Estudi de la regulació del procés de formació de la fusta per a l’obtenció de biomassa i biocombustibles: el paper clau de dos factors de transcripció MYB amb funcions antagòniques

Estudi realitzat a partir d’una estada al Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales - Université Toulouse III, entre 2010 i 2012. Durant l’estada s’han pogut complir els principals objectius del projecte de recerca sobre la regulació de la formació de les parets secundàries en un arbre d’importància econòmica, l’eucaliptus. S’ha caracteritzat dos factors de transcripció, EgMYB1 i 2, comparant el seu patró d’expressió espaciotemporal a nivell cel•lular i estudiant l’efecte fenotípic de la pèrdua de funció d’aquests gens. A més, s’ha construït una llibreria de xilema d’eucaliptus adaptada a la tècnica dels dos híbrids i s’ha descobert alguns del partners proteics d’EgMYB1 i 2, els quals estic actualment validant per mètodes alternatius. Augmentant els objectius inicials de la sol•licitud, he aprofitat la recent publicació del genoma de l’Eucalyptus grandis per identificar i caracteritzar el patró d’expressió de vàries famílies gèniques.

Estudi del paper de la JMJD3 en la progressió tumoral induïda per TGFB

La demetilasa d’histones JMJD3 (Jumonji domain containing protein 3), és un enzim capaç de de demetilar específicament la lisina 27 a la histona 3 (H3K27), eliminant així una marca epigenètica relacionada amb la repressió transcripcional. Recentment s’ha descrit que està implicada en el manteniment de la pluripotència de les cèl•lules mare embrionàries (ESCs). A més, també s’ha demostrat el seu paper en la regulació de processos fisiològics d’inflamació, de reprogramació epigenètica i de diferenciació, així com en la progressió del càncer de colon. En aquesta línia, resultats previs del grup han demostrat que l’expressió de JMJD3 està regulada per TGFB, en línies cel•lulars derivades de glioma. Tenint en compte aquests antecedents, l’objectiu principal d’aquest projecte ha estat estudiar el paper principal de la JMJD3 en la regulació epigenètica de la progressió tumoral induïda per TGFB. Els nostres resultats demostren que l’expressió de JMD3 en cèl•lules A549, derivades d’un adenocarcinoma de pulmó, es veu fortament induïda després d’un tractament amb TGFB. Aquest augment es produeix ràpidament i es manté almenys 48 hores, temps en el que té lloc la transició epitelio-mesenquimal (EMT). Per tal d’estudiar el paper de la JMD3 en aquest procés de transdiferenciació, vam generar línies cel•lulars estables mitjançant la infecció amb vectors lentivirals que expressaven shRNAs específics contra la seva seqüència. El knockdown de JMJD3 va bloquejar significativament l’expressió de marcadors mesenquimals, tant a nivell RNA com de proteïna en presència de TGFB. Aquests resultats suggereixen que la demetilasa d’histones JMJD3 té un paper clau en la regulació de la EMT induïda per TGFB.

Body fluid and tissue analysis using filter paper sampling support prior to LC-MS/MS: application to fatal overdose with colchicine

Because of the various matrices available for forensic investigations, the development of versatile analytical approaches allowing the simultaneous determination of drugs is challenging. The aim of this work was to assess a liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) platform allowing the rapid quantification of colchicine in body fluids and tissues collected in the context of a fatal overdose. For this purpose, filter paper was used as a sampling support and was associated with an automated 96-well plate extraction performed by the LC autosampler itself. The developed method features a 7-min total run time including automated filter paper extraction (2 min) and chromatographic separation (5 min). The sample preparation was reduced to a minimum regardless of the matrix analyzed. This platform was fully validated for dried blood spots (DBS) in the toxic concentration range of colchicine. The DBS calibration curve was applied successfully to quantification in all other matrices (body fluids and tissues) except for bile, where an excessive matrix effect was found. The distribution of colchicine for a fatal overdose case was reported as follows: peripheral blood, 29 ng/ml; urine, 94 ng/ml; vitreous humour and cerebrospinal fluid, < 5 ng/ml; pericardial fluid, 14 ng/ml; brain, < 5 pg/mg; heart, 121 pg/mg; kidney, 245 pg/mg; and liver, 143 pg/mg. Although filter paper is usually employed for DBS, we report here the extension of this alternative sampling support to the analysis of other body fluids and tissues. The developed platform represents a rapid and versatile approach for drug determination in multiple forensic media.

Communication skills training in oncology: a position paper based on a consensus meeting among European experts in 2009.

