MHC class II binding prediction by molecular docking

Proteins of the Major Histocompatibility Complex (MHC) bind self and nonself peptide antigens or epitopes within the cell and present them at the cell surface for recognition by T cells. All T-cell epitopes are MHC binders but not all MCH binders are T-cell epitopes. The MHC class II proteins are extremely polymorphic. Polymorphic residues cluster in the peptide-binding region and largely determine the MHC's peptide selectivity. The peptide binding site on MHC class II proteins consist of five binding pockets. Using molecular docking, we have modelled the interactions between peptide and MHC class II proteins from locus DRB1. A combinatorial peptide library was generated by mutation of residues at peptide positions which correspond to binding pockets (so called anchor positions). The binding affinities were assessed using different scoring functions. The normalized scoring functions for each amino acid at each anchor position were used to construct quantitative matrices (QM) for MHC class II binding prediction. Models were validated by external test sets comprising 4540 known binders. Eighty percent of the known binders are identified in the best predicted 15% of all overlapping peptides, originating from one protein. © 2011 Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim.

Major Histocompatibility Complex (MHC) Class II sequence polymorphism in long-finned pilot whale (Globicephala melas) from the North Atlantic

Funding Silvia S. Monteiro and Marisa Ferreira were supported by a Ph.D. grant from Fundação para a Ciência e Tecnologia (ref SFRH/BD/38735/2007 and SFRH/BD/30240/2006, respectively). Alfredo López was supported by a postdoctoral grant from Fundação para a Ciência e Tecnologia (ref SFRH/BPD/82407/2011). Catarina Eira is supported by CESAM (UID/AMB/50017), from FCT/MEC through national funds and FEDER (PT2020, Compete 2020). The work related with strandings and tissue collection in Portugal was partially supported by the SafeSea Project EEAGrants PT 0039 (supported by Iceland, Liechtenstein and Norway through the EEA Financial Mechanism), by the Project MarPro–Life09 NAT/PT/000038 (funded by the European Union–Program Life+) and by the project CetSenti FCT RECI/AAG-GLO/0470/2012; FCOMP-01-0124-FEDER-027472 (Funded by the Program COMPETE and Fundação para a Ciência e Tecnologia).

Two years survival rate of Class II ART restorations in primary molars using two ways to avoid saliva contamination

AIM To compare the survival rates of Class II Atraumatic Restorative Treatment (ART) restorations placed in primary molars using cotton rolls or rubber dam as isolation methods. METHODS A total of 232 children, 6-7 years old, both genders, were selected having one primary molar with proximal dentine lesion. The children were randomly assigned into two groups: control group with Class II ART restoration made using cotton rolls and experimental group using rubber dam. The restorations were evaluated by eight calibrated evaluators (Kappa > 0.8) after 6, 12, 18 and 24 months. RESULTS A total of 48 (20.7%) children were considered dropout, after 24 months. The cumulative survival rate after 6, 12, 18 and 24 months was 61.4%, 39.0%, 29.1% and 18.0%, respectively for the control group, and 64.1%, 55.1%, 40.1% and 32.1%, respectively for the rubber dam group. The log rank test for censored data showed no statistical significant difference between the groups (P = 0.07). The univariate Cox Regression showed no statistical significant difference after adjusting for independent variables (P > 0.05). CONCLUSION Both groups had similar survival rates, and after 2 years, the use of rubber dam does not increase the success of Class II ART restorations significantly.

