Going twice to the polls?: Optimality of two-stage voting procedures

A Masters Thesis, presented as part of the requirements for the award of a Research Masters Degree in Economics from NOVA – School of Business and Economics

Interaction of malaria parasites with host late endocytic and autophagic pathways is essential for Plasmodium liver stage development

RESUMO: A Malária é causada por parasitas do género Plasmodium, sendo a doença parasitária mais fatal para o ser humano. Apesar de, durante o século passado, o desenvolvimento económico e a implementação de diversas medidas de controlo, tenham permitido erradicar a doença em muitos países, a Malária continua a ser um problema de saúde grave, em particular nos países em desenvolvimento. A Malária é transmitida através da picada de uma fêmea de mosquito do género Anopheles. Durante a picada, os esporozoítos são injetados na pele do hospedeiro, seguindo-se a fase hepática e obrigatória do ciclo de vida. No fígado, os esporozoítos infetam os hepatócitos onde se replicam, dentro de um vacúolo parasitário (VP) e de uma forma imunitária silenciosa, em centenas de merozoitos. Estas novas formas do parasita são as responsáveis por infetar os eritrócitos, iniciando a fase sanguínea da doença, onde se os primeiros sintomas se manifestam, tais como a característica febre cíclica. A fase hepática da doença é a menos estudada e compreendida. Mais ainda, as interações entre o VP e os organelos da células hospedeira estão ainda pouco caracterizados. Assim, neste estudo, as interações entre os organelos endocíticos e autofágicos da célula hospedeira e o VP foram dissecados, observando-se que os anfisomas, que são organelos resultantes da intersecção do dois processos de tráfego intracelular, interagem com o parasita. Descobrimos que a autofagia tem também uma importante função imunitária durante a fase hepática inicial, ao passo, que durante o desenvolvimento do parasita, já numa fase mais tardia, o parasita depende da interação com os endossomas tardios e anfisomas para crescer. Vesiculas de BSA, EGF e LC3, foram, também, observadas dentro do VP, sugerindo que os parasitas são capazes de internalizar material endocítico e autofágico do hospedeiro. Mais ainda, mostramos que esta interação depende da cinase PIKfyve, responsável pela conversão do fosfoinositidio-3-fosfato no fosfoinositidio-3,5-bifosfato, uma vez que inibindo esta cinase o parasita não é capaz de crescer normalmente. Finalmente, mostramos que a proteína TRPML1, uma proteína efetora do fosfoinositidio-3,5-bifosfato, e envolvida no processo de fusão das membranas dos organelos endocíticos e autofágicos, também é necessária para o crescimento do parasita. Desta forma, o nosso estudo sugere que a membrana do VP funde com vesiculas endocíticas e autofágicas tardias, de uma forma dependente do fositidio-3,5-bifosfato e do seu effetor TRPML1, permitindo a troca de material com a célula hospedeira. Concluindo, os nossos resultados evidenciam que o processo autofágico que ocorre na célula hospedeira tem um papel duplo durante a fase hepática da malaria. Enquanto numa fase inicial os hepatócitos usam o processo autofágico como forma de defesa contra o parasita, já durante a fase de replicação o VP funde com vesiculas autofágicas e endocíticas de forma a obter os nutrientes necessários ao seu desenvolvimento.--------- ABSTRACT: Malaria, which is caused by parasites of the genus Plasmodium, is the most deadly parasitic infection in humans. Although economic development and the implementation of control measures during the last century have erradicated the disease from many areas of the world, it remains a serious human health issue, particularly in developing countries. Malaria is transmitted by female mosquitoes of the genus Anopheles. During the mosquito blood meal, Plasmodium spp. sporozoites are injected into the skin dermis of the vertebrate host, followed by an obligatory liver stage. Upon entering the liver, Plasmodium parasites infect hepatocytes and silently replicate inside a host cell-derived parasitophorous vacuole (PV) into thousands of merozoites. These new parasite forms can infect red blood cells initiating the the blood stage of the disease which shows the characteristic febrile malaria episodes. The liver stage is the least characterized step of the malaria infection. Moreover, the interactions between the Plasmodium spp. PV and the host cell trafficking pathways are poorly understood. We dissected the interaction between Plasmodium parasites and the host cell endocytic and autophagic pathways and we found that both pathways intersect and interconnect in the close vicinity of the parasite PV, where amphisomes are formed and accumulate. Interestingly, we observed a clearance function for autophagy in hepatocytes infected with Plasmodium berghei parasites at early infection times, whereas during late liver stage development late endosomes and amphisomes are required for parasite growth. Moreover, we found the presence of internalized BSA, EGF and LC3 inside parasite vacuoles, suggesting that the parasites uptake endocytic and autophagic cargo. Furthermore, we showed that the interaction between the PV and host traffic pathways is dependent on the kinase PIKfyve, which converts the phosphoinositide PI(3)P into PI(3,5)P2, since PIKfyve inhibition caused a reduction in parasite growth. Finally, we showed that the PI(3,5)P2 effector protein TRPML1, which is involved in late endocytic and autophagic membrane fusion, is also required for parasite development. Thus, our studies suggest that the parasite parasitophorous vacuole membrane (PVM) is able to fuse with late endocytic and autophagic vesicles in a PI(3,5)P2- and TRPML1-dependent manner, allowing the exchange of material between the host cell and the parasites, necessary for the rapid development of the latter that is seen during the liver stage of infection. In conclusion, we present evidence supporting a specific and essential dual role of host autophagy during the course of Plasmodium liver infection. Whereas in the initial hours of infection the host cell uses autophagy as a cell survival mechanism to fight the infection, during the replicative phase the PV fuses with host autophagic and endocytic vesicles to obtain nutrients required for parasite growth.

