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Efficacité des analyses de Gumbel pour déterminer les précipitations journalières extrêmes en Suisse
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Les précipitations journalières extrêmes centennales ont été estimées à partir d'analyses de Gumbel effectuées sur des séries de mesures pluviométriques à 151 endroits en Suisse pour 4 périodes de 30 ans différentes. Ces estimations ont été comparées avec les valeurs journalières maximales mesurées durant les 100 dernières années (1911-2010) afin de tester l'efficacité de ces analyses. Cette comparaison révèle que ces dernières aboutissent à de bons résultats pour 50 à 60% des stations de ce pays à partir des séries de mesures pluviométriques de 1961-1990 et de 1981-2010. Par contre, les précipitations journalières centennales estimées à partir des séries de mesures de 1931-1960 et surtout de 1911-1940 sont sous-estimées pour la plupart des stations. Cette sous-estimation résulte de l'augmentation des précipitations journalières maximales mesurées de 1911 à 2010 pour 90% des stations en Suisse.
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Stomach contents of Simulium perflavum Roubaud larvae were analyzed and compared with plankton and periphyton collected in five streams, in Central Amazonia (Manaus and Presidente Figueiredo counties), in Sep./Oct.1996 (dry season) and Feb./Mar. 1997 (rainy season). A total of 1,400 last-instar larvae were dissected; the stomach contents were analyzed using different methods: fresh and after oxidation. A total of 87 taxa (algae, diatoms and rotifers) were found in the stomach contents. In each stream, qualitative samples of plankton and periphyton were collected; these were mounted between slides and cover slips. A total of 94 taxa of plankton and 54 taxa of periphyton were collected. One species of Rotifera was present in the stomach contents, plankton and periphyton. Cluster analysis based on species composition of the organisms present in the stomach contents grouped the streams into two major groups, each belonging to a different drainage area. Correlations based on presence/absence of species of microalgae in the stomach contents, plankton and periphyton indicated significant associations (p<0.05) between stomach contents and plankton and between plankton and periphyton (z test); the Sorensen coefficient and cluster analysis corroborate the same associations.
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Despite the central role of quantitative PCR (qPCR) in the quantification of mRNA transcripts, most analyses of qPCR data are still delegated to the software that comes with the qPCR apparatus. This is especially true for the handling of the fluorescence baseline. This article shows that baseline estimation errors are directly reflected in the observed PCR efficiency values and are thus propagated exponentially in the estimated starting concentrations as well as 'fold-difference' results. Because of the unknown origin and kinetics of the baseline fluorescence, the fluorescence values monitored in the initial cycles of the PCR reaction cannot be used to estimate a useful baseline value. An algorithm that estimates the baseline by reconstructing the log-linear phase downward from the early plateau phase of the PCR reaction was developed and shown to lead to very reproducible PCR efficiency values. PCR efficiency values were determined per sample by fitting a regression line to a subset of data points in the log-linear phase. The variability, as well as the bias, in qPCR results was significantly reduced when the mean of these PCR efficiencies per amplicon was used in the calculation of an estimate of the starting concentration per sample.
