Tissue homing and persistence of defined antigen-specific CD8+ tumor-reactive T-cell clones in long-term melanoma survivors.

Tumor antigen-specific cytotoxic T cells (CTLs) play a major role in the adaptive immune response to cancers. This CTL response is often insufficient because of functional impairment, tumor escape mechanisms, or inhibitory tumor microenvironment. However, little is known about the fate of given tumor-specific CTL clones in cancer patients. Studies in patients with favorable outcomes may be very informative. In this longitudinal study, we tracked, quantified, and characterized functionally defined antigen-specific T-cell clones ex vivo, in peripheral blood and at tumor sites, in two long-term melanoma survivors. MAGE-A10-specific CD8+ T-cell clones with high avidity to antigenic peptide and tumor lytic capabilities persisted in peripheral blood over more than 10 years, with quantitative variations correlating with the clinical course. These clones were also found in emerging metastases, and, in one patient, circulating clonal T cells displayed a fully differentiated effector phenotype at the time of relapse. Longevity, tumor homing, differentiation phenotype, and quantitative adaptation to the disease phases suggest the contribution of the tracked tumor-reactive clones in the tumor control of these long-term metastatic survivor patients. Focusing research on patients with favorable outcomes may help to identify parameters that are crucial for an efficient antitumor response and to optimize cancer immunotherapy.

Somatic embryogenesis and plant regeneration in elite clones of Theobroma cacao

The objective of this work was to evaluated a procedure for somatic embryogenesis and regeneration of cacao (Theobroma cacao L.) elite clones. Petal explants from cacao clones TSH 565 and TSH 1188 were cultured on PCG and SCG-2 media, for calli growth. Somatic embryos were formed on the surface of embryogenic calli after transfer to embryo development (ED) medium. Clone TSH 565 showed a higher embryogenic potential than TSH 1188. The best combination of carbon source for embryo induction in ED medium was genotype-specific. Embryogenic callus formations increased in micropore tape-sealed Petri dishes, irrespective of cacao genotype. Mature somatic embryos were successfully converted into plantlets.

Desempenho de clones de copa de seringueira resistentes ao mal-das-folhas

O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho de 18 clones de seringueira resistentes ao Microcyclus ulei, usados como copas enxertadas. Foram utilizados oito clones híbridos de Hevea pauciflora x Hevea guianensis var. marginata, oito de H. pauciflora x H. rigidifolia e dois clones de H. pauciflora, enxertados sobre o painel de CNS AM 7905 - seleção primária de H. brasiliensis - e cultivados em Latossolo Amarelo distrófico, em Manaus, AM. Foram avaliados: perímetro do tronco, estado nutricional e produtividade de borracha seca. Copas enxertadas de híbridos H. pauciflora x H. guianensis var. marginata causam crescimento mais rápido do tronco, com redução do período de imaturidade da seringueira. O alto nível de resistência dos híbridos de H. rigidifolia ao percevejo-de-renda (Leptopharsa heveae) justifica a introdução de outros genótipos dessa espécie para novas hibridações. Os clones CPAA C 01, 06, 13, 15, 16 e 45 apresentam excelente potencial de produção de borracha seca, nas condições climáticas e de solos de terra firme da Amazônia Tropical Úmida.

Classificação da capacidade produtiva de povoamentos não desbastados de clones de eucalipto

O objetivo deste trabalho foi desenvolver e propor um procedimento para a estratificação de florestas de clones de eucalipto não desbastados, para a classificação de sua capacidade produtiva. Utilizaram-se dados provenientes de 70 clones, distribuídos em 5.020 parcelas permanentes de inventários florestais contínuos, com pelo menos três medições, de periodicidade anual, em cada clone. Para todos os clones, foi ajustado o modelo de Schumacher para as variáveis: área basal; altura dominante; diâmetro médio; e volume comercial, com casca. Com esses parâmetros, foi utilizado o método de Tocher, que se mostrou eficiente para agrupar clones com tendências semelhantes de crescimento em altura dominante. A estimativa de índice de local, para clones com menos de três medições, pode ser determinada a partir das informações de altura dominante, diâmetro médio, área basal e volume, obtidas do inventário florestal contínuo de outros clones.

