Synthesis and structure of La14V6CuO36.5: a transparent Cu(I) vanadate containing [OCuO](3-) sticks

The title compound, La14V6CuO36.5, was prepared from a stoichiometric mixture of La2O3,V2O5, and CuO at 1050-1080 degreesC. The compound forms transparent, pale green crystals and was characterized by wavelength dispersive spectroscopy and single crystal X-ray diffraction. The structure contains isolated VO43- tetrahedra and [OCuO](3-) sticks dispersed in a lanthanum oxide network. Films of La14V6CuO36.5 were grown on R-plane sapphire by using pulsed laser deposition. Rutherford backscattering spectroscopic and X-ray diffraction analyses of the films showed oriented growth of the title phase, a similar to5 eV optical band gap and n-type conductivity. The compound is an example of a transparent copper(I) oxide.

Effect of ester chemical structure and peptide bond conformation in fragmentation pathways of differently metal cationized cyclodepsipeptides

Fragmentation behavior of two classes of cyclodepsipeptides, isariins and isaridins, obtained from the fungus Isaria, was investigated in the presence of different metal ions using multistage tandem mass spectrometry (MS(n)) with collision induced dissociation (CID) and validated by NMR spectroscopy. During MS(n) process, both protonated and metal-cationized isariins generated product ions belonging to the identical `b-ion' series, exhibiting initial backbone cleavage explicitly at the beta-ester bond. Fragmentation behavior for the protonated and metal-cationized acyclic methyl ester derivative of isariins was very similar. On the contrary, isaridins during fragmentation produced ions belonging to the `b' or/and the `y' ion series depending on the nature of interacting metal ions, due to initial backbone cleavages at the beta-ester linkage or/and at a specific amide linkage. Interestingly, independent of the nature of the interacting metal ions, the product ions formed from the acyclic methyl ester derivative of isaridins belonged only to the `y-type'. Complementary NMR data showed that, while all metal ions were located around the beta-ester group of isariins, the metal ion interacting sites varied across the backbone for isaridins. Combined MS and NMR data suggest that the different behavior in sequence specific charge-driven fragmentation of isariins and isaridins is predetermined because of the constituent beta-hydroxy acid residue in isariins and the cis peptide bond in isaridins.

Conformational studies of the phosphazenyl side chain in cyclophosphazenes. Part 3. Crystal and molecular structure of N3P3Cl4(NEt2)(NPPh3)

The crystal structure of N3P3Cl4(NEt2)(NPPh3) has been determined. The crystals are orthorhombic, space group Pbca, with a= 8.208(1), b= 21.890(1), c= 31.722(2)Å, Z= 8, and m.p. = 146.5 °C. The structure was solved by direct methods and refined to a final R value of 0.045 for 2 025 independent reflections. The analysis reveals significant variations in the ring P–N bond lengths. The two nitrogenous substituents, NPPh3 and NEt2, reside on the same phosphorus atom. The latter, NEt2, has an almost exact type II conformation (the plane NC2 almost perpendicular to the local NPN plane)(the first observed for a dialkylamino-group in cyclophosphazenes), the former, NPPh3, deviates from type II towards type III (in type III the plane Pring–N–Pexo makes an angle of ca. 45° with the local N–P–N ring plane). The present structure is compared with others of triphenylphosphazenyl-cyclophosphazenes and the conformation of the NPPh3 substituent and its electron supply in the ground and perturbed states are discussed.

