Flow Pattern in Compound Channel with Floodplain Double Groyne

The results of an experimental study and velocity analysis of the flow characteristics in the vicinityof a floodplain with two rows of permeable/impermeable groynes in compound channels with oneand two floodplains are presented. A 60% permeable groyne model with three different lengthsrelative to the floodplain width was used. The results showed that double groyne could beconsidered as one groyne (one block) for aspect ratio Sr < 2 (Sr = distance between twosuccessive groynes/groyne length). When Sr > 2, each groyne started to act independently.The velocity reduction was more than 45-52% of the floodplain’s approach velocity compared with30-35% in the case of a single groyne. The significant velocity reduction was located at a distance1.5-2 times the groyne length downstream of the single or the double groynes. Generally, themaximum velocities in the main channel ranged from 1.1 to 1.35 times the original approachingvelocity. The effective groyne relative length and aspect ratio should not to be more than 0.5 and 2,respectively.

Metastatic melanoma:A regional review and future directions

Aims and background. The incidence of malignant melanoma has risen steadily over recent decades. NCI data from 2005-2007 have suggested that 1.93% of individuals born today in the US will develop melanoma at some stage. Approximately 15% of patients with MM either present with metastatic disease or develop metastases during the course of their illness. Unfortunately, metastatic MM remains a challenge with limited treatment options, and median overall survival is 6-9 months. Methods. We reviewed our data for the treatment of metastatic MM over a period of four years. Data from all patients with metastatic MM treated with systemic therapy without clinical trials from 2006 to 2009 were reviewed. Response rate was determined as per RECIST criteria. Results. Sixty four patients were treated with one or more lines of cytotoxic therapy. Median age was 62 years (range, 23-82) with 53% males. Primary site of the disease was the skin in 75%, mucosal in 12.5%, ocular in 9.4% and nodal with an occult primary in 3.1%. Visceral metastases were present in 75% of patients at the start of treatment, including pulmonary (39.6%) and hepatic (34.4%). All patients were screened for brain metastases, which were present in 26.5% of patients. ECOG performance status was 0 in 7.8%, 1 in 68.7%, 2 in 9.4% and undocumented in the remaining 14%. Patients without brain metastases received single agent DTIC as first line; those with brain metastases received temozolomide. Response rate was 7% for DTIC and 28% for temozolomide, with median progression-free survival of 2.4 and 3.2 months, respectively. Seven patients who received DTIC are alive on follow-up, 2 have ongoing stable disease post-DTIC at 41 months and 18 months. Second line therapy with vinblastine was given to 21 patients (32%), with a response rate of 9.5% and median progression-free survival of 3.4 months. Median overall survival from initiation of therapy was 7.7 months for DTIC and 3.6 months for patients with brain metastases receiving temozolomide. A performance status of 2 was associated with shorter median overall survival (2.0 months). Conclusions. Our results are comparable to published data. Malignant melanoma is a disease with rising incidence and limited treatment options. These patients are best treated in the context of clinical trials as new targeted therapies are promising as future strategies. © Il Pensiero Scientifico Editore.

Tumor suppressor Ras-association domain family 1 isoform A is a novel regulator of cardiac hypertrophy

BACKGROUND: Ras signaling regulates a number of important processes in the heart, including cell growth and hypertrophy. Although it is known that defective Ras signaling is associated with Noonan, Costello, and other syndromes that are characterized by tumor formation and cardiac hypertrophy, little is known about factors that may control it. Here we investigate the role of Ras effector Ras-association domain family 1 isoform A (RASSF1A) in regulating myocardial hypertrophy.

METHODS AND RESULTS: A significant downregulation of RASSF1A expression was observed in hypertrophic mouse hearts, as well as in failing human hearts. To further investigate the role of RASSF1A in cardiac (patho)physiology, we used RASSF1A knock-out (RASSF1A(-)(/)(-)) mice and neonatal rat cardiomyocytes with adenoviral overexpression of RASSF1A. Ablation of RASSF1A in mice significantly enhanced the hypertrophic response to transverse aortic constriction (64.2% increase in heart weight/body weight ratio in RASSF1A(-)(/)(-) mice compared with 32.4% in wild type). Consistent with the in vivo data, overexpression of RASSF1A in cardiomyocytes markedly reduced the cellular hypertrophic response to phenylephrine stimulation. Analysis of molecular signaling events in isolated cardiomyocytes indicated that RASSF1A inhibited extracellular regulated kinase 1/2 activation, likely by blocking the binding of Raf1 to active Ras.

