A robust algorithm for segmenting fluorescence images and its application to single-molecule counting

La microscopie par fluorescence de cellules vivantes produit de grandes quantités de données. Ces données sont composées d’une grande diversité au niveau de la forme des objets d’intérêts et possèdent un ratio signaux/bruit très bas. Pour concevoir un pipeline d’algorithmes efficaces en traitement d’image de microscopie par fluorescence, il est important d’avoir une segmentation robuste et fiable étant donné que celle-ci constitue l’étape initiale du traitement d’image. Dans ce mémoire, je présente MinSeg, un algorithme de segmentation d’image de microscopie par fluorescence qui fait peu d’assomptions sur l’image et utilise des propriétés statistiques pour distinguer le signal par rapport au bruit. MinSeg ne fait pas d’assomption sur la taille ou la forme des objets contenus dans l’image. Par ce fait, il est donc applicable sur une grande variété d’images. Je présente aussi une suite d’algorithmes pour la quantification de petits complexes dans des expériences de microscopie par fluorescence de molécules simples utilisant l’algorithme de segmentation MinSeg. Cette suite d’algorithmes a été utilisée pour la quantification d’une protéine nommée CENP-A qui est une variante de l’histone H3. Par cette technique, nous avons trouvé que CENP-A est principalement présente sous forme de dimère.

Box Products in Fuzzy Topological Spaces and Related Topics

The topology as the product set with a base chosen as all products of open sets in the individual spaces. This topology is known as box topology. The main objective of this study is to extend the concept of box products to fuzzy box products and to obtain some results regarding them. Owing to the fact that box products have plenty of applications in uniform and covering properties, here made an attempt to explore some inter relations of fuzzy uniform properties and fuzzy covering properties in fuzzy box products. Even though the main focus is on fuzzy box products, some brief sketches regarding hereditarily fuzzy normal spaces and fuzzy nabla product is also provided. The main results obtained include characterization of fuzzy Hausdroffness and fuzzy regularity of box products of fuzzy topological spaces. The investigation of the completeness of fuzzy uniformities in fuzzy box products proved that a fuzzy box product of spaces is fuzzy topologically complete if each co-ordinate space is fuzzy topologically complete. The thesis also prove that the fuzzy box product of a family of fuzzy α-paracompact spaces is fuzzy topologically complete. In Fuzzy box product of hereditarily fuzzy normal spaces, the main result obtained is that if a fuzzy box product of spaces is hereditarily fuzzy normal ,then every countable subset of it is fuzzy closed. It also deals with the notion of fuzzy nabla product of spaces which is a quotient of fuzzy box product. Here the study deals the relation connecting fuzzy box product and fuzzy nabla product

Java Applets for teaching quantum mechanics: Particle in a box

These Java Applets help to illustrate some of the difficult to grasp concepts of quantum mechanics. To run this Applet, use the 'Download as zip files' option. Make sure you extract the files first, then double click on the .html file to run the Applet. These are released as open access resources for the purpose of testing, and are to be deployed at the users own risk. Please report any errors you find.

Java Applets for teaching quantum mechanics: Particle in a 2D box

These Java Applets help to illustrate some of the difficult to grasp concepts of quantum mechanics. To run this Applet, use the 'Download as zip files' option. Make sure you extract the files first, then double click on the .html file to run the Applet. These are released as open access resources for the purpose of testing, and are to be deployed at the users own risk.

INFO2009 Group 16 - The Rice Box Resources

INFO2009, Coursework 2, Green ICT/IT

Baby Santa's : music box.

Se muestra a bebés y preescolares el mundo de la Navidad, con sus tradiciones y celebraciones propias. Las imágenes se acompañan con la música de clásicos como Tchaikovsky o Mozart.

The big box : a story about Biff and Chip.

Pertenece a un amplio programa infantil de lectura que abarca distintos niveles de edad y, por tanto, de conocimientos. Se abordan las necesidades de lectura en los niños y la amplia variedad de habilidades que necesitan adquirir para su aprendizaje y, se destaca, también, la importancia de la narración en las historias. Este nivel uno se concentra en el lenguaje y la prelectura y sirve para que los niños se familiaricen con los personajes, un grupo de niños de cuatro a seis años de edad y su perro, y con sus experiencias compartidas.

Amy and the rex box.

El objetivo de esta serie es desarrollar en los niños las habilidades para la lectura y la comprensión de textos, en doce niveles y mediante la narración de una historia distinta en cada uno de los libros que la componen. También se refuerza el vocabulario relacionado con el contenido de la historia y se acompaña de distintas actividades. En ésta, se narran las aventuras de la protagonista en una caja que le transporta en el tiempo hasta le época de los dinosaurios, y se incluye en el nivel nueve.