Structure of DNA-functionalized dendrimer nanoparticles

Atomistic molecular dynamics simulations have been carried out to reveal the characteristic features of ethylenediamine (EDA) cored protonated (corresponding to neutral pH) poly amido amine (PAMAM) dendrimers of generation 3 (G3) and 4 (G4) that are functionalized with single strand DNAs (ssDNAs). The four ssDNA strands that are attached via an alkythiolate [-S(CH(2))(6)-] linker molecule to the free amine groups on the surface of the PAMAM dendrimers are observed to undergo a rapid conformational change during the 25 ns long simulation period. From the RMSD values of ssDNAs, we find relative stability in the case of purine rich (having more adenine and guanine) ssDNA strands than pyrimidine rich (thymine and cytosine) ssDNA strands. The degree of wrapping of ssDNA strands on the dendrimer molecule was found to be influenced by the charge ratio of DNA and the dendrimer. As the G4 dendrimer contains relatively more positive charge than G3 dendrimer, we observe extensive wrapping of ssDNAs on the G4 dendrimer than G3 dendrimer. This might indicate that DNA functionalized G3 dendrimer is more suitable to construct higher order nanostructures. The linker molecule was also found to undergo drastic conformational change during the simulation. During nanosecond long simulation some portion of the linker molecule was found to be lying nearly flat on the surface of the dendrimer molecule. The ssDNA strands along with the linkers are seen to penetrate the surface of the dendrimer molecule and approach closer to the center of the dendrimer indicating the soft sphere nature of the dendrimer molecule. The effective radius of DNA-functionalized dendrimer nanoparticles was found to be independent of base composition of ssDNAs and was observed to be around 19.5 angstrom and 22.4 angstrom when we used G3 and G4 PAMAM dendrimers as the core of the nanoparticle respectively. The observed effective radius of DNA-functionalized dendrimer molecules apparently indicates the significant shrinkage in the structure that has taken place in dendrimer, linker and DNA strands. As a whole our results describe the characteristic features of DNA-functionalized dendrimer nanoparticles and can be used as strong inputs to design effectively the DNA-dendrimer nanoparticle self-assembly for their active biological applications.

Synthesis, X-ray crystal structure, DNA binding, antioxidant and cytotoxicity studies of Ni(II) and Pd(II) thiosemicarbazone complexes

New complexes, [Ni(HL)(PPh3)]Cl (1), [Pd(L)(PPh3)](2), and [Pd(L)(AsPh3)](3), were synthesized from the reactions of 4-chloro-5-methyl-salicylaldehyde thiosemicarbazone [H2L] with [NiCl2(PPh3)(2)], [PdCl2(PPh3)(2)] and [PdCl2(AsPh3)(2)]. They were characterized by IR, electronic, H-1-NMR spectral data. Further, the structures of the complexes have been determined by single crystal X-ray diffraction. While the thiosemicarbazone coordinated as binegative tridentate (ONS) in complexes 2 and 3, it is coordinated as mono negative tridentate (ONS) in 1. The interactions of the new complexes with calf thymus DNA was examined by absorption and emission spectra, and viscosity measurements. Moreover, the antioxidant properties of the new complexes have also been tested against DPPH radical in which complex 1 exhibited better activity than that of the other two complexes 2 and 3. The in vitro cytotoxicity of complexes 1-3 against A549 and HepG2 cell lines was assayed, and the new complexes exhibited higher cytotoxic activity with lower IC50 values indicating their efficiency in killing the cancer cells even at very low concentrations.

Synthesis, growth, and characterization of a new NLO material 3-(2,3-dimethoxyphenyl)-1-(pyridin-2-yl)prop-2-en-1-one

3-(2,3-Dimethoxyphenyl)-1-(pyridin-2-yl)prop-2-en-1-one (DMPP) a potential second harmonic generating (SHG) has been synthesized and grown as a single crystal by the slow evaporation technique at ambient temperature. The structure determination of the grown crystal was done by single crystal X-ray diffraction study. DMPP crystallizes with orthorhombic system with cell parameters a = 20.3106(8)angstrom, b = 4.9574(2)angstrom, c = 13.4863(5)angstrom, alpha = 90 degrees, beta = 90 degrees, gamma = 90 degrees and space group Pca2(1). The crystals were characterized by FT-IR, thermal analysis, UV-vis-NIR spectroscopy and SHG measurements. Various functional groups present in DMPP were ascertained by FTIR analysis. DMPP is thermally stable up to 80 degrees C and optically transparent in the visible region. The crystal exhibits SHG efficiency comparable to that of KDP. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.

Sequence-Structure Similarity: Do Sequentially Identical Peptide Fragments have Similar Three-Dimensional Structures?

The rapidly growing structure databases enhance the probability of finding identical sequences sharing structural similarity. Structure prediction methods are being used extensively to abridge the gap between known protein sequences and the solved structures which is essential to understand its specific biochemical and cellular functions. In this work, we plan to study the ambiguity between sequence-structure relationships and examine if sequentially identical peptide fragments adopt similar three-dimensional structures. Fragments of varying lengths (five to ten residues) were used to observe the behavior of sequence and its three-dimensional structures. The STAMP program was used to superpose the three-dimensional structures and the two parameters (Sequence Structure Similarity Score (Sc) and Root Mean Square Deviation value) were employed to classify them into three categories: similar, intermediate and dissimilar structures. Furthermore, the same approach was carried out on all the three-dimensional protein structures solved in the two organisms, Mycobacterium tuberculosis and Plasmodium falciparum to validate our results.

