Fine-needle aspiration cytology of Merkel cell carcinoma-A review of 69 cases

Background This study reviewed the clinical presentation, cytologic findings and the immunophenotype of 69 Merkel Cell Carcinoma (MCC) cases sampled by FNA. Methods Demographic and clinical data, the cytology findings and results of ancillary testing were reviewed. Results Median patient age was 78 years (37 – 104) with a 1:1.8 female to male ratio. The most common FNA sites sampled included lymph nodes in the neck, the axillary region, the inguinal region and the parotid gland. Most patients had a history of MCC (68%) &/or non-MCC malignancy (70%). The common cytologic pattern was a cellular smear with malignant cells arranged in a dispersed pattern with variable numbers of disorganised groups of cells. Cytoplasm was scant or absent and nuclei showed mild to moderate anisokaryosis, stippled chromatin, inconspicuous nucleoli and nuclear molding. Numerous apoptotic bodies were often present. Cell block samples (28 cases) were usually positive for cytokeratins in a perinuclear dot pattern, including 88% of cases with CK20 positivity. CD56 was the most sensitive (95%) neuroendocrine marker on cell blocks and was also positive with flow cytometry in 9 cases tested. Conclusions MCC is most commonly seen in FNA specimens from the head and neck of elderly patients, often with a history of previous skin lesions. Occasional cases present in younger patients and some may be mistaken for other round blue cell tumors, such as lymphoma. CD 56 may be a useful marker in cell block preparations and in flow cytometric analysis of MCC.

Transforming the core business of teaching and learning in classrooms through ICT

Information and Communication Technology (ICT) has become an integral part of societies across the globe. This study demonstrates how successful technology integration by 10 experienced teachers in an Australian high school was dependent on teacher-driven change and innovation that influenced the core business of teaching and learning. The teachers were subject specialists across a range of disciplines, engaging their Year Eight students (aged 12–14 years) in the Technology Rich Classrooms programme. Two classrooms were renovated to accommodate the newly acquired computer hardware. The first classroom adopted a one-to-one desktop model with all the computers with Internet access arranged in a front-facing pattern. The second classroom had computers arranged in small groups. The students also used Blackboard to access learning materials after school hours. Qualitative data were gathered from teachers mainly through structured and unstructured interviews and a range of other approaches to ascertain their perceptions of the new initiative. This investigation showed that ICT was impacting positively on the core business of teaching and learning. Through the support of the school leadership team, the built environment was enabling teachers to use ICT. This influenced their pedagogical approaches and the types of learning activities they designed and implemented. As a consequence, teachers felt that students were motivated and benefited through this experience.

Crowd Sourcing a New Paradigm for Interactome Driven Drug Target Identification in Mycobacterium tuberculosis

A decade since the availability of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) genome sequence, no promising drug has seen the light of the day. This not only indicates the challenges in discovering new drugs but also suggests a gap in our current understanding of Mtb biology. We attempt to bridge this gap by carrying out extensive re-annotation and constructing a systems level protein interaction map of Mtb with an objective of finding novel drug target candidates. Towards this, we synergized crowd sourcing and social networking methods through an initiative `Connect to Decode' (C2D) to generate the first and largest manually curated interactome of Mtb termed `3interactome pathway' (IPW), encompassing a total of 1434 proteins connected through 2575 functional relationships. Interactions leading to gene regulation, signal transduction, metabolism, structural complex formation have been catalogued. In the process, we have functionally annotated 87% of the Mtb genome in context of gene products. We further combine IPW with STRING based network to report central proteins, which may be assessed as potential drug targets for development of drugs with least possible side effects. The fact that five of the 17 predicted drug targets are already experimentally validated either genetically or biochemically lends credence to our unique approach.

The mouse and human IGSF6 (DORA) genes map to the inflammatory bowel disease 1 locus and are embedded in an intron of a gene of unknown function.

