di Real-Time PCR. Per un solo ceppo di isolamento clinico di E. histolytica l’identificazione, confermata mediante sequenziamento della porzione 18S-rDNA, non è stata ottenuta mediante sistema MALDI-TOF MS in quanto non sono stati trovati né i picchi corrispondenti a E. histolytica né i picchi corrispondenti a E. dispar. Per questo ceppo è possibile ipotizzare la presenza di mutazioni geno/fenotipiche a livello delle proteine individuate come marcatori specifici per E. histolytica. Per confermare questa ipotesi sarebbe necessario analizzare un numero maggiore di ceppi di isolamento clinico con analogo profilo proteico. L’analisi condotta a diversi tempi di incubazione del campione di feci positivo per E. histolytica ed E. dipar ha mostrato il ritrovamento dei 5 picchi discriminanti solo dopo 12 ore dall’inoculo del campione nel terreno iniziale di Robinson. Questo risultato suggerisce la possibile applicazione del sistema MALDI-TOF MS per identificare ceppi di isolamento clinico di E. histolytica ed E. dipar nonostante la presenza di materiale fecale che materialmente può disturbare e rendere difficile l’interpretazione dello spettro ottenuto mediante analisi MALDI-TOF MS. Infine in questo studio è stata valutata l’applicabilità della tecnologia MALDI-TOF MS come saggio fenotipico rapido per la determinazione di ceppi produttori di carbapenemasi, verificando l'avvenuta idrolisi del meropenem (carbapeneme di riferimento utilizzato in questo studio) a contatto con i ceppi di riferimento e ceppi di isolamento clinico potenzialmente produttori di carbapenemasi dopo la messa a punto di un protocollo analitico dedicato. Il saggio di idrolisi del meropenem mediante MALDI-TOF MS ha dimostrato la presenza o l’assenza indiretta di carbapenemasi nei 3 ceppi di riferimento e nei 1219 (1185 Enterobacteriaceae e 34 non-Enterobacteriaceae) ceppi di isolamento clinico inclusi nello studio. Nessuna interferenza è stata riscontrata per i ceppi di Enterobacteriaceae variamente resistenti ai tre carbapenemi ma risultati non produttori di carbapenemasi mediante i saggi fenotipici comunemente impiegati nella diagnostica routinaria di laboratorio: nessuna idrolisi del farmaco è stata infatti osservata al saggio di idrolisi mediante MALDI-TOF MS. In un solo caso (ceppo di K. pneumoniae N°1135) è stato ottenuto un profilo anomalo in quanto presenti sia i picchi del farmaco intatto che quelli del farmaco idrolizzato. Per questo ceppo resistente ai tre carbapenemi saggiati, negativo ai saggi fenotipici per la presenza di carbapenemasi, è stata dimostrata la presenza del gene blaKPC mediante Real-Time PCR. Per questo ceppo si può ipotizzare la presenza di mutazioni a carico del gene blaKPC che sebbene non interferiscano con il suo rilevamento mediante PCR (Real-Time PCR positiva), potrebbero condizionare l’attività della proteina prodotta (Saggio di Hodge modificato e Test di Sinergia negativi) riducendone la funzionalità come dimostrato, mediante analisi MALDI-TOF MS, dalla presenza dei picchi relativi sia all’idrolisi del farmaco sia dei picchi relativi al farmaco intatto. Questa ipotesi dovrebbe essere confermata mediante sequenziamento del gene blaKPC e successiva analisi strutturale della sequenza amminoacidica deducibile. L’utilizzo della tecnologia MALDI-TOF MS per la verifica dell’avvenuta idrolisi del maropenem è risultato un saggio fenotipico indiretto in grado di distinguere, al pari del test di Hodge modificato impiegato comunemente nella routine diagnostica in microbiologia, un ceppo produttore di carbapenemasi da un ceppo non produttore sia per scopi diagnostici che per la sorveglianza epidemiologica. L’impiego del MALDI-TOF MS ha mostrato, infatti, diversi vantaggi rispetto ai metodi convenzionali (Saggio di Hodge modificato e Test di Sinergia) impiegati nella routine diagnostica di laboratorio i quali richiedono personale esperto per l’interpretazione del risultato e lunghi tempi di esecuzione e di conseguenza di refertazione. La semplicità e la facilità richieste per la preparazione dei campioni e l’immediata acquisizione dei dati rendono questa tecnica un metodo accurato e rapido. Inoltre, il metodo risulta conveniente dal punto di vista economico, con un costo totale stimato di 1,00 euro per ceppo analizzato. Tutte queste considerazioni pongono questa metodologia in posizione centrale in ambito microbiologico anche nel caso del rilevamento di ceppi produttori di carbapenemasi. Indipendentemente dall’approccio identificativo utilizzato, comparato con i metodi convenzionali il MALDI-TOF MS conferisce in molti casi un guadagno in termini di tempo di lavoro tecnico (procedura pre-analititca per la preparazione dei campioni) e di tempo di ottenimento dei risultati (procedura analitica automatizzata). Questo risparmio di tempo si accentua quando sono analizzati in contemporanea un maggior numero di isolati. Inoltre, la semplicità e la facilità richieste per la preparazione dei campioni e l’immediata acquisizione dei dati rendono questo un metodo di identificazione accurato e rapido risultando più conveniente anche dal punto di vista economico, con un costo totale di 0,50 euro (materiale consumabile) per ceppo analizzato. I risultati ottenuti dimostrano che la spettrometria di massa MALDI-TOF sta diventando uno strumento importante in microbiologia clinica e sperimentale, data l’elevata efficacia identificativa, grazie alla disponibilità sia di nuove banche dati commerciali sia di aggiornamenti delle stesse da parte di diversi utenti, e la possibilità di rilevare con successo anche se in modo indiretto le antibiotico-resistenze.