Repetibilidade da produção de sementes em clones de guaraná

O objetivo deste trabalho foi avaliar a repetibilidade da produção de sementes 27 clones guaraná (Paullinia cupana). Os clones foram avaliados em dez ensaios instalados em blocos ao acaso com duas repetições e três plantas por parcela, com espaçamento de 5x5 m. A produção de sementes foi avaliada por quatro anos (1998, 1999, 2000 e 2001) a partir do início da fase produtiva, após dois anos do plantio. O coeficiente de repetibilidade foi estimado pelos métodos: análise de variância (ANOVA), componentes principais com base em matriz de correlações (CPCOR), componentes principais com base em matriz de variâncias e covariâncias fenotípicas (CPCOV) e análise estrutural com base na matriz de correlações (AECOR). Foram estimados também o número mínimo de observações e o coeficiente de determinação. As estimativas dos coeficientes de repetibilidade com base nos quatro anos, nos dez ambientes, foram relativamente baixas - 0,2618 (AECOR), 0,3064 (CPCOR), 0,3183 (ANOVA) e 0,5308 (CPCOV) - e variaram de acordo com o método e o ambiente. São necessários, no mínimo, quatro anos de avaliação para a obtenção de valores genotípicos dos clones com coeficiente de determinação de 80%.

Effects of epitope modification on T cell receptor-ligand binding and antigen recognition by seven H-2Kd-restricted cytotoxic T lymphocyte clones specific for a photoreactive peptide derivative.

We tested for antigen recognition and T cell receptor (TCR)-ligand binding 12 peptide derivative variants on seven H-2Kd-restricted cytotoxic T lymphocytes (CTL) clones specific for a bifunctional photoreactive derivative of the Plasmodium berghei circumsporozoite peptide 252-260 (SYIPSAEKI). The derivative contained iodo-4-azidosalicylic acid in place of PbCS S-252 and 4-azidobenzoic acid on PbCS K-259. Selective photoactivation of the N-terminal photoreactive group allowed crosslinking to Kd molecules and photoactivation of the orthogonal group to TCR. TCR photoaffinity labeling with covalent Kd-peptide derivative complexes allowed direct assessment of TCR-ligand binding on living CTL. In most cases (over 80%) cytotoxicity (chromium release) and TCR-ligand binding differed by less than fivefold. The exceptions included (a) partial TCR agonists (8 cases), for which antigen recognition was five-tenfold less efficient than TCR-ligand binding, (b) TCR antagonists (2 cases), which were not recognized and capable of inhibiting recognition of the wild-type conjugate, (c) heteroclitic agonists (2 cases), for which antigen recognition was more efficient than TCR-ligand binding, and (d) one partial TCR agonist, which activated only Fas (C1)95), but not perforin/granzyme-mediated cytotoxicity. There was no correlation between these divergences and the avidity of TCR-ligand binding, indicating that other factors than binding avidity determine the nature of the CTL response. An unexpected and novel finding was that CD8-dependent clones clearly incline more to TCR antagonism than CD8-independent ones. As there was no correlation between CD8 dependence and the avidity of TCR-ligand binding, the possibility is suggested that CD8 plays a critical role in aberrant CTL function.

Adaptabilidade e estabilidade de clones de guaraná

O objetivo deste trabalho foi determinar parâmetros de adaptabilidade e estabilidade fenotípica de clones de guaraná (Paullinia cupana) no Estado do Amazonas. Foram instalados dez experimentos, em três municípios, nos quais foi avaliado o desempenho produtivo de 27 clones pré-selecionados de guaraná, durante quatro anos. Os experimentos foram instalados em blocos ao acaso, com duas repetições, com parcelas constituídas por três plantas espaçadas em 5x5 m. Foram avaliados quatro métodos de determinação de adaptabilidade e estabilidade. O método não paramétrico de Lin & Binns modificado apresentou resultados satisfatórios e discriminou os clones quanto ao desempenho nos ambientes favoráveis e desfavoráveis e quanto aos graus de estabilidade. O clone CMU871 destacou-se pela ampla adaptabilidade e elevada estabilidade fenotípica. Os clones CMU619 e CMU609 apresentaram adaptabilidade específica a ambientes favoráveis e desfavoráveis, respectivamente.

