Caracterização e diversidade molecular do transposon Tn1546, carreador do gene vanA, responsável pela expressão de resistência à vancomicina, em amostras clínicas de diferentes espécies de Enterococcus

Enterococcus resistentes à vancomicina (VRE) são reconhecidos como importantes patógenos causadores de infecções nosocomiais, configurando um grave problema de saúde pública, principalmente pela escassez de opção terapêutica eficaz. O fenótipo de resistência VanA é o mais frequente, sendo definido pela resistência a altos níveis de vancomicina e teicoplanina. VanA é caracterizado por um conjunto gênico (vanRSHAXYZ) localizado no elemento genético móvel denominado transposon Tn1546. A diversidade de Tn1546 resulta de alterações estruturais promovidas por deleções ou integração de sequências de inserção (IS) que, exercem papel chave na evolução do elemento VanA, modificando os aspectos relacionados à sua transferência e expressão do fenótipo. O objetivo deste estudo foi caracterizar e avaliar o polimorfismo de elementos Tn1546 presentes em amostras de diferentes espécies de Enterococcus isoladas em instituições hospitalares do Estado do Rio de Janeiro no período de 2000 a 2012. Foram incluídas neste estudo 70 amostras VRE que foram caracterizadas quanto ao gênero, espécies e genótipo de resistência aos glicopeptídeos por métodos convencionais e PCR multiplex. A susceptibilidade a 17 antimicrobianos foi avaliada pelo método de difusão em ágar, e concentração inibitória mínima (CIM) para vancomicina e teicoplanina foi determinada por microdiluição em caldo. O tranposon foi obtido após lise das células bacterianas e amplificação por PCR longo, utilizando-se oligonucleotídeos específicos para a região repetida e invertida que flanqueia este elemento genético. A diversidade dos elementos Tn1546 foi avaliada por um conjunto de métodos moleculares que incluiu a análise do polimorfismo do tamanho de fragmentos de restrição (restriction fragment lenght polymorphism, RFLP), utilizando-se a endonuclease ClaI, amplificação de segmentos internos por PCR de sobreposição de oligonucleotídeos (overlapping PCR) e detecção de sequências de inserção (ISs). A caracterização em espécies considerada para as demais análises foi obtida pela metodologia de PCR de acordo com a seguinte distribuição: E. avium (N=6), E. faecalis (N=12), E. faecium (N=46), E. gallinarum (N=4) e E. raffinosus (N=2). Todas as amostras apresentaram o genótipo vanA. Nos testes de susceptibilidade aos antimicrobianos foi observado que todas as amostras foram multirresistentes, sendo resistente de 6 a 13 dentre os 17 antimicrobianos testados. A presença de elementos semelhantes ao arquétipo de Tn1546 foi observada em 61,5% das amostras; entretanto, 27 amostras apresentaram perfis variantes de Tn1546. Foram identificados nove perfis de RFLP, dentre 66 avaliadas, sendo o perfil I, prevalente e semelhante ao arquétipo de Tn1546. Não foi possível analisar quatro amostras por RFLP. Os produtos de amplificação de Tn1546 alterados, obtidos pela overlapping PCR e pelo rastreamento de IS, levaram à classificação de 15 tipos polimórficos, nomeados de A a O. A maioria dos Tn1546 polimórficos teve suas regiões de ORF1 e/ou ORF2 deletadas; e IS1542 juntamente com IS1216V foram as inserções mais frequentes, que em muitas situações compartilhavam a mesma região de inserção. IS19 foi detectada apenas na região vanS-vanH. Os dados apresentados neste estudo indicam que o polimorfismo de Tn1546 pode ser explorado no rastreamento de rotas de transmissão, acompanhamento da dispersão de elementos VanA e investigação da evolução de amostras VRE.

Perfil de secreção de citocinas e de ativação de células endoteliais após interação com cepas selvagens e mutantes de Aspergillus fumigatus

