Density, proportion, and dendritic coverage of retinal ganglion cells of the common marmoset (Callithrix jacchus jacchus)

We performed a quantitative analysis of M and P cell mosaics of the common-marmoset retina. Ganglion cells were labeled retrogradely from optic nerve deposits of Biocytin. The labeling was visualized using horseradish peroxidase (HRP) histochemistry and 3-3'diaminobenzidine as chromogen. M and P cells were morphologically similar to those found in Old- and New-World primates. Measurements were performed on well-stained cells from 4 retinas of different animals. We analyzed separate mosaics for inner and outer M and P cells at increasing distances from the fovea (2.5-9 mm of eccentricity) to estimate cell density, proportion, and dendritic coverage. M cell density decreased towards the retinal periphery in all quadrants. M cell density was higher in the nasal quadrant than in other retinal regions at similar eccentricities, reaching about 740 cells/mm2 at 2.5 mm of temporal eccentricity, and representing 8-14% of all ganglion cells. P cell density increased from peripheral to more central regions, reaching about 5540 cells/mm2 at 2.5 mm of temporal eccentricity. P cells represented a smaller proportion of all ganglion cells in the nasal quadrant than in other quadrants, and their numbers increased towards central retinal regions. The M cell coverage factor ranged from 5 to 12 and the P cell coverage factor ranged from 1 to 3 in the nasal quadrant and from 5 to 12 in the other quadrants. These results show that central and peripheral retinal regions differ in terms of cell class proportions and dendritic coverage, and their properties do not result from simply scaling down cell density. Therefore, differences in functional properties between central and peripheral vision should take these distinct regional retinal characteristics into account.

Influências dos ninhos de saúva (Formicidae: Attini) na nutrição, crescimento e proteção da vegetação contra o fogo, em uma floresta de transição Amazônia-Cerrado

Os ninhos de saúva são importantes perturbações naturais capazes de gerar mosaicos de determinados tipos de vegetação e afetar a estrutura e composição dos ecossistemas neotropicais. Nesse sentido, este estudo avaliou os efeitos dos ninhos de saúva (Atta spp.) na dinâmica de crescimento da vegetação de uma floresta de transição Amazônia-Cerrado submetida a um regime de incêndios periódicos, ao sul da bacia amazônica, Estado do Mato Grosso, Brasil. Especificamente, avaliou-se os efeitos dos ninhos: (1) na nutrição e crescimento da vegetação; (2) na proteção da vegetação contra o fogo e (3) na regeneração florestal pós-fogo. Para determinar tais efeitos, ninhos e vegetação associada (em um raio de até 10 m dos ninhos) estabelecidos em áreas de 150 ha da floresta de transição, foram mapeados e monitorados. Tais áreas subdivididas em parcelas de 50 ha com diferentes tratamentos: incêndios tri-anuais; incêndios anuais e proteção do fogo (controle) fazem parte do Projeto “Savanização” sob a coordenação do Instituto de Pesquisas Ambiental da Amazônia, IPAM. Os experimentos sobre os efeitos dos ninhos na nutrição e crescimento da vegetação indicaram que plantas estabelecidas próximas aos ninhos têm a absorção de nutriente facilitada e por isso apresentaram uma maior concentração foliar de Fósforo. Como conseqüência, foi registrado um maior crescimento em diâmetro do caule para estas plantas quando comparadas com aquelas distantes dos ninhos. Os ninhos funcionaram como aceiros (devido ao acúmulo de terra sobre os murundus resultante das escavações das saúvas) reduzindo a área total queimada em seu entorno, principalmente nos locais de bordas (local de maior incidência de ninhos) e protegendo a vegetação circundante da mortalidade pelo fogo. Em oposição a estes benefícios, foi constatado maior herbivoria de plântulas e remoção de sementes por saúvas nas áreas de alta densidade de colônias ativas, um resultado que compromete os estágios iniciais de sucessão florestal pós-fogo. Este estudo revela a importância das saúvas na redistribuição e reciclagem de nutrientes, e revela, pela primeira vez, a proteção da vegetação contra o fogo, por seus ninhos. Por outro lado, também mostra que perturbações antrópicas, como o fogo, aumentam as populações de saúva, o que pode tornar-se uma barreira ao sucesso da regeneração florestal pós-fogo. Com base nesse estudo, pode-se prever que ambientes naturais podem ter o crescimento da vegetação acelerado pela presença dos ninhos de saúva, mas em ambientes sob perturbação, a ação das saúvas pode ser a principal ameaça a regeneração da vegetação original. Desta forma, pode-se concluir que os efeitos (benéficos ou deletérios) das saúvas dependem do nível de perturbação ou maturidade do bioma no qual seus ninhos se estabelecem.