CONCLUSIONS: Our data establish RASSF1A as a novel inhibitor of cardiac hypertrophy by modulating the extracellular regulated kinase 1/2 pathway.

Specific role of neuronal nitric-oxide synthase when tethered to the plasma membrane calcium pump in regulating the beta-adrenergic signal in the myocardium

The cardiac neuronal nitric-oxide synthase (nNOS) has been described as a modulator of cardiac contractility. We have demonstrated previously that isoform 4b of the sarcolemmal calcium pump (PMCA4b) binds to nNOS in the heart and that this complex regulates beta-adrenergic signal transmission in vivo. Here, we investigated whether the nNOS-PMCA4b complex serves as a specific signaling modulator in the heart. PMCA4b transgenic mice (PMCA4b-TG) showed a significant reduction in nNOS and total NOS activities as well as in cGMP levels in the heart compared with their wild type (WT) littermates. In contrast, PMCA4b-TG hearts showed an elevation in cAMP levels compared with the WT. Adult cardiomyocytes isolated from PMCA4b-TG mice demonstrated a 3-fold increase in Ser(16) phospholamban (PLB) phosphorylation as well as Ser(22) and Ser(23) cardiac troponin I (cTnI) phosphorylation at base line compared with the WT. In addition, the relative induction of PLB phosphorylation and cTnI phosphorylation following isoproterenol treatment was severely reduced in PMCA4b-TG myocytes, explaining the blunted physiological response to the beta-adrenergic stimulation. In keeping with the data from the transgenic animals, neonatal rat cardiomyocytes overexpressing PMCA4b showed a significant reduction in nitric oxide and cGMP levels. This was accompanied by an increase in cAMP levels, which led to an increase in both PLB and cTnI phosphorylation at base line. Elevated cAMP levels were likely due to the modulation of cardiac phosphodiesterase, which determined the balance between cGMP and cAMP following PMCA4b overexpression. In conclusion, these results showed that the nNOS-PMCA4b complex regulates contractility via cAMP and phosphorylation of both PLB and cTnI.

Gaze behavior of the visually impaired during street crossing.

PURPOSE:

This study explored the gaze patterns of fully sighted and visually impaired subjects during the high-risk activity of crossing the street.

METHODS:

Gaze behavior of 12 fully sighted subjects, nine with visual impairment resulting from age-related macular degeneration and 12 with impairment resulting from glaucoma, was monitored using a portable eye tracker as they crossed at two unfamiliar intersections.

RESULTS:

All subject groups fixated primarily on vehicles and crossing elements but changed their fixation behavior as they moved from "walking to the curb" to "standing at the curb" and to "crossing the street." A comparison of where subjects fixated in the 4-second time period before crossing showed that the fully sighted who waited for the light to change fixated on the light, whereas the fully sighted who crossed early fixated primarily on vehicles. Visually impaired subjects crossing early or waiting for the light fixate primarily on vehicles.

CONCLUSIONS:

Vision status affects fixation allocation while performing the high-risk activity of street crossing. Crossing decision-making strategy corresponds to fixation behavior only for the fully sighted subjects.

Introducing the CTA concept

The Cherenkov Telescope Array (CTA) is a new observatory for very high-energy (VHE) gamma rays. CTA has ambitions science goals, for which it is necessary to achieve full-sky coverage, to improve the sensitivity by about an order of magnitude, to span about four decades of energy, from a few tens of GeV to above 100 TeV with enhanced angular and energy resolutions over existing VHE gamma-ray observatories. An international collaboration has formed with more than 1000 members from 27 countries in Europe, Asia, Africa and North and South America. In 2010 the CTA Consortium completed a Design Study and started a three-year Preparatory Phase which leads to production readiness of CTA in 2014. In this paper we introduce the science goals and the concept of CTA, and provide an overview of the project. © 2013 Elsevier B.V. All rights reserved.

