Malaria rapid diagnostic test performance: Results of WHO product testing of malaria RDTs: Round 6 (2014-2015)

Overview This report, published in conjunction with a summary overview of results of rounds 1–6, is the sixth in a series of laboratory-based evaluations of rapid diagnostic tests (RDTs) for malaria. It provides a comparative measure of their performance in a standardized way to distinguish between well and poorly performing tests. It can be used by malaria control programmes and guide WHO procurement recommendations for these diagnostic tools. The evaluation reported here was a joint project of the WHO Global Malaria Programme, the Foundation for Innovative New Diagnostics (FIND) and the United States Centers for Disease Control and Prevention (CDC) within the WHO-FIND Malaria RDT Evaluation Programme. The project was financed by FIND through a grant from UNITAID.

Mapping the risk of soil-transmitted helminthic infections in the Philippines

Background In order to increase the efficient allocation of soil-transmitted helminth (STH) disease control resources in the Philippines, we aimed to describe for the first time the spatial variation in the prevalence of A. lumbricoides, T. trichiura and hookworm across the country, quantify the association between the physical environment and spatial variation of STH infection and develop predictive risk maps for each infection. Methodology/Principal Findings Data on STH infection from 35,573 individuals across the country were geolocated at the barangay level and included in the analysis. The analysis was stratified geographically in two major regions: 1) Luzon and the Visayas and 2) Mindanao. Bayesian geostatistical models of STH prevalence were developed, including age and sex of individuals and environmental variables (rainfall, land surface temperature and distance to inland water bodies) as predictors, and diagnostic uncertainty was incorporated. The role of environmental variables was different between regions of the Philippines. This analysis revealed that while A. lumbricoides and T. trichiura infections were widespread and highly endemic, hookworm infections were more circumscribed to smaller foci in the Visayas and Mindanao. Conclusions/Significance This analysis revealed significant spatial variation in STH infection prevalence within provinces of the Philippines. This suggests that a spatially targeted approach to STH interventions, including mass drug administration, is warranted. When financially possible, additional STH surveys should be prioritized to high-risk areas identified by our study in Luzon.

Structural studies on members of the picornavirus superfamily

The pathogenic members of the picornavirus superfamily have adverse effects on humans, their crops and their livestock. As structure is related to function, detailed structural studies on these viruses are important not only for fundamental understanding of the viral life cycle, but also for the rational design of vaccines and inhibitors for disease control. These viruses have positive sense, single-stranded RNA genomes enclosed in a protein capsid. X-ray crystallography and cryo-electron microscopy studies have revealed that the isometric members of this group have icosahedrally-symmetric capsids made up of 60 copies of each of the structural proteins. The members that infect animal cells often employ one or more cellular receptors to facilitate cell entry which in some cases is known to initiate the uncoating sequence of the genome. The nature of the interactions between individual viruses and alternative cellular receptors has rarely been probed. The capsid assembly of the members of the picornavirus superfamily is considered to be cooperative and the interactions of RNA and capsid proteins are thought to play an important role in orchestrating virus assembly. The major aims of this thesis were to solve the structures of blackcurrant reversion virus (BRV), human parechovirus 1 (HPEV1) and coxsackievirus A7 (CAV7), as well as the structure of HPEV1 complexed with two of its cellular receptors using cryo-electron microscopy, three-dimensional image reconstruction and homology modeling. Each of the selected viruses represents a taxonomic group where little or no structural data was previously available. The results enabled the detailed comparison of the new structures to those of known picornaviruses, the identification of surface-exposed epitopes potentially important for host interaction, the mapping of RNA-capsid protein interactions and the elucidation of the basis for the specificity of two different receptor molecules for the same capsid. This work will form the basis for further studies on the influence of RNA on parechovirus assembly as a potential target for drug design.

Phylogenetic Predictions on Grids

A phylogenetic or evolutionary tree is constructed from a set of species or DNA sequences and depicts the relatedness between the sequences. Predictions of future sequences in a phylogenetic tree are important for a variety of applications including drug discovery, pharmaceutical research and disease control. In this work, we predict future DNA sequences in a phylogenetic tree using cellular automata. Cellular automata are used for modeling neighbor-dependent mutations from an ancestor to a progeny in a branch of the phylogenetic tree. Since the number of possible ways of transformations from an ancestor to a progeny is huge, we use computational grids and middleware techniques to explore the large number of cellular automata rules used for the mutations. We use the popular and recurring neighbor-based transitions or mutations to predict the progeny sequences in the phylogenetic tree. We performed predictions for three types of sequences, namely, triose phosphate isomerase, pyruvate kinase, and polyketide synthase sequences, by obtaining cellular automata rules on a grid consisting of 29 machines in 4 clusters located in 4 countries, and compared the predictions of the sequences using our method with predictions by random methods. We found that in all cases, our method gave about 40% better predictions than the random methods.