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Résumé Contexte et objectifs Les activités de recherche appliquée et développement (Ra&D) font partie du mandat de prestations des hautes écoles spécialisées (HES) prescrit par la loi. Néanmoins la tradition, le type et l'importance de la recherche varient fortement en fonction des domaines d'études. Il en va de même pour les liens avec les autres domaines de prestations que sont l'enseignement, la formation continue et les prestations de services. Les activités de Ra&D dans chaque HES s'inscrivent dans la tension entre l'orientation pratique (qui signifie le plus souvent une orientation vers le marché économique) et l'orientation vers la science (signe de leur rattachement au système scientifique). Il en découle des conflits d'intérêts entre les critères de qualité du « succès sur le marché » et de la « réputation scientifique ». En 2005, sur mandat de la Commission pour la technologie et l'innovation (CTI), B. Lepori et L. Attar (2006) ont mené une étude visant à examiner plus particulièrement les stratégies de recherche et l'organisation de la recherche au sein des hautes écoles spécialisées. Aujourd'hui, six ans plus tard, la phase de mise sur pied est en grande partie terminée. En lançant une nouvelle étude, l'Office fédéral de la formation professionnelle et de la technologie (OFFT) et la Commission fédérale des hautes écoles spécialisées (CFHES) souhaitaient faire le point sur les activités de recherche des HES, c'està- dire examiner les résultats des stratégies et de l'organisation de cette phase. Cette étude s'articule principalement autour de l'état actuel de la recherche, de ses problèmes et de ses perspectives. Structure de l'étude La recherche dans les HES se caractérise par différents facteurs d'influence (cultures disciplinaires, traditions, ancrage dans les régions linguistiques, structures organisationnelles, gouvernance, stratégies de positionnement, personnel, etc.). Dans la présente étude, ces facteurs sont systématiquement examinés selon deux dimensions: le « domaine d'études » et la « haute école spécialisée». L'analyse repose notamment sur l'exploitation de documents et de données. Mais cette étude se fonde principalement sur les entretiens menés avec les représentants des HES à différents niveaux de responsabilités. Les hautes écoles spécialisées (HES) Les entretiens avec les directions des HES ainsi que l'exploitation des données et des documents mettent en évidence la grande diversité des sept HES suisses de droit public dans leur structure, leurs combinaisons de domaines d'études et leurs orientations. Les modes de financement de la recherche varient fortement entre les HES. Concrètement, les sources de financement ne sont pas les mêmes d'une HES à l'autre (contributions des organes responsables, fonds de tiers, etc.). Les degrés et formes du pilotage concernant les contenus de la recherche diffèrent également dans une large mesure (définition de pôles de recherche, soutien cumulatif à l'acquisition de fonds de tiers), de même que les stratégies en matière de recrutement et d'encouragement du personnel. La politique de chaque HES implique des tensions et des problèmes spécifiques. Les domaines d'études Sur les dix domaines d'études, quatre ont été choisis à titre d'exemples pour des études approfondies : Technique et technologies de l'information (TI), Economie et services, Travail social, Musique, arts de la scène et autres arts. Chaque domaine d'études a été examiné à chaque fois dans deux HES. Cette méthode permet de relever les différences et les similitudes. Les résultats confirment qu'il existe des différences importantes à bien des égards entre les domaines d'études évalués. Ces différences concernent la position dans le système des hautes écoles, le volume des activités de recherche, l'importance de la recherche au sein des HES, la tradition, l'identité et l'orientation. Elles se retrouvent par ailleurs dans les buts et la place de la Ra&D dans les domaines d'études concernés. Il ressort toutefois qu'il n'y a pas lieu de parler d'une dichotomie entre les « anciens » et les « nouveaux » domaines d'études : Technique, économie et design (TED) d'une part et Santé, social et arts (SSA) d'autre part. Il semble plus pertinent de désigner le domaine d'études 4/144 Technique et TI comme le domaine dominant auquel se référent le pilotage et le financement des HES, que ce soit implicitement ou explicitement. Cadre homogène et espaces hétérogènes Le pilotage et le financement de la Ra&D au sein des hautes écoles spécialisées s'inscrivent dans un modèle-cadre fixé à l'échelle fédérale et principalement axé sur le domaine d'études Technique. Ce modèle-cadre se caractérise par un apport élevé de fonds de tiers (notamment les subventions de la CTI et les fonds privés) et des incitations en faveur de ce mode de financement, par une orientation vers le marché et par un haut degré d'autonomie des établissements partenaires/départements et instituts. Par comparaison avec les hautes écoles universitaires, les HES affichent notamment un faible niveau de financement de base dans le secteur Ra&D. Cet état de fait est certes compatible avec la forme actuelle du financement par la CTI, mais pas avec les règles de financement du Fonds national suisse (FNS). Un financement principalement basé sur les fonds de tiers signifie par ailleurs que l'orientation du contenu de la recherche et la définition de critères de qualité sont confiées à des instances externes, notamment aux mandants et aux institutions d'encouragement de la recherche. Il apparaît en dernier lieu qu'un tel modèle-cadre ne favorise pas les politiques visant à la constitution de pôles de recherche, l'obtention