Species management in aquatic Habitats WRc Nov 1993

This is the Species management in aquatic Habitats WRc Nov 1993 produced by the National Rivers Authority (NRA) in 1993. This report identified key rare and nuisance species of interest to the NRA and prioritised research needs to develop conservation strategies for these species. The NRA has in the past adopted a habitat maintenance and protection approach to conservation paying less attention at individual species. There is a risk that conservation based on a habitat management policy will no further the conservation of certain species. In addition, certain ‘nuisance’ species cause problems for conservation by having a negative impact on more valued species or ecosystems. Through the combination of the review of current legislation and literature and consultation with NRA staff, this project identified key rare and nuisance species of interest to the NRA and prioritised research needs to develop conservation strategies for these species.

我国煤核中的种子和大羽羊齿的初步研究

本论文为申请理学博士学位论文。文章以种子（胚珠）为线索，详细描述8种不同类型的种子。其中之一与叶，叶轴和含有原位花粉的花粉器官连接，因此作为整体化石植物描述。 七种脱落的种子分属不同的器官属。其中，五种是新发现的，它们是;—个新属种一太原类紫杉（Parataxospermum taiyuanense gen.et sp.now.);二个新种—小肥籽（pachytesta parva sp.nov)和小柄肉籽（Ssr-cospermum petiolulatum sp.nov.);一个比较种—瘦冠籽（Stephanospemum cf. akenioides);一个未定种—双籽（Diplotesta ap.)。此外，订正了二个种—薄角籽（Cornucarpus tenucupsis(Halle))和小心籽（Cardiocarpus(?)minor(wang)) 同其它器官连接的种子，作为整体植物定命为，原始隐羽羊齿（新属、种）（Cryptogigantonoclea primitivagen���et sp．nov．）并根据其叶和叶脉类型该属归到大羽羊齿目(Gigantonomiales (= Gigantopterjdaies)。 根据描述，文章对上述各种植物的分类和系统发育分别进行了讨论。在这些讨论中作者祥细地阐述了分类的依据，评价了各种有关的系统发育的观点•并提出了一些新的见解。 为了深入地进行研究，作者改进了一些旧的研究手段，采用了某些新的研究方法．其中包括：1)利用计算机技术进行三维重建，复原了原始隐羽羊齿的小羽片和大部分种子的形态，此外还有少数种子的内部结构也被复原：2）用分支系统分析和图论方法对肥籽属的系统发育进行了重新，探讨：3)把扫描电镜和光学显微镜结合起来观察大孢子膜和花粉的结构，过去这些结构通常需要采用的超薄切片和透射电镜才能观察;4)改用无毒溶剂进行快速撕片，以避免损害人体;5)初步探索了一套制作定厚连续切片的方法。此外，文章还就大羽羊齿的系统位置，种子的分类，华夏植物群和其它植物群的比较，以及某些新技术的优劣进行了讨论。论文原文为英文，全文约合36万印刷符号，附有四十幅图版。 此外还有三个附录： 1)插图8幅;2）表9个.3)同图论分析有关的计算公式，原始数据和许算机计算结果。为了得到连续的三雏形象，还有一组由计算机复原的隐羊齿种子的连续旋转图象。本节译由英文翻译而成，但有些部分按中文习惯作了增删。

湖北中泥盆世一植物新属的研究

植物自晚志留世登陆以来，经过对恶劣的陆生环境长期而艰难的适应，在泥盆纪，特别是中上泥盆世开始其大规模的演化发展。在此其间，石松类、楔叶类、前蕨类、真蕨类以及前裸子植物等相继出现，使得陆生植物进入其第一个空前繁盛时期。 但是，也正是在这个介于陆地植物起源及其大规模发展的阶段，植物分类以及各植物之间的亲缘关系很不清楚。特别是前蕨类，它起源于三枝蕨类，并且被认为是真蕨类和前裸子植物的祖先，但目前对它是如何从三枝蕨类进化到真蕨类和前裸子植物却几乎一无所知。就如同一个黑匣子，有一个入口和两个出口，我们的任务就是打开这个黑匣子，弄清楚前蕨类中各植物的自然分类位置以及他们之间的亲缘关系。那么，有关早期陆地植物进化的一些悬而未决的问题也便迎刃而解了。 本论文正是为此目的而作。并且，植物新属变枝蕨的发现将无疑为最终达到这个目的做出很大的贡献。