Benzothiophene Carboxamide Derivatives as Novel Antimalarials

Bromo-benzothiophene carboxamide derivatives have been shown in the preceding article to inhibit Plasmodium falciparum Enoyl-ACP reductase. Here, we report bromo-benzothiophene carboxamide derivatives as potent inhibitors of Plasmodium asexual blood-stages in vitro as well as in vivo in the mouse model. These compounds specifically impair the development of metabolically active trophozoite stage of intraerythrocytic cycle and the intravenous administration of 3-bromo-N-(4-fluorobenzyl)-benzo[b]thiophene-2-carboxamide (compound 6) enhances the longevity of P. berghei infected mice by 2 weeks compared to disease control animals thereby preventing the onset of ataxia and convulsions in treated mice. These compounds thus hold promise for the development of potent antimalarials.(C) 2011 IUBMB IUBMB Life, 63(12): 1111-1115, 2011

Progress in tuberculosis vaccine development and host-directed therapies-a state of the art review

Tuberculosis continues to kill 1.4 million people annually. During the past 5 years, an alarming increase in the number of patients with multidrug-resistant tuberculosis and extensively drug-resistant tuberculosis has been noted, particularly in eastern Europe, Asia, and southern Africa. Treatment outcomes with available treatment regimens for drug-resistant tuberculosis are poor. Although substantial progress in drug development for tuberculosis has been made, scientific progress towards development of interventions for prevention and improvement of drug treatment outcomes have lagged behind. Innovative interventions are therefore needed to combat the growing pandemic of multidrug-resistant and extensively drug-resistant tuberculosis. Novel adjunct treatments are needed to accomplish improved cure rates for multidrug-resistant and extensively drug-resistant tuberculosis. A novel, safe, widely applicable, and more effective vaccine against tuberculosis is also desperately sought to achieve disease control. The quest to develop a universally protective vaccine for tuberculosis continues. So far, research and development of tuberculosis vaccines has resulted in almost 20 candidates at different stages of the clinical trial pipeline. Host-directed therapies are now being developed to refocus the anti-Mycobacterium tuberculosis-directed immune responses towards the host; a strategy that could be especially beneficial for patients with multidrug-resistant tuberculosis or extensively drug-resistant tuberculosis. As we are running short of canonical tuberculosis drugs, more attention should be given to host-directed preventive and therapeutic intervention measures.

Revision bibliográfica. Cuidados del catéter periférico

[ES]Los cateterismos venosos periféricos son los dispositivos que con mayor frecuencia se emplean en el acceso vascular para pacientes que se encuentran ingresados en unidades hospitalarias. Estos catéteres son reemplazados sistemáticamente cada tres o cuatro días para tratar de prevenir la flebitis como refleja la guía de Center for Disease control and prevention (CDC) y por extensión, nuestro sistema de salud de Osakidetza. Sin embargo, la evidencia que apoya esta práctica no está del todo cimentada.El objetivo de esta revisión bibliográfica es evaluar la efectividad de esta práctica clínica tan integrada en la vida diaria de los profesionales de enfermería mediante la evaluación de la evidencia científica existente hasta el momento.Se realizo una búsqueda exhaustiva en diferentes bases de datos electrónicas desde Octubre de 2012 hasta Abril del año 2013. Se descargaron los textos completos de aquellos artículos que pudiesen ser potencialmente útiles en el estudio y se analizaron bajo los criterios de inclusión y selección. Los siete artículos seleccionados como válidos no demuestran que sea necesario sustituir de forma sistemática el catéter venoso periférico así como lo defiende la CDC. Debido a ello, se podría abolir esta práctica clínica que reduciría significativamente el dolor y las molestias que sufren los pacientes día a día, el tiempo que el personal de enfermería dedica en este tipo de prácticas, además de todo el coste sanitario que ello con lleva.