d'une taille critique, et la mise en place d'une coordination. Ces résultats concernent tous les domaines d'études sans avoir pour autant les mêmes conséquences : les domaines d'études se prêtant dans une faible mesure à l'acquisition de fonds de tiers sur des marchés économiques (dans cette étude, il s'agit essentiellement de la Musique, arts de la scène et autres arts, mais également du Travail social dans certains cas) ont plus de difficultés à répondre aux attentes énoncées en termes de succès et de profit. Les HES modifient plus ou moins le modèle-cadre en élaborant elles-mêmes des modèles d'organisation qui prennent en compte leur combinaison de domaines d'études et soutiennent leurs propres orientations et positionnements stratégiques. La combinaison de domaines d'études hétérogènes et de politiques différentes au sein des HES se traduit par une complexité du système des HES, beaucoup plus importante que ce que généralement supposée. De plus, au regard des connaissances lacunaires sur les structures « réelles » de gouvernance des HES, il n'est quasiment pas possible de comparer directement les hautes écoles spécialisées entre elles. Conclusions et recommandations Le principal constat qui ressort d'un ensemble de conclusions et de recommandations des auteurs est que le secteur Ra&D dans les HES doit être plus explicitement évalué en fonction des spécificités des domaines d'études, à savoir du rôle de la recherche pour l'économie et la société, des différences entre les marchés (économiques) correspondants et de l'importance de la Ra&D pour les objectifs visés. L'étude montre clairement qu'il n'y a pas à proprement parler une seule et unique recherche au sein des hautes écoles spécialisées et que la notion de « recherche appliquée » ne suffit ni comme description ni, par conséquence, comme critère d'identité commun. Partant de ce constat, nous recommandons de revoir le mode de financement de la recherche dans les HES et d'approfondir le débat sur les structures de gouvernance sur l'orientation de la Ra&D (et notamment sur les critères de qualité appliqués), de même que sur l'autonomie et la coordination. Les recommandations constituent des points de discussion et n'engagent aucunement l'OFFT ou la CFHES.
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Rapport de synthèse: Les rendez-vous manqués représentent un problème important, tant du point de vue de la santé des patients que du point de vue économique. Pourtant peu d'études se sont penchées sur le sujet, particulièrement dans une population d'adolescents. Les buts de cette étude étaient de caractériser les adolescents qui sont à risque de manquer ou d'annuler leurs rendez-vous dans une clinique ambulatoire de santé pour adolescents, de comparer les taux des rendez-vous manqués et annulés entre les différents intervenants et d'estimer l'efficacité d'une politique de taxation des rendez-vous manqués non excusés. Finalement, un modèle multi-niveau markovien a été utilisé afin de prédire le risque de manquer un rendez-vous. Ce modèle tient compte du passé de l'adolescent en matière de rendez-vous manqués et d'autres covariables et permet de grouper les individus ayant un comportement semblable. On peut ensuite prédire pour chaque groupe le risque de manquer ou annuler et les covariables influençant significativement ce risque. Entre 1999 et 2006, 32816 rendez-vous fixés pour 3577 patients âgés de 12 à 20 ans ont été analysés. Le taux de rendez-vous manqués était de 11.8%, alors que 10.9% avaient été annulés. Soixante pour cent des patients n'ont pas manqué un seul de leur rendezvous et 14% en ont manqué plus de 25%. Nous avons pu mettre en évidence plusieurs variables associées de manière statistiquement significative avec les taux de rendez-vous manqués et d'annulations (genre, âge, heure, jour de la semaine, intervenant thérapeutique). Le comportement des filles peut être catégorisé en 2 groupes. Le premier groupe inclut les diagnostiques psychiatriques et de trouble du comportement alimentaire, le risque de manquer dans ce groupe étant faible et associé au fait d'avoir précédemment manqué un rendez-vous et au délai du rendez-vous. Les autres diagnostiques chez les filles sont associés à un second groupe qui montre un risque plus élevé de manquer un rendez-vous et qui est associé à l'intervenant, au fait d'avoir précédemment manqué ou annulé le dernier rendez-vous et au délai du rendez-vous. Les garçons ont tous globalement un comportement similaire concernant les rendez-vous manqués. Le diagnostic au sein de ce groupe influence le risque de manquer, tout comme le fait d'avoir précédemment manqué ou annulé un rendez-vous, le délai du rendez-vous et l'âge du patient. L'introduction de la politique de taxation des rendez-vous non excusés n'a pas montré de différence significative des tàux de rendez-vous manqués, cependant cette mesure a permis une augmentation du taux d'annulations. En conclusion, les taux de présence des adolescents à leurs rendez-vous sont dépendants de facteurs divers. Et, même si les adolescents sont une population à risque concernant les rendez-vous manqués, la majorité d'entre eux ne manquent aucun de leurs rendez-vous, ceci étant vrai pour les deux sexes. Etudier les rendez-vous manqués et les adolescents qui sont à risque de rater leur rendez-vous est un pas nécessaire vers le contrôle de ce phénomène. Par ailleurs, les moyens de contrôle concernant les rendez-vous manqués devraient cibler les patients ayant déjà manqué un rendez-vous. La taxation des rendez-vous manqués permet d'augmenter les rendez-vous annulés, ce qui a l'avantage de permettre de fixer un nouveau rendez-vous et, de ce fait, d'améliorer la continuité des soins.
