Botulism in Brazil, 2000-2008: epidemiology, clinical findings and laboratorial diagnosis

Botulism is a rare and potentially lethal illness caused by Clostridium botulinum neurotoxin. We describe the findings of a laboratorial investigation of 117 suspected cases of botulism reported to the surveillance system in Brazil from January 2000 to October 2008. Data on the number and type of samples analyzed, type of toxins identified, reporting of the number of botulism cases and transmission sources are discussed. A total of 193 clinical samples and 81 food samples were analyzed for detection and identification of the botulism neurotoxin. Among the clinical samples, 22 (11.4%) presented the toxin (nine type A, five type AB and eight with an unidentified type); in food samples, eight (9.9%) were positive for the toxin (five type A, one type AB and two with an unidentified type). Of the 38 cases of suspected botulism in Brazil, 27 were confirmed by a mouse bioassay. Laboratorial botulism diagnosis is an important procedure to elucidate cases, especially food-borne botulism, to confirm clinical diagnosis and to identify toxins in food, helping sanitary control measures.

Syndromic surveillance: etiologic study of acute febrile illness in dengue suspicious cases with negative serology. Brazil, Federal District, 2008

With the aim of identifying the etiology of acute febrile illness in patients suspected of having dengue, yet with non reagent serum, a descriptive study was conducted with 144 people using secondary serum samples collected during convalescence. The study was conducted between January and May of 2008. All the exams were re-tested for dengue, which was confirmed in 11.8% (n = 17); the samples that remained negative for dengue (n = 127) were tested for rubella, with 3.9% (n = 5) positive results. Among those non reactive for rubella (n = 122), tests were made for leptospirosis and hantavirus. Positive tests for leptospirosis were 13.9% (n = 17) and none for hantavirus. Non reactive results (70.8%) were considered as Indefinite Febrile Illness (IFI). Low schooling was statistically associated with dengue, rubella and leptospirosis (p = 0.009), dyspnea was statistically associated with dengue and leptospirosis (p = 0.012), and exanthem/petechia with dengue and rubella (p = 0.001). Among those with leptospirosis, activities in empty or vacant lots showed statistical association with the disease (p = 0.013). Syndromic surveillance was shown to be an important tool in the etiologic identification of IFI in the Federal District of Brazil.

Epidemiological profile of malaria in the state of Tocantins, Brazil, from 2003 to 2008

This study describes the epidemiological profile of malaria in the State of Tocantins, in the period 2003-2008, investigates the association between the frequency of malaria and population growth, classifies the cases by 'autochthonous' and 'imported', reports the indices of the disease and analyses the distribution of the cases by Plasmodium species, age and gender. The retrospective study was based on secondary data, stored in SIVEP-malaria and analyzed using the software Epi-Info 3.5.1. and Bioestat 5.0. 19,004 samples were investigated for malaria, 19% of them were positive, 73.32% with Plasmodium vivax, 21.80% with Plasmodium falciparum, 4.79% with mixed infections and only 0.08% with Plasmodium malariae. Male individuals accounted for 76.95% and predominated in all years and age groups, especially in the 15 to 49 years old group. From the overall cases, 34.27% were autochthonous and 65.73% were imported (χ2 = 356.8, p = 0.0001). The frequency of malaria decreased significantly during the entire series (rp = 0.96, p = 0.002) and the number of municipalities with autochthonous transmission also diminished. It was found that malaria is predominantly imported, related to land activities, which confirms the need for effective measures to maintain vigilance throughout the state and enhance educational activities in order to guide the population towards early treatment-seeking.

Benign and malignant neoplasias in 261 necropsies for HIV-positive patients in the period of 1989 to 2008

Considering that there are some studies with autopsies from AIDS describing only malignant neoplasias and that changes can occur after the introduction of Highly Active Antiretroviral Therapy (HAART), our objectives were to analyze the frequency of benign and malignant neoplasms in AIDS patients in the periods of both pre- and post-HAART. This is a retrospective study with 261 autopsies of HIV-positive patients between 1989 and 2008 in Uberaba, Brazil. Sixty-six neoplasms were found (39 benign, 21 malignant and six premalignant) in 58 patients. The most frequent malignant neoplasms were lymphoid, in 2.7% (four Non-Hodgkin lymphoma, one Hodgkin, one multiple myeloma and one plasmablastic plasmacytoma), and Kaposi's Sarcoma, in 2.3% (six cases). The most frequent benign neoplasms were hepatic hemangiomas in 11 (4.2%) of 261 cases and uterine leiomyoma in 11 (15.7%) of 70 woman. In the pre-HAART period eight (9.8%) benign neoplasias and four (4.9%) malignant occurred in 82 patients; in the post-HAART period, 29 (16.2%) benign and 17 (9.5%) malignant were present; however, the differences were not significant. We conclude that the introduction of HAART in our region doesn't look to have modified the frequency of neoplasms occurring in patients with HIV.