The economic impact of diseases and parasitic problems in freshwater fish production

Diseases and parasitic problems could constitute significant economic losses in fish production if not controlled, thus the need to continue monitoring its prevalence. Based on field studies on feral and intensively raised fish at the Kainji Lake Research Institute Nigeria, some diseases and parasitic problems have been identified. These include; helminthiasis; fungal disease; protozoa which include Myxosoma sp., Myxobolus spp., Henneguya sp., Trichodina sp., Ichthopthrius sp. bacterial mainly Aeromonas sp., Pseudomonas sp., mechanical injuries; death due to unknown causes and economic assessment of myxosporidian infection. Suggestion for disease control in fish production are recommended

A review of recent advances in commercial tilapia culture

The paper introduces the tilapias as important culture fish; their classification, breeding habits and general ecology are discussed. The versatility and plasticity of their reproduction and growth are major advantages as well as draw backs in their use as culture species. The culture of tilapias in ponds, cages, pens and raceways are described and a comparison of extensive and intensive cultivation is made. The major factors in commercial cultivation of tilapias such as feeds, hatchery/fry production and disease control are discussed. Recommendation is made for the consideration of tilapia as the equivalent of the common carp in tropical African fish culture in either monoculture or in polyculture with other fish species

Engineered underdominance as a method of insect population replacement and reproductive isolation

Insect vector-borne diseases, such as malaria and dengue fever (both spread by mosquito vectors), continue to significantly impact health worldwide, despite the efforts put forth to eradicate them. Suppression strategies utilizing genetically modified disease-refractory insects have surfaced as an attractive means of disease control, and progress has been made on engineering disease-resistant insect vectors. However, laboratory-engineered disease refractory genes would probably not spread in the wild, and would most likely need to be linked to a gene drive system in order to proliferate in native insect populations. Underdominant systems like translocations and engineered underdominance have been proposed as potential mechanisms for spreading disease refractory genes. Not only do these threshold-dependent systems have certain advantages over other potential gene drive mechanisms, such as localization of gene drive and removability, extreme engineered underdominance can also be used to bring about reproductive isolation, which may be of interest in controlling the spread of GMO crops. Proof-of-principle establishment of such drive mechanisms in a well-understood and studied insect, such as Drosophila melanogaster, is essential before more applied systems can be developed for the less characterized vector species of interest, such as mosquitoes. This work details the development of several distinct types of engineered underdominance and of translocations in Drosophila, including ones capable of bringing about reproductive isolation and population replacement, as a proof of concept study that can inform efforts to construct such systems in insect disease vectors.

Parâmetros de avaliação nutricional para detectar desnutrição em pacientes com AIDS em tratamento com antirretrovirais

A avaliação do estado nutricional em pacientes com HIV é de grande importância, pois as conseqüências provocadas pelo processo patológico da doença estão associadas com perda de peso corporal, massa magra e desnutrição grave, o que prediz aumento da morbimortalidade. Os valores de linfometria CD4 também têm sido utilizados como preditores a curto e médio prazo para o desenvolvimento de infecções oportunistas, as quais são incomuns em pacientes com CD4 >200 cels/mm3. Partindo deste conhecimento, optou-se por estudar o estado nutricional de homens e mulheres HIV positivos de acordo com a contagem de células CD4. Utilizou-se como parâmetros nutricionais o índice de massa corporal (IMC), a área muscular do braço corrigida (AMBc), albumina sérica e o ângulo de fase (AF). Foram estudados 39 pacientes HIV positivos, acompanhados pelo ambulatório de doenças infectoparasitárias do Hospital Universitário Pedro Ernesto (HUPE/UERJ). Não foi observada desnutrição na população estudada, quando avaliada pelo IMC e albumina em ambos os sexos, independente do número de células CD4. Entretanto, a AMBc e o AF, tanto nos homens quanto nas mulheres, demonstraram comprometimento nos parâmetros de massa magra. Em relação à associação entre os indicadores nutricionais e o número de células CD4, foi observado correlação significante com a AMBc e a albumina no grupo estudado. A correlação de acordo com o sexo manteve-se significante em ambos os grupos para AMBc e com uma tendência positiva (p=0,06) entre o AF e CD4 no grupo dos homens. Portanto, estes resultados demonstram que para avaliar o estado nutricional, principalmente o compartimento de massa corporal magra de pacientes HIV positivos sob terapia antirretroviral, é preciso utilizar indicadores mais sensíveis, mesmo naqueles pacientes com melhor estado de controle da doença.