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Missed appointments represent an important medical and economical issue. Few studies on the subject are reported in the literature, particularly regarding adolescents. Our aim was to characterize missed and cancelled appointments in a multidisciplinary outpatient clinic for adolescents, to assess the effectiveness of a policy aimed at reducing missed appointments by introducing payment for those missed appointments not cancelled in advance, and to compare the rates between staff and resident physicians. A total of 32,816 consultations (representing 35 patients aged 12-20 years, 82.4% females) between 1999 and 200 were analysed. The missed appointment rate was 11.8% whilst another 10.9% were cancellations. Females cancelled more than males (11.3% vs. 8.4%, AOR 1.31, 99% CI 1.08-1.59), but there was no difference for missed appointments (11.6% vs. 12.3%, AOR 0.88, 99% CI 0.61-1.08). April and June to October (vacation months) were associated with more missed appointments. Globally mornings had higher rates of missed appointments than afternoons (13.6% vs. 11.2%, AOR 1.25, 99% CI 1.11-1.40). There was a slight difference in missed appointment rates between staff physicians and residents (10.4%; 11.8%, AOR 1.20, 99% CI 1.08-1.33). Missed appointment rates before and after the new policy on missed appointments were similar (1999-2003: 11.9%; 2004-2006: 11.6%, AOR 0.96, 99% CI 0.83-1.10). Conversely, cancellation rates increased from 8.4% (1999-2003) to 14.5% (2004-2006) (AOR 1.83, 99% CI 1.63-2.05). Attendance rates among adolescents show variations depending on vacation and school hours. Being attentive to these factors could help prevent missed appointments. Although having to pay for missed appointments does not increase attendance, it increases cancellations with the advantage that the appointment can be rescheduled.
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BACKGROUND: Vitamin D insufficiency has been associated with the occurrence of various types of cancer, but causal relationships remain elusive. We therefore aimed to determine the relationship between genetic determinants of vitamin D serum levels and the risk of developing hepatitis C virus (HCV)-related hepatocellular carcinoma (HCC). METHODOLOGYPRINCIPAL FINDINGS: Associations between CYP2R1, GC, and DHCR7 genotypes that are determinants of reduced 25-hydroxyvitamin D (25[OH]D3) serum levels and the risk of HCV-related HCC development were investigated for 1279 chronic hepatitis C patients with HCC and 4325 without HCC, respectively. The well-known associations between CYP2R1 (rs1993116, rs10741657), GC (rs2282679), and DHCR7 (rs7944926, rs12785878) genotypes and 25(OH)D3 serum levels were also apparent in patients with chronic hepatitis C. The same genotypes of these single nucleotide polymorphisms (SNPs) that are associated with reduced 25(OH)D3 serum levels were found to be associated with HCV-related HCC (P = 0.07 [OR = 1.13, 95% CI = 0.99-1.28] for CYP2R1, P = 0.007 [OR = 1.56, 95% CI = 1.12-2.15] for GC, P = 0.003 [OR = 1.42, 95% CI = 1.13-1.78] for DHCR7; ORs for risk genotypes). In contrast, no association between these genetic variations and liver fibrosis progression rate (P>0.2 for each SNP) or outcome of standard therapy with pegylated interferon-α and ribavirin (P>0.2 for each SNP) was observed, suggesting a specific influence of the genetic determinants of 25(OH)D3 serum levels on hepatocarcinogenesis. CONCLUSIONSSIGNIFICANCE: Our data suggest a relatively weak but functionally relevant role for vitamin D in the prevention of HCV-related hepatocarcinogenesis.
