THE TEMPO AND MODE OF EVOLUTION OF TRANSPOSABLE ELEMENTS AS REVEALED BY MOLECULAR PHYLOGENIES RECONSTRUCTED FROM MOSQUITO GENOMES

Although many mathematical models exist predicting the dynamics of transposable elements (TEs), there is a lack of available empirical data to validate these models and inherent assumptions. Genomes can provide a snapshot of several TE families in a single organism, and these could have their demographics inferred by coalescent analysis, allowing for the testing of theories on TE amplification dynamics. Using the available genomes of the mosquitoes Aedes aegypti and Anopheles gambiae, we indicate that such an approach is feasible. Our analysis follows four steps: (1) mining the two mosquito genomes currently available in search of TE families; (2) fitting, to selected families found in (1), a phylogeny tree under the general time-reversible (GTR) nucleotide substitution model with an uncorrelated lognormal (UCLN) relaxed clock and a nonparametric demographic model; (3) fitting a nonparametric coalescent model to the tree generated in (2); and (4) fitting parametric models motivated by ecological theories to the curve generated in (3).

Recessive COL6A2 C-globular Missense Mutations in Ullrich Congenital Muscular Dystrophy ROLE OF THE C2a SPLICE VARIANT

Ullrich congenital muscular dystrophy (UCMD) is a disabling and life-threatening disorder resulting from either recessive or dominant mutations in genes encoding collagen VI. Although the majority of the recessive UCMD cases have frameshift or nonsense mutations in COL6A1, COL6A2, or COL6A3, recessive structural mutations in the COL6A2 C-globular region are emerging also. However, the underlying molecular mechanisms have remained elusive. Here we identified a homozygous COL6A2 E624K mutation (C1 subdomain) and a homozygous COL6A2 R876S mutation (C2 subdomain) in two UCMD patients. The consequences of the mutations were investigated using fibroblasts from patients and cells stably transfected with the mutant constructs. In contrast to expectations based on the clinical severity of these two patients, secretion and assembly of collagen VI were moderately affected by the E624K mutation but severely impaired by the R876S substitution. The E624K substitution altered the electrostatic potential of the region surrounding the metal ion-dependent adhesion site, resulting in a collagen VI network containing thick fibrils and spots with densely packed microfibrils. The R876S mutation prevented the chain from assembling into triple-helical collagen VI molecules. The minute amount of collagen VI secreted by the R876S fibroblasts was solely composed of a faster migrating chain corresponding to the C2a splice variant with an alternative C2 subdomain. In transfected cells, the C2a splice variant was able to assemble into short microfibrils. Together, the results suggest that the C2a splice variant may functionally compensate for the loss of the normal COL6A2 chain when mutations occur in the C2 subdomain.

Effects of Inspiratory Muscle Training on Muscular and Pulmonary Function After Bariatric Surgery in Obese Patients

This study seeks to assess the effect of inspiratory muscle training (IMT) on pulmonary function, respiratory muscle strength, and endurance in morbidly obese patients submitted to bariatric surgery. Thirty patients were randomly assigned to sham muscular training, or to IMT with a threshold device (40% of maximum inspiratory pressure, MIP), for 30 min/day, from the 2nd until 30th postoperative (PO) day. All of them were submitted to a standard respiratory kinesiotherapy and early deambulation protocol. Data on spirometry, maximum static respiratory pressures, and respiratory muscle endurance were collected on the PO days 2, 7, 14, and 30 in a blinded matter. IMT enabled increases in PO MIP and endurance, and an earlier recovery of the spirometry parameters FEV(1), PEF, and FEF(25-75%). Comparing to preoperative values, MIP was increased by 13% at the 30th PO day in the trained group, whereas control group had a reduction of 8%, with higher values for the IMT group (30th PO, IMT-130.6 +/- 22.9 cmH(2)O; controls-112.9 +/- 25.1 cmH(2)O; p < 0.05). Muscular endurance at the 30th PO day was increased in the trained group comparing to preoperative value (61.5 +/- 39.6 s vs 114.9 +/- 55.2 s; p < 0.05), a finding not observed in the control group (81.7 +/- 44.3 vs 95.2 +/- 42.0 s). IMT improves inspiratory muscle strength and endurance and accounts for an earlier recovery of pulmonary airflows in morbidly obese patients submitted to bariatric surgery.