Yellow fever epizootics in non-human primates, São Paulo state, Brazil, 2008-2009

Since 2000, the expansion of Sylvatic Yellow Fever (YF) has been observed in the southeast of Brazil, being detected in areas considered silent for decades. Epizootics in non-human primates (NHPs) are considered sentinel events for the detection of human cases. It is important to report epizootic events that could have impact on the conservation status of susceptible species. We describe the epizootics in NHPs, notified in state of São Paulo, Brazil, between September 2008 to August 2009. Ninety-one epizootic events, involving 147 animals, were reported in 36 counties. Samples were obtained from 65 animals (44.2%). Most of the epizootics (46.6%) were reported between March and April, the same period during which human cases of YF occurred in the state. Biological samples were collected from animals found dead and were sent to Instituto Adolfo Lutz, in São Paulo. Two samples, collected in two counties without an indication for YF vaccination, were positive for the virus. Another 48 animals were associated with YF by clinical-epidemiological linkage with laboratory confirmed cases. Because the disease in human and NHPs occurred in the same period, the detection of the virus in NHPs did not work as sentinel, but aided in the delineation of new areas of risk.

Implementação do referencial IFS alimentar numa indústria de produtos pré-confeccionados e ultracongelados integração com a NP EN ISO 9001:2008

Dissertação para a obtenção do Grau de Mestre em Tecnologia e Segurança Alimentar – Qualidade Alimentar

HAND-FOOT-AND-MOUTH DISEASE EPIDEMIOLOGICAL STATUS AND RELATIONSHIP WITH METEOROLOGICAL VARIABLES IN GUANGZHOU, SOUTHERN CHINA, 2008-2012

Hand-foot-and-mouth disease (HFMD) is becoming one of the extremely common airborne and contact transmission diseases in Guangzhou, southern China, leading public health authorities to be concerned about its increased incidence. In this study, it was used an ecological study plus the negative binomial regression to identify the epidemic status of HFMD and its relationship with meteorological variables. During 2008-2012, a total of 173,524 HFMD confirmed cases were reported, 12 cases of death, yielding a fatality rate of 0.69 per 10,000. The annual incidence rates from 2008 to 2012 were 60.56, 132.44, 311.40, 402.76, and 468.59 (per 100,000), respectively, showing a rapid increasing trend. Each 1 °C rise in temperature corresponded to an increase of 9.47% (95% CI 9.36% to 9.58%) in the weekly number of HFMD cases, while a one hPa rise in atmospheric pressure corresponded to a decrease in the number of cases by 7.53% (95% CI -7.60% to -7.45%). Similarly, each one percent rise in relative humidity corresponded to an increase of 1.48% or 3.3%, and a one meter per hour rise in wind speed corresponded to an increase of 2.18% or 4.57%, in the weekly number of HFMD cases, depending on the variables considered in the model. These findings revealed that epidemic status of HFMD in Guangzhou is characterized by high morbidity but low fatality. Weather factors had a significant influence on the incidence of HFMD.

Classificação de sons urbanos usando motifs e MFCC

A classificação automática de sons urbanos é importante para o monitoramento ambiental. Este trabalho apresenta uma nova metodologia para classificar sons urbanos, que se baseia na descoberta de padrões frequentes (motifs) nos sinais sonoros e utiliza-los como atributos para a classificação. Para extrair os motifs é utilizado um método de descoberta multi-resolução baseada em SAX. Para a classificação são usadas árvores de decisão e SVMs. Esta nova metodologia é comparada com outra bastante utilizada baseada em MFCC. Para a realização de experiências foi utilizado o dataset UrbanSound disponível publicamente. Realizadas as experiências, foi possível concluir que os atributos motif são melhores que os MFCC a discriminar sons com timbres semelhantes e que os melhores resultados são conseguidos com ambos os tipos de atributos combinados. Neste trabalho foi também desenvolvida uma aplicação móvel para Android que permite utilizar os métodos de classificação desenvolvidos num contexto de vida real e expandir o dataset.