Impacto das etapas do tratamento orto-cirúrgico na qualidade de vida de pacientes portadores de deformidades dentofaciais

Pacientes portadores de deformidades dentofaciais podem relatar dificuldades de mastigação e fala, desordens temporomandibulares, preocupação com a imagem corporal e baixa autoestima. Frequentemente, buscam tratamento orto-cirúrgico pela motivação de obter melhora notável nos aspectos estético, funcional e psicossocial. A evidência atualmente disponível sobre os benefícios na qualidade de vida relacionada à saúde bucal desta modalidade terapêutica ainda não é conclusiva, devido à diversidade de metodologias adotadas entre os estudos existentes, majoritariamente realizados na América do Norte, Europa, Oriente Médio e Ásia. Logo, é essencial utilizar instrumentos específicos para avaliar os efeitos desta modalidade de tratamento também na vida diária dos pacientes brasileiros. O propósito do presente estudo transversal foi determinar o impacto que o tratamento orto-cirúrgico exerce sobre a percepção de qualidade de vida dos pacientes portadores de deformidades dentofaciais, bem como a influência exercida pelo gênero, idade, renda, escolaridade e características da má oclusão, nas quatro etapas inerentes a esta modalidade de tratamento: (1) Inicial; (2) Preparo ortodôntico para a cirurgia; (3) Pós-cirúrgico; e (4) Contenção (pós-tratamento). Duzentos e cinquenta e quatro pacientes foram entrevistados em três importantes centros de atendimento na cidade do Rio de Janeiro. A qualidade de vida foi avaliada pelos questionários OHIP-14 (Oral Health Impact Profile - Short Version) e pelo OQLQ (Orthognathic Quality of Life Questionnaire) em suas versões traduzidas e validadas para o português. A gravidade da má oclusão e autopercepção estética foram avaliadas com base no Índice de Necessidade de Tratamento Ortodôntico (IOTN) e pelo Índice de Estética Dental (DAI). A análise dos dados foi efetuada pelos testes qui-quadrado, Kruskal-Wallis e modelos de regressão binomial negativa múltipla. Os pacientes dos quatro grupos foram semelhantes em relação ao gênero (p = 0,463), escolaridade (p = 0,276) e renda familiar (p = 0,100). Entre os entrevistados houve o predomínio de mulheres, com ensino médio completo e renda familiar entre 2 e 3 salários mínimos, portadores de má oclusão de Classe III de Angle grave. No modelo de regressão binomial negativa ajustado para os fatores gênero, idade, renda familiar e escolaridade, a qualidade de vida aferida pelo OHIP-14 demonstrou que o grupo Inicial sofreu impactos mais negativos do que os grupos Pós-cirúrgico, Preparo e Contenção; o OQLQ indicou que o grupo Inicial sofreu impactos mais negativos do que os grupos Preparo, Pós-cirúrgico e Contenção, nesta sequência. Não foi detectada influência da idade, renda e escolaridade nestes resultados. Foi observado que o gênero feminino sofreu mais impacto negativo na qualidade de vida, principalmente nas dimensões relativas à função e a aspectos sociais. Concluiu-se que os pacientes que finalizaram o tratamento orto-cirúrgico apresentaram como benefícios menores impactos na qualidade de vida específica e relacionada à saúde bucal, melhor autopercepção estética e menor gravidade da má oclusão, em comparação aos pacientes nas etapas pré e pós-cirúrgica e aos pacientes portadores de deformidades dentofaciais em busca de tratamento.

Distalização dos molares superiores com aparelho Pendex: estudo em modelos de gesso

OBJETIVO: a presente pesquisa clínica, longitudinal e prospectiva, avaliou os efeitos do aparelho Pendex mediante o emprego de modelos de gesso. METODOLOGIA: utilizou-se uma amostra de 30 modelos de gesso, obtidos no início e no final da distalização dos molares superiores com o aparelho Pendex, de 15 jovens brasileiros tratados no Curso de Pós-Graduação, nível de Mestrado em Ortodontia, da Faculdade de Odontologia de Araçatuba - UNESP. RESULTADOS E CONCLUSÕES: os resultados mostraram aumento do perímetro do arco dentário superior com inclinação distal e controle transversal dos primeiros molares superiores.