BACKGROUND: Communication in cancer care has become a major topic of interest. Since there is evidence that ineffective communication affects both patients and oncology clinicians (physicians and nurses), so-called communication skills trainings (CSTs) have been developed over the last decade. While these trainings have been demonstrated to be effective, there is an important heterogeneity with regard to implementation and with regard to evidence of different aspects of CST. METHODS: In order to review and discuss the scientific literature on CST in oncology and to formulate recommendations, the Swiss Cancer League has organised a consensus meeting with European opinion leaders and experts in the field of CST, as well as oncology clinicians, representatives of oncology societies and patient organisations. On the basis of a systematic review and a meta-analysis, recommendations have been developed and agreed upon. RESULTS: Recommendations address (i) the setting, objectives and participants of CST, (ii) its content and pedagogic tools, (iii) organisational aspects, (iv) outcome and (v) future directions and research. CONCLUSION: This consensus meeting, on the basis of European expert opinions and a systematic review and meta-analysis, defines key elements for the current provision and future development and evaluation of CST in oncology.

Little effect of seasonal constraints on population genetic structure in eusocial paper wasps.

Climate has long been suggested to affect population genetic structures of eusocial insect societies. For instance, Hamilton [Journal of Theoretical Biology7 (1964) 17] discusses whether temperate and tropical eusocial insects may show differences in population-level genetic structure and viscosity, and how this might relate to differences in the degree of synchrony in their life cycles or modes of nest founding. Despite the importance of Hamilton's 1964 papers, this specific idea has not been tested in actual populations of wasps, probably due to the paucity of studies on tropical species. Here, we compare colony and population genetic structures in two species of primitively eusocial paper wasps with contrasting ecologies: the tropical species Polistes canadensis and the temperate species P. dominulus. Our results provide important clarifications of Hamilton's discussion. Specifically, we show that the genetic structures of the temperate and tropical species were very similar, indicating that seasonality does not greatly affect population viscosity or inbreeding. For both species, the high genetic differentiation between nests suggests strong selection at the nest level to live with relatives, whereas low population viscosity and low genetic differentiation between nest aggregations might reflect balancing selection to disperse, avoiding competition with relatives. Overall, our study suggests no prevalence of seasonal constraints of the life cycle in affecting the population genetic structure of eusocial paper wasps. These conclusions are likely to apply also to other primitively eusocial insects, such as halictine bees. They also highlight how selection for a kin structure that promotes altruism can override potential effects of ecology in eusocial insects.

Del ciberespai al paper

El món editorial més tradicional tendeix cada vegada més a apostar per medis electrònics com a base per a la difusió del seu contingut o com a complement de l’edició en paper. És pràcticament un pas natural que han fet o estant fent la majoriade publicacions en paper.El creixement d’Internet, tant en nombre d’usuaris com en inversió publicitària, juntament amb la poca necessitat d’inversió per a la creació de revistes online, ha propiciat el sorgiment de revistes exclusivament virtuals que han esdevingut les mésimportants d’Internet, per sobre de publicacions virtuals de revistes amb edició en paper.Però tot i que Internet es el futur, el medi en paper és i serà un mercat molt important a mitjà termini. El mercat publicitari es paga força millor que en les pàgines web, on els models s’esgoten molt ràpidament i s’ha d’innovar constantment per tal de mantenir el click-rate dels usuaris. L’atenció que l’usuari presta a la publicitat en paper és molt més alta que en les pàgines web i menys molesta per l’usuari.El nostre treball es centrarà en fer el pas contrari a l’habitual, és a dir, en convertir una revista exclusivament virtual en una revista que publiqui també en paper. Analitzarem els possibles beneficis d’aquest pas així com els costos que suposaria adaptar un medi virtual al paper.El repte estarà en investigar quin és el model de revista idoni per completar el pas del medi virtual al paper, aconseguint maximitzar els beneficis.

Nevera, mp3, mòbil... quin és el seu paper actual?