Implementação do sistema de gestão da qualidade NP EN ISO 9001:2008 numa indústria de produção de presunto

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Tecnologia e Segurança Alimentar - Especialização em Qualidade Alimentar

Eventos Adversos na Prestação de Cuidados Hospitalares em Portugal no Ano de 2008

Introdução: A criação pela Organização Mundial de Saúde da World Alliance for Patient Safety em 2004, é resultado da preocupação crescente face ao domínio da segurança do doente, sendo a ocorrência de erros reconhecida como um grande problema de saúde pública e uma ameaça à qualidade dos cuidados prestados. Objectivo, material e métodos: Tendo por base os códigos da Classificação Internacional de Doenças, 9.ª Revisão, Modificação Clínica (subclasses 996-999, E870-E876 e E878-879), esta investigação procurou conhecer a dimensão dos eventos adversos, decorrentes da prestação de cuidados de saúde nos hospitais públicos de Portugal Continental, relatados no sistema de classificação de doentes em Grupos de Diagnóstico Homogéneo, no ano de 2008. Resultados e discussão: Os resultados revelaram a ocorrência de eventos adversos em 2,5% dos episódios de internamento hospitalar, surgindo na sua maioria como diagnósticos secundários de internamento. A frequência de eventos adversos foi ligeiramente superior nos indivíduos do sexo masculino (2,6%) quando comparada com o sexo feminino (2,4%). A idade dos indivíduos com eventos adversos é em média cinco anos superior à dos restantes indivíduos. O tempo de internamento nos casos de eventos adversos foi em média 4,14 vezes superior quando comparado com o tempo médio de internamento dos restantes episódios. Foi possível também estimar que os custos associados a eventos adversos correspondam a cerca de 4.436€ por episódio de internamento, tendo como referência o custo unitário total por dia de hospitalização no Serviço Nacional de Saúde. A frequência de destino após alta para outra instituição com internamento foi 2,5 vezes superior nos casos de eventos adversos, enquanto o número de falecimentos foi 2,44 vezes superior, quando comparados com os restantes episódios de internamento. Verificou-se ainda que o destino após alta para o domicílio foi menos frequente nos episódios com eventos adversos. As diferenças de frequência de eventos adversos por região foram ligeiras, sendo superior na região centro (3,0%) e inferior na região do Alentejo (1,7%). Conclusão: Os dados sugerem que a ocorrência de eventos adversos possa estar associada a períodos de internamento mais prolongados, maiores custos e maior mortalidade. A frequência de eventos adversos foi maior em indivíduos mais velhos e a diferença entre sexo ou região hospitalar não se mostrou substancial. Neste sentido, é urgente conhecer o real impacto dos eventos adversos, nomeadamente em indicadores como morbilidade e mortalidade dos portugueses.

Incidência do cancro do estômago e do pulmão : um estudo espacio-temporal na região sul de Portugal Continental entre 2000-2008

RESUMO - Enquadramento/Objectivos: As doenças oncológicas constituem a segunda causa de morte em Portugal, e têm um profundo impacto psicossocial, não só pela sua elevada incidência e mortalidade mas também pelos enormes custos envolvidos na sua prevenção, tratamento e reabilitação. De acordo com estudos anteriores, existem disparidades geográficas na incidência da doença oncológica. É por isso indispensável caracterizar e analisar as diferentes distribuições espaciais no tempo e no espaço, para controlar a doença e promover a saúde, contribuindo ao mesmo tempo para uma melhor compreensão da etiologia da doença. Este projecto compreende 3 objectivos principais que são: a caracterização de distribuição espacio-temporal do cancro do pulmão e do cancro do estômago, separadamente e em conjunto, na região sul de Portugal Continental (abrangida pelo ROR-Sul) no espaço temporal de 2000 a 2008, procurando identificar potenciais áreas de risco no desenvolvimento destes tumores. Metodologia: Numa primeira fase realizou-se um estudo descritivo das taxas de incidência dos tumores aqui retratados por idades, por sexo, por ano e por distritos. Posteriormente com o objectivo de identificar a presença de áreas de elevada incidência, procedeu-se à análise de clustering espacio-temporal das taxas de incidência ao nível dos concelhos na região do estudo, em 2000-2008. Resultados: Os resultados da análise descritiva revelaram que ambos os tumores são mais incidentes nos homens do que nas mulheres e que estes são igualmente mais incidentes em pessoas com mais de 75 anos. A análise de clustering espacio temporal permitiu verificar a existência um padrão geográfico heterogéneo da incidência de ambos os tumores, da qual resultaram 3 clusters para o cancro do estômago e 2 clusters para o cancro do pulmão (p <0,001). Os clusters do estômago pertencem maioritariamente à região do Alentejo e os clusters do cancro do pulmão à região da grande Lisboa. Conclusões: Os resultados da análise de clustering demonstraram um padrão heterogéneo da distribuição da incidência dos dois cancros na região e período temporal do estudo. As zonas identificadas de elevado risco são diferentes para ambos o tumores. A região que apresenta maior risco para o desenvolvimento do cancro do estômago é o Alentejo e do pulmão é o distrito de Lisboa.