We have previously characterized IGSF6 (DORA), a novel member of the immunoglobulin superfamily (IGSF) from human and rat expressed in dendritic and myeloid cells. Using a probe from the open reading frame of the rat cDNA, we isolated a cosmid which contains the entire mouse gene. By comparative analysis and reverse transcriptase polymerase chain reaction, we defined the intron/exon structure and the mRNA of the mouse gene and, with respect to human BAC clones, the human gene. The genes span 10 kb (mouse) and 12 kb (human), with six exons arranged in a manner similar to other members of the IGSF. All intron/exon boundaries follow the GT-AG rule. Expression of the mouse Igsf6 gene is restricted to cells of the immune system, particularly macrophages. Northern blot revealed a single mRNA of 2.5 kb, in contrast to the human gene which is expressed as two mRNAs of 1 and 2.5 kb. The human and mouse genes were localized to a locus associated with inflammatory bowel disease. Analysis of the flanking regions of the Igsf6 gene revealed the presence of an unrelated gene, transcribed from the opposite strand of the DNA and oriented such that the Igsf6 gene is encoded entirely within an intron. An identical organization is seen in human. This gene of unknown function is transcribed and processed, contains homologues in Caenorhabditis elegans and prokaryotes, and is expressed in most organs in the mouse.

Salivary proteomics and peptidomics of type 1 diabetes Mellitus

A Diabetes Mellitus (DM) compreende um conjunto de desordens metabólicas comuns caracterizadas por hiperglicemia, que afeta diferentes órgãos do organismo. Ao longo do tempo, ocorrem danos microvasculares no glomérulo renal, retina e nervos periféricos, bem como doença macrovascular nas artérias. A composição da saliva também é afetada pela DM, com consequências na homeostasia oral. No entanto, o proteoma e o peptidoma salivar têm sido pouco explorados na DM tipo 1 e nas suas complicações crónicas. Tendo em conta o crescente interesse na saliva como fluido diagnóstico, o objetivo principal deste trabalho foi avaliar os eventos proteolíticos subjacentes à DM tipo 1 e às suas complicações microvasculares, bem como, caracterizar as alterações induzidas pela DM tipo 1 no proteoma e peptidoma salivar. A DM tipo 1 e particularmente as complicações microvasculares associadas modulam o perfil proteolítico dos fluidos biológicos, com diferenças significativas de atividade observadas na urina e saliva, atribuídas principalmente ao complexo Metaloproteinase da Matriz (MMP)-9/lipocalina associada à gelatinase de neutrófilos, aminopeptidase N, azurocidina e calicreína 1. O aumento da atividade proteolítica observado na saliva total dos diabéticos resultou no aumento da percentagem de péptidos, principalmente de um número acrescido de fragmentos de colagénio do tipo I, refletindo possivelmente um estado inflamatório crónico dos tecidos orais e periodontais. O peptidoma também corrobora uma maior suscetibilidade das proteínas salivares, especificamente, das proteínas ricas em prolina básicas (bPRP) 1, bPRP2 e proteínas ricas em prolina ácidas (aPRP) à proteólise, evidenciando a geração de fragmentos de proteínas associadas à ligação a bactérias. A análise do proteoma salivar baseada em iTRAQ mostrou uma sobre-expressão de L-plastina, fator do adenocarcinoma do pâncreas e das proteínas S100-A8 e S100-A9, enfatizando a importância do sistema imune inato na patogénese da DM tipo 1 e das complicações microvasculares associadas. A análise integrada de todas as proteínas expressas diferencialmente entre os pacientes diabéticos com ou sem complicações microvasculares e indivíduos saudáveis foi realizada com o STRING, onde se observam três conjuntos funcionalmente ligados, um compreende a interação entre o colagénio tipo I, colagénio tipo II e MMP-9, um segundo conjunto envolve a MMP-2 e o colagénio de tipo I e um terceiro conjunto composto por proteínas salivares e inflamatórias. Estes conjuntos estão associados com as vias Kegg de interação recetor-matriz extracelular, de adesão focal e migração transendotelial dos leucócitos. Por outro lado, a análise do proteoma e peptidoma salivar destacou potenciais biomarcadores para o diagnóstico e prognóstico da DM tipo 1 e das suas complicações.