NanoStreams: Codesigned Microservers for Edge Analytics in Real Time

NanoStreams explores the design, implementation,and system software stack of micro-servers aimed at processingdata in-situ and in real time. These micro-servers can serve theemerging Edge computing ecosystem, namely the provisioningof advanced computational, storage, and networking capabilitynear data sources to achieve both low latency event processingand high throughput analytical processing, before consideringoff-loading some of this processing to high-capacity datacentres.NanoStreams explores a scale-out micro-server architecture thatcan achieve equivalent QoS to that of conventional rack-mountedservers for high-capacity datacentres, but with dramaticallyreduced form factors and power consumption. To this end,NanoStreams introduces novel solutions in programmable & con-figurable hardware accelerators, as well as the system softwarestack used to access, share, and program those accelerators.Our NanoStreams micro-server prototype has demonstrated 5.5×higher energy-efficiency than a standard Xeon Server. Simulationsof the microserver’s memory system extended to leveragehybrid DDR/NVM main memory indicated 5× higher energyefficiencythan a conventional DDR-based system. 

Diagnostic value of H3F3A mutations in giant cell tumour of bone compared to osteoclast-rich mimics

Driver mutations in the two histone 3.3 (H3.3) genes, H3F3A and H3F3B, were recently identified by whole genome sequencing in 95% of chondroblastoma (CB) and by targeted gene sequencing in 92% of giant cell tumour of bone (GCT). Given the high prevalence of these driver mutations, it may be possible to utilise these alterations as diagnostic adjuncts in clinical practice. Here, we explored the spectrum of H3.3 mutations in a wide range and large number of bone tumours (n 5 412) to determine if these alterations could be used to distinguish GCT from other osteoclast-rich tumours such as aneurysmal bone cyst, nonossifying fibroma, giant cell granuloma, and osteoclast-rich malignant bone tumours and others. In addition, we explored the driver landscape of GCT through whole genome, exome and targeted sequencing (14 gene panel). We found that H3.3 mutations, namely mutations of glycine 34 in H3F3A, occur in 96% of GCT. We did not find additional driver mutations in GCT, including mutations in IDH1, IDH2, USP6, TP53. The genomes of GCT exhibited few somatic mutations, akin to the picture seen in CB. Overall our observations suggest that the presence of H3F3A p.Gly34 mutations does not entirely exclude malignancy in osteoclast-rich tumours. However, H3F3A p.Gly34 mutations appear to be an almost essential feature of GCT that will aid pathological evaluation of bone tumours, especially when confronted with small needle core biopsies. In the absence of H3F3A p.Gly34 mutations, a diagnosis of GCT should be made with caution.

Distinct H3F3A and H3F3B driver mutations define chondroblastoma and giant cell tumor of bone

It is recognized that some mutated cancer genes contribute to the development of many cancer types, whereas others are cancer type specific. For genes that are mutated in multiple cancer classes, mutations are usually similar in the different affected cancer types. Here, however, we report exquisite tumor type specificity for different histone H3.3 driver alterations. In 73 of 77 cases of chondroblastoma (95%), we found p.Lys36Met alterations predominantly encoded in H3F3B, which is one of two genes for histone H3.3. In contrast, in 92% (49/53) of giant cell tumors of bone, we found histone H3.3 alterations exclusively in H3F3A, leading to p.Gly34Trp or, in one case, p.Gly34Leu alterations. The mutations were restricted to the stromal cell population and were not detected in osteoclasts or their precursors. In the context of previously reported H3F3A mutations encoding p.Lys27Met and p.Gly34Arg or p.Gly34Val alterations in childhood brain tumors, a remarkable picture of tumor type specificity for histone H3.3 driver alterations emerges, indicating that histone H3.3 residues, mutations and genes have distinct functions.