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INTRODUÇÃO: A incidência de pacientes apresentando alergia à proteína do leite de vaca (APLV) após os 5 anos de idade vem crescendo. Definir se estes pacientes tolerariam a ingestão de alimento produzido com leite processado a altas temperaturas (LPAT) proporcionaria melhor qualidade de vida, definiria melhor prognóstico e possibilitaria avaliar a indicação de dessensibilização com muffin. OBJETIVO: (1) identificar quais pacientes com APLV persistente aos quatro anos poderiam tolerar a ingestão de LPAT, (2) descrever as características clínicas e laboratoriais dos grupos reativo e não reativo ao LPAT, e (3) compara-las entre os dois grupos. MÉTODOS: Estudo transversal, utilizando amostra de conveniência, incluindo todos os pacientes acompanhados no ambulatório de alergia alimentar do Instituto da Criança HCFMUSP que preenchiam os critérios de inclusão e que concordaram em realizar o TPO, entre janeiro/2013 e novembro/2014. Os pacientes foram admitidos em hospital-dia sob supervisão médica e submetidos à ingestão de um muffin contendo 2,8 gramas de proteína do leite de vaca. Foram definidos como tolerantes se não apresentassem nenhuma reação alérgica. Estes pacientes foram submetidos na sequência a novo TPO com leite de vaca in natura para excluir a tolerância ao leite de vaca. RESULTADOS: Foram realizados 38 TPO com LPAT, sendo que 30 pacientes (15 masculinos) preencheram todos os critérios de inclusão. A mediana da idade foi de 7 anos e 7 meses (4a10m -14a2m). 14 pacientes (46%) não apresentaram reação após a ingestão do muffin, sendo considerados como não reativos. A análise comparativa entre os grupos reativos e não reativos ao LPAT, não mostrou diferença estatisticamente significante quanto às características clínicas: idade (p=0,8), sexo (p=0,4), história pessoal de rinite (p=0,7), história pessoal de asma (p=0,7), história pessoal de outras alergias (p=0,6), história familiar de rinite (p=0,7), história familiar de asma (p=0,3), história familiar de outras alergias (p=0,1), relato de anafilaxia prévia (p=0,07), relato de ingestão de traços de leite previamente ao TPO (p=0,4), relato de reação alérgica no último ano antes da provocação (p=0,6), relato de anafilaxia no último ano antes do TPO (p=0,6). Não se observou diferença estatisticamente significante entre os dois grupos para IgE total (p=0,1) e eosinófilos (p=0,6). O teste de puntura para leite de vaca e frações mostrou diferença estatisticamente significante para ?-lactoalbumina (p= 0,01) e para a caseína (p = 0,004); em relação ao ImmunoCAP® apenas para a caseína (p= 0,05) essa diferença foi significante. Ao avaliar estes pacientes 1 ano após o TPO, nenhum dos 16 pacientes que foram reativos ao LPAT estava ingerindo leite de vaca, enquanto 28% dos pacientes que foram tolerantes ao LPAT estavam consumindo leite de vaca in natura sem reação (p=0,037). CONCLUSÃO: O estudo mostrou que os pacientes com APLV desta amostra brasileira apresentaram 2 diferentes fenótipos, sendo que aproximadamente metade tolerou o LPAT. Sendo assim, o TPO para LPAT deve ser considerado para pacientes com APLV, sempre sob supervisão médica e estrutura segura e adequada, pois pode contribuir para uma mudança no paradigma do seguimento destes pacientes. Teste de puntura e ImmunoCAP® para caseína podem sugerir quais pacientes estariam tolerantes ao TPO com LPAT, reforçando dados da literatura internacional

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Introdução. Apesar das evidências dos efeitos imunomodulatórios da morfina, não há na literatura estudos que tenham comparado a interação entre citocinas, imunidade celular (linfócitos T, B e NK) e a administração prolongada de morfina administrada pelas vias oral ou intratecal em doentes com dor crônica neuropática não relacionada ao câncer. Foram avaliados de forma transversal e comparativa 50 doentes com diagnóstico de dor lombar crônica e com presença de radiculopatia (dor neuropática) previamente operados para tratar hérnia discal lombar (Síndrome Dolorosa Pós- Laminectomia), sendo 18 doentes tratados prolongadamente com infusão de morfina pela via intratecal com uso de sistema implantável no compartimento subaracnóideo (grupo intratecal); 