Host genetic factors in mouse malaria liver stage infection

Fundação para a Ciência e a Tecnologia

In vitro predatory activity of conidia of fungal isolates of the Duddingtonia flagrans on Angiostrongylus vasorum first-stage larvae

INTRODUCTION: Angiostrongylus vasorum is a nematode that parasitizes molluscs, dogs, and even man. METHODS: The objective was to evaluate the predatory activity of the conidia of two fungal isolates of Duddingtonia flagrans (AC001 and CG722) on first-stage larvae (L1) of A. vasorum in laboratory conditions. RESULTS: At the end of the experiment, there were significant reductions (p<0.01) of 74.5% and 63.2%, on average, in the A. vasorum L1 recovered in the AC001 and CG722 treatment conditions, respectively. CONCLUSIONS: The two isolates of fungi were efficient in the capture and destruction of A. vasorum L1.

Bloodstream infection in patients with end-stage renal disease in a teaching hospital in central-western Brazil

Introduction Vascular access in patients undergoing hemodialysis is considered a critical determinant of bloodstream infection (BSI) and is associated with high morbidity and mortality. The purpose of this study was to investigate the occurrence of BSI in patients with end-stage renal disease using central venous catheters for hemodialysis. Methods A cohort study was conducted in a public teaching hospital in central-western Brazil from April 2010 to December 2011. For every patient, we noted the presence of hyperemia/exudation upon catheter insertion, as well as fever, shivering, and chills during hemodialysis. Results Fifty-nine patients were evaluated. Thirty-five (59.3%) patients started dialysis due to urgency, 37 (62.7%) had BSI, and 12 (20%) died. Hyperemia at the catheter insertion site (64.9%) was a significant clinical manifestation in patients with BSI. Statistical analysis revealed 1.7 times more cases of BSI in patients with hypoalbuminemia compared with patients with normal albumin levels. The principal infective agents identified in blood cultures and catheter-tip cultures were Staphylococcus species (24 cases), non-fermentative Gram-negative bacilli (7 cases of Stenotrophomonas maltophilia and 5 cases of Chryseobacterium indologenes), and Candida species (6). Among the Staphylococci identified, 77.7% were methicillin-resistant, coagulase-negative Staphylococci. Of the bacteria isolated, the most resistant were Chryseobacterium indologenes and Acinetobacter baumannii. Conclusions Blood culture was demonstrated to be an important diagnostic test and identified over 50% of positive BSI cases. The high frequency of BSI and the isolation of multiresistant bacteria were disturbing findings. Staphylococcus aureus was the most frequently isolated microorganism, although Gram-negative bacteria predominated overall. These results highlight the importance of infection prevention and control measures in dialysis units.