Variabilidad molecular en una población de lotus tenuis tolerante a la salinidad

Resumen: Lotus tenuis Waldst et Kit (ex Lotus glaber Mill) (2n=2x=12), es una leguminosa perenne, utilizada como forrajera, que se introdujo en suelos salinoalcalinos de la Pampa Deprimida de la Provincia de Buenos Aires. L. tenuis presenta variabilidad genética para caracteres asociados a la tolerancia a salinidad que esta siendo explorada y explotada en programas de mejoramiento. El estudio de la variabilidad molecular en esta especie permitirá ayudar a los programas de mejoramiento a incrementar la adaptación de la especie en la Pampa Deprimida, permitiendo identificar poblaciones aptas para lograr alta productividad en los suelos salinos de la región. Mediante este trabajo se buscó cuantificar la variabilidad molecular de una población de L. tenuis tolerante a alta salinidad, para lo cual se extrajo ADN de 23 plantas y se utilizaron 8 marcadores ISSRs (Inter Secuencias Simples Repetidas) con la técnica de PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa). Con el uso de los programas de análisis molecular Structure (Pritchard et al., 2000), PowerMarker (Liu et al., 2005) y Arlequín (Excoffier et al., 2010), se estimó la estructura genética, varianza, medidas de diversidad y de distancia genética. A su vez se realizó a modo de complemento una comparación entre la población tolerante y otra población de L. tenuis susceptible a salinidad, para estimar la variabilidad genética entre poblaciones e identificar bandas especificas asociadas a la tolerancia a salinidad. El número obtenido de bandas presentes en la población tolerante fue de 73, que permitió realizar un estudio de la variabilidad molecular. La estructura genética representada por Structurama y Structure arrojó un K=1, observándose a las 23 plantas tolerantes agrupadas en una misma población. El uso de los 8 marcadores seleccionados permitieron estudiar la variabilidad molecular y la estructura genética de las poblaciones de L. tenuis, identificándose un total de 117 bandas totales. El análisis de la estructura poblacional reveló la existencia de una mayor homogeneidad en los individuos de la población tolerante que en la población susceptible. Los marcadores ISSRs desarrollados en este trabajo podrán ser utilizados en otros programas de mejoramiento genético de L. tenuis, para evaluar la variabilidad molecular presente en otras poblaciones de la especie

Familia romana e identidad femenina en época de Augusto

Resumen: Hacia el 167 a.C., un joven Polibio, se sorprendía de que Roma hubiera podido afi rmar su poderío en la península, resistir los ataques cartagineses y acabar imponiendo sus leyes en Oriente. Probablemente –explica P. Grimal– en ello también haya infl uido que las costumbres y tradiciones romanas contribuían a asegurar una superioridad sobre el resto de las culturas y hacían de Roma una ciudad única entre todas. La familia y la mujer constituyeron parte fundamental dentro de la consolidación de esa estructura socio política y de ello heredaríamos, especialmente a nivel normativo, una sólida tradición jurídico-romana. Sin embargo, la época imperial representó un grave período de crisis en el cual, tomar esposa, dar hijos a la patria y controlar los patrimonios, se convirtió en una importante reafi rmación moral, jurídica y política para la sociedad de su tiempo. En esta forma, se analizarán brevemente algunos conceptos y leyes relevantes –cuyos ecos volveremos a encontrar refl ejados a lo largo y ancho de la España cristiana medieval– los cuales nos ayudarán a adentrarnos en la cotidianidad de este singular período, sus emancipadas mujeres aristocráticas y el derecho privado.