Spatial relational learning and memory abilities do not differ between men and women in a real-world, open-field environment

This study assesses gender differences in spatial and non-spatial relational learning and memory in adult humans behaving freely in a real-world, open-field environment. In Experiment 1, we tested the use of proximal landmarks as conditional cues allowing subjects to predict the location of rewards hidden in one of two sets of three distinct locations. Subjects were tested in two different conditions: (1) when local visual cues marked the potentially-rewarded locations, and (2) when no local visual cues marked the potentially-rewarded locations. We found that only 17 of 20 adults (8 males, 9 females) used the proximal landmarks to predict the locations of the rewards. Although females exhibited higher exploratory behavior at the beginning of testing, males and females discriminated the potentially-rewarded locations similarly when local visual cues were present. Interestingly, when the spatial and local information conflicted in predicting the reward locations, males considered both spatial and local information, whereas females ignored the spatial information. However, in the absence of local visual cues females discriminated the potentially-rewarded locations as well as males. In Experiment 2, subjects (9 males, 9 females) were tested with three asymmetrically-arranged rewarded locations, which were marked by local cues on alternate trials. Again, females discriminated the rewarded locations as well as males in the presence or absence of local cues. In sum, although particular aspects of task performance might differ between genders, we found no evidence that women have poorer allocentric spatial relational learning and memory abilities than men in a real-world, open-field environment.

Comunidade infestante e sua interferência no feijoeiro implantado sob plantio direto, na safra de primavera

O objetivo deste estudo foi determinar os períodos críticos de interferência das plantas daninhas no feijoeiro no sistema de plantio direto, na safra de primavera. A cultura antecessora ao feijoeiro foi a de milheto, que gerou 2 t ha-1 de massa seca. Os tratamentos foram constituídos por períodos crescentes (0, 10, 17, 24, 31, 45 e 66 dias após a emergência) de convivência ou de controle das plantas daninhas. O delineamento experimental adotado foi o de blocos ao acaso, com os tratamentos dispostos no esquema fatorial 2 x 6, com quatro repetições, mais duas testemunhas: uma limpa durante todo o ciclo da cultura e outra suja, ausente de controle. A comunidade infestante foi composta por 16 espécies, sendo dez eudicotiledôneas. A espécie de maior importância foi a losna-branca (Parthenium hysterophorus). O período anterior à interferência (PAI) ocorreu até o estádio fenológico V2, e o período total de prevenção à interferência (PTPI), até o estádio V4; assim, o período crítico de prevenção à interferência (PCPI) ficou entre os estádios V2 e V4 do feijoeiro. A safra de primavera mostrou-se alternativa viável de produção. O acúmulo médio de massa e o número médio de indivíduos das plantas daninhas foram pequenos, ocasionando menor interferência na cultura e, consequentemente, um curto PCPI. Houve redução de 19% na produtividade média do feijoeiro quando a cultura conviveu durante todo o seu ciclo com a comunidade infestante.

Aspectos germinativos de capim-camalote (Rottboellia cochinchinensis)

O capim-camalote (Rottboellia cochinchinensis), originário da Índia, é encontrado em várias regiões do mundo, sendo uma espécie temida pelos agricultores devido ao seu difícil controle e avanço crescente. Objetivou-se com este trabalho estudar os fatores que afetam a germinação das sementes dessa espécie. Foram avaliados os métodos de superação de dormência: 1 - escarificação mecânica, 2 - escarificação química, 3 - tratamento pré-semeadura, 4 - tratamento químico, 5 - tratamento hormonal e 6 - sementes não tratadas. Foram estudados os efeitos da temperatura (5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 e 40 ºC), do fotoperíodo (6, 8, 10, 12, 14 e 16 horas de luz), da qualidade da luz incidente (branca, vermelha, vermelha distante, amarela, verde, azul e ausência de luz), da disponibilidade de água (0,0, -0,2, -0,3, -0,4, -0,5, -0,6, -1,2 e -2,4 MPa) e da viabilidade de suas sementes quando armazenadas sob condições de câmara fria e seca e sob condições naturais. Todos os ensaios foram conduzidos por 30 dias em câmara de germinação, com os tratamentos arranjados em delineamento experimental inteiramente casualizado, em quatro repetições. Verificou-se que as sementes apresentaram elevado índice de germinação, praticamente não apresentaram dormência e não se mostraram fotoblásticas. A disponibilidade de água foi indispensável para a germinação, com temperatura ideal de 25 °C. As sementes recém-coletadas são inviáveis para o estudo da germinação, apresentando redução na germinação quando armazenadas sob condição de câmara fria e seca.