买麻藤目的化石记录及其与 被子植物起源关系的探讨

二十世纪初，前人在中国的东北地区发现了大量保存完好的动物化石，其中以狼鳍鱼最具代表性，科学家将在该地区发现的化石生物群命名为“热河生物群”。“热河”这一名称得名于该化石群的经典产地，即当时的热河省东部地区。建国后，热河省被撤消，其西部划归河北省，东部划归辽宁省。原热河生物群的经典产地因此落在了今天辽宁省的西部，即辽西地区。但是，“热河生物群”这一在地质古生物学界具有深刻影响的名称仍然保留着，而且近几年来在该地区又有大量的鸟类以及恐龙的化石被发现。该地区现在已经成为世界级的古生物宝库。通过不同的方法对该地区进行时代测定的结果认为该地区的时代为白垩纪早期。 与发现众多、研究深入的动物群相比，在该地区开展的植物学研究起步较晚，但在最近几年取得了很大的进展。目前为止，已经发现的植物类群就有苔藓、蕨类、银杏、苏铁、松柏类和被子植物。其中，银杏、苏铁、松柏类尤为丰富。理论上，被子植物也正是从该生物群所代表的白垩纪早期开始出现并逐步走向繁荣的。近年来在热河生物群中就有不少关于被子植物早期类群的报道，如古果属A rchaefructus和里海果属Hyrcantha等。传统上认为，买麻藤目植物与被子植物起源的关系非常密切，但是最近的分子系统学研究却将该类群推离了被子植物，而作为裸子植物高等类群松柏类的姐妹群对待。但是，在热河生物群中的一些新买麻藤目植物的化石标本与被子植物早期类型化石标本的发现却提供了新的思路或证据。如近年来，我国学者已经在该生物群中报道的麻黄科下的2属4种。这些发现的类群都与买麻藤植物的基部类群麻黄属密切相关。这种新发现带来的证据或许可以为被子植物起源这一世界难题的解决提供新的思路。 在对前人关于买麻藤目植物化石标本的研究进行整理的时候，我们发现我们的部分化石与前人发表的一个种Ephedrites chenii在标本的形态学特征方面完全相同。但是在对该类群及其所在的属与麻黄的现代类群作对比研究后发现，该种植物的繁殖器官的特征完全符合麻黄属的特征，因此将该类群转移到麻黄属中作为新组合对待。另外，根据前人对该种在种加词的命名上的修改，我们将该新组合命名为Ephedra cheniae。 在调查该生物群中的买麻藤植物时，我们发现在部分化石类群中出现了前人没有记载过的新性状，比如在麻黄科类植物中发现了互生的分枝方式，并据此命名一个新的单种属Alloephedra xingxuei。为了探讨互生分枝这一性状对于麻黄科的分类意义，我们调查了国内外不少标本馆中的标本，并在野外做了取样统计。结果发现，在不少现代麻黄的枝条上都出现了不同程度的分枝发育不均衡，表现为在同一节上对生的两个分枝中一侧分枝能够正常发育而另一侧发育迟缓甚至不发育，这种不均衡的发育造成了在现代麻黄中出现了类似互生的分枝状况。在整理前人对麻黄分枝方式研究的基础上，结合我们对野外类群形态学性状的调查，我们认为由于在同一节上对生的两个分枝中一侧延迟或不发育而引起的类似互生的性状是较为广泛存在的，它不应该成为属一级的分类依据，而只能作为种一级的分类依据对待。因此我们将AHoephedra xingxuei转移到麻黄属中作为新组合Ephedra xingxuei处理。 除此之外，我们也发现了不少其他的买麻藤目化石标本，在对买麻藤目以往的化石记录了解以及对这些标本形态学性状把握的基础上，我们将这些新发现的化石标本放置在麻黄科麻黄属中作为新种对待，并根据其叶片以及苞片的特征分别将他们命名为披针叶麻黄（Ephedra lanceoleta）、裂叶麻黄（Ephedra divisa），卵叶麻黄（Ephedra ovata）以及双苞麻黄（Ephedra bibracta）。 与此同时，我们也发现了保存完好的被子植物的化石标本。该标本中具有5个离生的心皮、分枝方式兼具侧生和二叉分枝两种、并具有多裂的叶片。在辽西地区同时代发现的被子植物早期类型共有两个，分别是Archaefructus和Hyrcantha。其中前者具有许多个离生的螺旋状排列在可育枝的顶端1cm内的子房／心皮，而后者只有2-4个子房／心皮。在对我们新发现的化石标本与这两个被子植物的早期类型在叶片形态、分枝式样、果实大小、果实构成、果实排布、心 皮数目等形态学特征对比的基础上，我们认为新的化石标本描述了一个被子植物早期类群的新形态，并根据其具有五个心皮以及多裂的叶片的特征，命名为裂叶文采果Wentsaia divisa gen.＆sp. nov。 由于我们有幸能在辽西同时发现了买麻藤植物的化石标本和被子植物早期类型的标本，这就给了我们一个讨论二者在起源关系方面的机会。在对二者的营养器官特征、繁殖器官结构组成、繁殖器官性别构成以及对二者生活环境理解进行对比的基础上，我们认为，买麻藤目植物的早期类型与被子植物的早期类型之间存在相关性。但是就目前的证据而言，尚无法推测二者之间是否存在性状上的演化关系，而该问题的解决需要更多的化石证据的积累。