Distalização dos molares superiores com aparelho Pendex: estudo cefalométrico prospectivo

A distalização dos molares superiores constitui um desafio na correção da má oclusão de Classe II em tratamentos sem extrações dentárias e sem avanço mandibular. Há uma procura por dispositivos que substituam a tração extrabucal (AEB) e que não exijam demasiada colaboração do paciente, o que estimula os ortodontistas a testarem métodos alternativos aos relatados na literatura. Dentre estes, destacam-se os aparelhos Pêndulo e Pendex de Hilgers. OBJETIVO: a realização desta pesquisa teve o intuito de avaliar, mediante a cefalometria, os efeitos do aparelho Pendex aplicado no final da dentadura mista e na dentadura permanente. METODOLOGIA: a amostra constou de 14 pacientes com má oclusão de Classe II bilateral, com média de idade de 11 anos e 3 meses. Foram tomadas duas telerradiografias em norma lateral, uma correspondente ao início do tratamento e outra aproximadamente 5 meses após sua finalização, quando a relação dos molares encontrava-se sobrecorrigida. RESULTADOS: após a determinação e mensuração das grandezas cefalométricas lineares e angulares e análise estatística (Teste t de Student), pode-se concluir que os efeitos do aparelho Pendex foram predominantemente ortodônticos: distalização da coroa dos primeiros molares permanentes numa velocidade média de 0,8 mm/mês e vestibularização dos incisivos superiores com aumento do trespasse horizontal. CONCLUSÃO: assim sendo, quando há indicação para distalização dos molares, cumpre-se fazer uma análise dos fatores envolvidos, a fim de eleger, com prudência, a solução terapêutica mais adequada às exigências individuais e profissionais.

Distalização dos molares superiores com aparelho Pendex unilateral: estudo piloto com radiografia panorâmica

OBJETIVO: o presente ensaio científico põe em pauta o efeito imediato da distalização unilateral de molares superiores, lançando mão do distalizador intrabucal Pendex de ação unilateral. METODOLOGIA: o estudo prospectivo foi conduzido em três pacientes na dentadura permanente madura, no estágio de adolescência, que apresentavam uma má oclusão Classe II, subdivisão. O aparelho Pendex foi instalado com a mola distalizadora de TMA, construída apenas no lado direito. A metodologia baseou-se nas radiografias panorâmicas inicial e pós-distalização para quantificar a inclinação axial mesiodistal dos molares superiores. RESULTADOS E CONCLUSÕES: os resultados mostraram que os molares do lado esquerdo mantiveram sua inclinação mesiodistal inicial, sugerindo ancoragem, enquanto os molares do lado direito foram inclinados para distal, à semelhança do que ocorre com a distalização simétrica dos molares superiores, obtida com o aparelho Pendex convencional. Os primeiros molares foram inclinados 11,5º, enquanto os segundos molares foram inclinados 21º para distal.

Os efeitos dos aparelhos funcionais sobre a dimensão transversal da maxila e mandíbula

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Influence of the banded Herbst appliance on dental changes in mixed dentition

OBJECTIVE: This prospective clinical study was conducted with the purpose of evaluating the influence of the banded Herbst appliance on dental changes during the early treatment of Class II malocclusion. METHOD: The sample consisted of 15 prepubertal subjects (12 boys and 3 girls, initial age: 9 years and 6 months) who were treated with the Herbst appliance. Treatment effects were compared with those of a Class II Division 1 group of 15 subjects (8 boys and 7 girls, mean initial age 9 years and 1 month), not treated orthodontically. Statistical analysis was performed using Student t-test with 5% significance level. RESULTS: The results showed that treatment with the banded Herbst appliance in the mixed dentition stage tended to upright maxillary incisors (mean: 4.14°). The maxillary molars were distalized and intruded significantly (mean 2.65 mm and 1.24 mm, respectively), the lower incisors slightly protruded anteriorly (mean 1.64 mm) and the molars showed no significant changes in the horizontal and vertical directions. Furthermore, significant improvements were noted in overbite (1.26 mm), overjet (4.8 mm) and molar relationship (12.08 mm). CONCLUSIONS: Changes in the upper dental arch were found to be greater than changes in the lower arch. Furthermore, mandibular anchorage loss was reduced due to the anchorage system used in the study.