Apesar do desenvolvimento de novas drogas antifúngicas e da sua utilização como terapia profilática visando à prevenção de infecções fúngicas invasivas, estas ainda constituem-se num problema emergente, com elevadas taxas de mortalidade. Neste contexto, destaca-se a aspergilose invasiva, uma infecção fúngica oportunista que acomete pacientes com neutropenia profunda e prolongada, principalmente os pacientes com leucemia aguda ou submetidos a transplante de medula óssea. Aspergillus fumigatus, um fungo filamentoso, é o principal agente etiológico da aspergilose invasiva, sendo um patógeno angioinvasivo. As hifas deste fungo são capazes de causar injúria e ativação endotelial, induzindo o endotélio a um fenótipo pró-trombótico, que por sua vez, é mediado pela secreção de citocinas pró-inflamatórias, em especial, o TNF-α. O presente trabalho teve como objetivo estudar a capacidade de cepas mutantes de A. fumigatus em ativar células endoteliais, avaliando o perfil de secreção de citocinas em meio condicionado e a expressão de fator tecidual. Resumidamente, monocamadas confluentes de células endoteliais isoladas da veia umbilical humana foram incubadas com conídios e tubos germinativos de cepas selvagens (Af293 e Ku80) e mutantes (Δugm1, ΔcalA, ΔcrzA, ΔprtT) de A. fumigatus. A taxa de adesão e endocitose destas cepas às monocamadas de HUVEC foi avaliada a partir de um ensaio quantitativo de imunofluorescência diferencial. O perfil cinético de secreção de citocinas foi determinado em meio condicionado das HUVECs, por ensaio de multiplex para IL-6, IL-8 e TNF-α. A ativação endotelial, por sua vez, foi determinada pela expressão de fator tecidual por RT-PCR em tempo real. Os resultados obtidos demonstraram que a mutante para o gene ugm1, responsável por codificar a enzima UDP-galactopiranose mutase, que converte resíduos de galactopiranose a galactofuranose, apresentou um fenótipo hiperaderente às células endoteliais e um estímulo 10 vezes maior à secreção de TNF-α e 2,5 vezes maior a secreção de IL-6, quando comparada a ativação observada para as cepas selvagens. A galactofuranose é um componente importante de glicoconjugados da parede celular de A. fumigatus. Dessa forma, a ausência desse monossacarídeo na célula fúngica leva a um mecanismo compensatório caracterizado por um aumento na expressão de moléculas de galactosaminogalactana na parede celular. De maneira contrária, mutantes para os genes calA e crzA, apresentaram um fenótipo hipoaderente às HUVECs e uma perda na capacidade de induzir a secreção de citocinas e ativar o endotélio. Essas mutantes apresentam deleções que interferem na via de cálcio/calcineurina, responsável por regular a morfogênese e virulência de A. fumigatus, além de apresentarem alterações no conteúdo de beta-1-3 glucana. Já a cepa ΔprtT, mutante para o fator de transcrição prtT que regula a secreção de múltiplas proteases, apresentou um fenótipo de adesão, estímulo e ativação endotelial semelhante ao observado para as cepas selvagens. A comparação entre a capacidade de conídios e tubos germinativos em ativar células endoteliais, corroborou achados anteriores da literatura que reportam que só hifas são capazes de ativar células endoteliais, independentemente da sua viabilidade. Os dados deste estudo permitiram concluir que dentre os componentes de superfície celular de A. fumigatus, os polímeros de galactose, em especial a galactosaminogalactana, parecem ser responsáveis, pelo menos em parte, pelos mecanismos de interação e ativação endotelial.

Caracterização da distribuição de alelos de loci STR do cromossomo Y com elevada taxa de mutação em uma amostra populacional do Rio de Janeiro