Tuberculose nos imigrantes : análise comparativa entre os biénios 2000-2001 e 2008-2009 das características sóciodemográficas e clínicas dos casos de tuberculose em Portugal Continental

RESUMO - Objectivos: Este estudo pretende caracterizar os casos de Tuberculose notificados em Portugal Continental, em função das suas características sociodemográficas e clínicas, aferir a sua evolução através da comparação dos biénios 2000/2001 e 2008/2009 e a possibilidade de existência de diferenças entre os casos de Tuberculose na população imigrante e não imigrante. Métodos: Foi desenvolvido um estudo descritivo de casos notificados nos biénios 2000/2001 (n= 9182) e 2008/2009 (n= 6087). A fonte de dados foi o Sistema De Vigilância Intrínseco ao Programa Nacional de Luta contra a Tuberculose (SVIG-TB). Para calcular as incidências foram utilizados os dados disponibilizados pelo Instituto Nacional de Estatística e pelo Serviço de Estrangeiros e Fronteiras referentes à população não imigrante e imigrante residente em Portugal. Foi utilizado o teste do Qui-quadrado e o teste exacto de Fisher para analisar possíveis relações entre variáveis qualitativas. O teste de Mann-Whitney foi utilizado para comparação da distribuição entre variáveis quantitativas nos dois grupos. A odds ratio foi determinada para aferir a força de associação entre as variáveis e a condição de imigrante. Resultados: No biénio 2000/2001, 10,2% dos casos notificados eram de imigrantes e no biénio 2008/2009 aumentou para 13,3%. Relativamente às características sociodemográficas dos pacientes, observaram-se diferenças estatisticamente significativas apenas na idade. Nas características clínicas observaram-se diferenças significativas em algumas patologias associadas, nomeadamente na infecção VIH (p <0,001: OR=1,696).Quanto aos factores de risco, observaram-se diferenças no consumo do tabaco (p <0,001: OR= 0,499) e drogas (p <0,001; OR= 0,582). Relativamente à situação final de tratamento existem diferenças significativas nas categorias em tratamento (p <0,001;OR=0,661), tratamento completo (p <0,001;OR =1,293) e morte (p <0,001; OR=1,806). Conclusões: O número de casos de Tuberculose em Portugal, bem como a taxa de incidência, diminuíram do biénio 2000/2001 para o biénio 2008/2009 em ambos os grupos. Os imigrantes são mais jovens, têm maior risco de infecção VIH e menor risco de patologias crónicas.

Decreasing Incidence and Changes in Serotype Distribution of Invasive Pneumococcal Disease in Persons Aged Under 18 Years Since Introduction of 10-Valent and 13-Valent Conjugate Vaccines in Portugal, July 2008 to June 2012

The 10-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV10) became available in Portugal in mid-2009 and the 13-valent vaccine (PCV13) in early 2010. The incidence of invasive pneumococcal disease (IPD) in patients aged under 18 years decreased from 8.19 cases per 100,000 in 2008–09 to 4.52/100,000 in 2011–12. However, IPD incidence due to the serotypes included in the 7-valent conjugate vaccine (PCV7) in children aged under two years remained constant. This fall resulted from significant decreases in the number of cases due to: (i) the additional serotypes included in PCV10 and PCV13 (1, 5, 7F; from 37.6% to 20.6%), particularly serotype 1 in older children; and (ii) the additional serotypes included in PCV13 (3, 6A, 19A; from 31.6% to 16.2%), particularly serotype 19A in younger children. The decrease in serotype 19A before vaccination indicates that it was not triggered by PCV13 administration. The decrease of serotype 1 in all groups, concomitant with the introduction of PCV10, is also unlikely to have been triggered by vaccination, although PCVs may have intensified and supported these trends. PCV13 serotypes remain major causes of IPD, accounting for 63.2% of isolates recovered in Portugal in 2011–12, highlighting the potential role of enhanced vaccination in reducing paediatric IPD in Portugal.

Proxy statement proposals after the 2008 financial crash

A Work Project, presented as part of the requirements for the Award of a Masters Degree in Finance from the NOVA – School of Business and Economics