Detection of Spinal Muscular Atrophy Carriers in a Sample of the Brazilian Population

Background: Spinal muscular atrophy is a common autosomal recessive neuromuscular disorder caused by mutations in the SMN1 gene. Identification of spinal muscular atrophy carriers has important implications for individuals with a family history of the disorder and for genetic counseling. The aim of this study was to determine the frequency of carriers in a sample of the nonconsanguineous Brazilian population by denaturing high-performance liquid chromatography (DHPLC). Methods: To validate the method, we initially determined the relative quantification of DHPLC in 28 affected patients (DHPLC values: 0.00) and 65 parents (DHPLC values: 0.49-0.69). Following quantification, we studied 150 unrelated nonconsanguineous healthy individuals from the general population. Results: Four of the 150 healthy individuals tested (with no family history of a neuromuscular disorder) presented a DHPLC value in the range of heterozygous carriers (0.6-0.68). Conclusions: Based on these results, we estimated there is a carrier frequency of 2.7% in the nonconsanguineous Brazilian population, which is very similar to other areas of the world where consanguineous marriage is not common. This should be considered in the process of genetic counseling and risk calculations. Copyright (C) 2011 S. Karger AG, Basel

Neurophysiological findings of the late-onset, dominant, proximal spinal muscular atrophies with dysautonomia because of the VAPB PR056SER mutation

The vesicle-associated membrane protein/synaptobrevin-associated membrane protein B (VAPB) Pro56Ser Mutation has been identified in Brazilian families showing various motor neuron syndromes. However, the neurophysiological characteristics of these patients have not been detailed, and some questions Still need to be solved, such as the possible presence of myotonia and the origin of the abdominal protrusion seen in most patients. The eventual finding of suggestive electrophysiological characteristics would be helpful not only for clinical diagnosis but also to selection of the appropriate DNA test. To clarify these questions we carried out sensory and motor conduction Studies, including symphatetic skin response, and needle examination in six genetically proven affected members. The electromyographic findings were those of a slowly progressive motor neuron disorder. Topographically, the abdominal muscles were severely affected, but the facial and laryngeal muscles were preserved or very mildly involved. Sensory conduction studies and sympathetic Skin responses were normal. No myotonic discharge was recorded. These findings are indistinguishable from those of other motor neuron disorders, although the predominant involvement of the proximal limbs and of the abdominal muscles may be of some help in the appropriate clinical setting.

Physical therapy assessment tools to evaluate disease progression and phenotype variability in Golden Retriever muscular dystrophy

Dogs suffering from Golden Retriever muscular dystrophy (GRMD) present symptoms that are similar to human patients with Duchenne muscular dystrophy (DMD). Phenotypic variability is common in both cases and correlates with disease progression and response to therapy. Physical therapy assessment tools were used to study disease progression and assess phenotypic variability in dogs with GRMD. At 5 (TO), 9 (T1), 13 (T2) and 17 (T3) months of age, the physical features, joint ranges of motion (ROM), limb and thorax circumferences, weight and creatine kinase (CK) levels were assessed in 11 dogs with GRMD. Alterations of physical features were higher at 13 months, and different disease progression rates were observed. Passive ROM decreased until 1 year old, which was followed by a decline of elbow and tarsal ROM. Limb and thorax circumferences, which were corrected for body weight, decreased significantly between TO and T3. These measurements can be used to evaluate disease progression in dogs with GRMD and to help discover new therapies for DMD patients. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

M??dulo 2 - gerenciamento de escopo, tempo e custos do projeto: curso ger??ncia de projetos

Esse documento trata de gerenciamento do escopo do projeto; gerenciamento do tempo do projeto; gerenciamento dos custos do projeto

Dos clássicos aos hereges : Keynes e a economia de seu tempo

O artigo trata da posição teórica de Keynes relativamente à economia clássica e à abordagem denominada herética. A primeira seção resgata os traços distintivos das escolas clássica e neoclássica segundo a demarcação proposta por Keynes, bem como as críticas por ele dirigidas às principais teses defendidas por essas linhagens teóricas. A seguir, retoma-se a sua avaliação dos argumentos subconsumistas, indicando-se os seus pontos de convergência e distanciamento dessa visão econômica. Na continuação, apresentam-se as interpretações neoclássicas ao problema da demanda, comentando-se a relação da obra de Keynes com a tradição marshalliana. A última seção avalia a teoria neoclássica do produto real sob condições cíclicas e introduz a versão de Keynes para o equilíbrio agregado definido pelas propensões a gastar e a investir, além de indicar o componente de fragilidade da leitura marshalliana de sua estrutura teórica. Por fim, comenta-se a contribuição de Keynes ao conhecimento econômico da época perante a escola clássica e os hereges.