A concepção geossistêmica aplicada ao estudo da dinâmica da paisagem na bacia hidrográfica do rio Lourenço Velho, sul do estado de Minas Gerais - Brasil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Comunidades de aves em um mosaico de Eucalyptus em Rio Claro, São Paulo

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Variabilidade fenótipica e interação com polinizadores ao longo de um gradiente latitudinal em Zeyheria montana Mart. (Bignoniaceae)

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Botânica) - IBB

A recepção do mito de Heráclio por Gautier d’Arras

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estabilizações e mudanças na composição semiótica da imagem de Cristo: o cruzamento entre sagrado e profano

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Relações entre tamanho populacional, uso do habitat, dieta e predação de ninhos por Nasua nasua (Carnivora, Procyonidae) em remanescentes florestais

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Produção de mudas de espécies florestais de restinga, com base em estudos florísticos e fitossociológicos, visando a recuperação de áreas degradadas, em Ilha Comprida - SP

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Aprendendo isometria com mosaicos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

O ensino de geometria através da pavimentação do plano

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Combining ALOS/PALSAR derived vegetation structure and inundation patterns to characterize major vegetation types in the Mamiraua Sustainable Development Reserve, Central Amazon floodplain, Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Segmentação de texturas em imagens digitais utilizando wavelets redundantes

Pós-graduação em Matematica Aplicada e Computacional - FCT

BF Integrase Genes of HIV-1 Circulating in Sao Paulo, Brazil, with a Recurrent Recombination Region

Although some studies have shown diversity in HIV integrase (IN) genes, none has focused particularly on the gene evolving in epidemics in the context of recombination. The IN gene in 157 HIV-1 integrase inhibitor-naive patients from the Sao Paulo State, Brazil, were sequenced tallying 128 of subtype B (23 of which were found in non-B genomes), 17 of subtype F (8 of which were found in recombinant genomes), 11 integrases were BF recombinants, and 1 from subtype C. Crucially, we found that 4 BF recombinant viruses shared a recurrent recombination breakpoint region between positions 4900 and 4924 (relative to the HXB2) that includes 2 gRNA loops, where the RT may stutter. Since these recombinants had independent phylogenetic origin, we argue that these results suggest a possible recombination hotspot not observed so far in BF CRF in particular, or in any other HIV-1 CRF in general. Additionally, 40% of the drug-naive and 45% of the drug-treated patients had at least 1 raltegravir (RAL) or elvitegravir (EVG) resistance-associated amino acid change, but no major resistance mutations were found, in line with other studies. Importantly, V151I was the most common minor resistance mutation among B, F and BF IN genes. Most codon sites of the IN genes had higher rates of synonymous substitutions (dS) indicative of a strong negative selection. Nevertheless, several codon sites mainly in the subtype B were found under positive selection. Consequently, we observed a higher genetic diversity in the B portions of the mosaics, possibly due to the more recent introduction of subtype F on top of an ongoing subtype B epidemics and a fast spread of subtype F alleles among the B population.

Clinical, epidemiological and molecular features of the HIV-1 subtype C and recombinant forms that are circulating in the city of Sao Paulo, Brazil

Background: The city of Sao Paulo has the highest AIDS case rate, with nearly 60% in Brazil. Despite, several studies involving molecular epidemiology, lack of data regarding a large cohort study has not been published from this city. Objectives: This study aimed to describe the HIV-1 subtypes, recombinant forms and drug resistance mutations, according to subtype, with emphasis on subtype C and BC recombinants in the city of Sao Paulo, Brazil. Study design: RNA was extracted from the plasma samples of 302 HIV-1-seropositive subjects, of which 211 were drug-naive and 82 were exposed to ART. HIV-1 partial pol region sequences were used in phylogenetic analyses for subtyping and identification of drug resistance mutations. The envelope gene of subtype C and BC samples was also sequenced. Results: From partial pol gene analyses, 239 samples (79.1%) were assigned as subtype B, 23 (7.6%) were F1, 16 (5.3%) were subtype C and 24 (8%) were mosaics (3 CRF28/CRF29-like). The subtype C and BC recombinants were mainly identified in drug-naive patients (72.7%) and the heterosexual risk exposure category (86.3%), whereas for subtype B, these values were 69.9% and 57.3%, respectively (p = 0.97 and p = 0.015, respectively). An increasing trend of subtype C and BC recombinants was observed (p < 0.01). Conclusion: The HIV-1 subtype C and CRFs seem to have emerged over the last few years in the city of Sao Paulo, principally among the heterosexual population. These findings may have an impact on preventive measures and vaccine development in Brazil.