17 doentes tratados prolongadamente com morfina pela via oral (n=17) e 15 doentes tratados com fármacos mas sem opióides (grupo sem opioide). Foram analisadas as concentração das citocinas IL-2, IL-4, IL-8, TNFalfa, IFNy, IL-5, GM-CSF, IL-6, IL-10 e IL-1beta no plasma e no líquido cefalorraquidiano; imunofenotipagem de linfócitos T, B e células NK e avaliados os Índice de Escalonamento de Opióide (em percentagem de opióide utilizada e em mg), dose cumulativa de morfina (mg), duração do tratamento em meses, dose final de morfina utilizada (em mg), e equivalente de morfina por via oral (em mg). Resultados. Não houve diferença estatisticamente significativa entre o número de linfócitos T, B e NK nos doentes com morfina administrada pelas vias IT, VO e os não usuários de morfina. Houve correlação positiva entre as concentrações de linfócitos T CD4 e o Índice de Escalonamento de Opióide (em % e mg) nos doentes tratados com morfina por via intratecal. Houve correlação negativa entre as concentrações de células NK (CD56+) e o Índice de Escalonamento de Opióide (em % e mg) nos doentes tratados com morfina por via intratecal. Houve correlação positiva entre o número de células NK (CD56+) e a dose cumulativa de morfina (em mg) administrada pelas vias intratecal e oral. Houve correlação positiva entre as concentrações de linfócitos T CD8 e a duração do tratamento em meses nos doentes tratados com morfina pela via oral. As concentrações de IL-8 e IL-1beta foram maiores no LCR do que no plasma em todos os doentes da amostra analisada. As concentrações de IFNy no LCR foram maiores nos doentes que utilizavam morfina pela via oral e nos não usuários de morfina do que nos que a utilizavam pela via intratecal. As concentrações de plasmáticas de IL-5 foram maiores nos doentes utilizavam morfina pela via oral ou intratecal do que nos que não a utilizavam. A concentração de IL-5 no LCR correlacionou-se negativamente com a magnitude da dor de acordo com a EVA nos doentes tratados com morfina pelas via oral ou intratecal. Nos doentes tratados com morfina pelas via oral ou intratecal, a concentração de IL-2 no LCR correlacionou-se positivamente com a magnitude da dor de acordo com a EVA e negativamente com o Índice de Escalonamento de Opióide (em % e mg) e a dose cumulativa de morfina (em mg). As concentrações plasmáticas de GMCSF foram maiores nos doentes utilizavam morfina pela via oral ou intratecal do que nos não a utilizavam. A concentração de TNFalfa no LCR nos doentes tratados com morfina pela via intratecal correlacionou-se negativamente com o Índice de Escalonamento de Opióide (em % e mg), a dose cumulativa de morfina (em mg) e dose equivalente por via oral (em mg) de morfina. A concentração plasmática das citocinas IL-6 e IL-10 correlacionou-se negativamente com a duração do tratamento (em meses) nos doentes tratados com morfina administrada pela via oral. O Índice de Escalonamento de Opióide (em mg e %) correlacionou-se negativamente com as concentrações no LCR de IL-2 e TNFalfa nos doentes tratados com morfina administrada pela via intratecal. O Índice de Escalonamento de Opióide (em mg e %) correlacionou-se negativamente com as concentrações no LCR de IL-2 e IL-5 nos doentes tratados com morfina administrada pela via oral. Houve correlação negativa entre a intensidade da dor de acordo com a EVA e as concentrações de IL-5 e IL-2 no LCR nos doentes tratados com morfina administrada pelas vias oral e intratecal. Houve correlação negativa entre a intensidade da dor de acordo com a EVA e as concentrações plasmáticas de IL-4 nos doentes tratados com morfina administrada pela via intratecal. Houve correlação negativa entre a intensidade da dor de acordo com a EVA e as concentrações plasmáticas de IL-1beta nos doentes tratados com morfina administrada pela via intratecal. Conclusões: Os resultados sugerem associações entre citocinas e imunidade celular (células T , B e NK) e o tratamento prolongado com morfina administrada pela via oral ou intratecal. Estes resultados podem contribuir para a compreensão da imunomodulação da morfina administrada por diferentes vias em doentes com dor neuropática crônica não oncológica . São necessários mais estudos sobre os efeitos da morfina sobre o sistema imunológico