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Cognitive errors (CE) and coping strategies (CS) are the focus of most cognitive-behavioral treatments for incarcerated child molesters. Several studies have reported differences in CEs and CSs between child molesters and controls. However, the vast majority of these studies assessed cognitive errors and coping using questionnaires, which are known to present a number of important limitations. This pilot study aimed to compare the CEs and CSs of N = 17 incarcerated child abusers and N = 12 controls using observer-rated methods, namely the Cognitive Error Rating Scale (CERS; Drapeau et al., 2005) and the Coping Action Pattern Rating Scale (CAPRS; Perry, Drapeau, & Dunkley, 2005). Results showed that child molesters presented more cognitive errors, in particular positive selective abstraction, and lower coping functioning, such as escape strategies. Treatment and research implications, including the use of observer-rated methods, are discussed.
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OBJECTIVE: Cognitive change over the course of psychodynamic psychotherapy has been postulated by several models, but has rarely been studied. Based on the adaptive skills model (Badgio, Halperin, & Barber, 1999), it is reasonable to expect that very brief dynamic psychotherapy may be associated with change in coping patterns and cognitive errors (also known as cognitive distortions) y. METHOD: N = 50 outpatients presenting with various psychiatric disorders and undergoing 4 sessions of Brief Psychodynamic Intervention (BPI; Despland, Drapeau, & de Roten, 2005; Despland, Michel, & de Roten, 2010) were included in this naturalistic study (mean age: 31 years; 56% female; all Caucasian). Cognitive errors and coping strategies were assessed using the Cognitive Errors Rating Scale (Drapeau et al., 2008) and Coping Patterns Rating Scale (Perry et al., 2005). These observer rated methods were applied to the verbatim transcriptions of all 4 therapy sessions completed by each patient. RESULTS: Results indicate change in both cognitive errors and coping patterns over the course of BPI, including an increase in the Overall Coping Functioning and a decrease in unhelpful coping processes, such as isolation, which reflects a shift in participant appraisal towards stress appraised as a challenge at the end of treatment. These changes predicted symptom change at the end of treatment. While cognitive errors also changed over the course of BPI, no predictive effect was found with regard to symptom change. CONCLUSIONS: These results are interpreted within the framework of common change principles in psychotherapy. Implications and future research are discussed.
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We briefly review findings from Brazilian settings where the human immunodeficiency virus/acquired immunodeficiency syndrome (HIV/AIDS) epidemic among injection drug users (IDUs) seems to be decreasing, highlighting recent findings from Rio de Janeiro and discussing methodological alternatives. Former analyses using serologic testing algorithm for recent HIV seroconversion have shown that HIV incidence has been low in IDUs recruited by two different surveys carried out in Rio, where low injection frequencies and infection rates have been found among new injectors. The proportion of AIDS cases among IDUs in Rio has been fairly modest, compared to São Paulo and especially to the southernmost states. Notwithstanding, the interpretation of findings from serial surveys constitutes a challenge, magnified in the assessment of HIV spread among IDUs due to the dynamic nature of the drug scenes and limitations of sampling strategies targeting hard-to-reach populations. Assessment of epidemic trends may profit from the triangulation of data, but cannot avert biases associated with sampling errors. Efforts should be made to triangulate data from different sources, besides exploring specific studies from different perspectives. In an attempt to further assess the observed trends, we carried out original analyses using data from Brazilian AIDS databank.