Vicky's box.

Las historias fantásticas tienen éxito con los niños reacios a la lectura ya que el niño y el personaje tiene juntos una aventura. Para la lectura en voz alta de niños a partir de cinco años, cumple con los requisitos del currículo de Inglaterra, Gales e Irlanda. Las ilustraciones están muy relacionadas con el texto, lo que permite a los alumnos predecir las palabras desconocidas al desarrollar un vocabulario basado en la imagen que facilita la lectura. El profesor puede proponer actividades tanto para lectores con más dificultad como para los más rápidos. Adecuado para lectura guiada.

Nishal's box.

Material de apoyo para la enseñanza de la lectura en la educación primaria. Pertenece al género de historias sobre mundos de fantasía, un género que ha demostrado tener éxito con los niños que son reacios a leer. Es un día caluroso, Nishal encuentra en el jardín una caja de la que salen unos ruidos. De repente, se abre la tapa y salta un gran pingüino. El nuevo amigo le llevará a alguna parte muy fría.

A big book of counting and chanting rhymes.

Es una colección de poemas para niños de tres a seis años. Las rimas son al mismo tiempo entretenidas y educativas, y les ponen en contacto con la aritmética, la lectura y escritura.

Out for the count : a counting adventure.

Tom no puede dormir aunque está rodeado de sus juguetes de peluche, por lo que su padre le sugiere que intente contar ovejas. Comienza a contar , pero la séptima oveja, delgada y ágil, desaparece por el armario del dormitorio antes de que el niño pestañee. El niño intenta contar otras criaturas y es sorprendido por lobos, pitones, cabras monteses, piratas, pingüinos, vampiros, fantasmas, y tigres hasta que, afortunadamente, cierra la puerta apaga la luz, y puede dormir. El cuento es acumulativo en verso. En doble página aparecen las criaturas en una variedad de tamaños, ángulos y formas, dando la sensación de movimiento. La página de la derecha es un recuadro de texto y conjuntos de siluetas. Para leer en voz alta, y para contar hasta cien. El texto es ideal para llamar la atención sobre la gran variedad de opciones de palabras y ortografía.

Primary Grammar box : grammar games and activities for younger learners.

Recurso fotocopiable para enseñar gramática a estudiantes de siete a doce años. Incluye cincuenta y tres juegos y actividades con una duración entre veinte a sesenta minutos, para hacer a los niños divertido el aprendizaje. El texto incluye rompecabezas, juegos y crucigramas. Se divide en cuatro secciones: tres secciones de ampliación para los alumnos agrupados según las edades y el nivel, y la cuarta sección de crucigramas. Muchas de las actividades son apropiadas para la preparación de los alumnos para las pruebas de inglés del Cambridge Young Learners (Cambridge ESOL).

Primary communication box : speaking and listering activities for younger learners.

Recurso fotocopiable con actividades para ayudar a los profesores a desarrollar las destrezas de comunicación en estudiantes de siete a doce años aproximadamente. Incluye cincuenta y dos actividades agrupadas en cuatro secciones: tres secciones en función de los niveles y edades de los alumnos y una sección de crucigramas. Las actividades duran desde quince minutos hasta ocupar a mayor parte del tiempo de la lección. Se basan en situaciones reales de manera que luego los alumnos puedan comunicarse adecuadamente en la vida cotidiana. Éstos son estimulados a trabajar en parejas, pequeños grupos y con toda la clase para compartir ideas y opiniones en distintos contextos:Juegos de rol, encuestas y debates abiertos. Muchas de las actividades son apropiadas para la preparación de los alumnos para las pruebas de inglés del Cambridge Young Learners (Cambridge ESOL).

Primary activity box : games and activities for younger learners.

Recurso fotocopiable con actividades para estudiantes de cinco a once años aproximadamente. Incluye canciones, rimas, rompecabezas y juegos para escuchar, hablar, leer y escribir y están diseñadas para adaptarse a una variedad de estilos de enseñanza y aprendizaje, como la adquisición del lenguaje a través del movimiento corporal, además del enfoque visual y auditivo. Las actividades tienen diferente duración, que va desde diez minutos hasta ocupar la mayor parte del tiempo de la lección. Muchas de las actividades son apropiadas para la preparación de los alumnos para las pruebas de inglés del Cambridge Young Learners (Cambridge ESOL).