Estudo comparativo da microflora fúngica de doentes portadores de prótese total acrílica mucosuportada e implantosuportada

Dissertação para obtenção do grau de Mestre no Instituto Superior de Ciências da Saúde Egas Moniz

Candidaemia or Candidasis: Controversy of Staphylococcus Sexually Transmitted Infection?

Herbal medications are becoming increasingly popular but a most-extraordinary claim by traditional/herbal medical practitioners relates to a Gram-positive bacterium, Staphylococcus , which has been depicted as a deadly sexually transmitted disease that manifest in the form of worms and other symptoms; with contributory roles including infertility, sexual dysfunction and impotency. They further boasted that they are the only ones that possessed the remedy (herbal) for the Staphylococcus sexually transmitted scourge. In the absence of distinguishing phenotypic taxonomic tools, Staphylococcus and Candida spp. may be confused for each other. However, Staphylococcus is a bacterium and not an infection; therefore, there must be more to the traditional medical practitioners’ boasts in ability to cure an infection that was not an infection in the first place. In conclusion, the common sense is that candiaemia or candidiasis is most likely the misdiagnosed sexually transmitted Staphylococcus disease, which is of significant human clinical health issue.

MICROBIOLOGICAL ANALYSIS OF TRADITIONALLY FERMENTED MILK SOLD IN KINIGI SECTOR OF MUSANZE DISTRICT IN RWANDA

A research work entitled: “Microbiological analysis of traditionally fermented milk (Ikivuguto) sold in Kinigi Sector of Musanze District,” was carried out at Higher Learning Institution of Applied Sciences (INES-Ruhengeri) Laboratory of Microbiology located near Volcanoes in the Northern Province of Rwanda. The main objective of this work was to determine the microbiological quality of traditionally fermented milk, which is consumed by Kinigi Center local people. The hypothesis was to analyze if traditionally fermented milk commercialized in Kinigi restaurants contained pathogenic bacteria such as fecal coliforms and Escherichia coli , in addition to staphylococci and yeasts. Milk samples were collected from Kinigi sector and examined in the microbiology laboratory in order to assess the microbiological quality and safety of traditionally fermented milk in rural areas. The samples were analyzed qualitatively and quantitatively for the microbes found in fermented milk sold in Kinigi Center, and the results were as follows: 7.21x107 CFU/ml for total counts; 3.89x107 CFU/ml for Lactobacillus ; 2.77x107 CFU/ml for yeasts; 1.196x105 CFU/ml for total coliforms; 9.63x104 CFU/ml for fecal coliforms and 8.92x103 CFU/ml for staphylococci. Biochemical tests were carried out and the results showed that identified pathogens were E. coli, Providencia alcalifaciens , and the staphylococci group. It was found that fermented milk contained genera and species of Staphylococcus haemolyticus , Staphylococcus aureus , Staphylococcus intermedius , Staphylococcus xylosus and Staphylococcus saprophyticus . Findings showed that the commercial milk samples were cross-contaminated by different pathogens from environment. These contaminations could have been due to improper handling, presence of flies, soil erosion, dust from atmosphere, as well as contaminated milk vessels or pots, stirrers and unpasteurized water. It was concluded that local farmers and milk retailers did not adhere to required hygienic conditions for milk safety. In this regard, the sold traditional fermented milk does not meet health and safety standards because people did not respect good manufacturing practices. The hypothesis and main objective were confirmed, because traditionally fermented milk of Kinigi was cross-contaminated before consumption. Thus, it would be better to train farmers in the areas of product hygiene, sanitation and safety during milking, processing and marketing.

