Weed interference on coffee fruit production during a four-year investigation after planting

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource

O café é um dos principais produtos agrícolas, sendo considerado o segundo item em importância do comércio internacional de commodities. O gênero Coffea pertence à família Rubiaceae que também inclui outras plantas importantes. Este gênero contém aproximadamente 100 espécies, mas a produção comercial é baseada somente em duas espécies, Coffea arabica e Coffea canephora, que representam aproximadamente 70 % e 30 % do mercado total de café, respectivamente. O Projeto Genoma Café Brasileiro foi desenvolvido com o objetivo de disponibilizar os modernos recursos da genômica à comunidade científica e aos diferentes segmentos da cadeia produtiva do café. Para isso, foram seqüenciados 214.964 clones escolhidos aleatoriamente de 37 bibliotecas de cDNA de C. arabica, C. canephora e C. racemosa representando estádios específicos do desenvolvimento de células e de tecidos do cafeeiro, resultando em 130.792, 12.381 e 10.566 seqüências de cada espécie, respectivamente, após processo de trimagem. Os ESTs foram agrupados em 17.982 contigs e em 32.155 singletons. A comparação destas seqüências pelo programa BLAST revelou que 22 % não tiveram nenhuma similaridade significativa às seqüências no banco de dados do National Center for Biotechnology Information (de função conhecida ou desconhecida). A base de dados de ESTs do cafeeiro resultou na identificação de cerca de 33.000 unigenes diferentes. Os resultados de anotação das seqüências foram armazenados em base de dados online em <A HREF=http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe>http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe</A>. Os recursos desenvolvidos por este projeto disponibilizam ferramentas genéticas e genômicas que podem ser decisivas para a sustentabilidade, a competitividade e a futura viabilidade da agroindústria cafeeira nos mercados interno e externo.

Description of new cicada species associated with the coffee plant and an identification key for the species of Fidicinoides (Hemiptera: Cicadidae) from Brazil

The genus Fidicinoides Boulard & Martinelli is characterized by its partially exposed timbal, not totally covered by the meta-scutellar plate as occurs in Fidicina Amyot & Serville, and has an extensive geographic distribution in Central and South America. In this work a new species for the genus is described. Fidicinoides sarutaiensis Santos, Martinelli & Maccagnan sp. n. is a medium-sized cicada, with the collected and studied specimens associated with coffee (Coffee arabica L.), in the municipality of Sarutaia, in the southeast region of São Paulo state. The species F. glauca (Goding, 1925) and F. viridifemur (Walker, 1850) are transferred to Dorisiana. An identification key for the Fidicinoides species of Brazil is also proposed.

Diversidade de hemerobiídeos (Neuroptera) e suas associações com presas em cafeeiros

O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade de Hemerobiidae (Neuroptera) em cafeeiros, e suas relações com Leucoptera coffeella, Coccus sp., Planococcus sp., Oligonychus ilicis, Brevipalpus phoenicis, Aphis spiraecola e Toxoptera aurantii. As amostragens foram realizadas em Cravinhos, SP, entre maio de 2005 e abril de 2007. Os hemerobiídeos foram coletados com rede de varredura, armadilha de Möricke e armadilhas luminosas e, para a amostragem das presas, foram coletadas folhas de cafeeiro. Foram obtidos 882 exemplares de hemerobiídeos: Nusalala tessellata (467 espécimes, 52,9% do total coletado), Hemerobius bolivari (153, 17,3%), Megalomus impudicus (114, 12,9%), Sympherobius miranda (109, 12,4%), Megalomus rafaeli (30, 3,4%), Sympherobius ariasi (6, 0,7%) e Nomerobius psychodoides (3, 0,3%). A ocorrência de Nusalala tessellata e M. impudicus foi correlacionada positivamente à de Coccus sp.; o mesmo fato ocorreu para M. rafaeli com lagartas de L. coffeella e A. spiraecola e para H. bolivari com O. ilicis. As correlações foram negativas e significativas entre as ocorrências de S. miranda e O. ilicis e entre as de N. tessellata e L. coffeella e O. ilicis. As correlações mostraram que os Hemerobiidae, predadores generalistas, foram favorecidos pelo constante suprimento de presas que ocorreram na cultura do café, no período estudado.