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In this study the kinetics of humoral and cellular immune responses in first-time vaccinees and re-vaccinees with the yellow fever 17DD vaccine virus was analyzed. Flow cytometric analyses were used to determine percentual values of T and B cells in parallel to the yellow fever neutralizing antibody production. All lymphocyte subsets analyzed were augmented around the 30th post vaccination day, both for first-time vaccinees and re-vaccinees. CD3+ T cells increased from 30.8% (SE ± 4%) to 61.15% (SE ± 4.2%), CD4+ T cells from 22.4% (SE ± 3.6%) to 39.17% (SE ± 2%) with 43% of these cells corresponding to CD4+CD45RO+ T cells, CD8+ T cells from 15.2% (SE ± 2.9%) to 27% (SE ± 3%) with 70% corresponding to CD8+CD45RO+ T cells in first-time vaccinees. In re-vaccinees, the CD3+ T cells increased from 50.7% (SE ± 3%) to 80% (SE ± 2.3%), CD4+ T cells from 24.9% (SE ± 1.4%) to 40% (SE ± 3%) presenting a percentage of 95% CD4+CD45RO+ T cells, CD8+ T cells from 19.7% (SE ± 1.8%) to 25% (SE ± 2%). Among CD8+CD38+ T cells there could be observed an increase from 15 to 41.6% in first-time vaccinees and 20.7 to 62.6% in re-vaccinees. Regarding neutralizing antibodies, the re-vaccinees presented high titers even before re-vaccination. The levels of neutralizing antibodies of first-time vaccinees were similar to those presented by re-vaccinees at day 30 after vaccination, indicating the success of primary vaccination. Our data provide a basis for further studies on immunological behavior of the YF 17DD vaccine.
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One of the crucial steps of authentication of aDNA sequences is phylogenetic consistency. Amplified sequences should fit into the phylogenetic framework of their supposed origin. An inherent property of aDNA sequences however, is their short sequence length. Additionally, genes for aDNA studies are often chosen by their preservation potential rather than by phylogenetically informative content. This poses potential challenges regarding their analyses, and might result in an inaccurate reflection of the supposed phylogenetic history of the sequence or organism under study. In this paper some fundamental problems of phylogenetic analysis and interpretation of aDNA datasets are discussed. Suggestions for character sampling and treatment of missing data are made. The publication is the result of a talk from the 1st PAMINSA Meeting in Rio de Janeiro, July 2005.
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Pantomimes of object use require accurate representations of movements and a selection of the most task-relevant gestures. Prominent models of praxis, corroborated by functional neuroimaging studies, predict a critical role for left parietal cortices in pantomime and advance that these areas store representations of tool use. In contrast, lesion data points to the involvement of left inferior frontal areas, suggesting that defective selection of movement features is the cause of pantomime errors. We conducted a large-scale voxel-based lesion-symptom mapping analyses with configural/spatial (CS) and body-part-as-object (BPO) pantomime errors of 150 left and right brain-damaged patients. Our results confirm the left hemisphere dominance in pantomime. Both types of error were associated with damage to left inferior frontal regions in tumor and stroke patients. While CS pantomime errors were associated with left temporoparietal lesions in both stroke and tumor patients, these errors appeared less associated with parietal areas in stroke than in tumor patients and less associated with temporal in tumor than stroke patients. BPO errors were associated with left inferior frontal lesions in both tumor and stroke patients. Collectively, our results reveal a left intrahemispheric dissociation for various aspects of pantomime, but with an unspecific role for inferior frontal regions.
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Swiss laboratories performing toxicological road traffic analyses have been authorized for many years by the Swiss Federal Roads Office (FEDRO). In 2003 FEDRO signed a contract with the Swiss Society of Legal Medicine (SSLM) to organize the complete quality management concerning road traffic analyses. For this purpose a multidisciplinary working group was established under the name of "road traffic commission (RTC)". RTC has to organize external quality control, to interpret the results of these controls, to perform audits in the laboratories and to report all results to FEDRO. Furthermore the working group can be mandated for special tasks by FEDRO. As an independent organization the Swiss Center for Quality Control (CSCQ) in Geneva manages the external quality controls in the laboratory over the past years. All tested drugs and psychoactive substances are listed in a federal instruction. The so-called 'zero tolerance substances' (THC, morphine, cocaine, amphetamine, methamphetamine, MDMA and MDEA) and their metabolites have to be tested once a year, all other substances (benzodiazepines, zolpidem, phenobarbital, etc.) periodically. Results over the last years show that all laboratories are generally within the confidence interval of +/-30% of the mean value. In cases of non-conformities measures have to be taken immediately and reported to the working group. External audits are performed triennially but accredited laboratories can combine this audit with the approval of the Swiss Accreditation Service (SAS). During the audits a special checklist filled in by the laboratory director is assessed. Non-conformities have to be corrected. During the process of establishing a new legislation, RTC had an opportunity of advising FEDRO. In collaboration with FEDRO, RTC and hence SSLM can work actively on improving of quality assurance in road traffic toxicological analyses, and has an opportunity to bring its professional requests to the federal authorities.