The impact of denture related disease on the oral microbiome of denture wearers

Advances in healthcare over the last 100 years has resulted in an ever increasing elderly population. This presents greater challenges for adequate systemic and oral healthcare delivery. With increasing age there is a natural decline in oral health, leading to the loss of teeth and ultimately for some having to wear denture prosthesis. It is currently estimated that approximately one fifth of the UK and US populations have some form of removable prosthesis. The microbiology of denture induced mucosal inflammation is a pivotal factor to consider in denture care management, similar to many other oral diseases of microbial influence, such as caries, gingivitis and periodontitis. Dentures support the growth of microbial biofilms, structures commonly known as denture plaque. Microbiologically, denture stomatitis (DS) is a disease primarily considered to be of yeast aetiology, with the literature disproportionately focussed on Candida spp. However, the denture surface is capable of carrying up to 1011 microbes per milligram, the majority of which are bacteria. Thus it is apparent that denture plaque is more diverse than we assume. There is a fundamental gap in our understanding of the bacterial composition of denture plaque and the role that they may play in denture related disease such as DS. This is categorised as inflammation of the oral mucosa, a disease affecting around half of all denture wearers. It has been proposed that bacteria and fungi interact on the denture surface and that these polymicrobial interactions lead to synergism and increased DS pathogenesis. Therefore, understanding the denture microbiome composition is the key step to beginning to understand disease pathogenesis, and ultimately help improve treatments and identify novel targets for therapeutic and preventative strategies. A group of 131 patients were included within this study in which they provided samples from their dentures, palatal mucosa, saliva and dental plaque. Microbes residing on the denture surface were quantified using standard Miles and Misra culture technique which investigated the presence of Candida, aerobes and anaerobes. These clinical samples also underwent next generation sequencing using the Miseq Illumina platform to give a more global representation of the microbes present at each of these sites in the oral cavity of these denture wearers. This data was then used to compare the composition and diversity of denture, mucosal and dental plaque between one another, as well as between healthy and diseased individuals. Additional comparisons included denture type and the presence or absence of natural teeth. Furthermore, microbiome data was used to assess differences between patients with varying levels of oral hygiene. The host response to the denture microbiome was investigated by screening the patients saliva for the presence and quantification of a range of antimicrobial peptides that are associated with the oral cavity. Based on the microbiome data an in vitro biofilm model was developed that reflected the composition of denture plaque. These biofilms were then used to assess quantitative and compositional changes over time and in response to denture cleansing treatments. Finally, the systemic implications of denture plaque were assessed by screening denture plaque samples for the presence of nine well known respiratory pathogens using quantitative PCR. The results from this study have shown that the bacterial microbiome composition of denture wearers is not consistent throughout the mouth and varies depending on sample site. Moreover, the presence of natural dentition has a significant impact on the microbiome composition. As for healthy and diseased patients the data suggests that compositional changes responsible for disease progression are occurring at the mucosa, and that dentures may in fact be a reservoir for these microbes. In terms of denture hygiene practices, sleeping with a denture in situ was found to be a common occurrence. Furthermore, significant shifts in denture microbiome composition were found in these individuals when compared to the denture microbiome of those that removed their denture at night. As for the host response, some antimicrobial peptides were found to be significantly reduced in the absence of natural dentition, indicating that the oral immune response is gradually impaired with the loss of teeth. This study also identified potentially serious systemic implications in terms of respiratory infection, as 64.6% of patients carried respiratory pathogens on their denture. In conclusion, this is the first study to provide a detailed understanding of the oral microbiome of denture wearers, and has provided evidence that DS development is more complex than simply a candidal infection. Both fungal and bacterial kingdoms clearly play a role in defining the progression of DS. The biofilm model created in this study demonstrated its potential as a platform to test novel actives. Future use of this model will aid in greater understanding of host: biofilm interactions. Such findings are applicable to oral health and beyond, and may help to identify novel therapeutic targets for the treatment of DS and other biofilm associated diseases.