Endophytic microorganisms from coffee tissues as plant growth promoters and biocontrol agents of coffee leaf rust

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Kinetics of zinc uptake and anatomy of roots and leaves of coffee trees as affected by zinc nutrition

Zinc (Zn) uptake kinetics and root and leaf anatomy were studied in coffee trees grown in nutrient solutions with or without Zn. Leaves and roots were sampled and cuts were made in the medium part of the leaves and in root tips and observed under an optical microscope. Plants grown without Zn showed an increase in root and in root stele diameter. There was also an increase in epidermis thickness and in the cross-sectional area of the cortex and stele due to Zn deficiency, but the diameter of xylem vessels was decreased. An increase in root cortex and stele diameter provided for an increased surface for nutrient uptake. Accordingly, C(min) was decreased from 13.8 to 3.4 mu mol L(-1) and V(max) increased from 0.50 to 2.1 mu mol cm(-2) h(-1) .

Transposable elements in Coffea (Gentianales : Rubiacea) transcripts and their role in the origin of protein diversity in flowering plants

Transposable elements are major components of plant genomes and they influence their evolution, acting as recombination hot spots, acquiring specific cell functions or becoming part of protein-coding regions. The latter is the subject of the present analysis. This study is a report on the annotation of transposable elements (TEs) in expressed sequences of Coffea arabica, Coffea canephora and Coffea racemosa, showing the occurrence of 383 ESTs and 142 unigenes with TE fragments in these three Coffea species. Based on selected unigenes, it was possible to suggest 26 putative proteins with TE-cassette insertions, demonstrating a likely contribution to protein variability. The genes for two of those proteins, the fertility restorer (FR) and the pyrophosphate-dependent phosphofructokinase (PPi-PFKs) genes, were selected for evaluating the impact of TE-cassettes on host gene evolution of other plant genomes (Arabidopsis thaliana, Oryza sativa and populus trichocarpa). This survey allowed identifying a FR gene in O. sativa harboring multiple insertions of LTR retrotransposons that originated new exons, which however does not necessarily mean a case of molecular domestication. A possible transduction event of a fragment of the PPi-PFK beta-subunit gene mediated by Helitron ATREPX1 in Arabidopsis thaliana was also highlighted.

FISH using a gag-like fragment probe reveals a common Ty3-gypsy-like retrotransposon in genome of Coffea species

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Controle biológico de nematóides de galha do cafeeiro com fungos nematófagos

Pós-graduação em Agronomia (Produção Vegetal) - FCAV

Estudo químico e biológico de espécies de Rubiaceae

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Cobertura e depósito de calda fitossanitária em plantas de café pulverizadas com equipamento original e adaptado para plantas altas

The objective of this study was to evaluate the coverage of spray droplets on coffee plants as well as their deposition using a sprayer with and without adaptation of an auxiliary branch for tall plants. The experiment was conducted following a randomized block design with six treatments and four replications to evaluate the percentage of coverage for the spraying liquids in water sensitive paper fixed at four quadrants and two heights (lower and upper) of the plants, and the spray deposit with metallic marker (MnSO4) on sheets in the same positions of the water sensitive paper in two spray volumes (450 and 750 L h(-1)). The experiment was conducted in October 2011 in the town of Patroc nio-MG, and the experimental plots consisted of 30 plants of Catua IAC-99, with approximately 12 years of age and average height of 3.50 meters. The experiments were conducted following a randomized block design with six treatments and four replications to evaluate the coverage and deposition, in two spray volumes (450 and 750 L ha(-1)). Leaves were collected in four positions and also at the top four in the lower canopy. The results of the evaluations were analysed statistically by F test and for comparison of means by Tukey test at 5% probability. The auxiliary branch installed at the rear of the equipment is the most suitable when compared to use of equipment without this feature or installed in the front of the equipment. Furthermore, the application volume of 450 L ha(-1) results in coverages and deposits of spraying liquids equivalents to volume of 750 L ha(-1), considered sufficient according to the parameters evaluated.