Marcadores genéticos presentes no cromossomo Y, como os microssatélites (Y-STRs) e polimorfismos de único nucleotídeo (Y-SNPs) são utilizados na caracterização de linhagens masculinas, visto que são transmitidos às gerações seguintes sem alterações, a menos que ocorram mutações (Singh et al., 2011; Mitchell & Hammer, 1996; Butler, 2009). Por isso, esses marcadores são amplamente empregados em diversas situações, destacando-se o uso constante dos Y-STRs na genética forense por apresentarem alta capacidade de discriminar linhagens. Recentemente, foram descritos 13 marcadores com taxas de mutação substancialmente superiores àquelas verificadas para loci STR do cromossomo Y, denominados Rapidly Mutating (RM) Y-STRs (Ballantyne et al., 2010; Kayser et al., 2012). Devido às taxas de mutação elevadas, os RM-YSTRs apresentam maior eficiência na discriminação entre indivíduos proximamente relacionados, pertencentes à mesma linhagem patrilínea. O presente trabalho buscou aprofundar o conhecimento acerca das características populacionais e mutacionais dos loci RM-YSTRs em amostra do Rio de Janeiro, contribuindo com estudos desta natureza na população brasileira. Realizou-se a análise de 13 loci do cromossomo Y em 258 indivíduos do sexo masculino, compondo 129 pares de pais e filhos, nascidos no estado do Rio de Janeiro. O DNA das amostras foi extraído, conforme os protocolos vigentes na rotina do LDD-UERJ. As sequências genéticas de interesse foram amplificadas pela técnica de reação em cadeira da polimerase (PCR) através da realização de três PCR multiplex, cujos produtos de amplificação foram separados por eletroforese em sequenciador automático ABI-3500 (Applied Biosystems). Para os pares pai/filho que apresentaram haplótipos mutados, empregou-se a técnica de sequenciamento para confirmação das mutações. Os loci RM-YSTR geraram um poder de discriminação de 1,0 na amostra analisada, o que significa que todos os 129 indivíduos da amostra populacional apresentaram haplótipos diferentes para tais marcadores, com frequências de 0,0077 e diversidade haplotípica igual a 1. Além disso, foram obtidos valores elevados de diversidade gênica para os 13 marcadores. A análise de distância genética e os resultados de AMOVA baseados nos valores de Fst demonstraram que os RM-YSTR não indicam subdivisão populacional e traços ancestrais comuns. Tais valores estão associados às elevadas taxas de mutação encontradas, cuja média foi de 2,11 x 10-2. Foi possível observar que os loci RM-YSTR são muito discriminativos na amostra miscigenada analisada, além de terem maior capacidade de diferenciar indivíduos do que outros conjuntos de marcadores normalmente usados em estudos populacionais e análises forenses. Sendo assim, é possível concluir que os marcadores RM-YSTR são promissores para discriminar indivíduos da mesma linhagem patrilínea, visto que devido às suas elevadas taxas mutacionais e poder de discriminação, são capazes de diferenciar indivíduos de maneira mais eficiente do que os outros conjuntos de STR. Porém, é necessário maior número de estudos para melhor caracterização destes loci em diferentes populações.

Estudo do perfil salivar proteico de crianças obesas pré-púberes com foco nas alterações de mediadores da metainflamação

O objetivo deste estudo foi investigar na saliva de crianças pré-púberes obesas, em comparação com crianças eutróficas, a presença de possíveis diferenças na expressão de mediadores proteicos relacionados à metainflamação através de um estudo observacional transversal. Foram selecionadas 105 crianças pré-púberes com idade entre 5 e 9 anos, sem quaisquer outros comprometimentos sistêmicos ou bucais sendo realizada a mensuração do comprimento da circunferência da cintura (CC), além do peso e estatura para cálculo do IMC e seu escore Z (zscore IMC), de forma a compor 3 grupos: EU - eutrofia (-2SD≤ zscore IMC≤1SD), SP - sobrepeso (1SD < zscore IMC < 2SD) e OB obesidade (zscore IMC ≥ 2SD). Após o exame médico e odontológico foi feita a coleta de sangue e de saliva total não estimulada, de forma protocolada. Amostras séricas e salivares foram analisadas, individualmente, para a dosagem de IL1β, IL6, IL8. IL10, IL12p70, TNFα, MCP1, leptina, grelina e insulina, por Multiplex e adiponectina total e de alto peso molecular (adipoHMW), por ELISA. Além disso, as amostras séricas foram utilizadas para o delineamento hemodinâmico dos pacientes. As amostras salivares de EU e OB foram também analisadas em pools por espectrometria de massa (MS) e a presença de algumas proteínas foi validada por imunoblotting, para a comparação do perfil salivar proteico. As concentrações dos analitos foram comparadas tanto entre os grupos (teste de Kruswall-Wallis), como em relação ao zscore IMC e ao CC (Correlação de Spearman ou Pearson). Dos 12 analitos, somente a adipoHMW não foi detectada em nenhuma das amostras salivares. Na comparação OBxEU houve aumento na concentração total de proteínas salivares, da insulina e leptina sérica e salivar e do MCP1, além de diminuição da adiponectina sérica total e de adipoHMW e uma menor relação adiponectina/leptina (A/L) no grupo OB. As principais correlações obtidas com o zscore IMC foram com as concentrações séricas e salivares de insulina e leptina (positivas) e com a relação A/L (negativa), observando-se também a correlação negativa com a adiponectina total e adipoHMW séricas. Na comparação entre as concentrações séricas e salivares, foi possível detectar correlação positiva entre as dosagens de insulina e leptina, assim como com os valores da relação A/L. Na análise proteômica por MS foram identificadas 670 proteínas, sendo 163 delas com expressão diferenciada na saliva de OB em relação a EU. Dentre estas, encontram-se alteradas proteínas relacionadas à resposta inflamatória humoral, em especial com a via alternativa do sistema complemento e do metabolismo redox. Foram selecionadas três destas proteínas para validação por imunoblotting, que confirmou o aumento do Fator H e a diminuição do Fator B e da tioredoxina na saliva de OB em relação a EU. Considerando os resultados, podemos verificar que embora com menores concentrações absolutas dos mediadores, a saliva mostrou praticamente as mesmas associações observadas no sangue, em especial para a insulina, leptina e relação A/L, sendo possível admitir que a análise salivar venha a ser um bom método diagnóstico não invasivo para a obesidade infantil.