Controle do mofo-branco com palhada e Trichoderma harzianum 1306 em soja

O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da cobertura vegetal com palhada de Brachiaria ruziziensis, da aplicação de Trichoderma harzianum 1306 e da interação entre esses métodos na redução da densidade de inóculo de Sclerotinia sclerotiorum, na incidência de mofo-branco e na produtividade da soja. As avaliações foram realizadas entre 2006 e 2008 em Jataí, GO, em lavoura comercial, com média de 136,08 escleródios do patógeno m-2. Em março e outubro de 2006, foram aplicados 0, 0,5, 1 e 1,5 L ha-1 do inóculo de T. harzianum 1306 (2x10(9) esporos viáveis mL-1) em parcelas cultivadas com e sem B. ruziziensis. Após dessecação da braquiária com glifosato (2,5 L ha-1) e plantio da soja 'M-Soy 6101' sobre 10,1 Mg ha-1 de palhada, verificou-se redução de 98% de apotécios. Nos tratamentos com palhada e 0,5 e 1 L ha-1 de T. harzianum, verificou-se 72,1 e 84,1% de escleródios parasitados a mais, respectivamente. Em 2006/2007, o rendimento da soja 'M-Soy 6101' foi inversamente proporcional à população de apotécios por metro quadrado, porém 7,6% menor nos tratamentos com palha. Na safra 2007/2008, a incidência da doença em soja 'M-Soy 7908' foi menor nas parcelas com palhada e 0,5 e 1 L ha-1 de T. harzianum 1306, aplicados apenas no ano anterior. O biocontrole com T. harzianum 1306 em campo e uso da palhada de B. ruziziensis é eficiente e viável para o controle do mofo-branco da soja em áreas de Cerrado.

Seleção de clones de batata-doce resistentes a Meloidogyne incognita raça 1

O objetivo deste trabalho foi selecionar clones de batata-doce (Ipomoea batatas) resistentes à raça 1 de Meloidogyne incognita e avaliar a eficiência do método de seleção empregado, pela estimação dos coeficientes de variação genética e ambiental e das herdabilidades no sentido amplo. Foram utilizados 123 genótipos de batata-doce, entre os quais quatro cultivares comerciais - Brazlândia Rosada, Brazlândia Roxa, Brazlândia Branca e Palmas -, e 119 acessos previamente selecionados no programa de melhoramento vegetal da Universidade Federal de Lavras. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos aumentados, com três tratamentos comuns: as cultivares de batata-doce Brazlândia Branca e Palmas, e a cultivar de tomate Santa Clara, suscetível ao nematoide. A classificação dos níveis de resistência foi realizada de acordo com o fator de reprodução do nematoide e o índice de reprodução relativo à cultivar Santa Clara, de tomateiro. A relação entre os coeficientes de variação genética e ambiental e as herdabilidades no sentido amplo foram altas, tanto para o fator de reprodução quanto para o índice de reprodução dos nematoides, o que demonstra a eficiência do método empregado para a seleção de genótipos resistentes. Foram identificados 57 genótipos promissores de batata-doce, resistentes à raça 1 de M. incognita, e selecionados para continuar no programa de melhoramento.

Leaf development and growth of selected sugarcane clones in a subtropical environment

The objective of this work was to compare phyllochron and leaf area on individual stalks of selected sugarcane (Saccharum officinarum) clones grown in a subtropical environment. A two-year field experiment was carried out in Santa Maria, RS, Brazil, during the 2007/2008 and 2008/2009 growing seasons. Three sugarcane clones were used: IAC 822045 (early), SP 711406 (median) and CB 4176 (late), in a complete randomized block design, with four replications. Expanded leaf and total leaf (tips) number were determined, and expanded leaf area was measured. The phyllochron (ºC day leaf-1) based on expanded and tip leaf number was estimated, using 10ºC as base temperature. Allometric relationships between individual area and number of expanded leaves were fitted. Phyllochron was analysed as a four-factor experiment: clone, growing season, phyllochron phase, and phyllochron type. The early clone had the greatest potential for growing in a subtropical climate because of higher leaf output and leaf area.