Synthesis of a 7-Membered Biaryl Guanidine Catalyst and its Use in the Vinylogous Aldol Reaction

The present thesis outlines the preparation of a 7-membered guanidine. Initial efforts to obtain this guanidine via 2-chloro-1,3-dimethylimidazolinium chloride induced ring forming chemistry failed to provide the target in a reproducible fashion. Changing strategies, we were able to obtain the desired guanidine through CuCl mediated amination of a 7-membered thiourea intermediate to arrive at the target. In addition, the catalytic activity of this compound was evaluated in a vinylogous aldol reaction of dibromofuranone and four aromatic aldehydes to generate chiral γ-butenolides with modest to good enantiomeric excess. It was found that electron-poor aldehydes resulted in higher, 81% ee, whereas electron rich aldehydes led to low, 41% ee, levels of enantiomeric excess.

Temporary Natural Resource Cartels

We analyze the behavior of a nonrenewable resource cartel that anticipates being forced, at some date in the future, to break-up into an oligopolistic market in which its members will then have to compete as rivals. Under reasonable assumptions about the value function of the individual firms in the oligopolistic equilibrium that follows the break-up, we show that the cartel will then produce more over the same interval of time than it would if there were no threat of dissolution, and that its rate of extraction is a decreasing function of the cartel's life; that there are circumstances under which the cartel will attach a negative marginal value to the resource stocks, in which case the rate of depletion will be increasing over time during the cartel phase; that, for a given date of dissolution, the equilibrium stocks allocated to the post-cartel phase will increase as a function of the total initial stocks, whereas those allocated to the cartel phase will increase at first, but begin decreasing beyond some level of the total initial stocks.

On the Profitability of Production Constraints in a Dynamic Natural Resource Oligopoly

Static oligopoly analysis predicts that if a single firm in Cournot equilibrium were to be constrained to contract its production marginally, its profits would fall. on the other hand, if all the firms were simultaneously constrained to reduce their productino, thus moving the industry towards monopoly output, each firm's profit would rise. We show that these very intuitive results may not hold in a dynamic oligopoly.

Regulation of microsomal prostaglandin E2 synthase-1 and 5-lipoxygenase-activating protein/5-lipoxygenase by 4-hydroxynonenal in human osteoarthritic chondrocytes

L’arthrose (OA) est une maladie dégénérative et multifactorielle caractérisée par une destruction de cartilage, une formation d’ostéophytes et une inflammation au niveau de la membrane synoviale. Le 4-hydroxynonénal (HNE), un produit final de la peroxydation lipidique, a été identifié récemment comme un facteur catabolique et un médiateur inflammatoire dans le cartilage arthrosique humain. Notre projet vise à étudier l’effet du HNE sur la régulation de la prostaglandine E2 synthase-1 microsomale (mPGES-1) et de la protéine activante 5-lipoxygénase (FLAP)/5-lipoxygénase (5-LOX) dans les chondrocytes arthrosiques humains. Lorsque les cellules sont traitées une seule fois avec 10 µM HNE, les résultats de Western blot et de PCR en temps réel montrent que l’expression de la cyclooxygénase-2 (COX-2) et de la mPGES-1 augmente de manière significative et atteint respectivement le maximum après 8 et 16 heures d’incubation puis diminue graduellement. Cependant, lorsque les cellules sont traitées plusieurs fois avec 10 µM HNE à 2 heures d’intervalle, l’expression de la COX-2 et de la mPGES-1 augmente en fonction du temps sans subir une baisse après 24 heures d’incubation. Le HNE induit l’activité du promoteur de la mPGES-1 via l’activation du facteur de transcription Egr-1. L’investigation de la 2ème voie du métabolisme de l’acide arachidonique, à savoir 5-LOX/FLAP, montre que le HNE induit l’expression de FLAP après 24 heures de stimulation et celle de 5-LOX seulement après 48 heures. Ceci semble survenir à l’étape de transcription au cours de laquelle HNE induit l’expression de l’ARNm et l’activité du promoteur du gène 5-LOX. Nous avons démontré aussi que le niveau de leukotriène B4 (LTB4) augmente et suit le même profil que celui de la 5-LOX. L’étude des mécanismes moléculaires susceptibles d’être impliqués dans la régulation de la 5-LOX/FLAP par le HNE montre que ce dernier stimule leur expression via l’action de prostaglandine E2 (PGE2) et du facteur de croissance transformant-beta 1 (TGF-β1). En conclusion, notre étude démontre que le HNE induit à court-terme d’incubation la voie de COX-2/mPGES-1 puis par la suite stimule celle de FLAP/5-LOX à long-terme d’incubation dans les chondrocytes arthrosiques humains. Ces résultats suggèrent que la mPGES-1 et 5-LOX/FLAP sont des potentielles cibles thérapeutiques intéressantes pour contrôler la production de PGE2 et LTB4 dans OA.