Estudo multicêntrico nacional para avaliação da incidência de autoanticorpos e eventos adversos em pacientes com diferentes enfermidades em uso de infliximabe

Introdução: O infliximabe é um anticorpo monoclonal quimérico que inibe o fator de necrose tumoral, sendo usado em doenças autoimunes e/ou inflamatórias, tais como a artrite reumatóide (AR), a espondilite anquilosante (EA), a psoríase e a artrite psoriásica (AP) e as doenças inflamatórias intestinais (DII). Objetivos: Avaliar se o infliximabe induz à formação de autoanticorpos e verificar a ocorrência de eventos adversos, sobretudo o lúpus induzido por este medicamento. Metodologia: Trata-se de um estudo aberto, prospectivo, de fase IV, onde dosamos os autoanticorpos antes e depois do tratamento (das doenças citadas anteriormente), o qual teve duração mínima de 6 meses (5 infusões). Resultados: No total, 286 pacientes foram avaliados para o fator anti-nuclear (FAN) por imunofluorescência indireta em células Hep2, sendo significativo o aumento de número de indivíduos (p = 0,0001), antes e depois da medicação. Além do FAN, foram dosados, em 146 pacientes, 17 outros autoanticorpos pelo método multiplex, sendo que o anti-DNA de dupla hélice (anti-dsDNA) e o anticardiolipina IgM (aCL IgM) tiveram um aumento significativo (p = 0,003 e 0,0024, respectivamente). Pacientes com AR tiveram uma variação significativa nos títulos do anticorpo anti-proteína citrulinada (ACPA) (antes e depois do tratamento) (p = 0,012). De todos os pacientes avaliados (n = 286), somente 1 (0,35%) apresentou sinais clínicos e laboratoriais de lúpus induzido pelo infliximabe. Conclusão: O estudo demonstrou que o infliximabe interferiu na formação de autoanticorpos (FAN, anti-dsDNA, aCL IgM e ACPA), sendo rara a indução de lúpus pelo medicamento.

Estudo das características fenotípicas e genotípicas de amostras de Corynebacterium pseudotuberculosis

Uma vez que C. pseudotuberculosis é o agente etiológico de processos infecciosos em animais caprinos e ovinos e que também pode ser isolado de processos infecciosos em seres humanos as investigações direcionadas para a espécie em questão são necessárias, visto que a escassez de dados epidemiológicos e de conhecimento relativo ao comportamento do microrganismo em hospedeiros animais e humanos em nosso país dificulta o diagnóstico laboratorial da espécie, à semelhança do observado com outra espécie de transmissão zoonótica, o C. ulcerans. Uma preocupação adicional é o fato da espécie em questão também ser capaz de albergar bacteriófagos codificadores da toxina diftérica, representando uma ameaça à circulação dos bacteriófagos. Assim, o presente estudo tem como objetivo geral analisar as características fenotípicas e genotípicas de amostras de C. pseudotuberculosis. Neste sentido, foram propostos os seguintes objetivos: Avaliar as características bioquímicas das amostras através de testes bioquímicos convencionais; avaliar as características bioquímicas das amostras utilizando o sistema semi-automatizado API Coryne; diferenciar amostras de C. pseudotuberculosis de C. ulcerans utilizando a técnica de PCR multiplex; pesquisar a presença de gene tox. Os resultados demonstraram que amostras de C. diphtheriae, C. ulcerans e C. pseudotuberculosis podem ser caracterizadas por métodos bioquímicos convencionais e por taxonomia numérica (API Coryne System). C. ulcerans e C. pseudotuberculosis, com potencial de circulação zoonótica, da mesma forma que C. diphtheriae são capazes de albergar o gene da toxina diftérica. A reação m-PCR foi capaz de discernir as amostras de C. diphtheriae, C. ulcerans e C. pseudotuberculosis e ainda definir o potencial das amostras em produzir a toxina diftérica. Os dados enfatizam a necessidade da técnica multiplex PCR para o diagnostico e para o controle de espécies associadas a quadros de difteria em populações humana.