Des dels seus inicis, l’ésser humà ha tingut una sèrie de necessitats. Ha requerit d’aliment per sobreviure, d’un sostre on refugiar-se, de roba per vestirse, etc. Conforme han passat els anys, ha anat generant tècniques per a millorar la seva estància al planeta, des del descobriment del foc per escalfarse fins al desenvolupament de màquines complexes. És per això, que ha anat introduint invents a la seva vida que han cobert les necessitats sorgides al llarg del temps.El treball que desenvolupem a continuació es centra en un seguit d’aparells que han sorgit al llarg del segle XX i que han revolucionat la nostra vida. Concretament, els set aparells escollits com a objecte del nostre estudi són: la nevera, la rentadora, l’automòbil, la televisió, el reproductor d’àudio portàtil, el telèfon mòbil i l’ordinador.L’aparició d’electrodomèstics, com la nevera o la rentadora, no només ens ha permès dedicar menys esforç a les tasques domèstiques, sinó també estalviarnos temps a l’hora de realitzar-les. Aquest fet, que ara potser ni tan sols considerem, va ser del tot determinant a l’època que van sorgir, ja que va permetre alliberar mà d’obra domèstica promovent la inserció al mercat laboral d’un sector de la població com el del sexe femení.Per la seva banda, la introducció de l’automòbil també ha estat un gran avenç. Aquest, ha revolucionat la manera de desplaçar-nos, proporcionant-nos una autonomia fins aleshores impensable.Aquest mateix patró segueixen la resta d’altres aparells escollits; tots van provocar un canvi profund a la societat amb la seva aparició i, encara avui, segueixen mantenint un paper destacat al nostre dia a dia. La importància que tenen a les nostres vides ha estat la motivació que ens ha conduït a dur a terme un treball que els tingués com a protagonistes.El nostre treball consta de dues parts:A la primera, de caràcter teòric, ens hem proposat estudiar la història d’aquests aparells, és a dir, hem volgut donar resposta a una sèrie de preguntes com: quan van aparèixer, quins van ser els seus creadors i quines transformacions han anat experimentant al llarg del temps, entre d’altres.A la segona part, més pràctica, hem realitzat un treball de camp (les característiques del qual expliquem detalladament a l’apartat següent) amb l’objectiu d’analitzar la rellevància que tenen aquests aparells a la societat actual. És a dir, hem volgut saber quins aparells, dels escollits, són els més valorats per la població avui dia i quins són els que menys. Pensem que l’ús que els enquestats fan d’aquests béns serà un criteri clau a l’hora de puntuarlos, encara que no l’únic. Hem realitzat aquest anàlisi diferenciant els individus per franges d’edat i sexes. A més, també hem treballat altres qüestions comserien, entre d’altres, si el seu ús s’entén com una necessitat o va encaminat cap a l’oci; quant temps triguen els usuaris a renovar-los, quin és el motiu, etc. En relació amb aquesta segona part, hem formulat un seguit d’hipòtesis amb l’objectiu de contrastar-les posteriorment amb els resultats de les enquestes.Les hipòtesis són:- Avui dia, els individus donen més importància a aquells aparells que són més moderns, (entenent com a tals, aquells que han sorgit més recentment i estan lligats a les noves tecnologies i la innovació contínua), com poden ser l’ordinador i el telèfon mòbil, que els electrodomèstics més tradicionals com serien la nevera o la rentadora. Tot això, a més, considerant que pel que fa als primers, entenem que part del seu ús està destinat a l’oci; mentre que pels segons el seu ús està motivat per una necessitat, com seria l’alimentació en el cas de la nevera.- Pel que fa a les franges d’edat, les valoracions mostraran diferències importants en els diversos aparells. Entre la franja més jove (de 16 a 25 anys) i la de més edat (més de 60 anys), les valoracions seran més extremes, gairebé oposades.- Pel que fa als dos sexes, les valoracions que donin als aparells seran molt semblants.Hem considerat que per a dur a terme un bon anàlisi, el més adequat és presentar la informació de cada aparell per separat. És per això que cada bé constitueix un apartat independent que consta d’una primera part referent a la seva història, i una segona referent als resultats obtinguts de les enquestes.A continuació, hem procedit a ajuntar els resultats extrets dels diferents aparells i a presentant-los de forma conjunta per a comparar-los. Així, hem pogut contrastar les nostres hipòtesis inicials i hem raonat possibles causes que justificarien dels resultats obtinguts.

Developmental time of immature forms of Sabethes aurescens Lutz (Diptera, Culicidae) from artificially perforated bamboo in the rain forest of southern Brazil

The development time of the immature forms of Sabethes aurescens Lutz, 1905, from perforated bamboo in the southern Brazil rain forest was studied under laboratory conditions. Mean development periods were 5±2.23, 10±5.20, 14±8.26, 36±13.90 and 9±2.43 days, respectively, for the four larval instars and pupae. The 4th instar of females was longer than that of males. Implications of the long development time of the immature forms of Sa. aurescens are discussed.