Consórcios de alface crespa e pepino em função da população do pepino e época de cultivo

With the aim of evaluating the yields of cucumber and lettuce for two cucumber population densities. inter-cropped with lettuce Under protected environment, and for two growing seasons, one from August to November 2005 and the other from February to May 2006. four experiments were conducted at UNESP Jaboticabal, SP Brazil The experimental design in each case was of randomized complete blocks with the treatments arranged in 2x4+1 factorial scheme and with four replications, where the first factor was given by two cropping systems (intercropping and individual crop), the second one for four transplanting dates for lettuce in relation to cucumber (0, 10, 20 and 30 days), and an additional treatment of the sole cucumber crop Total yield. commercial and misshapen cucumber fruits were not affected by the presence of lettuce. The growing season influenced the commercial yield of cucumber which is greater from February to May. The yield of lettuce was affected by the date of transplantation (establishment of the inter-cropping), with further reduction as the transplantation of lettuce was delayed in relation to that of cucumber Lettuce grown in intercropping with cucumber in the second growing season did not have commercial quality, due to the deep shade provided by the cucumber

ADUBAÇÃO FOSFATADA E ÉPOCAS DE COLHEITA do AMENDOIM: EFEITOS NA PRODUÇÃO DE ÓLEO E DE PROTEÍNA

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Temperatura e período de exposição de sementes de milho no teste de envelhecimento acelerado

O teste de envelhecimento acelerado (EA) apresenta possibilidades de uso nos programas de controle de qualidade de sementes de milho. Porém, para uso em rotina, há necessidade de padronização das condições de temperatura e período de exposição das sementes na realização do teste. Esta pesquisa teve por objetivo avaliar o efeito da combinação de duas temperaturas (42 e 45ºC) e dois períodos de envelhecimento (72 e 96h) nos resultados do teste de envelhecimento acelerado em sementes de milho. Para isso, sementes de seis genótipos de milho, tratadas e sem tratamento fungicida, com altos valores de germinação inicial, semelhantes entre si, dentro de cada genótipo, foram submetidas ao EA, de acordo com condições de temperatura e período de exposição pré-estabelecidos. Utilizou-se o delineamento experimental inteiramente casualizado com os tratamentos (lotes x germinação, antes e após o EA) dispostos em esquema fatorial, empregando-se o teste de Tukey a 5% de probabilidade na comparação das médias. Verificou-se que sementes de milho apresentam diferenças de sensibilidade ao envelhecimento acelerado, condicionadas pelo genótipo e tratamento fungicida. Contudo, a combinação 45ºC por 72h possibilita separar lotes de qualidade fisiológica superior e inferior, independentemente do genótipo. O período de exposição das sementes ao envelhecimento acelerado determina o teor de água atingido pelas mesmas.

Evaluation of corn cultivars harvested at two cutting heights for ensilage

Objetivou-se neste estudo avaliar as características agronômicas, a composição químico-bromatológica e a digestibilidade de 11 cultivares de milho (Zea mays) colhido em duas alturas de corte. As cultivares D 766, D 657, D 1000, P 3021, P 3041, C 805, C 333, AG 5011, FO 01, CO 9621 e BR 205 foram avaliadas quando colhidas 5 cm acima do solo (baixa) e 5 cm abaixo da inserção da primeira espiga (alta). O experimento foi delineado como blocos casualizados, com três repetições, arranjados em esquema fatorial 11 x 2. Os cultivares apresentaram produções semelhantes de matéria seca de forragem e de grãos. As porcentagens das frações colmo, folha, palha, sabugo e grão diferiram entre os cultivares, assim como os teores de matéria seca da planta inteira no momento da colheita. Considerando a planta inteira, apenas os teores de energia bruta, nitrogênio da fração fibra em detergente neutro e a digestibilidade in vitro da fibra em detergente neutro e detergente ácido não diferiram entre os cultivares. O aumento da altura de corte melhorou a qualidade da forragem, devido à redução das frações colmo e folha e dos teores dos constituintes da parede celular.