Sistema Único de Saúde: de que sistema se trata?

Constata-se que a reforma sanitária brasileira representa um avanço na direção de uma concepção avançada de sistema de saúde. Entretanto o SUS, com toda a materialidade das reformas ao nível macro induzidas a partir dos avanços na legislação, a implantação da regionalização e hierarquização da assistência, e dos instrumentos de gestão, assim como todas as grandes organizações modernas, padece de problemas de coordenação na operação de suas ações. Este trabalho pretende discutir as possibilidades e limites das mudanças organizacionais induzidas pela implementação do SUS na configuração dos sistemas locoregionais de saúde, à luz das experiências internacionais e das contribuições mais recentes das teorias organizacionais, no contexto da transição do fordismo à acumulação flexível. A partir do referencial da teoria dos sistemas, considera-se a contribuição das teorias organizacionais fordistas, pós-fordistas e pós-modernistas na especificidade do campo da saúde coletiva, para discutir a efetividade dos seus subsistemas cibernéticos do SUS: controle, avaliação, regulação, auditoria e vigilância em saúde, no complexo contexto da configuração do poder deste setor. Verifica-se que o SUS, constituído a partir de culturas organizacionais fordistas, do antigo INAMPS e da Saúde Pública tradicional, não tem obtido êxito em configurar estruturas organizacionais competentes, na medida em que reproduz os modelos tradicionais nos seus sistemas de controle. Esta dificuldade em parte deve-se ao momento histórico, que fez coincidir o momento dos avanços na legislação, em direção à ampliação do direito à saúde, com o momento das reestruturações dos aparelhos estatais decorrente da crise global do modo de produção fordista, e com as profundas transformações demográficas, epidemiológicas e da tecnologia da assistência médica. Por outro lado, a disponibilidade de soluções pósfordistas propicia um padrão para a conformação de novas regras e novos modos de regulação do sistema de saúde, que induzam a comportamentos auto-reguladores por parte dos prestadores de serviços de saúde, considerando as metas de equidade e de melhoria da saúde da população. Conclui-se que a necessária reforma do setor saúde demanda o fortalecimento de uma tecno-burocracia protegida contra injunções político-partidárias, que possibilite a incubação uma cultura organizacional profissional em todas as esferas de governo e níveis de gestão, que incentive um trabalho em saúde competente e moralmente comprometido com as finalidades do SUS nesse país.

The role of probiotics in aquaculture in Nigeria - a review

Aquaculture is beset by many problems especially diseases caused by bacteria as the major deteriorating factors. The use of vaccines and antimicrobial agents have been centered on disease control, but are associated with problems The development of antibiotic resistance among the microorganisms have become a global concern as a result of indiscriminate use of antibiotics. Several alternative suggestions for disease prevention have been on probiotics for its efficacy, low cost, less side effects and accessible to farmers. Probiotics is gaining a high priority in the developed countries with the aim of replacing conventional drugs. The principal bacterial groups tested as probiotic bacteria in culture of shrimps, crabs, oysters, fish and humans are Vibrio, Pseudomonas, Bacillus, Bifidobacteria and several Lactobacilli. Experiments have mainly been conducted with fish larvae, adult fish, crustaceans and animals where significant reduction in mortalities has been obtained. The purpose of this review is to create awareness of the role of probiotics in disease control in aquaculture as alternative to antibiotics.

Sobrevida e fatores prognósticos para o câncer de mama em Juiz de Fora, Minas Gerais, na coorte diagnosticada entre 1998 e 2000