Les croyances des enseignants et des apprenants adultes quant à la rétroaction corrective à l’oral et la pratique réelle en classe de français langue étrangère en Égypte

Différentes études ont montré que le niveau des futurs enseignants, issus des écoles publiques, en français langue étrangère (FLE) en Égypte est assez faible. Ceux-ci font un grand nombre d’erreurs répétitives à l’oral. Quoique ce manque de précision langagière puisse être dû à plusieurs facteurs, il appert que la rétroaction soit une des variables contribuant à ce phénomène (comme le nombre d’étudiants en classe, la durée du cours, l’âge et la motivation des étudiants, les méthodes d’enseignement, etc.). La rétroaction corrective est généralement définie comme toute correction explicite ou implicite de la part de l’enseignant indiquant que la production de l’apprenant est erronée. Elle est considérée comme indispensable dans les classes de langues secondes (LS) (Shmidt, 1983, 2001 ; Long, 1991, 1996 ; Lightbown, 1998). Pour ces raisons, cette étude porte sur la rétroaction corrective et, plus spécifiquement, sur les croyances des enseignants et des apprenants quant à celle-ci, ainsi qu’à son utilisation dans les classes de FLE en Égypte. Les recherches antérieures indiquent que les croyances des enseignants quant à l’acte d’enseigner influencent leurs pratiques en classe, que les croyances des apprenants influencent leur motivation, leur niveau et leurs efforts déployés pour l’apprentissage de la langue, et qu’une divergence entre les croyances des professeurs et celles des apprenants peut entraîner des effets négatifs sur l’apprentissage de la langue cible, ce qui indique ainsi qu’il est de grande importance d’explorer les croyances. Ainsi, la présente étude vise à explorer les croyances des professeurs égyptiens et celles de leurs étudiants en ce qui a trait à la rétroaction corrective à l’oral, la différence entre ces croyances, et l’identification des pratiques réelles des professeurs afin de décrire à quel point celles-ci reflètent les croyances exprimées. Pour ce faire, un questionnaire a été administré à 175 étudiants et 25 professeurs appartenant à trois universités égyptiennes afin de déterminer leurs croyances déclarées. Des entrevues semi-dirigées et des observations directes ont été réalisées auprès de neuf des 25 professeurs participants pour mieux déterminer leurs croyances et leurs pratiques rétroactives. Les résultats obtenus ont révélé qu’il existe des divergences importantes entre les croyances des professeurs et celles des étudiants, d’un côté, et entre les croyances des professeurs et leur pratique, de l’autre côté. Par exemple, la plupart des étudiants ont déclaré leur opposition à l’utilisation de la reformulation alors que presque la moitié des professeurs ont indiqué être en faveur de cette même technique. Les professeurs ont indiqué que leur choix de techniques rétroactives dépend du type d’erreurs et qu’ils préfèrent inciter les apprenants à s’auto corriger. Cependant, ces mêmes professeurs ont utilisé la reformulation pour corriger la majorité des erreurs de leurs apprenants, quelle que soit leur nature. Nous parvenons ainsi à la conclusion que l’utilisation de la reformulation, qui fait l’objet d’une divergence au niveau des croyances, pourrait être à l’origine du manque de précision langagière rapporté par les chercheurs.