Cephalometric evaluation of skeletal alterations induced by Herbst appliance during mixed dentition

OBJECTIVE: The present prospective clinical study was designed in order to evaluate horizontal and vertical skeletal alterations induced by the use of Herbst appliance in individuals with Class II, division 1 malocclusion during mixed dentition stage. METHODS: The sampling consisted of 15 pre-pubertal individuals (12 boys and 3 girls; initial age 9 years and 6 months), who were treated with Herbst appliance for a period of 7 months. The effects of the treatment were compared to a group of 15 individuals with Class II, division 1 malocclusion (8 boys and 7 girls, initial age averaged 9 years and 1 month), orthodontically untreated, who were followed up for a period of 12 months. Statistical analysis was performed with Student's t-test with significance level at 5%. RESULTS: It was showed that the treatment with Herbst appliance in mixed dentition stage has restricted maxilla growth. Mandibular and palatal planes have not undergone significant alteration; however, anterior and posterior facial heights have increased significantly. Facial convexity and maxillomandibular relationship were altered positively. Mandible has positioned significantly forward and its effective length increased 2.5 times more than the increase observed in control group. CONCLUSION: It was possible to conclude that Herbst appliance was able to provide satisfactory results in individuals during mixed dentition stage.

Long-term effectiveness and treatment timing for bionator therapy

The aim of the present investigation was to provide information about the long-term effects and optimal timing for class-II treatment with the Bionator appliance. Lateral cephalograms of 23 class-II patients treated with the Bionator were analyzed at three time periods: T1, start of treatment; T2, end of Bionator therapy; and T3, long-term observation (after completion of growth). T3 includes a phase with fixed appliances. The treated sample was divided into two groups according to their skeletal maturity as evaluated by the cervical vertebral maturation (CVM) method. The early-treated group (13 subjects) initiated treatment before the peak in mandibular growth, which occurred after completion of Bionator therapy. The late-treated group (10 subjects) received Bionator treatment during the peak. The T1-T2, T2-T3, and T1-T3 changes in the treated groups were compared with changes in control groups of untreated class-II subjects by nonparametric statistics (P < .05). The findings of the present study on Bionator therapy followed by fixed appliances indicate that this treatment protocol is more effective and stable when it is performed during the pubertal growth spurt. Optimal timing to start treatment with the Bionator is when a concavity appears at the lower borders of the second and the third cervical vertebrae (CVMS 11). In the long term, the amount of significant supplementary elongation of the mandible in subjects treated during the pubertal peak is 5.1 mm more than in the controls, and it is associated with a backward direction of condylar growth. Significant increments in mandibular ramus height also were recorded.

Lower intercanine width and gingival margin changes. A retrospective study.

OBJECTIVE: To determine if changes in the lower intercanine widths during orthodontic treatment with fixed appliances result in gingival margin changes around the lower canines and incisors. METHOD: Pre- and post-treatment intra-oral photographs and orthodontic study models of 178 Caucasian adolescents (101 female, 77 male) were used. All subjects were treated with fixed appliances. The subjects had mean ages of 11.41 (SD: 1.83) years and 14.91 (SD: 1.78) years on their initial and final records respectively. The latter were taken 28 days or more after the appliances had been removed. The inclusion criteria were: Angle Class I or Class II malocclusion (with or without transverse and/or vertical discrepancies); nonextraction treatment; less than 4 mm crowding or spacing; fully erupted lower incisors and good periodontal health. The intercanine widths and the positions of the gingival margins relative to the maximum curvatures of the labial surfaces of the lower canines and incisors were measured with digital calipers. RESULTS: A significant association was found between unaltered intercanine widths and coronal migration of the gingival margins (p = 0.045). There were no significant associations between either increased or reduced intercanine widths and changes in the gingival margins. CONCLUSIONS: Following orthodontic treatment coronal migration of the gingival margins around the lower incisors and canines is more likely to be associated with an unaltered intercanine width.