Five-year evaluation of bloodstream yeast infections in a tertiary hospital: the predominance of non-C. albicans Candida species

This is a retrospective observational study of clinical and epidemiologic data from bloodstream yeast infections over 5 years (2004-2008) in a tertiary-care hospital. During this period, there were 52 such infections, at a rate of 2.4 per 1,000 hospital admissions. Non-C. albicans Candida species and other genera were responsible for 82% of infections, with C. tropicalis and C. parapsilosis being the most common. In 2008 no C. albicans infections occurred. Several uncommon fungal pathogens were observed, including Trichosporon asahii, Rhodotorula spp. and Candida zeylanoides. Of 16 isolates tested, 3 (19%) were resistant to fluconazole, including one C. zeylanoides (MIC 8 mu g/ml) and one C. tropicalis (MIC 16 mu g/ml) isolate, as well as intrinsically resistant C. krusei. All isolates tested were susceptible to itraconazole (n = 7) and amphotericin B (n = 8). Yeast infections were associated with severe underlying diseases, mainly hematological/solid cancers (71%), hospitalization in the ICU (41%), central venous catheters (80%), and use of antimicrobials (94%). The overall mortality rate was 50%. Our finding of a predominance of non-C. albicans Candida species infection with uncommon yeasts, and fluconazole resistance, suggests the need for continuous surveillance of fungemia and of antibiotic susceptibility trends, in order to adopt treatment strategies applicable to particular healthcare institutions.

Erucismo por Lonomia spp em Teresópolis, RJ, Brasil: relato de um caso provável e revisão da literatura

Relata-se o caso de um homem de 44 anos, natural do Rio de Janeiro, residente no município de Teresópolis (RJ), vítima de um provável acidente por lagarta do gênero Lonomia, que evoluiu com quadro caracterizado por anemia hemolítica, plaquetopenia e insuficiência renal aguda. O diagnóstico de erucismo por Lonomia foi estabelecido a partir da anamnese e das manifestações clínicas e laboratoriais. O esquema terapêutico, baseado em hemodiálise e hemotransfusão, resultou em excelente resposta clínica. São discutidos os aspectos clínicos e fisiopatológicos do erucismo por Lonomia.

MALDI-TOF MS-based drug susceptibility testing of pathogens: The example of Candida albicans and fluconazole.

MALDI-TOF MS can be used for the identification of microorganism species. We have extended its application to a novel assay of Candida albicans susceptibility to fluconazole, based on monitoring modifications of the proteome of yeast cells grown in the presence of varying drug concentrations. The method was accurate, and reliable, and showed full agreement with the Clinical Laboratory Standards Institute's reference method. This proof-of-concept demonstration highlights the potential for this approach to test other pathogens.

Desempenho operacional de uma colhedora de cana-de-açucar ( Saccarum spp.) em função dos turnos de trabalho

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Efeito do tráfego agrícola na produtividade da cultura de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) nos espaçamentos 1,4 e 1,5m

Pós-graduação em Agronomia (Energia na Agricultura) - FCA

Avaliação do potencial antimicrobiano de Pouteria spp. e de triterpenos quinonametídeos com enfoque no Helicobacter pylori

Pós-graduação em Ciências Farmacêuticas - FCFAR

Propagação vegetativa e produção de mudas de Bauhinia spp

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Presença de Microorganismos dos gêneros staphyococcus e candida na cavidade bucal humana

Pós-graduação em Biopatologia Bucal - ICT

Avaliação da qualidade microbiológica, contagem de Pseudomonas spp, e sua importância durante a obtenção e armazenamento de leite cru refrigerado no período de seca e chuva