Effect of potassium sources and rates on arabica coffee yield, nutrition, and macronutrient export

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Effects of elevated atmospheric carbon dioxide on the biological control of coffee leaf rust under controlled conditions

The effect of elevated atmospheric CO2 concentration on biological control of coffee leaf rust, caused by Hemileia vastatrix, was evaluated by leaf disc assay, under controlled conditions. The biocontrol agents Bacillus subtilis, Bacillus pumilus and Lecanicillium longisporum were applied 24h before, 24h after, and simultaneously with the H. vastatrix on leaf discs (diameter of 1.5cm). The CO2 concentrations tested were: 380, 430, 700 and 1300ppm for B. subtilis and B. pumilus; and 380, 430, 670 and 1200ppm for L. longisporum. The antagonists were not affected by CO2 concentrations. B. subtilis was the most effective in controlling the disease when applied before and simultaneously with pathogen.

Eficiência de fontes, dinâmica do magnésio no solo sob a cultura do café no Brasil e comparação da análise de K, Ca e Mg em solos do Arkansas-EUA seco em estufa e úmido de campo

A cultura do café no Brasil tem apresentado frequente deficiência de magnésio (Mg) limitando sua produtividade, portanto faz-se necessário o estudo de fontes que contenham Mg para essa cultura. Por outro lado, o estudo das metodologias de análise de K, Ca e Mg no solo é um outro ponto que precisa ser estudado para melhor manejo da fertilidade do solo e recomendação de adubações. Objetivou-se com o primeiro experimento avaliar a eficiência de fontes de magnésio para a cultura do café e a dinâmica deste nutriente no perfil do solo. E com o experimento desenvolvido em Arkansas-EUA, avaliar as correlações entre as concentrações de nutrientes do solo seco em estufa e úmido de campo extraídos com Mehlich-3 e 1 mol L-1 NH4OAc. Observou-se que o óxido e oxissulfato de Mg elevaram os valores de pH e CTC e diminuíram a concentração de H + Al do solo. As fontes diminuíram a disponibilidade de K e Ca, e aumentaram o Mg no solo. Na planta, óxido e sulfato de Mg proporcionaram maior concentração de Mg foliar. Apenas no segundo ano de avaliação houve aumento de produtividade do café. Os fertilizantes óxido e oxissulfato de Mg obtiveram o maior índice de eficiência agronômica em relação ao carbonato de Mg. No segundo experimento, K, Ca e Mg extraíveis com Mehlich-3 e NH4OAc foram altamente correlacionados (r2> 0,95) tanto para solo úmido de campo quanto para o seco em estufa. A relação entre as concentrações de K no solo seco em estufa e úmido de campo para Mehlich-3 e NH4OAc foram muito semelhantes e altamente correlacionados (r2 = 0,92). A secagem do solo em estufa teve efeito mínimo sobre as concentrações de Ca e reduziu a concentração de Mg tanto para Mehlich-3 quanto para NH4OAc. Entre os nutrientes estudados, a concentração de K foi a mais afetada pela secagem em estufa, necessitando de pesquisas de campo para correlacionar e calibrar novas recomendações agronômicas.

Cafés Especiales. El caso del Cauca en Colombia

El éxito en los mercados internacionales de la industria de los denominados cafés especiales, incluyendo el rápido aumento del número de pequeños-medianos tostadores de café de alta calidad y la aparición de "boutiques" de café, pone de manifiesto que existen consumidores capaces de apreciar y distinguir el café de calidad y además están dispuestos a pagar por él (Oberthuer et al., 2011). Colombia se caracteriza fundamentalmente por sus variedades de café procedentes de la especie Coffea arabica, obtenidos mediante el denominado procesado "húmedo" del café, que consiste en el despulpado, la licuefacción del mucílago por fermentación microbiana y su posterior retirada mediante el lavado con agua. Este método permite la obtención de los cafés verdes con mejor calidad aromática (Gonzalez-Rios et al., 2007) que en el mercado alcanzarán mayor precio, siendo estos la base para la obtención de los denominados cafés especiales.