Opciones conceptuales, metodológicas y prácticas en la medición de la pobreza : el Informe sobre Pobreza de Irak 2010

Resumen: En el presente trabajo, la autora sostiene que las opciones conceptuales, metodológicas y prácticas involucradas en todo ejercicio de medición de la pobreza tienen consecuencias sobre la estimación de su dimensión, profundidad y estructura. Sin embargo, dichas opciones no están siempre explícitas. El informe de pobreza de Irak de 2010, publicado por el Banco Mundial, representa una excepción en este sentido. La autora propone en este caso, explorar en detalle las opciones subyacentes a la construcción del indicador de bienestar, la línea de pobreza y las medidas de pobreza, señalando la importancia de la explicitación de dichas elecciones.

Las claves narrativas del poema caballeresco en Ludovico Ariosto

Integran este número de la revista ponencias presentadas en Studia Hispanica Medievalia VIII: Actas de las IX Jornadas Internacionales de Literatura Española Medieval, 2008, y de Homenaje al Quinto Centenario de Amadis de Gaula

Implementación del Modelo de Red Causal en un texto narrativo en español

Resumen: El Modelo de Red Causal propone que la estructura causal de una historia y su representación en la memoria episódica se asemejan a una red, en la que los acontecimientos resultan de una combinación de antecedentes causales, que a su vez tienen múltiples consecuencias. El estudio de la comprensión de textos según este modelo ha tendido a llevarse a cabo utilizando textos experimentales en inglés. En razón de ello, el objetivo de este trabajo consistió en presentar la aplicación del Modelo de Red Causal a un texto narrativo natural en español, a fin de abogar por su utilidad para examinar los procesos cognitivos involucrados en la comprensión textual.

Fuesse paral Papa et contól la sua fazienda : la escritura ejemplar del viaje en el Conde Lucanor

Resumen: Tomando como precepto la idea de que el motivo del viaje sirve de elemento organizador de la materia narrativa en textos como los Cuentos del papagayo, Canterbury Tales o Las mil y una noches, el autor se propone analizar la estructura de El conde Lucanor a la luz del mencionado motivo. El viaje aparece explicitado en el primero y en el último de los relatos, a los que se suma el exemplo XXV, episodio central en el diálogo entre el conde y su ayo. Su análisis lo llevará a develar en los restantes exemplos que este motivo central sirve de nexo de unión entre cada cuento, organiza la trama general en forma de episodios y configura distintos tipos de viajes: escatológico, de ultratumba, iniciático, alegórico, celestial o fantástico. El viaje se ofrece, así, como instrumento portador de sentido, de forma y de estructura en la trama general del marco y, en particular, de cada episodio.

La confesión en el Salmo 106 (107) de la traducción jerónima iuxta Hebraeos

Resumen: El salmo 106 (107) es una confesión de la misericordia de Dios que hace desvanecer las necesidades y angustias de quien clama a Él en distintas instancias de su camino de purificación y perfección. A la vez que confiesa, exhorta a la confesión. Esta confesión está estrechamente unida a la confianza y al abandono en Dios a las que, a su vez, se dirige dicha purificación. En la traducción jerónima iuxta Hebraeos hay marcas lingüísticas que indican el sentido de esta confesión, especialmente mediante la estructura confiteor + dativo.

Hacia una ética de la responsabilidad: Derrida y el otro “por venir” en Lévinas

Resumen: La tesis del trabajo es que la deconstrucción entraña en sí misma una actitud ética, y que ésta radica intrínsecamente en su apertura al otro y en la responsabilidad frente a ese otro. Para ello, se intenta en primer lugar una elucidación del concepto, caracterizándola como un protocolo de lectura compuesto de dos fases: des-sedimentación y reinscripción, siendo este último momento el que la identifica como una lectura singular y no universalizable. Posteriormente, a través de las nociones de “sujeto” y “alteridad del texto”, se muestra cómo las bases de la ética deconstructiva giran en torno a las nociones de “yo” y “otro”, conceptos que Derrida, como se demuestra, toma de Lévinas. La instancia ética es la apertura al otro, que se verifica por la responsabilidad que supone concebir al otro como aquello incapaz de apropiación. Dicha responsabilidad configura la aporía ética de lo general-particular, al concebirse como la posibilidad imposible de una opción general que es al mismo tiempo una decisión personal o singular, o, en otros términos, la indecidibilidad entre la norma general y la decisión concreta, que es a su vez la tensión entre “justicia”, “hospitalidad” y “negociación”. Lo anterior demuestra que el acto ético (o acto deconstructivo) tiene la misma estructura de la différance, imbricada siempre en la iteración del significante.