Molecular biodiversity of microbial communities in polluted soils and their role in soil phytoremediation

Les métaux lourds (ML) s’accumulent de plus en plus dans les sols à l’échelle mondiale, d’une part à cause des engrais minéraux et divers produits chimiques utilisés en agriculture intensive, et d’autre part à cause des activités industrielles. Toutes ces activités génèrent des déchets toxiques qui s’accumulent dans l’environnement. Les ML ne sont pas biodégradables et leur accumulation cause donc des problèmes de toxicité des sols et affecte la biodiversité des microorganismes qui y vivent. La fertilisation en azote (N) est une pratique courante en agriculture à grande échelle qui permet d’augmenter la fertilité des sols et la productivité des cultures. Cependant, son utilisation à long terme cause plusieurs effets néfastes pour l'environnement. Par exemple, elle augmente la quantité des ML dans les sols, les nappes phréatiques et les plantes. En outre, ces effets néfastes réduisent et changent considérablement la biodiversité des écosystèmes terrestres. La structure des communautés des champignons mycorhiziens à arbuscules (CMA) a été étudiée dans des sols contaminés par des ML issus de la fertilisation à long terme en N. Le rôle des différentes espèces de CMA dans l'absorption et la séquestration des ML a été aussi investigué. Dans une première expérience, la structure des communautés de CMA a été analysée à partir d’échantillons de sols de sites contaminés par des ML et de sites témoins non-contaminés. Nous avons constaté que la diversité des CMA indigènes a été plus faible dans les sols et les racines des plantes récoltées à partir de sites contaminés par rapport aux sites noncontaminés. Nous avons également constaté que la structure de la communauté d'AMF a été modifiée par la présence des ML dans les sols. Certains ribotypes des CMA ont été plus souvent associés aux sites contaminés, alors que d’autres ribotypes ont été associés aux sites non-contaminés. Cependant, certains ribotypes ont été observés aussi bien dans les sols pollués que non-pollués. Dans une deuxième expérience, les effets de la fertilisation organique et minérale (N) sur les différentes structures des communautés des CMA ont été étudiés. La variation de la structure de la communauté de CMA colonisant les racines a été analysée en fonction du type de fertilisation. Certains ribotypes de CMA étaient associés à la fertilisation organique et d'autres à la fertilisation minérale. En revanche, la fertilisation minérale a réduit le nombre de ribotypes de CMA alors que la fertilisation organique l’a augmenté. Dans cette expérience, j’ai démontré que le changement de structure des communautés de CMA colonisant des racines a eu un effet significatif sur la productivité des plantes. Dans une troisième expérience, le rôle de deux espèces de CMA (Glomus irregulare et G. mosseae) dans l'absorption du cadmium (Cd) par des plants de tournesol cultivés dans des sols amendés avec trois niveaux différents de Cd a été évalué. J’ai démontré que les deux espèces de CMA affectent différemment l’absorption ou la séquestration de ce ML par les plants de tournesol. Cette expérience a permis de mieux comprendre le rôle potentiel des CMA dans l'absorption des ML selon la concentration de cadmium dans le sol et les espèces de CMA. Mes recherches de doctorat démontrent donc que la fertilisation en N affecte la structure des communautés des CMA dans les racines et le sol. Le changement de structure de la communauté de CMA colonisant les racines affecte de manière significative la productivité des plantes. J’ai aussi démontré que, sous nos conditions expériemntales, l’espèce de CMA G. irregulare a été observée dans tous les sites (pollués et non-pollués), tandis que le G. mosseae n’a été observé en abondance que dans les sites contaminés. Par conséquent, j’ai étudié le rôle de ces deux espèces (G. irregulare et G. mosseae) dans l'absorption du Cd par le tournesol cultivé dans des sols amendés avec trois différents niveaux de Cd en serre. Les résultats indiquent que les espèces de CMA ont un potentiel différent pour atténuer la toxicité des ML dans les plantes hôtes, selon le niveau de concentration en Cd. En conclusion, mes travaux suggèrent que le G. irregulare est une espèce potentiellement importante pour la phytoextration du Cd, alors que le G. mosseae pourrait être une espèce appropriée pour phytostabilisation du Cd et du Zn.