Fatty acids and intact polar lipids of laminated microbial sediments from St. Peter Ording, German Wadden Sea

Hidden for the untrained eye through a thin layer of sand, laminated microbial sediments occur in supratidal beaches along the North Sea coast. The inhabiting microbial communities organize themselves in response to vertical gradients of light, oxygen or sulfur compounds. We performed a fine-scale investigation on the vertical zonation of the microbial communities using a lipid biomarker approach, and assessed the biogeochemical processes using a combination of microsensor measurements and a 13C-labeling experiment. Lipid biomarker fingerprinting showed the overarching importance of cyanobacteria and diatoms in these systems, and heterocyst glycolipids revealed the presence of diazotrophic cyanobacteria even in 9 to 20 mm depth. High abundance of ornithine lipids (OL) throughout the system may derive from sulfate reducing bacteria, while a characteristic OL profile between 5 and 8 mm may indicate presence of purple non-sulfur bacteria. The fate of 13C-labeled bicarbonate was followed by experimentally investigating the uptake into microbial lipids, revealing an overarching importance of cyanobacteria for carbon fixation. However, in deeper layers, uptake into purple sulfur bacteria was evident, and a close microbial coupling could be shown by uptake of label into lipids of sulfate reducing bacteria in the deepest layer. Microsensor measurements in sediment cores collected at a later time point revealed the same general pattern as the biomarker analysis and the labeling experiments. Oxygen and pH-microsensor profiles showed active photosynthesis in the top layer. The sulfide that diffuses from deeper down and decreases just below the layer of active oxygenic photosynthesis indicates the presence of sulfur bacteria, like anoxygenic phototrophs that use sulfide instead of water for photosynthesis.

Una oda de Horacio: Musis Amicus (I 26)

Fil: Syndikus, Hans Peter.

(Table 1) Concentration of iron, DIP and silicic acid in water samples taken during Nathaniel B. Palmer cruises NBP06-01 and NBP06-08 (CORSACS I+II), Ross Sea

The Ross Sea polynya is among the most productive regions in the Southern Ocean and may constitute a significant oceanic CO2 sink. Based on results from several field studies, this region has been considered seasonally iron limited, whereby a "winter reserve" of dissolved iron (dFe) is progressively depleted during the growing season to low concentrations (~0.1 nM) that limit phytoplankton growth in the austral summer (December-February). Here we report new iron data for the Ross Sea polynya during austral summer 2005-2006 (27 December-22 January) and the following austral spring 2006 (16 November-3 December). The summer 2005-2006 data show generally low dFe concentrations in polynya surface waters (0.10 ± 0.05 nM in upper 40 m, n = 175), consistent with previous observations. Surprisingly, our spring 2006 data reveal similar low surface dFe concentrations in the polynya (0.06 ± 0.04 nM in upper 40 m, n = 69), in association with relatively high rates of primary production (~170-260 mmol C/m**2/d). These results indicate that the winter reserve dFe may be consumed relatively early in the growing season, such that polynya surface waters can become "iron limited" as early as November; i.e., the seasonal depletion of dFe is not necessarily gradual. Satellite observations reveal significant biomass accumulation in the polynya during summer 2006-2007, implying significant sources of "new" dFe to surface waters during this period. Possible sources of this new dFe include episodic vertical exchange, lateral advection, aerosol input, and reductive dissolution of particulate iron.

Beati Alphonsi Thostati Episcopi Abule[n]sis Super Leviticum i[n] sensu litterali nova [et] hactenus absco[n]dita a se edita comme[n]taria

Copia digital: Biblioteca valenciana, 2010

La estética de la deformación en la era de la cultura de masas : un proyecto de Alison y Peter Smithson