Changes on facial profile in the mixed dentition, from natural growth and induced by Balters' bionator appliance

Objective: The purpose of this study was to evaluate the facial profile changes induced by Balters' bionator appliance in Class II division 1 patients, at mixed dentition stage. Methods: The sample consisted of 28 prepubertal individuals at stages 1 and 2 of skeletal maturation (CVM), which were divided in two groups. The experimental group consisted of 14 individuals (7 boys and 7 girls, initial mean age of 8y12m) which were treated with Balters' bionator appliance for 14.7 months. The effects of treatment were compared to a control group of 14 subjects (7 boys and 7 girls, initial mean age of 8y5m) with Class II malocclusion, division 1, not orthodontically treated, which were followed up for 15.4 months. The statistical analysis was performed using Student's t test, at a significance level of 5%. Results: The results showed that the Balters' bionator appliance promoted a significant increase on the mentolabial angle, in addition to demonstrating a tendency to reduce the facial skeletal convexity, to restrict the maxillary growth and to increase the nasolabial angle and the lower anterior facial height. Conclusion: It can be concluded that the Balters' bionator appliance improved the facial profile of children treated at mixed dentition stage. © 2013 Dental Press Journal of Orthodontics.

Alterações tridimensionais dos arcos dentários de pacientes submetidos à cirurgia ortognática

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Estudo epidemiológico de ocorrência da má oclusão na dentição decídua de crianças da rede pública e privada do município de Belém-Pará

A literatura evidencia que a má oclusão pode se manifestar desde os estágios mais precoces do desenvolvimento oclusal, e, na maioria dos tipos morfológicos, não apresenta auto-correção nos estágios posteriores do desenvolvimento oclusal. Para que políticas públicas possam ser adotadas no sentido de incluir a ortodontia preventiva e interceptativa nos programa de saúde bucal, visando beneficiar principalmente a parte da população menos favorecida, este trabalho teve como objetivo avaliar a prevalência da má oclusão na dentição decídua na cidade de Belém-PA, examinando crianças de escolas públicas e privadas, verificando a influência do nível sócio-econômico na manifestação da má oclusão. Para tanto, foram examinadas 652 crianças, de ambos os sexos, de 3 a 6 anos de idade, na fase de dentição decídua completa, matriculadas em préescolas da rede privada e da rede pública do ensino de Belém- Pará. Foi observada uma prevalência de 81,44% de má oclusão, sendo mais frequente nas crianças do gênero feminino da rede privada (p=0.01). A má- oclusão de Classe II foi mais prevalente, seguida da Classe I e da Classe III. Dentre os diferentes tipos morfológicos de má oclusão, a sobremordida e a mordida cruzada posterior foram mais prevalentes nas crianças da rede privada, em ambos os gêneros, enquanto o trespasse horizontal aumentado e a classe II, apresentaram uma maior ocorrência nas crianças da rede privada no gênero feminino. A má oclusão de Classe I e III foram mais freqüentes nas crianças do gênero feminino na rede pública. A mordida aberta anterior e a mordida cruzada anterior, mostraram comportamento semelhante nos dois grupos de escola, em ambos os gêneros. A perda precoce de dentes decíduos foi mais prevalente (p=0.000) nas crianças da rede pública em ambos os gêneros. Assim, pode-se concluir que a ocorrência da má oclusão na dentição decídua na cidade de Belém é muito alta; que o nível sócio-econômico exerce influência sobre a manifestação das más oclusões, pois essas foram mais freqüente nas crianças da rede privada do gênero feminino e que a ocorrência da perda precoce de dentes decíduos nas crianças da rede pública ainda apresenta um índice alarmante, decorrente provavelmente de uma política de saúde pública ineficiente, que atue em nível preventivo e interceptativo.