Challenges of converting nonprofit in for-profit-reasons decision making and key success factores of a conversion

Due to external constraints (opposed by the market and legal system) and internal changes nonprofit organizations have been converting to for-profit entities combining commercial revenue and social value creation. To create an understanding of the conversion process considering its challenges, the reasons, the decision-making process and key success factors of a conversion are examined. Therefore, a two-step research procedure is used combining literature research and a multiple case study approach based on expert interviews with known companies. The outcome is a helpful guideline (including a decision matrix) for social entrepreneurs that might face a conversion.

Avaliação económica em transplantação renal : abordagem estratégica do processo de doação e análise de custo-utilidade do programa de transplantação renal versus hemodiálise

SUMÁRIO - O desafio atual da Saúde Pública é assegurar a sustentabilidade financeira do sistema de saúde. Em ambiente de recursos escassos, as análises económicas aplicadas à prestação dos cuidados de saúde são um contributo para a tomada de decisão que visa a maximização do bem-estar social sujeita a restrição orçamental. Portugal é um país com 10,6 milhões de habitantes (2011) com uma incidência e prevalência elevadas de doença renal crónica estadio 5 (DRC5), respetivamente, 234 doentes por milhão de habitantes (pmh) e 1.600 doentes/pmh. O crescimento de doenças associadas às causas de DRC, nomeadamente, diabetes Mellitus e hipertensão arterial, antecipam uma tendência para o aumento do número de doentes. Em 2011, dos 17.553 doentes em tratamento substitutivo renal, 59% encontrava-se em programa de hemodiálise (Hd) em centros de diálise extra-hospitalares, 37% viviam com um enxerto renal funcionante e 4% estavam em diálise peritoneal (SPN, 2011). A lista ativa para transplante (Tx) renal registava 2.500 doentes (SPN 2009). O Tx renal é a melhor modalidade terapêutica pela melhoria da sobrevida, qualidade de vida e relação custo-efetividade, mas a elegibilidade para Tx e a oferta de órgãos condicionam esta opção. Esta investigação desenvolveu-se em duas vertentes: i) determinar o rácio custo-utilidade incremental do Tx renal comparado com a Hd; ii) avaliar a capacidade máxima de dadores de cadáver em Portugal, as características e as causas de morte dos dadores potenciais a nível nacional, por hospital e por Gabinete Coordenador de Colheita e Transplantação (GCCT), e analisar o desempenho da rede de colheita de órgãos para Tx. Realizou-se um estudo observacional/não interventivo, prospetivo e analítico que incidiu sobre uma coorte de doentes em Hd que foi submetida a Tx renal. O tempo de seguimento mínimo foi de um ano e máximo de três anos. No início do estudo, colheram-se dados sociodemográficos e clínicos em 386 doentes em Hd, elegíveis para Tx renal. A qualidade de vida relacionada com a saúde (QVRS) foi avaliada nos doentes em Hd (tempo 0) e nos transplantados, aos três, seis, 12 meses, e depois, anualmente. Incluíram-se os doentes que por falência do enxerto renal transitaram para Hd. Na sua medição, utilizou-se um instrumento baseado em preferências da população, o EuroQol-5D, que permite o posterior cálculo dos QALY. Num grupo de 82 doentes, a QVRS em Hd foi avaliada em dois tempos de resposta o que permitiu a análise da sua evolução. Realizou-se uma análise custo-utilidade do Tx renal comparado com a Hd na perspetiva da sociedade. Identificaram-se os custos diretos, médicos e não médicos, e as alterações de produtividade em Hd e Tx renal. Incluíram-se os custos da colheita de órgãos, seleção dos candidatos a Tx renal e follow-up dos dadores vivos. Cada doente transplantado foi utilizado como controle de si próprio em diálise. Avaliou-se o custo médio anual em programa de Hd crónica relativo ao ano anterior à Tx renal. Os custos do Tx foram avaliados prospetivamente. Considerou-se como horizonte temporal o ciclo de vida nas duas modalidades. Usaram-se taxas de atualização de 0%, 3% e 5% na atualização dos custos e QALY e efetuaram-se análises de sensibilidade one way. Entre 2008 e 2010, 65 doentes foram submetidos a Tx renal. Registaram-se, prospetivamente, os resultados em saúde incluíndo os internamentos e os efeitos adversos da imunossupressão, e o consumo dos recursos em saúde. Utilizaram-se modelos de medidas repetidas na avaliação da evolução da QVRS e modelos de regressão múltipla na análise da associação da QVRS e dos custos do transplante com as características basais dos doentes e os eventos clínicos. Comparativamente à Hd, observou-se melhoria da utilidade ao 3º mês de Tx e a qualidade de vida aferida pela escala EQ-VAS melhorou em todos os tempos de observação após o Tx renal. O custo médio da Hd foi de 32.567,57€, considerado uniforme ao longo do tempo. O custo médio do Tx renal foi de 60.210,09€ no 1º ano e 12.956,77€ nos anos seguintes. O rácio custo-utilidade do Tx renal vs Hd crónica foi de 2.004,75€/QALY. A partir de uma sobrevivência do enxerto de dois anos e cinco meses, o Tx associou-se a poupança dos custos. Utilizaram-se os dados nacionais dos Grupos de Diagnóstico Homogéneos e realizou-se um estudo retrospectivo que abrangeu as mortes ocorridas em 34 hospitais com colheita de órgãos, em 2006. Considerou-se como dador potencial o indivíduo com idade entre 1-70 anos cuja morte ocorrera a nível hospitalar, e que apresentasse critérios de adequação à doação de rim. Analisou-se a associação dos dadores potenciais com características populacionais e hospitalares. O desempenho das organizações de colheita de órgãos foi avaliado pela taxa de conversão (rácio entre os dadores potenciais e efetivos) e pelo número de dadores potenciais por milhão de habitantes a nível nacional, regional e por Gabinete Coordenador de Colheita e Transplantação (GCCT). Identificaram-se 3.838 dadores potenciais dos quais 608 apresentaram códigos da Classificação Internacional de Doenças, 9.ª Revisão, Modificações Clínicas (CID- 9-MC) que, com maior frequência, evoluem para a morte cerebral. O modelo logit para dados agrupados identificou a idade, o rácio da lotação em Unidades de Cuidados Intensivos e lotação de agudos, existência de GCCT e de Unidade de Transplantação, e mortalidade por acidente de trabalho como fatores preditivos da conversão dum dador potencial em efetivo e através das estimativas do modelo logit quantificou-se a probabilidade dessa conversão. A doação de órgãos deve ser assumida como uma prioridade e as autoridades em saúde devem assegurar o financiamento dos hospitais com programas de doação, evitando o desperdício de órgãos para transplantação, enquanto um bem público e escasso. A colheita de órgãos deve ser considerada uma opção estratégica da atividade hospitalar orientada para a organização e planeamento de serviços que maximizem a conversão de dadores potenciais em efetivos incluindo esse critério como medida de qualidade e efetividade do desempenho hospitalar. Os resultados deste estudo demonstram que: 1) o Tx renal proporciona ganhos em saúde, aumento da sobrevida e qualidade de vida, e poupança de custos; 2) em Portugal, a taxa máxima de eficácia da conversão dos dadores cadavéricos em dadores potenciais está longe de ser atingida. O investimento na rede de colheita de órgãos para Tx é essencial para assegurar a sustentabilidade financeira e promover a qualidade, eficiência e equidade dos cuidados em saúde prestados na DRC5.