Crescimento aéreo e radicular de arroz de terras altas em função da adubação fosfatada e bioestimulante

The use of plant regulators that stimulate root growth can increase phosphorus uptake by upland rice. The objective of this study was to evaluate shoot and root growth of upland rice fertilized with different phosphorus doses with and without biostimulant. The experiment was carried out in greenhouse in the Faculdade de Ciencias Agronomicas-UNESP, in Botucatu-SP. The treatments consisted of six phosphorus doses applied in sowing (0, 12,5, 25, 50, 100 and 200 mg dm(-3)), with and without Stimulate (R) applied in the seeds (cv. Primavera). The plants were grown for 78 days and then cut at soil level to evaluate leaf area and leaves and collar dry matter. Root samples that were harvested on the same day had their root diameter and dry matter evaluated. The experimental design was the completely randomized, with three replications, arranged as a factorial 2x6. Variance analysis and regression were used to data evaluation. Linear and quadratic equations were adjusted at a probability level of 5%, using those with higher determination coefficient (R(2)). The increase on the phosphorus dose contributed to the lower matter production and leaf area of the plants when the biostimulant was applied. For shoot phosphorus accumulation and root evaluations, the same behavior was observed. It was concluded that the use of Stimulate (R) in seeds, for fitomass production or root system evaluation, was only efficient in low phosphorus doses.

Efeito da chuva na eficiência de herbicidas aplicados em pós-emergência sobre corda-de-viola

O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da chuva na eficiência de herbicidas aplicados em pós-emergência em plantas de Ipomoea grandifolia. As plantas de I. grandifolia foram cultivadas em vasos plásticos com capacidade de 2,5 L, em casa de vegetação, com uma planta por vaso. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, com quatro repetições, com os tratamentos dispostos em um esquema fatorial 7x8 (sete tratamentos químicos e oito períodos para ocorrência de chuva após a aplicação dos tratamentos). Os tratamentos químicos constaram da aplicação de glyphosate em cinco formulações comerciais (Roundup Original, Roundup WG, Roundup Transorb, Roundup Transorb R e Roundup Ultra) a 1.080 g e.a. ha-1, amônio-glufosinate (Finale) a 400 g i.a. ha-1 e 2,4-D (DMA 806) a 1.000 g e.a. ha-1 e de oito intervalos de tempo para simulação de uma chuva de 15 mm, com duração de cinco minutos: 15', 30', 1h, 2h, 4h, 6h, 8h após a aplicação dos tratamentos e uma testemunha sem chuva, Foram realizadas avaliações visuais de controle das plantas aos 7, 14, 21, 28 e 35 dias após a aplicação e, por ocasião da última avaliação, determinou-se a massa seca das plantas. A ocorrência de chuvas após a aplicação de 2,4-D não alterou a sua eficiência no controle das plantas de I. grandifolia; já os herbicidas amônio-glufosinate e glyphosate, em todas suas formulações testadas, apresentaram redução na eficiência de controle quando da ocorrência de chuvas em até oito horas após a aplicação dos tratamentos.

Qualidade fisiológica de sementes de leiteiro (Peschiera fuchsiaefolia) em função do estádio de maturação dos frutos

O leiteiro (Peschiera fuchsiaefolia) é uma infestante de pastagens de importância para as regiões Sudeste e Centro-Oeste do Brasil, cuja dispersão ocorre por sementes. Com o objetivo de avaliar a qualidade fisiológica das sementes de leiteiro, em função do estádio de maturação e armazenamento dos frutos, foram colhidos frutos em cinco regiões diferentes, constituindo cinco acessos: lote 1-Vitoriana/SP, lote 2-Botucatu/SP, lote 3Bauru/SP, lote 4-São Manuel/SP e lote 5-São Pedro/SP. Cada lote de sementes foi avaliado individualmente, seguindo-se o delineamento estatístico inteiramente casualizado, com os tratamentos dispostos em esquema fatorial 2x4, sendo dois períodos de armazenamento dos frutos (0 e 7 dias após colheita) e quatro estádios de maturação (verde-oliva, verde-limão, alaranjado-fechado e alaranjado-aberto). A polpa dos frutos foi retirada e as sementes extraídas mediante fricção em peneira sob água corrente. As sementes foram colocadas para germinar a 30 ºC com 8 h de luz, sendo as contagens realizadas semanalmente até os 42 dias do início do teste. Os resultados dos testes da primeira contagem de germinação, IVG e condutividade elétrica mostraram que o vigor das sementes foi superior em frutos colhidos nos estádios finais de maturação e que, de modo geral, o armazenamento dos frutos prejudicou a qualidade das sementes.