Na propriedade rural, onde o leite cru refrigerado fica armazenado até a captação pelo caminhão tanque em coleta a granel, o mesmo é mantido a temperatura de refrigeração entre 1 a 4ºC por longos períodos (até 96 horas), os microrganismos psicrotróficos encontram condições favoráveis para sua multiplicação, produzindo enzimas proteolíticas e lipolíticas termotolerantes, podendo provocar alterações indesejáveis no leite e nos seus derivados. Quando estes microrganismos estão presentes em elevadas populações, pode ser indicativo de baixa qualidade do leite e insatisfatória condições sanitárias para o processamento. Devido a necessidade da melhora da qualidade dos produtos lácteos, objetivou-se a execução desta pesquisa realizando levantamentos sobre o cumprimento dos padrões microbiológicos exigidos pela atual legislação brasileira IN 62 (BRASIL, 2011), pesquisas sobre os microrganismos psicrotróficos, Pseudomonas spp. e produção de enzimas proteolítica e lipolítica por Pseudomonas spp. As coletas foram realizadas em 10 propriedades do Estado de São Paulo na Regional Agrícola do Escritório de Desenvolvimento Rural - EDR Limeira - SP, sendo, 5 propriedades com ordenha manual e 5 propriedades com ordenha mecânica, nos períodos de chuva e seca e em vários pontos durante a obtenção do leite cru refrigerado e também do leite com intervalo de 24 horas até a captação deste leite pelo caminhão. As médias das populações dos microrganismos mesófilos na ordenha manual, foi diferente estatisticamente significativo no leite recém ordenhado (1,52×106 UFC.mL-1) para o leite com 24 horas de armazenamento (2,67×107 UFC.mL-1) no período chuvoso, e na ordenha mecânica, o encontrado foi uma diferença estatisticamente significativa no leite recém ordenhado (3,87×106 UFC.mL-1) para o leite com 24 horas de armazenamento (9,82×108 UFC.mL-1) também no período chuvoso. Nas populações dos microrganismos psicrotróficos, suas médias diferiram estatisticamente na ordenha manual no período da chuva no leite recém ordenhado (1,48×104 UFC.mL-1) para o leite com 48 horas de armazenamento (1,49×105 UFC.mL-1) e na ordenha mecânica, o leite recém ordenhado (8,74×103 UFC.mL-1), com 24 horas de armazenamento (4,33×104 UFC.mL-1) não diferiram entre si e foram diferentes estatisticamente do leite com 48 horas de armazenamento (3,46×105 UFC.mL-1) apresentaram valor elevado, principalmente quando o leite cru refrigerado permanece por longos períodos de armazenamento na propriedade rural, que pode ser um sério fator de comprometimento pela produção de lipases ou proteases principalmente pelas Pseudomonas spp. onde em todos os pontos amostrados foram isolados este microrganismo produzindo enzimas (lipase e/ou protease). A maior porcentagem de atividade lipolítica foi verificada no período seco, já a maior porcentagem de atividade proteolítica foi verificada no período chuvoso. Contudo, deve-se intensificar as medidas de autocontrole para minimizar os efeitos dos microrganismos mesófilos e psicrotróficos sobre a qualidade do leite cru refrigerado e, consequentemente, de seus derivados.

Caracterização genotípica de Arcobacter spp. isolados de carnes de aves comercializadas no Município de São Paulo - SP

Arcobacter spp. é um micro-organismo Gram negativo que provoca diarreia aquosa e sepse em seres humanos. A. butzleri, A. cryaerophilus e A. skirrowii são espécies patogênicas para humanos. O objetivo deste estudo foi detectar a presença de Arcobacter spp. na carne de aves comercializadas em açougues na cidade de São Paulo, verificando os genes de virulência e o perfil genotípico. Um total de 300 cortes de carne de frango foram submetidos ao cultivo e isolamento sob condições aeróbicas, a 30°C por 72 horas. Colônias suspeitas de Arcobacter spp. foram selecionadas para a detecção molecular pela reacção em cadeia da polimerase (PCR), a fim de determinar as espécies e os genes de virulência. Os resultados revelaram a presença de Arcobacter spp. em 18.3% (55/300) de amostras de carne de aves, sendo identificado como A. butzleri 63,6% (35/55) e A. cryaerophilus 36,3% (20/55). Os genes de virulência pesquisados demonstraram positividade de 100% (55/55) para o ciaB e mviN, seguidos de cj1349 98,1% (54/55), pldA 94,4% (52/55), cadF 72,7% (40/55), tlyA 92,7% (51/55), hecA 49% (27/55), irgA 47,2% (26/55) e hecB 34,5% (19/55). Estas cepas foram submetidas ao AFLP gerando dois dendogramas. Foram identificados 19 perfis genotípicos para A. butzleri e 17 para A. cryaerophilus. Os resultados desta pesquisa apontam a presença de A. butzleri e A. cryaerophilus na fase final da distribuição de carne de frangos nos açougues. A falta de inocuidade dos alimentos de origem animal, bem como a presença de estirpes virulentas representam riscos de Saúde Pública, com especial atenção para a possibilidade de contaminação cruzada gerados por alimentos crus e utensílios de cozinha