Alison Margaret Gill y Peter Denham Smithson son, o eran, ambos murieron hace ya algunos años, dos arquitectos. Así dicho, esto suena a obviedad. Sin embargo no lo es, porque siempre han sido compactados en una unidad proyectual, bien bajo las siglas Alison y Peter Smithson, o bien, más puntualmente todavía, como los Smithson. Cuando Leibniz en 1696 le dice a la princesa electora Sofía que en algo tan puntual y homogéneo aparentemente como una gota de agua, vista al microscopio, resulta haber más de un millón de animales vivos, se puede empezar a vislumbrar el resultado de la Tesis. El resultado de este trabajo no se contempla un millón de partículas pero sí dos. La obra de Alison y Peter Smithson esta conformada desde su inicio probablemente por la particularidad de que en ella intervienen tanto Gill como Smithson, aunque cada uno sea en mayor o menor medida la o el responsable de un proyecto. Puesto al microscopio el proyecto del que se ocupa la Tesis, el concurso de 1953 para la ampliación de la Universidad de Sheffield, se estima que está compuesto de dos partes diferentes y que como Los Smithson o como una gota de agua, su unidad es una mera convención, una forma de designarlo y tratarlo, que falsea en algo su apreciación, aunque, como se verá, es lo que provoca el extraño efecto que como imagen ejerce. El Capítulo I descubre la duplicidad. Reyner Banham fijó en 1955, en el artículo The New Brutalism, el modo de encarar el proyecto de Sheffield cuando proyectó sobre él lo más novedoso que en el campo de la pintura ocurría en ese momento, el Art Autre. Michel Tapié ve en el informalismo presente en las obras que él engloba como un <> rasgos que puede presentar a la luz de conceptos que extrae de Riemann, matemático del s. XIX, introductor de una nueva geometría. La Tesis remonta por tanto hasta Riemann, a la búsqueda del concepto del que penden tanto Tapié como Banham. El concepto es la variedad continua; un conjunto, cuyos elementos pueden recorrer la extensión de la variedad mediante una deformación continua, como si dijéramos, diluyéndose unos en otros sin cortes entre sí. Los ejemplos del informalismo serían, por tanto, los puntos de la variedad, formas inestables o detenciones aleatorias en este transitar continuo de un mismo objeto. La visión de cuerpos en cortes aleatorios a la evolución otorga a sus formas cualesquiera la condición de extrañeza o perturbación, produciendo un impacto en la mente que lo graba instintivamente en la materia de la memoria. Así, es la memorabilidad, dada precisamente por el impacto que supone ver cuerpos en estado evolutivo, sin una forma precisa, la propiedad que gobierna a los objetos que caen bajo el Art Autre, y es la memorabilidad el rasgo distintivo de Sheffield para Banham. Este sentido evolutivo que se puede asociar a los elementos de una variedad entra en consonancia con una variedad de estados en evolución en el marco de las especies orgánicas. No sólo como individuo sino también como especie. La coincidencia no sólo es formal, también es temporal entre el descubrimiento de Riemann de la variedad continua y el de Darwin de la evolución de las especies. Ve Darwin que algunos ejemplares presentan en su cuerpo conformaciones normales de especies diferentes, que puede entenderse como una anormalidad o defecto evolutivo, lo que él llama <>. Un ejemplar monstruoso no es capaz de abrir una escisión de la variedad y en este sentido rompe su cadena evolutiva. Es un elemento, por tanto extraño a la variedad. Lo peculiar que expone Darwin, es que la monstruosidad puede ser provocada artificialmente por motivos estéticos, como ocurre en determinados animales o plantas ornamentales. Bien, esto es exactamente lo que descubre la Tesis en el proyecto de Sheffield. La unión en un solo proyecto de dos conformaciones de naturaleza diferente. El Capítulo II indaga en la naturaleza dual de Sheffield. Y la descubre en la aplicación de dos principios que tienen múltiples derivas, pero interesante en una en particular, referida al espacio. Uno es el Principio de Posición. Bajo él se contempla la situación del concurso dada en su globalidad, en una visión totalizadora que permite buscar y destacar posiciones singulares y tener un control preciso del proyecto desde el inicio. Se dice que es la opción normal en arquitectura comprender el espacio en su conjunto y que el trazado de ejes y el reparto del espacio obedecen a este principio. Son así vistos la propuesta ganadora del equipo GMW y fundamentalmente el trazado de ejes en la obra de Le Corbusier. Una parte de Sheffield es un producto típico de este modo de proceder. Hay un segundo principio que es el Principio de Transición Continua. En los términos expuestos para la variedad de Riemann, sería como si en lugar de ver cuerpos en estados concretos, por deformados que pudieran ser, nos introdujéramos dentro de la propia variedad acoplándonos al curso de la evolución misma, en un acto de unión interior con la marcha de la evolución. Para ejercer esta acción se toma como punto inicial el extremo del edificio universitario existente, el Firth Court, y se lleva cabo un estiramiento continuo. En esto radica lo que la Tesis distingue como la ampliación, el cuerpo que se enrosca paulatinamente. Para exponer este concepto, la Tesis se apoya en un ejercicio llevado a cabo por Raymond Unwin en Hampstead, el close, o estiramiento lateral del borde de un viario para hacer surgir el espacio útil residencial. A partir del concepto de close, se deriva en la urbanística americana de principios del s. XX el concepto de cluster, que pasa a ser uno de los argumentos principales de la teoría de Alison y de Peter Smithson en los años 50. El Capítulo III plantea la dificultad de mantener la dualidad de Sheffield a primeros de los 50, sometido el proyecto