Chemotherapy versus best supportive care in stage IV non-small cell lung cancer, non metastatic to the brain

Stage IV non-small cell lung cancer is a fatal disease, with a median survival of 14 months. Systemic chemotherapy is the most common approach. However the impact in overall survival and quality of life still a controversy. OBJECTIVES: To determine differences in overall survival and quality of life among patients with stage IV non-small cell lung cancer non-metastatic to the brain treated with best supportive care versus systemic chemotherapy. PATIENTS: From February 1990 through December 1995, 78 eligible patients were admitted with the diagnosis of stage IV non-small cell lung cancer . Patients were divided in 2 groups: Group A (n=31 -- treated with best supportive care ), and Group B (n=47 -- treated with systemic chemotherapy). RESULTS: The median survival time was 23 weeks (range 5 -- 153 weeks) in Group A and 55 weeks (range 7.4 -- 213 weeks) in Group B (p=0.0018). In both groups, the incidence of admission for IV antibiotics and need of blood transfusions were similar. Patients receiving systemic chemotherapy were also stratified into those receiving mytomycin, vinblastin, and cisplatinum, n=25 and those receiving other combination regimens (platinum derivatives associated with other drugs, n=22). Patients receiving mytomycin, vinblastin, and cisplatinum, n=25 had a higher incidence of febrile neutropenia and had their cycles delayed for longer periods of time than the other group. These patients also had a shorter median survival time (51 versus 66 weeks, p=0.005). CONCLUSION: In patients with stage IV non-small cell lung cancer, non-metastatic to the brain, chemotherapy significantly increases survival compared with best supportive care.