俄罗斯远东和中国湖南晚泥盆世石松类的新发现

在现代的陆地植被当中，石松类为草本植物，在植物界中属于高等植物的低等部分。然而在陆地植物起源和发展演化的早期阶段，石松类是陆地植被的重要成分。石炭纪时期石松类处于最繁盛时期，多生长成为高大乔木，形成森林，是陆地植被的优势类群，也是主要的成煤植物。作为演化历史最长的陆地植物之一，石松类在泥盆纪时期就广泛分布于世界各地，泥盆纪成为石松类演化发展的一个非常重要的时期。研究泥盆纪石松类对认识石松类的起源和发展有重要意义。 本论文是作者在博士期间多个工作之中的两个内容，对采自俄罗斯远东地区的晚泥盆世石松类Haskinsia标本以及采自湖南醴陵的晚泥盆世石松类Lilingostrobus longifolius标本进行了研究。 我们在俄罗斯远东地区的标本中发现了具有三角形叶片的简单叶。泥盆纪石松类Haskinsia属的最典型特征就是其叶由叶柄和三角形或戟形的叶片组成。综合标本的其它特征我们将这些标本归入Haskinsia colophylla这个种中。俄罗斯学者曾在与我们相同的采集地点采集了相似的标本并将其命名为Pseudolepidodendron igrischense，经过仔细对比后我们认为俄罗斯学者的标本也应归并入H. colophylla。同时根据Haskinsia属分布于早泥盆世晚期至晚泥盆世早期的特点，我们对采集地点的地层时代进行了修订，认为其地层时代要比俄罗斯学者认为的晚泥盆世至早石炭世要早。 我们在标本中还首次发现了Haskinsia colophylla这个种的孢子囊。在此之前，Haskinsia 属内的H. colophylla和H. sagittata由于具有相类似的叶而被认为可能是同一个种。由于仅在H. sagittata中发现了孢子囊（椭圆形/卵形）而没有发现H. colophylla的生殖结构，无法确切地区分这两个种。我们在标本中发现了着生于孢子叶腹面的圆形孢子囊。这一发现使我们确认了H. colophylla与H. sagittata的区别，这两个种都是有效种。 我们还对采自湖南醴陵望仙桥水库剖面晚泥盆统岳麓山组地层的部分石松类标本进行了研究。该石松类被命名为Lilingostrobus longifolius。它为木本石松类，茎为二岐分枝，叶在茎上螺旋形排列，叶为长披针形，具有中脉。孢子叶球顶生，呈长锥形，顶端钝圆，孢子叶在孢子叶球上呈紧密的螺旋形排列，每轮约6-8枚。孢子叶分化为孢子叶梗和孢子叶片。孢子叶梗与穗轴近垂直，水平向外延伸后向上弯曲成孢子叶片，叶片至少长45mm，超过孢子叶球长度的一半，孢子叶片与营养叶同型。孢子囊长椭圆形，着生于孢子叶梗的上面。Lilingostrobus longifolius为异型孢子叶球，分为大孢子叶球和小孢子叶球。茎轴具有外始式的初生木质部以及呈放射状的次生木质部。管胞次生壁具有梯纹加厚，加厚的横棒之间有纵向的条状物，即“威廉姆森结构”。Lilingostrobus longifolius具有孢子叶分化明显的孢子叶球因而被归入广义的水韭目。根据其管胞类型和孢子叶球特点，我们认为其可能与Sublepidodendron属亲缘关系较近。 通过对Lilingostrobus longifolius的孢子叶球以及解剖特点的分析，我们认为它代表了晚泥盆世石松类中较为先进的一个类群，这种类群在石炭纪时期得到大规模发展。 结合晚泥盆世其他具有生殖结构的石松类，我们认为晚泥盆世时期石松类的生殖结构类型丰富多样，而且远比中泥盆世石松类生殖结构复杂。这个时期石松类的发展为其在石炭纪的进一步演化奠定了基础。同时，在这个时期石松类植物的叶舌与孢子类型关系中，包括四种类型，即不具叶舌产生单型孢子类型，不具叶舌产生异型孢子类型，具叶舌产生单型孢子类型以及具叶舌产生异型孢子类型。这与现代石松类仅具有两种类型即不具叶舌的类群孢子囊产生同型孢子，而具叶舌的类群孢子囊产生异型孢子有很大的差别。