de arquitectura a la unicidad que impone el criterio hegemónico de Rudolf Wittkower desde “Los Fundamentos de la Arquitectura en la Edad del Humanismo”. Como en el Capítulo I, la obligación que se traza la Tesis es remontar los orígenes de las cosas que se tratan, y en este caso, entrar en las fuentes del principio proporcional. Se descubren así los fundamentos de la proporción aritmética y geométrica en el seno del pitagorismo, sus problemas y su evolución. La postura de los dos arquitectos frente a Wittkower es de admiración, pero también de libertad. Esta libertad suya es la que defiende la Tesis. Cotejando lo que da de sí la arquitectura basada en los principios proporcionales con otra arquitectura estancada en el paso del Renacimiento al Barroco como es la arquitectura perspectiva y proyectiva, la arquitectura oblicua, recuperada a la sazón por medio de la intervención en la Tesis de Panofsky, se dirimen aspectos colaterales pero fundamentales de una renovación de los planteamientos: hay planteamientos que se dicen esencialistas y objetivos y otros funcionales y que derivan en subjetivos y relacionales. Sobre estas dos marcos de categorías el propósito que persigue la Tesis es dar cuenta de los dos principios que rigen lo visto en el Capítulo II, el Principio de Posición y el Principio de Transición Continua, responsables ambos, al 50%, de la monstruosidad detectada en Sheffield, que no es negativa, sino, como decía Darwin, la combinación en un solo cuerpo de conformaciones normales en animales de especies diferentes, incluso con fines estéticos. En Sheffield existe, y esta dibujada, la figura de una cabeza escultural con un doble rostro. Todo el trabajo de la Tesis se encamina, en definitiva, a explicar, con toda la claridad y extensión que me ha sido posible, en qué consiste ese doble rostro. ABSTRACT Peter and Alison Smithson’s work is, is from its start, very influenced by both Alison Margaret Gill and Peter Denham Smithson. The matter of study of this Thesis, the 1953 competition for the expansion of the University of Sheffield, estimated after its exam, which is composed by two different parts, which, together produce a strange effect as an image. Reyner Banham in 1955 described the image in his article “The New Brutalism” as the key argument (most iconic) for the Sheffield’s project. The way his image powerfully influences sensitivity, by perturbation, makes this a singular and memorable image. This feature, only present in Sheffield, over any other building of the time, even from the same architects, allow Banham to associate the project to Art Autre, thought by Michel Tapié as a new artistic movement, to which Sheffield will belong, in the architecture part. Tapié sees in the informalism of works considered Art Autre some aspects that can bring concepts he extracts from Riemann, XIX Century mathematician, father of the new geometry. This Thesis discovers Riemann’s concept of continuous variety, a set whose elements are able to go through variety by a continuous deformation, diluting themselves without touching each other. Examples of informalism would be, points of that variety, unstable forms or random detentions in the continuous transit of the same object. Therefore, the condition of memorability comes precisely from the impact that seeing bodies in state of evolution creates. That evolutive sense that can be associated to elements of a variety, comes together with a variety of states of evolution in the world of organic species. Not only as an individual, but as well as a species. Coincidence between Riemann and Darwin’s discoveries is not only formal, but as well temporary. Darwin observes that some individuals of concrete species present on their bodies some features, typical of other species, which may be interpreted as evolutive failure. But the most peculiar part of what Darwin exposes is that monstrosity can indeed be artificially made for aesthetical purposes, like it happens in certain animals and plants. Well, this is what the Thesis discovers in Sheffield’s project. The union in a single project of two different nature forms, of which none on the parts is a deformation of the other, but they are both irreducible. Once both parts are collated, a new system which adapts well is discovered. It is a system created by Leibniz in the XVII Century, created to distinguish to principles that clear the difference between the equation methods and differential calculus. This principles are the Principle of Position and the Principle of Continuity. This two principles, translated to the spatial analysis field are key for the two parts of the project. On the one hand, the part developing in a lineal axis belongs to the Principle of Position. This means that that there is a global vision of space after which it is decided which operation to follow, which in this case consists of establishing an axis between two singular positions of the university area. The part which is being deformed while it goes is studied as a continuous action of stretching an existing building, the Firth Court, in which there is no previous spatial analysis. The only way to understand and to explain this action is by the Principle of Continuity. So, all in all, the Thesis changes the view of Sheffield from an Art Autre work to a “monstrosity”, without the negative meaning of it, just as a combination of two different nature formations, which, at the same time, justifies its power as iconic image. Finally, I would like to point out that in the Sheffield’s project there is (drawn and also physically) a sculptural head which has the feature of representing both, a man and a woman’s face. All the work of this Thesis leads to explaining the double nature of the project, taking this double expression head as inspiration.