A case study on the conversion of an internal combustion engine vehicle into an electric vehicle

This paper presents the conversion process of a traditional Internal Combustion Engine vehicle into an Electric Vehicle. The main constitutive elements of the Electric Vehicle are presented. The developed powertrain uses a three-phase inverter with Field Oriented Control and space vector modulation. The developed on-board batteries charging system can operate in Grid-to-Vehicle and Vehicle-to-Grid modes. The implemented prototypes were tested, and experimental results are presented. The assembly of these prototypes in the vehicle was made in accordance with the Portuguese legislation about vehicles conversion, and the main adopted solutions are presented.

A new empirical system for rock slope stability analysis in exploitation stage

An empirical system was developed to obtain a quality index for rock slopes in road infrastructures, named Slope Quality Index (SQI), and it was applied to a set of real slopes.The SQI is supported in nine factors affecting slope stability that contemplate the evaluation of different parameters. Consequently, each factor is classified by the degree of importance and influence by assigned weights. These weights were established through a statistical analysis of replies to a survey that was distributed to several experienced professionals in the field. The proposed SQI varies between1 and 5, corresponding to slopes in very good and very bad condition state, respectively. Besides the advantage linked to a quantitative and qualitative evaluation of slopes, theSQI also allows identifying the most critical factors on the slope stability, which is a fundamental issue for an efficient management of the slope network in the road infrastructure, namely in the planning of conservation and maintenance operations.

Development of a new 3D OpenFOAM® solver to model the cooling stage in profile extrusion

[Excerpt] The advantages resulting from the use of numerical modelling tools to support the design of processing equipment are almost consensual. The design of calibration systems in profile extrusion is not an exception . H owever , the complex geome tries and heat exchange phenomena involved in this process require the use of numerical solvers able to model the heat exchange in more than one domain ( calibrator and polymer), the compatibilization of the heat transfer at the profile - calibrator interface and with the ability to deal with complex geometries. The combination of all these features is usually hard to find in commercial software. Moreover , the dimension of the meshes required to ob tain accurate results, result in computational times prohibitive for industrial application. (...)

Comparison of oleate conversion under microaerophilic and anaerobic conditions

Excessive accumulation of Long Chain Fatty Acids (LCFA) in methanogenic bioreactors is the cause of process failure associated to a severe decrease in methane production. In particular, fast and persistent accumulation of palmitate is critical and still not elucidated. Aerobes or facultative anaerobes were detected in those reactors, raising new questions on LCFA biodegradation. To get insight into the influence of oxygen, two bioreactors were operated under microaerophilic and anaerobic conditions, with oleate at 1 and 4 gCOD/(L d). Palmitate accumulated up to 2 and 16 gCOD/L in the anaerobic and microaerophilic reactor, respectively, which shows the importance of oxygen in this conversion. A second experiment was designed to understand the dynamics of oleate to palmitate conversion. A CSTR and a PFR were assembled in series and fed with oleate under microaerophilic conditions. HRT from 6 to 24 h were applied in the CSTR, and 14 to 52 min in the PFR. In the PFR a biofilm was formed where palmitate accounted for 82% of total LCFA. Pseudomonas was the predominant genus (42 %) in this biofilm, highlighting the role of aerobic and facultative anaerobic bacteria in LCFA bioconversion.

Gestão de inventários numa empresa de produção de linhas de costura

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia e Gestão Industrial

Indicadores chave de sustentabilidade para edifícios residenciais em estrutura metálica

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Civil

Assessment of prognosis in patients with stage II colon cancer

Assessment of prognosis of patients with stage II colon cancer.