Análise dos aspectos biológicos e epidemiológicos de cepas de Escherichia coli associadas à infecção do trato urinário (ITU)

A invasão de bactérias no trato urinário caracteriza a infecção do sistema urinário. A Escherichia coli é o principal microrganismo associado a esta infecção devido a sua importância em causar ITU, recebeu a denominação de UPEC (Escherichia coli uropatogênica). No presente trabalho pesquisamos em 50 cepas de UPEC, inicialmente isolados de urina de pacientes ambulatoriais com infecções sintomática ou assintomática, a presença de 7 fatores de virulência, através das técnicas de PCR simples e multiplex para verificação dos genes que codificam adesinas P (pap) , fímbria S (sfa), adesina afimbrial (afa), sideroforo (aerobactina- aer), toxinas fator necrotizante citotóxico (cnf) e alfa-hemolisinas (hly), proteína de membrana (traT); ilhas de patogenicidade (virulência) através do marcador PAI. O marcador pCVD432 de EAEC também foi pesquisado nestas amostras. O método difusão em disco foi o utilizado para a determinação dos testes de susceptibilidade aos antimicrobianos. Podemos observar duas faixas etárias de maior incidência de ITU entre as mulheres: 19 a 35 anos, e acima de 50 anos. Sessenta e oito por cento das amostras apresentaram pelo menos um fator de virulência, onde os genes traT (54%) e aer (34%) foram os mais prevalentes. A sequência pCVD432 foi detectado em 6 amostras. No entanto, no ensaio de adesão em células Hep-2, doze amostras não apresentaram aderência (NA 24%). Nas 38 cepas restantes, 24 (48%) apresentaram aderência agregativa (AA). Observamos aderência sem padrão típico (SPT) em 48% das amostras, tendo sido dividido em discreto (SPT-D 22%), moderado (SPT-M 18%) e intenso (SPT-I 8%). Notamos os seguintes perfis de resistência para os antimicrobianos testados: ampicilina (44%), gentamicina (8%), nitrofurantoína (2%), norfloxacino (18%) e sulfametozaxol-trimetoprima (34%).

Compact holographic optical interconnections using nematic liquid crystal spatial light modulators

In a fibre-optic communication network, the wavelength-division multiplexing (WDM) technique enables an expansion of the data-carrying capacity of optical fibres. This can be achieved by transmitting different channels on a single optical fibre, with each channel modulating a different wavelength. In order to access and manipulate these channels at a node of the network, a compact holographic optical switch is designed, modelled, and constructed. The structure of such a switch consists of a series of optical components which are used to collimate the beam from the input, de-multiplex each individual wavelength into separated channels, manipulate the separated channels, and reshape the beam to the output. A spatial light modulator (SLM) is crucial in this system, offering control and flexibility at the channel manipulation stage, and providing the ability to redirect light into the desired output fibre. This is achieved by the use of a 2-D analogue phase computer generated hologram (CGH) based on liquid crystal on silicon (LCOS) technology. © 2011 Copyright Society of Photo-Optical Instrumentation Engineers (SPIE).

All optical mode-multiplexing using holography and multimode fiber couplers

A spatial light modulator at the transmitter is used in conjunction with a standard multimode coupler at the receiver to modally multiplex 2 × 12.5 Gb/s nonreturn-to-zero channels using direct detection over 2 km of 940 MHz OM2 fiber without electronic processing. The wavelength dependence of this technique over a 4.5 THz band is also investigated. © 2012 IEEE.

Optical vortex based Mode Division Multiplexing over graded-index multimode fibre

Mode Division Multiplexing is performed over 2km and 8km of 50μm graded-index multimode fibre using (de)multiplex phase masks based around optical vortex modes to transmit 2×56Gbps QPSK signals without MIMO equalization. © 2013 OSA.

Optical vortex based mode division multiplexing over graded-index multimode fibre

Mode Division Multiplexing is performed over 2km and 8km of 50μm graded-index multimode fibre using (de)multiplex phase masks based around optical vortex modes to transmit 2x56Gbps QPSK signals without MIMO equalization. © 2013 OSA.

Non-microcystin producing Microcystis wesenbergii (Komarek) Komarek (Cyanobacteria) representing a main waterbloom-forming species in Chinese waters

It is well known that several morphospecies of Microcystis, such as Microcystis aeruginosa (Kutzing) Lemmermann and Microcystis viridis (A. Brown) Lemmermann can produce hepatotoxic microcystins. However, previous studies gave contradictory conclusions about microcystin production of Microcystis wesenbergii (Komarek) Komarek. In the present study, ten Microcystis morphospecies were identified in waterblooms of seven Chinese waterbodies, and Microcystis wesenbergii was shown as the dominant species in these waters. More than 250 single colonies of M. wesenbergii were chosen, under morphological identification, to examine whether M. wesenbergii produce hepatotoxic microcystin by using multiplex PCR for molecular detection of a region (mcyA) of microcystin synthesis genes, and chemical analyses of microcystin content by ELISA and HPLC for 21 isolated strains of M. wesenbergii from these waters were also performed. Both molecular and chemical methods demonstrated that M. wesenbergii from Chinese waters did not produce microcystin. (C) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Tunable MQW-DBR lasers using selective area growth