Explosive invasion of plant mitochondria by a group I intron

Group I introns are mobile, self-splicing genetic elements found principally in organellar genomes and nuclear rRNA genes. The only group I intron known from mitochondrial genomes of vascular plants is located in the cox1 gene of Peperomia, where it is thought to have been recently acquired by lateral transfer from a fungal donor. Southern-blot surveys of 335 diverse genera of land plants now show that this intron is in fact widespread among angiosperm cox1 genes, but with an exceptionally patchy phylogenetic distribution. Four lines of evidence—the intron’s highly disjunct distribution, many incongruencies between intron and organismal phylogenies, and two sources of evidence from exonic coconversion tracts—lead us to conclude that the 48 angiosperm genera found to contain this cox1 intron acquired it by 32 separate horizontal transfer events. Extrapolating to the over 13,500 genera of angiosperms, we estimate that this intron has invaded cox1 genes by cross-species horizontal transfer over 1,000 times during angiosperm evolution. This massive wave of lateral transfers is of entirely recent occurrence, perhaps triggered by some key shift in the intron’s invasiveness within angiosperms.

Inhibition of MHC class I-restricted antigen presentation by γ2-herpesviruses

The γ-herpesviruses, in contrast to the α- and β-herpesviruses, are not known to inhibit antigen presentation to CD8+ cytotoxic T lymphocytes (CTLs) during lytic cycle replication. However, murine γ-herpesvirus 68 causes a chronic lytic infection in CD4+ T cell-deficient mice despite the persistence of a substantial CTL response, suggesting that CTL evasion occurs. Here we show that, distinct from host protein synthesis shutoff, γ-herpesvirus 68 down-regulates surface MHC class I expression on lytically infected fibroblasts and inhibits their recognition by antigen-specific CTLs. The viral K3 gene, encoding a zinc-finger-containing protein, dramatically reduced the half-life of nascent class I molecules and the level of surface MHC class I expression and was by itself sufficient to block antigen presentation. The homologous K3 and K5 genes of the related Kaposi's sarcoma-associated virus also inhibited antigen presentation and decreased cell surface expression of HLA class I antigens. Thus it appears that an immune evasion strategy shared by at least two γ-herpesviruses allows continued lytic infection in the face of strong CTL immunity.

ATM-dependent expression of the insulin-like growth factor-I receptor in a pathway regulating radiation response

The ATM gene is mutated in the syndrome of ataxia telangiectasia (AT), associated with neurologic dysfunction, growth abnormalities, and extreme radiosensitivity. Insulin-like growth factor-I receptor (IGF-IR) is a cell surface receptor with tyrosine kinase activity that can mediate mitogenesis, cell transformation, and inhibition of apoptosis. We report here that AT cells express low levels of IGF-IR and show decreased IGF-IR promoter activity compared with wild-type cells. Complementation of AT cells with the ATM cDNA results in increased IGF-IR promoter activity and elevated IGF-IR levels, whereas expression in wild-type cells of a dominant negative fragment of ATM specifically reduces IGF-IR expression, results consistent with a role for ATM in regulating IGF-IR expression at the level of transcription. When expression of IGF-IR cDNA is forced in AT cells via a heterologous viral promoter, near normal radioresistance is conferred on the cells. Conversely, in ATM cells complemented with the ATM cDNA, specific inhibition of the IGF-IR pathway prevents correction of the radiosensitivity. Taken together, these results establish a fundamental link between ATM function and IGF-IR expression and suggest that reduced expression of IGF-IR contributes to the radiosensitivity of AT cells. In addition, because IGF-I plays a major role in human growth and metabolism and serves as a survival and differentiation factor for developing neuronal tissue, these results may provide a basis for understanding other aspects of the AT syndrome, including the growth abnormalities, insulin resistance, and neurodegeneration.