Interface Multimodal com Predição de Movimentos para Uso em Reabilitação de Membros Inferiores

Esta dissertação apresenta o desenvolvimento de uma plataforma multimodal de aquisição e processamento de sinais. O projeto proposto insere-se no contexto do desenvolvimento de interfaces multimodais para aplicação em dispositivos robóticos cujo propósito é a reabilitação motora adaptando o controle destes dispositivos de acordo com a intenção do usuário. A interface desenvolvida adquire, sincroniza e processa sinais eletroencefalográficos (EEG), eletromiográficos (EMG) e sinais provenientes de sensores inerciais (IMUs). A aquisição dos dados é feita em experimentos realizados com sujeitos saudáveis que executam tarefas motoras de membros inferiores. O objetivo é analisar a intenção de movimento, a ativação muscular e o início efetivo dos movimentos realizados, respectivamente, através dos sinais de EEG, EMG e IMUs. Para este fim, uma análise offline foi realizada. Nessa análise, são utilizadas técnicas de processamento dos sinais biológicos e técnicas para processar sinais provenientes de sensores inerciais. A partir destes, os ângulos da articulação do joelho também são aferidos ao longo dos movimentos. Um protocolo experimental de testes foi proposto para as tarefas realizadas. Os resultados demonstraram que o sistema proposto foi capaz de adquirir, sincronizar, processar e classificar os sinais combinadamente. Análises acerca da acurácia dos classificadores utilizados mostraram que a interface foi capaz de identificar intenção de movimento em 76, 0 ± 18, 2% dos movimentos. A maior média de tempo de antecipação ao movimento foi obtida através da análise do sinal de EEG e foi de 716, 0±546, 1 milisegundos. A partir da análise apenas do sinal de EMG, este valor foi de 88, 34 ± 67, 28 milisegundos. Os resultados das etapas de processamento dos sinais biológicos, a medição dos ângulos da articulação, bem como os valores de acurácia e tempo de antecipação ao movimento se mostraram em conformidade com a literatura atual relacionada.

Educação infantil em jornada de tempo integral : dilemas e perspectivas

Vania Carvalho de Araújo (Org.)

Análise do padrão de ativação muscular de indivíduos hemiparéticos pós-AVC em marcha assistida por andador robótico

O Acidente Vascular Cerebral (AVC) é uma das principais causas de prejuízos ao sistema neuromuscular. Dispositivos Robóticos vêm sendo amplamente desenvolvidos e estudados com a finalidade de serem utilizados na assistência à marcha e para o treinamento da marcha durante a reabilitação. O objetivo deste trabalho é avaliar a marcha assistida pelo AROW (Assistive Robotic Walker) em indivíduos hemiparéticos pós-AVC, através da análise de sinais de acelerometria e sinais mioelétricos de superfície (sEMG) provenientes dos músculos vasto medial (VM), bíceps femoral (BF), tibial anterior (TA) e gastrocnêmio medial (GM), e também utilizando os métodos de avaliação GAS (Goal Attainment Scaling) e SUS (System Usability Scale). Nove indivíduos hemiparéticos participaram dos testes. A velocidade da marcha foi reduzida com o uso do AROW e, consequentemente, houve algumas alterações na duração das fases da marcha, por exemplo, uma maior duração da fase de apoio (p = 0,0174). O padrão de ativação muscular para o grupo analisado não apresentou diferença estatisticamente significativa (início da ativação VM: p= 0,4999; término da ativação VM: p= 0,5647; início BF: p= 0,1186; término BF: p= 0,7823; início TA: p= 0,5833; término TA: p= 0,8393; início GM: p= 0,6077; término GM: p= 0,1429). Entretanto, avaliando o padrão de ativação muscular individualmente, podem-se notar algumas alterações benéficas, por exemplo, redução da coativação dos músculos tibial anterior e gastrocnêmio medial. Os resultados das avaliações através do GAS (54,8) e SUS (81,4) sobre o uso do AROW mostraram boa aceitação pelos usuários, e os objetivos esperados durante o uso do andador foram atingidos. A adaptação rápida, facilidade de utilização e sentimento de segurança ao usar o dispositivo são pontos positivos obtidos com o uso do AROW.