The tunable ridge waveguide distributed Bragg reflector (DBR) lasers designed for wavelength-division-multiplex (WDM) communication systems at 1.55 um by using selective area growth (SAG) is reported. The threshold current of the DBR laser is 62mA and the output power is more than 8mW. The isolation resistance between the active region and the Bragg region is 30K Ohm. The total tuning range is 6.5nm and this DBR laser can provide 6 continuous standard WDM channels with 100GHz channel spacing; in the tuning range, the single mode suppression ratio (SMSR) is maintained more than 32dB and the maximum output power variation is less than 3dB.

Strained MQW electro-absorption modulators with high extinction ratio and low capacitance

We fabricate an electro-absorption modulator for optical network system using a new strategy, the improved modulation properties of the strained InGaAs/InAlAs MQW show it's polarization independent, high extinction ratio (> 40dB) and low capacitance (C <0.6pF) which can achieve an ultra-high frequency(> 10GHz). The device is be used in 10Gbps optical time division multiplex (OTDM) system as a signal generator.

黄龙世界自然遗产地岷江冷杉原始林群落结构与植物多样性：生境差异性研究

黄龙世界自然遗产地岷江冷杉林(Abies faxoniana)生境类型多样，群落结构复杂，群落植物种类组成多样性丰富。揭示不同生境的生物多样性及其差异是认识生物多样性格局、形成及维持机制的前提和进行多样性保育的基础。本文采用样方法对黄龙钙化滩生境、阴坡非钙化生境及半阳坡非钙化生境的岷江冷杉原始林植物群落结构及植物多样性进行了研究。结果表明： 黄龙岷江冷杉林具有明显的复层异龄结构，垂直结构明显，乔木、灌木、草本、苔藓层次分明。共发现高等植物386 种，其中维管植物46 科103 属163 种，苔藓植38 科83 属物223 种。各层片结构及物种组成如下: (1)钙化滩生境、阴坡非钙化生境、半阳坡非钙化生境分别发现乔木18 种、13种、8 种。乔木层均可分为两个亚层，第一亚层优势种均为岷江冷杉，第二亚层主要为岷江冷杉异龄树或其它大高位芽物种。钙化滩生境第一亚层除优势种岷江冷杉外混生有巴山冷杉(Abies fargesii)、粗枝云杉(Picea asperata)以及阔叶树种白桦(Betula platyphylla)等，第二亚层主要为岷江冷杉异龄树；阴坡非钙化生境第一亚层除优势种岷江冷杉外间有巴山冷杉和白桦，第二亚层物种主要为川滇长尾槭(Acer caudatum var. prattii)；半阳坡非钙化生境第一亚层除优势种岷江冷杉外混生有巴山冷杉，第二亚层主要为岷江冷杉异龄树。依乔木层优势种的差异，钙化滩生境及半阳坡非钙化生境为岷江冷杉纯林，阴坡非钙化生境为岷江冷杉－川滇长尾槭混交林。不同生境乔木层郁闭度、乔木密度、树高结构、直径结构均存在差异。 (2)钙化滩生境发现灌木41 种，平均盖度为18.49±1.72(％)，平均高度为52.12±4.45(cm)，优势种为直穗小檗(Berberis dasystachya)；阴坡非钙化生境发现灌木30 种，平均盖度为29.33±2.56 (％)，平均高度为119.55±8.01 (cm)，优势种为箭竹 (Fargesia spathacea) 、唐古特忍冬(Lonicera tangutica) 和袋花忍冬(Lonicera saccata)；半阳坡非钙化生境发现灌木29 种，平均盖度为31.35±1.93 (％)，平均高度为107.55±4.24 (cm)，优势种为箭竹(Fargesia spathacea)。不同生境灌木层结构和物种组成多样性差异显著，钙化滩生境的灌木盖度、高度总体上较非钙化的坡地生境低, 钙化滩生境灌木以小型叶的落叶灌木为主，沟两侧非钙化的坡地生境上则发育了丰富箭竹。 (3)钙化滩生境发现草本46 种，平均盖度为7.18±0.79 (％)，平均高度为5.04±0.26(cm)，以山酢浆草(Oxalis griffithii)为优势种；阴坡非钙化生境发现草本物种71 种，平均盖度达29.04±2.31(％)，平均高度为9.08±0.52(cm)，以钝叶楼梯草(Elatostema obtusum)、山酢浆草为优势种；半阳坡非钙化生境草本物种50 种，平均盖度为以8.79±0.82(％)，平均高度为7.67±0.43 (cm)，以扇叶铁线蕨(Adiantum flabellulatum)、双花堇菜(Viola biflora)、华中蛾眉蕨(Lunathyrium shennongense)、山酢浆草为优势种。阴坡非钙化生境草本层片发育良好，多样性最为丰富，盖度和物种丰富度均显著高于钙化滩生境和半阳坡非钙化生境。 (4)钙化滩生境发现苔藓物种140 种，平均盖度达84.25±1.30 (％)，以仰叶星塔藓(Hylocomiastrum umbratum) 等大型藓类为优势种；阴坡非钙化生境发现苔藓物种115 种，平均盖度为79.29±1.64 (％)，以刺叶提灯藓(Mnium spinosum)、大羽藓(Thuidium cymbifolium)、毛尖燕尾藓(Bryhnia trichomitra)等个体较小的物种为优势种；半阳坡非钙化生境发现苔藓物种91 种，平均盖度为60.64±1.93 (％)，也以刺叶提灯藓为优势种。 (5)钙化滩生境、阴坡非钙化生境、半阳坡非钙化生境的物种数分别为234 种、221 种、175 种。乔木层的Shannon-Wiener 指数分别为0.75 ±0.12、1.87±0.12、1.78±0.07（灌木层，0.44±0.08、1.71± 0.15、2.49±0.06；草本层，0.33±0.13、1.31±0.15 、2.15±0.08； 苔藓层1.30±0.11、2.08±0.04、1.73±0.11，）；Pielou 均匀度指数分别为0.45±0.05、0.29±0.06、0.28±0.08（灌木层，0.75±0.03、0.68±0.05、0.52±0.06；草本层，0.68±0.02、0.77±0.02、0.74±0.02；苔藓层，0.40±0.03、0.63±0.02、0.52±0.03）；Simpson's 优势度指数分别为0.63±0.06、0.78±0.04、0.83±0.07（灌木层，0.21±0.03、0.28±0.05、0.45±0.06；草本层，0.25±0.02、0.12±0.01、0.17±0.01；苔藓层，0.45±0.04、0.18±0.01、0.31±0.04）。