First report of interspecific facultative social parasitism in the paper wasp genus Mischocyttarus Saussure (Hymenoptera, Vespidae)

First report of interspecific facultative social parasitism in the paper wasp genus Mischocyttarus Saussure (Hymenoptera, Vespidae). Parasitism of colonies of the social wasp Mischocyttarus cerberus Ducke, 1918 by females of Mischocyttarus consimilis Zikán, 1949 was observed in a rural area of Dourados, state of Mato Grosso do Sul, Brazil. In all monitored cases, the invasion occurred in the pre-emergence colony stage, generally by a single female of M. consimilis. The period of establishment of the foreign female in the host colony was marked by antagonistic behaviors between the host female and the invasive. In general, the architecture of the parasitized nest was modified from the typical architecture of the host species nest.

Cumulative frequency-dependent selective episodes allow for rapid morph cycles and rock-paper-scissors dynamics in species with overlapping generations.

Rock-paper-scissors (RPS) dynamics, which maintain genetic polymorphisms over time through negative frequency-dependent (FD) selection, can evolve in short-lived species with no generational overlap, where they produce rapid morph frequency cycles. However, most species have overlapping generations and thus, rapid RPS dynamics are thought to require stronger FD selection, the existence of which yet needs to be proved. Here, we experimentally demonstrate that two cumulative selective episodes, FD sexual selection reinforced by FD selection on offspring survival, generate sufficiently strong selection to generate rapid morph frequency cycles in the European common lizard Zootoca vivipara, a multi-annual species with major generational overlap. These findings show that the conditions required for the evolution of RPS games are fulfilled by almost all species exhibiting genetic polymorphisms and suggest that RPS games may be responsible for the maintenance of genetic diversity in a wide range of species.

European society of hypertension position paper on ambulatory blood pressure monitoring.

Ambulatory blood pressure monitoring (ABPM) is being used increasingly in both clinical practice and hypertension research. Although there are many guidelines that emphasize the indications for ABPM, there is no comprehensive guideline dealing with all aspects of the technique. It was agreed at a consensus meeting on ABPM in Milan in 2011 that the 34 attendees should prepare a comprehensive position paper on the scientific evidence for ABPM.This position paper considers the historical background, the advantages and limitations of ABPM, the threshold levels for practice, and the cost-effectiveness of the technique. It examines the need for selecting an appropriate device, the accuracy of devices, the additional information and indices that ABPM devices may provide, and the software requirements.At a practical level, the paper details the requirements for using ABPM in clinical practice, editing considerations, the number of measurements required, and the circumstances, such as obesity and arrhythmias, when particular care needs to be taken when using ABPM.The clinical indications for ABPM, among which white-coat phenomena, masked hypertension, and nocturnal hypertension appear to be prominent, are outlined in detail along with special considerations that apply in certain clinical circumstances, such as childhood, the elderly and pregnancy, and in cardiovascular illness, examples being stroke and chronic renal disease, and the place of home measurement of blood pressure in relation to ABPM is appraised.The role of ABPM in research circumstances, such as pharmacological trials and in the prediction of outcome in epidemiological studies is examined and finally the implementation of ABPM in practice is considered in relation to the issue of reimbursement in different countries, the provision of the technique by primary care practices, hospital clinics and pharmacies, and the growing role of registries of ABPM in many countries.

Reaction paper : what? why? how?

Abstract

Paper 4: EUROCAT statistical monitoring: identification and investigation of ten year trends of congenital anomalies in Europe.

BACKGROUND: As part of EUROCAT's surveillance of congenital anomalies in Europe, a statistical monitoring system has been developed to detect recent clusters or long-term (10 year) time trends. The purpose of this article is to describe the system for the identification and investigation of 10-year time trends, conceived as a "screening" tool ultimately leading to the identification of trends which may be due to changing teratogenic factors.METHODS: The EUROCAT database consists of all cases of congenital anomalies including livebirths, fetal deaths from 20 weeks gestational age, and terminations of pregnancy for fetal anomaly. Monitoring of 10-year trends is performed for each registry for each of 96 non-independent EUROCAT congenital anomaly subgroups, while Pan-Europe analysis combines data from all registries. The monitoring results are reviewed, prioritized according to a prioritization strategy, and communicated to registries for investigation. Twenty-one registries covering over 4 million births, from 1999 to 2008, were included in monitoring in 2010.CONCLUSIONS: Significant increasing trends were detected for abdominal wall anomalies, gastroschisis, hypospadias, Trisomy 18 and renal dysplasia in the Pan-Europe analysis while 68 increasing trends were identified in individual registries. A decreasing trend was detected in over one-third of anomaly subgroups in the Pan-Europe analysis, and 16.9% of individual registry tests. Registry preliminary investigations indicated that many trends are due to changes in data quality, ascertainment, screening, or diagnostic methods. Some trends are inevitably chance phenomena related to multiple testing, while others seem to represent real and continuing change needing further investigation and response by regional/national public health authorities.