Estudantes público-alvo da educação especial na educação em tempo integral : um estudo em Vitória-ES

Este estudo tem como tema “Estudantes Público-Alvo da Educação Especial na Educação em Tempo Integral no Município de Vitoria-ES”. Seu objetivo geral foi investigar os modos de atendimento aos estudantes público-alvo da Educação Especial do Programa Educação em Tempo Integral – Educação Ampliada, oferecido pelo ensino público municipal nas Escolas de Ensino Fundamental (EMEFs) do município de Vitória, pela fala dos gestores e executores do programa. Seus objetivos específicos foram compreender a configuração da proposta de Educação em Tempo Integral – Educação Ampliada no município de Vitória-ES; caracterizar o conjunto de estudantes público-alvo da Educação Especial participantes do Programa Educação em Tempo Integral – Educação Ampliada no município; compreender os sentidos e significados da inclusão de estudantes público-alvo da Educação Especial no Programa Educação em Tempo Integral – Educação Ampliada no município de Vitória-ES. Trata-se de pesquisa qualitativa, cuja metodologia envolveu revisão de literatura e estudo de caso. O instrumento de pesquisa foi uma entrevista semiestruturada, por permitir explorar mais amplamente as abordagens e proporcionar aos entrevistados maior liberdade para emitir as suas opiniões. Os sujeitos da pesquisa foram os gestores responsáveis pelo desenvolvimento do Programa Educação em Tempo Integral – Educação Ampliada da Secretaria Municipal de Educação do município de Vitória (Seme) e a equipe de uma das EMEFs que compôs o grupo focal, profissionais diretamente envolvidos no exercício das práticas pedagógicas com os estudantes matriculados no Programa da Unidade de Ensino. Os resultados das análises da pesquisa foi que a Educação em Tempo Integral – Educação Ampliada é uma realidade no município de Vitória-ES, desde a sua implantação em 1989. O programa atende hoje a 3.203 estudantes. Desse total, apenas 35, ou seja, 1,9%, compõem o público-alvo da Educação Especial atendido pelo programa em foco. A análise das informações documentais, os relatos dos gestores que se revezaram desde a implantação do Peti e as entrevistas com os sujeitos desta pesquisa revelaram que a educação em tempo integral se processa no município de Vitória de forma lenta e descontínua, especialmente por ocasião do revezamento entre uma administração e outra, quando muda a gestão política.

Sensitividade e especificidade do potencial de média latência

O Potencial Evocado Auditivo de Média Latência (PEAML) foi primeiramente descrito por Geisler, Frishkopf, Rosenblith em 1958.¹ É caracterizado por uma série de ondas/respostas neuroelétricas gravadas no cérebro através de eletrodos de superfície. Atualmente, tem sido visto como um dos testes eletrofisiológicos mais promissores para a avaliação das disfunções e/ou alterações do Sistema Nervoso Auditivo Central. Suas ondas aparecem no intervalo entre 10 e 80 milissegundos (ms) após o início do estímulo auditivo. A onda Pa é a mais estudada por ser a mais visível e robusta deste potencial. Esse teste ainda é pouco utilizado na prática clínica pelo fato de existir uma grande variabilidade nos resultados encontrados intersujeitos, o que torna difícil o estabelecimento de medidas de normalidade. OBJETIVO: O objetivo desse trabalho foi estabelecer a efetividade - sensitividade e especificidade do PEAML para que este potencial possa ser mais utilizado com maior fidedignidade. FORMA DE ESTUDO: Caso-controle. MATERIAL E MÉTODO: Fizeram parte desse estudo indivíduos com idade entre 15 e 55 anos, portadores de lesões de Sistema Nervoso Auditivo Central, comprovada através de diagnóstico por imagem ou que tenham sido submetidos a cirurgias crânio-encefálicas, indivíduos portadores de Transtornos do Processamento Auditivo (TPA) comprovadas através de avaliação comportamental e indivíduos normais (Grupo Controle). RESULTADOS: Os resultados mostram que o corte de 30% apresentou melhores resultados, tanto para o efeito de eletrodo quanto para o efeito de orelha. O efeito de orelha foi mais fidedigno para evidenciar Transtornos de Processamento Auditivo, enquanto o efeito de eletrodo foi mais efetivo para evidenciar lesão.