Chryseobacterium flavum sp nov., isolated from polluted soil

A Gram-negative, non-motile, rod-shaped bacterial strain, designated CW-E 2(T), was isolated from a polluted soil sample collected from Jiangsu Province, China. A taxonomic study of the isolate, including phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene seque

Pontibacter akesuensis sp nov., isolated from a desert soil in China

A Gram-negative, non-motile, rod-shaped bacterium, designated strain AKS 1 T, was isolated from a desert soil sample collected from Alkesu, Xin.lang Province, China. A taxonomic study, including phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences and p

Bacillus pallidus sp nov., isolated from forest soil

A Gram-positive bacterium, designated strain CW 7(T), was isolated from forest soil in Anhui Province, south-east China. Cells were strictly aerobic, motile with peritrichous flagella and rod-shaped. The strain grew optimally at 30-37 degrees C and pH 7.0-8.0. The major fatty acids of strain CW 7(T) were anteiso-C-15:0, iso-C-15:0 and anteiso-C-17:0. The predominant menaquinone was MK-7. The cell-wall peptidoglycan contained meso-diaminopimelic acid. The G + C content of the genomic DNA was 42.3 mol%. Phylogenetic analysis indicated that strain CW 7(T) belonged to a monophyletic cluster within the genus Bacillus and showed 16S rRNA gene sequence similarities of less than 96.5% to recognized species of the genus Bacillus. The results of the polyphasic taxonomic study, including phenotypic, chemotaxonomic and phylogenetic analyses, showed that strain CW 7(T) represents a novel species of the genus Bacillus, for which the name Bacillus pallidus sp. nov. is proposed. The type strain is CW 7(T) (=KCTC 13200(T)=CCTCC AB 207188(T)=LMG 24451(T)).

Pseudomonas duriflava sp nov., isolated from a desert soil

A Gram-negative, rod-shaped, non-motile, non-spore-forming bacterium, designated strain HR2(T) was isolated from a soil sample from the Talklimaken Desert in Xinjiang Province, China. Strain HR2(T) grew optimally at pH 7.0-8.0 and 30-37 degrees C in the presence of 0-1% (w/v) NaCl. An analysis of 16S rRNA gene sequences revealed that strain HR2(T) fell within the radiation of the genus Pseudomonas, the highest level of similarity being found with respect to Pseudomonas luteola IAM 13000(T) (97.5%); the levels of sequence similarity with respect to other recognized Pseudomonas species were < 96.4%. DNA-DNA hybridization showed that the genetic relatedness between strain HR2(T) and P. luteola IAM 13000(T) was 53.2%. The G + C content of the genomic DNA of strain HR2(T) was 55.2 mol%. The major fatty acids were 18: 1, summed feature 3 and 16:0. The hydroxylated fatty acids 10:0 3-OH, 12:0 3-OH and 12:0 2-OH were also present. The data obtained in this polyphasic study indicated that this isolate represents a novel species of the genus Pseudomonas, for which the name Pseudomonas duriflava sp. nov. is proposed, The type strain is HR2(T) (=KCTC 221129(T) =CGMCC 1.6858(T)).