三种生境间乔木层、草本层的Sorenson 群落相似性系数较低, 灌木层、苔藓层的的Sorenson 群落相似性系数较高。 综上所述，黄龙岷江冷杉林的群落结构、植物多样性在三种生境间存在差异性，这将意味着我们在进行黄龙世界自然遗产地的森林经营管理时要较多地关注岷江冷山林群落在不同生境中的差异性。 There were multiplex habitat types, complicated community structure and abundant species composition in the Huanglong World Natural Heritage Site. Uncovering the differences of biodiversity among different habitats was a precondition to understand the distribution, formation and sustaining mechanism of the biodiversity, and the foundation of biodiversity conservation. In the present study, using plenty of quadrants, we investigated the community structure and the biodiversity of the primitive Abies faxoniana forest in different habitats (travertine bottomland, semi-sunny-slope non-calcified habitat and shady-slope non-calcified habitat) in the Huanglong World Natural Heritage Site. The main results are as follows: All the primitive Abies faxoniana forests in the three habitats were uneven-aged with obvious vertical structure including tree layer, shrub layer, herb layer and bryophyte layer. A total of 386 higher plants including 163 vascular plant species (103 generic, 46 families) and 223 bryophyte species (83 generic, 38 families) were investigated. The structure and species composition of each layer are as follows: (1) There were 18, 13 and 8 tree species in travertine bottomland, shady-slope non-calcified habitat and semi-sunny-slope non-calcified habitat, respectively. The tree layers in all habitats can be divided into two clear sub-layers. The upper tree layers were dominated by Abies faxoniana, and the lower tree layers were dominated by uneven-aged Abies faxoniana or other phanerophytes species. There were Abies fargesii , Picea asperata and Betula platyphylla besides the dominated species (Abies faxoniana) in the upper tree layer in travertine bottomland, and the lower tree layers were dominated by uneven-aged Abies faxoniana; There were Abies fargesii and Betula platyphylla besides the dominated species (Abies faxoniana) in the upper tree layer in shady-slope non-calcified habitat, and the lower tree layers were dominated by Acer caudatum var. prattii; There was Abies fargesii besides the dominated species (Abies faxoniana) in the upper tree layer semi-sunny-slope non-calcified habitat, and the lower tree layers were dominated by uneven-aged Abies faxoniana. According to composition percentage of dominate species in tree layer, both the forest in travertine bottomland and in semi-sunny-slope non-calcified habitat could be ranked as pure forest, and the forest in shady-slope non-calcified habitat could be ranked as mingled forest. There were significant differences in crown density, plant density, height structure and diameter structure among the three habitats. (2) A total of 41 shrub species (average coverage 18.49±1.72％; average height 52.12±4.45 ㎝)were found in travertine bottomland, and the dominate species was Berberis dasystachya; A total of 30 shrub species (average coverage 29.33±2.56 ％;average height 119.55±8.01 ㎝)were found in shady-slope non-calcified habitat, and the dominate species was Fargesia spathacea, Lonicera tangutica and Lonicera saccata. A total of 29 shrub species (average coverage 31.35±1.93％; average height 107.55±4.24 ㎝) were found in semi-sunny-slope non-calcified