Uso de Metarhizium spp. na produção de mudas pré-brotadas de cana-de-açúcar e seus efeitos na planta, em pragas e doenças

Os fungos do gênero Metarhizium são entomopatogênicos e ainda apresentam relações endofíticas e podem viver saprofiticamente no solo. A associação desses microrganismos com insetos é bem conhecida, mas as interações diretas com as plantas ainda são incipientes. Objetivou-se com este estudo, determinar a capacidade de colonização endofítica em raízes de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) de M. robertsii, M. anisopliae e três linhagens brasileiras recém-descobertas, bem como revelar o potencial destes fungos como antagonistas a dois fungos fitopatogênicos responsáveis pela podridão-vermelha (Fusarium moniliforme e Colletotrichum falcatum) e no controle de duas importantes pragas, a broca da cana-de-açúcar, Diatraea saccharalis e o nematóide-das-galhas, Meloidogyne javanica. Foram utilizados 24 isolados de Metarhizium spp. nos experimentos de promoção de crescimento de plantas após a inoculação em gemas de cana-de-açúcar em condições de casa-de-vegetação e campo. O efeito da inoculação do fungo em mudas de cana-de-açúcar foi investigado quanto a mortalidade e redução no desenvolvimento de D. saccharalis e redução nas populações de M. javanica. Experimentos de inibição in vitro em cultivo pareado foram conduzidos com os fungos F. moniliforme e C. falcatum e Trichoderma harzianum. Além disto, foram realizados testes qualitativos \"in vitro\" para avaliar a capacidade desses fungos em produzir β-1,3-Glucanase e Sideróforos. A inoculação de Metarhizium de todas as espécies testadas promoveu o crescimento de parte aérea, peso úmido e seco de raízes em relação ao controle (água). Enquanto o tratamento de gemas rotineiramente usado na usina onde se realizou a produção de mudas pré-brotadas com aplicação do fungicida Comet® + o fertilizante Biozyme TF resultou em pegamento de 32% e 59,6%, apenas com o uso de isolados de Metarhizium spp. estes valores foram de até 50% e 86,4%, nos dois experimentos em campo, respectivamente. As mortalidades observadas em lagartas de D. saccharalis que se alimentaram das plantas inoculadas com isolados de Metarhizium spp. atingiram valores de até 80%, sendo a mortalidade confirmada pela esporulação do fungo de até 55%. As lagartas sobreviventes apresentaram menor peso do que aquelas do controle não tratado. A inoculação de Metarhizium spp. em mudas de cana-de-açúcar conferiu proteção a M. javanica, resultando em uma densidade de massa de ovos por grama de raiz nas mudas inoculadas com o fungo até 59,8% menor no primeiro experimento e 64,1% menor no segundo em relação as mudas sem inoculação. Os ensaios de antagonismo mostraram que, todos os isolados de Metarhizium spp. apresentaram alguma forma de inibição tanto para F. moniliforme como para C. falcatum. Dos 24 isolados testados, 20,8% produziram a enzima hidrolítica, β-1,3-glucanase, o que pode estar associado a capacidade de inibição dos fungos fitopatogênicos. Constatou-se que 8 (33,3%) dos isolados produziram sideróforos e sugere que esses fungos apresentam mecanismos de disponibilização do ferro. O conhecimento gerado com este estudo poderá subsidiar novas estratégias de utilização de Metarhizium spp. em campo na produção de MPB de cana-de-açúcar.