Este estudo teve como objetivo analisar a sobrevida e fatores prognósticos para o câncer de mama feminino, com ênfase no papel de variáveis relacionadas aos serviços de saúde. Foram analisadas 782 mulheres com câncer invasivo da mama e submetidas à cirurgia curativa, que realizaram tratamento cirúrgico e/ou terapia complementar no município de Juiz de Fora, Minas Gerais, com diagnóstico da doença entre 1998 e 2000. O recrutamento dos casos foi efetuado a partir de busca ativa nos registros médicos de todos os serviços de saúde que prestam atendimento em oncologia na cidade. O seguimento foi realizado mediante retorno aos prontuários e complementado por busca no banco do Sistema de Informação sobre Mortalidade (SIM), contato telefônico e consulta de situação cadastral no Cadastro de Pessoas Físicas (CPF). As principais variáveis analisadas foram: cor da pele, idade ao diagnóstico, tamanho do tumor, comprometimento de linfonodos, estadiamento, cidade de residência e variáveis relativas aos serviços de saúde, entre outras. As funções de sobrevida foram calculadas por meio do método de Kaplan-Meier. Foi utilizado o modelo de riscos proporcionais de Cox para avaliação dos fatores prognósticos. No primeiro artigo, foi observada taxa de sobrevida específica em cinco anos de 80,9%, sendo identificados tamanho tumoral e comprometimento de linfonodos axilares como importantes fatores prognósticos associados de forma independente à sobrevida pela doença na população de estudo (HR=1,99, IC95%: 1,27-3,10 e HR=3,92, IC95%: 2,49-6,16, respectivamente). No segundo artigo, quando consideradas as variáveis relativas aos serviços de saúde, foi verificada pior sobrevida para as mulheres assistidas no serviço público, embora com significância limítrofe (p=0,05), e para aquelas que não tinham plano privado de saúde, apesar de não significativa (p=0,1). As funções de sobrevida não ajustadas e estratificadas por natureza do serviço de saúde exibiram sobrevida mais desfavorável para as mulheres não brancas e para os casos com nenhum ou menos de 10 linfonodos isolados somente no serviço público, embora com significâncias estatísticas apenas marginais (p=0,09 e p=0,07, respectivamente). Na análise multivariada, foi observado maior risco de óbito nas mulheres que não fizeram uso de hormonioterapia apenas para os casos assistidos no serviço público (HR=1,56; IC95%: 1,01-2,41), independentemente do tamanho tumoral e do status ganglionar axilar. Tais achados sugerem desigualdades sociais e disparidades na prevenção primária e secundária da doença na região estudada, com desvantagem para o serviço público de saúde, enfatizando a maior necessidade de esclarecimento sobre a doença, assim como de diagnóstico e tratamento dos casos em estádios mais precoces. Destacou-se, ainda, o valor de se trabalhar com informações produzidas pelos serviços de saúde responsáveis pela assistência oncológica no país, possibilitando a caracterização do perfil e da sobrevida das pacientes assistidas e fornecendo subsídios aos órgãos competentes do setor saúde local para nortear a adoção de estratégias de prevenção direcionadas ao controle da doença na população avaliada.

Iniciativas internacionais de segurança do paciente: contribuições para o refinamento dos sistemas de proteção

Trata-se da temática Segurança do Paciente, que teve como objeto as iniciativas sobre segurança do paciente estabelecidas por organizações internacionais de segurança. O objetivo proposto pelo estudo foi analisar tais iniciativas estabelecidas por organizações internacionais de segurança. Para compor este estudo identificaram-se as principais organizações de segurança, atarvés de uma revisão bibliográfica de literatura realizada com base em fontes eletrônicas primárias, considerando-se as organizações pioneiras na abordagem do tema Segurança do Paciente que fomentam prioritariamente a segurança do paciente e que divulgaram amplamente esta temática no período de 2002 a 2012. Foram encontradas na plataforma Google referências a mais de 100 instituições no mundo que abordam este tema. No entanto somente sete atenderam a todos os critérios de seleção, havendo predomínio de organizações americanas (seis). A organização mais antiga é o Centers for Disease Control and Prevention (1946), e a mais recente é a World Alliance for Patient Safety (2004). Quanto à natureza jurídica, duas são governamentais (CDC e AHRQ), quatro são não governamentais (The Joint Commission, IHI, WHO Alliance e ISMP) e uma organização independente (NCCMERP). Totalizaram-se 103 iniciativas de segurança do paciente no contexto hospitalar. A organização que mais publicou iniciativas para a segurança do paciente no contexto hospitalar foi o ISMP com 20 iniciativas, totalizando 19% das iniciativas exploradas. As iniciativas relacionadas à terapia medicamentosa, higienização das mãos, controle de infecções e cirurgias seguras foram as mais abordadas. Conclui-se que ao atentar para as iniciativas internacionais de Segurança do Paciente o profissional de saúde poderá contextualizar-se, aprimorando seu conhecimento técnico científico, além de pôr em prática o que as principais organizações mundiais voltadas para a Segurança do Paciente preconizam para a realização de um cuidado mais seguro.