Traduzinho XML para o modelo relacional: experiência no SIGI.

Conversão de dados de banco de dados relacional para/de o formato XML. Arquitetura do SIGI. Bancos de dados relacional e XML. A experiência no SIGI: XML e Oracle 8i. Exemplos.

Entendendo e interpretando os parâmetros utilizados por BLAST.

O método BLAST para determinação de similaridades entre sequências biológicas. Score e matrizes de substituição. Determinação de matrizes de substituição BLOSUM. Determinação de matrizes de substituição PAM. Resultados da teoria Estatística de comparação local de sequências. O Algoritmo usado por BLAST. NCBI-BLAST. Exemplo de busca.

Migrando do Parodox para o Interbase: a experiência do AINFO.

O objetivo do trabalho é relatar a experiência na migração do sistema de automação das bibliotecas da Embrapa - AINFO, em Paradox para o interbase, versào gratuita com código aberto, disponibilizado pela Borland Software Corporation em setembro de 2000. O método utilizado foi o de estudar a viabilidade, performance e aplicação de componentes de acesso nativo Interbase Ex´press (IBX) e Interbase Objects (IBO) que dispensam a Borland Database Engine (BDE) para conexão do sistema ao banco de dados.

Utilização do software GRASP para gerar arquivo de coordenadas com valores de potencial eletrostático.

Com o intuito de disponibilizar um banco de dados de valores de potencial eletrostático para todas as estruturas de proteínas depositadas no PDB, foi utilizado o programa GRASP (Graphical Representation and Analysis of Structural Properties) (Nicholls et al., 1991) para geração deste banco de dados.

Estudo da influência de seqüências polipeptídicas e de códons na determinação da estrutura secundária de proteínas.

O propósito desse trabalho foi descrever e quantificar os casos de polipeptídicos idênticos em diferentes estruturas secundárias, encontrados em banco de dados de estrutura: Protein Data Bank (PDB).

Oracle Discoverer: guia do usuário.

Administration editon. Objetos e operações de uma área de negócios. Discoverer plus. Exportando folhas com o discoverer. Enviando folhas atráves de correio. eletrônico

Criação de um núcleo para a pesquisa e descrição dos serviços oferecidos na área de Bioinformática estrutural.

Instalação e oferta de ferramentas.Computacionais sting millennium suite. (SMS) através da interface web. Criação de novos algoritmos e programas. Para análise estrutural das proteínas. Oferta de banco de dados públicos. Estabelecimento de um ambiente para.Pesquisa e oferta de serviços na área. De bioinformática. Formação de recursos humanos. Organização de cursos e congresso. Projetos em colaboração.

Tradução de interfaces de aplicações para idiomas distintos.

Este documento apresenta o esquema de tradução proposto para as telas de entrada de dados do banco de dados de experimentos em manejo de fertilizantes para cana-de-açúcar.

Projeto físico de Data Warehouse no Oracle: um estudo de caso.

Este trabalho visa compartilhar a experiência no projeto físico de um DW desenvolvido pela Embrapa Informática Agropecuária utilizando o SGBD Oracle. São apresentadas algumas características do Oracle que favorecem a manutenção e o desempenho de consultas a um DW em geral, utilizando como exemplo o DW específico.

Uma introdução a tecnologia de reflexão Java.

Este documento tem por objetivo apresentar a tecnologia de reflexão existente na linguagem JAVA. Esta exposição será realizada a partir de uma implementação real de uma classe Java que fornece a funcionalidade de mapeamento entre objetos de um programa computacional e de um banco de dados relacional. Este mapeamento é também conhecido como camada de persistência.

AINFO - versão 5.0: manual on-line.

O AINFO é um sistema para automação de bibliotecas e recuperação de informação, desenvolvimento em padrão Windows, com arquitetura cliente/servidor baseada no sistema gerenciador de banco de dados relacional Firebird. Pemite o gerenciamento de informação técnico-científica, integrando bases de dados documentais, cadastrais e processos bibliográficos através do armazenamento, atualização, indexação e recuperação de informação de forma simples e rápida, utilizando não apenas recursos de um istema gerenciador de banco de dados, como controle de concorrência e manutenção de integridade das bases de dados, mas também oferecendo facilidades de recuperação de informação textual não disponíveis nesses sistemas.

Utilização de aplicativos Base e Calc do pacote BrOffice.org para criação de Sistema de Suporte à Decisão.

Neste trabalho, tem-se uma proposta de mostrar como se constrói um sistema de apoio à decisão de pequeno porte, usando-se os aplicativos Calc e Base. O aplicativo Base será usado para armazenar dados que estão em suas tabelas ou para importá-los a partir de uma outra fonte, isto é, a partir de um outro banco de dados (MySQL, PostgreSQL, etc.) ou de arquivos. Com os dados no aplicativo Base, o Calc irá acessá-los e manipulá-los para, finalmente, mostrar os resultados de apoio à decisão do usuário.

Sistema de mapa de telefonema interurbano pela Web (MTI) para acompanhamento de ligações telefônicas.

O objetivo deste trabalho é mostrar um sistema de MTI pela web, implementado na Embrapa Informática Agropecuária e pode, com algumas adaptações, servir para outras empresas.

Sistema de Informação de solos brasileiros.

Com o objetivo de possibilitar o armazenamento e a disponibilização das informações sobre os solos brasileiros, a Embrapa Informática Agropecuária e a Embrapa Solos investem no desenvolvimento de um Sistema de Informações de Solos. O sistema foi concebido para armazenar dados detalhados sobre este recurso natural, para que possam ser acessados pela internet, combinados e analisados sob vários pontos de vista. Seu banco de dados reunirá informações de solos coletados e analisados de todas as regiões do Brasil. A partir desta base de dados serão desenvolvidas aplicações para a tomada de decisões do agronegócio, em zoneamento agrícola, na estimativa da produtividade de culturas, no ensino e na pesquisa.

Eutils-search - manual do usuário.

O software Eutils-search tem por objetivo trazer do banco de dados PubMed informações sobre artigos relacionados a genes de um organismo específico, de acordo com as regras referentes à taxa de acesso impostas pelo site. As informações trazidas são, então, armazenadas localmente em um banco de dados para acesso rápido. Além disso, o software também gera documentos XML correspondentes às informações do organismo requisitado. O eutils-search é uma ferramenta de apoio ao desenvolvimento de aplicações de mineração de textos voltadas para os domínios de biotecnologia e biologia molecular, baseada em informações textuais obtidas do banco de dados PubMed. Este documento apresenta os pré-requisitos e a descrição dos parâmetros necessários para utilização do software, bem como uma descrição de alguns aspectos internos do software, para melhor entendimento do processo que ele automatiza, além de alguns exemplos e uso.