Growth rate and wood properties of Norway spruce cutting clones on different sites

[Abstract]

Characterization and multivariate classification of grapes and wines of two Cabernet Sauvignon clones

The objective of this work was to assess and characterize two clones, 169 and 685, of Cabernet Sauvignon grapes and to evaluate the wine produced from these grapes. The experiment was carried out in São Joaquim, SC, Brazil, during the 2009 harvest season. During grape ripening, the evolution of physical-chemical properties, phenolic compounds, organic acids, and anthocyanins was evaluated. During grape harvest, yield components were determined for each clone. Individual and total phenolics, individual and total anthocyanins, and antioxidant activity were evaluated for wine. The clones were also assessed regarding the duration of their phenological cycle. During ripening, the evolution of phenolic compounds and of physical-chemical parameters was similar for both clones; however, during harvest, significant differences were observed regarding yield, number of bunches per plant and berries per bunch, leaf area, and organic acid, polyphenol, and anthocyanin content. The wines produced from these clones showed significant differences regarding chemical composition. The clones showed similar phenological cycle and responses to bioclimatic parameters. Principal component analysis shows that clone 685 is strongly correlated with color characteristics, mainly monomeric anthocyanins, while clone 169 is correlated with individual phenolic compounds.

Cooccurrence of predominant Panton-Valentine leukocidin-positive sequence type (ST) 152 and multidrug-resistant ST 241 Staphylococcus aureus clones in Nigerian hospitals.

Ninety-six clinical isolates of Staphylococcus aureus from Nigeria were characterized phenotypically and genetically. Twelve multidrug-resistant methicillin (meticillin)-resistant S. aureus (MRSA) isolates carrying a new staphylococcal cassette chromosome mec element and a high proportion of Panton-Valentine leukocidin (PVL)-positive methicillin-susceptible S. aureus (MSSA) isolates were observed. The cooccurrence of multidrug-resistant MRSA and PVL-positive MSSA isolates entails the risk of emergence of a multidrug-resistant PVL-positive MRSA clone.

Seleção de clones de batata para processamento industrial em condições de clima subtropical e temperado

O objetivo deste trabalho foi selecionar clones de batata para processamento industrial, cultivados em condições de clima subtropical e temperado do Sul do Brasil. Foram avaliados 30 clones avançados e três cultivares (testemunhas), na primavera de 2007 e 2008, e no outono de 2008, em Júlio de Castilhos, RS (condição de clima subtropical), e no verão de 2008 e 2009, em São Joaquim, SC (condição de clima temperado). Utilizou-se o delineamento experimental de blocos ao acaso, em arranjo fatorial (33 clones em 5 ambientes), com duas ou três repetições de dez covas. Foram avaliados: a produção por cova, a aparência, a cor de chips e os teores de matéria seca e de açúcares redutores dos tubérculos. Houve interação significativa entre clones e ambientes para todas as características avaliadas, exceto quanto à cor de chips. A produção por cova e o teor de matéria seca dos tubérculos foram maiores no cultivo de verão. As condições ambientais de cultivo afetaram todos os caracteres avaliados. As condições de cultivo do Sul do Brasil possibilitam a seleção de clones de batata, com suficiente teor de matéria seca, para atender às exigências da indústria de processamento de batata.

Desempenho silvicultural e seleção precoce de clones de híbridos de eucalipto

O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética e o desempenho silvicultural de clones de híbridos interespecíficos de Eucalyptus urophylla, E. globulus, E. maidenii, E. saligna, E. grandis, E. pellita, E. resinifera, E. kirtoniana e E. dunnii, e determinar a viabilidade da seleção precoce em selecionar clones superiores. Os diâmetros do tronco à altura do peito aos três (DAP3) e sete (DAP7) anos de idade e a altura total das árvores aos sete anos de idade foram mensurados. Utilizou-se o delineamento experimental de blocos ao acaso, com 138 clones, 10 repetições e seis plantas por parcela. Os dados foram submetidos à análise de variância e agrupados pelo método das k-médias, tendo-se realizado a comparação de médias e determinado a correlação de Pearson (r) entre as variáveis avaliadas. A validação do agrupamento foi realizada por meio de análise de variância e do teste de Tukey. Os clones de híbridos interespecíficos de Eucalyptus apresentaram variabilidade genética. Foram estabelecidos cinco grupos de clones com base no desempenho silvicultural (DAP3, DAP7 e altura). O DAP3 é altamente correlacionado ao DAP7 e à altura aos sete anos de idade. A seleção com base no DAP3 pode ser utilizada para identificar clones superiores de Eucalyptus com grande vigor de crescimento.