habitat, and the dominate species was Fargesia spathacea. There were significant differences in structure and species diversity of the shrub layers among the three habitats. The coverage and height of shrub had lower value in travertine bottomland than in two non-calcified habitats. Moreover, travertine bottomland was dominated by deciduous shrub species with microphyll and non-calcified habitats developed abundant Fargesia spathacea species. (3) A total of 46 herb species (average coverage 7.18±0.79％;average height 5.04±0.26 ㎝)were found in travertine bottomland, and the dominate species was Oxalis griffithii; A total of 71 herb species (average coverage 29.04±2.31％;average height 9.08±0.52 ㎝)were found in shady-slope non-calcified habitat, and the dominate species was Elatostema obtusum and Oxalis griffithii. A total of 50 herb species (average coverage 8.79±0.82％;average height 7.67±0.43 ㎝) were found in semi-sunny-slope non-calcified habitat, and the dominate species was Adiantum flabellulatum, Viola biflora, Lunathyrium shennongense and Oxalis griffithii. Herb layers developed well in shady-slope non-calcified habitat and had the higher species richness and coverage than travertine bottomland and semi-sunny-slope non-calcified habitat. (4) A total of 140 bryophyte species (average coverage 84.25±1.30％)were found in travertine bottomland, and the dominate species was big bryophyte species such as Hylocomiastrum umbratum and so on; A total of 115 bryophyte species (average coverage 79.29±1.64％)were found in shady-slope non-calcified habitat, and the dominate species was small bryophyte species such as Mnium spinosum, Thuidium cymbifolium, Bryhnia trichomitra and so on. A total of 91 bryophyte species (average coverage 60.64±1.93％) were found in semi-sunny-slope non-calcified habitat, and the dominate species was Mnium spinosum. (5) There were 234, 221 and 175 plant species in travertine bottomland, shady-slope non-calcified habitat and semi-sunny-slope non-calcified habitat, respectively. Shannon-Wiener index of the tree layer was 0.75 ±0.12, 1.87±0.12 and 1.78±0.07 (the shrub layer, 0.44±0.08, 1.71± 0.15 and 2.49±0.06; the herb layer, 0.33±0.13, 1.31±0.15 and 2.15±0.08; the bryophyte layer, 1.30±0.11, 2.08±0.04 and 1.73±0.11.) for the three habitats, respectively; Pielou index of the tree layer was 0.45±0.05, 0.29±0.06 and 0.28±0.08 (the shrub layer, 0.75±0.03, 0.68±0.05 and 0.52±0.06; the herb layer, 0.68±0.02, 0.77±0.02 and 0.74±0.02; the bryophyte layer, 0.40±0.03, 0.63±0.02 and 0.52±0.03.) for the three habitats, respectively. Simpson's index of the tree layer was 0.63±0.06, 0.78±0.04 and 0.83±0.07 (the shrub layer, 0.21±0.03、0.28±0.05、0.45±0.06; the herb layer, 0.25±0.02, 0.12±0.01 and 0.17±0.01; the bryophyte layer, 0.45±0.04, 0.18±0.01 and 0.31±0.04.) for the three habitats, respectively. There were low Sorenson index both in the tree layer and in the herb layer among the three habitats, whereas, high Sorenson index occurred both in the shrub layer and in the bryophyte layer. To sum up, there were differences both in community structure and plant diversity among the three different habitats, which means that we should pay more attention to habitats heterogeneities of the primitive Abies faxoniana forest when we take action to manage the forest in the Huanglong World Natural Heritage Site.