Fasciculus temporum, vel Chronica ab initio mundi.

Colofón en h. 65

From ab initio quantum mechanics to molecular neurobiology: A cation–π binding site in the nicotinic receptor

The nicotinic acetylcholine receptor is the prototype ligand-gated ion channel. A number of aromatic amino acids have been identified as contributing to the agonist binding site, suggesting that cation–π interactions may be involved in binding the quaternary ammonium group of the agonist, acetylcholine. Here we show a compelling correlation between: (i) ab initio quantum mechanical predictions of cation–π binding abilities and (ii) EC50 values for acetylcholine at the receptor for a series of tryptophan derivatives that were incorporated into the receptor by using the in vivo nonsense-suppression method for unnatural amino acid incorporation. Such a correlation is seen at one, and only one, of the aromatic residues—tryptophan-149 of the α subunit. This finding indicates that, on binding, the cationic, quaternary ammonium group of acetylcholine makes van der Waals contact with the indole side chain of α tryptophan-149, providing the most precise structural information to date on this receptor. Consistent with this model, a tethered quaternary ammonium group emanating from position α149 produces a constitutively active receptor.

Emergence of half-metallicity in suspended NiO chains: Ab initio electronic structure and quantum transport calculations

Contrary to the antiferromagnetic and insulating character of bulk NiO, one-dimensional chains of this material can become half metallic due to the lower coordination of their atoms. Here we present ab initio electronic structure and quantum transport calculations of ideal infinitely long NiO chains and of more realistic short ones suspended between Ni electrodes. While infinite chains are insulating, short suspended chains are half-metallic minority-spin conductors that displays very large magnetoresistance and a spin-valve behavior controlled by a single atom.

Mécanismes de transfert de proton d’une réaction acido-basique en phase aqueuse : une étude ab-initio

Les réactions de transfert de proton se retrouvent abondamment dans la nature et sont des processus cruciaux dans plusieurs réactions chimiques et biologiques, qui se produisent souvent en milieu aqueux. Les mécanismes régissant ces échanges de protons sont complexes et encore mal compris, suscitant un intérêt des chercheurs en vue d’une meilleure compréhension fondamentale du processus de transfert. Le présent manuscrit présente une étude mécanistique portant sur une réaction de transfert de proton entre un acide (phénol fonctionnalisé) et une base (ion carboxylate) en phase aqueuse. Les résultats obtenus sont basés sur un grand nombre de simulations de dynamique moléculaire ab-initio réalisées pour des systèmes de type « donneur-pont-accepteur », où le pont se trouve à être une unique molécule d’eau, permettant ainsi l’élaboration d’un modèle cinétique détaillé pour le système étudié. La voie de transfert principalement observée est un processus ultra-rapide (moins d’une picoseconde) passant par la formation d’une structure de type « Eigen » (H9O4+) pour la molécule d’eau pontante, menant directement à la formation des produits. Une seconde structure de la molécule d’eau pontante est également observée, soit une configuration de type « Zündel » (H5O2+) impliquant l’accepteur de proton (l’ion carboxylate) qui semble agir comme un cul-de-sac pour la réaction de transfert de proton.

Mécanismes de transfert de proton d’une réaction acido-basique en phase aqueuse : une étude ab-initio

Les réactions de transfert de proton se retrouvent abondamment dans la nature et sont des processus cruciaux dans plusieurs réactions chimiques et biologiques, qui se produisent souvent en milieu aqueux. Les mécanismes régissant ces échanges de protons sont complexes et encore mal compris, suscitant un intérêt des chercheurs en vue d’une meilleure compréhension fondamentale du processus de transfert. Le présent manuscrit présente une étude mécanistique portant sur une réaction de transfert de proton entre un acide (phénol fonctionnalisé) et une base (ion carboxylate) en phase aqueuse. Les résultats obtenus sont basés sur un grand nombre de simulations de dynamique moléculaire ab-initio réalisées pour des systèmes de type « donneur-pont-accepteur », où le pont se trouve à être une unique molécule d’eau, permettant ainsi l’élaboration d’un modèle cinétique détaillé pour le système étudié. La voie de transfert principalement observée est un processus ultra-rapide (moins d’une picoseconde) passant par la formation d’une structure de type « Eigen » (H9O4+) pour la molécule d’eau pontante, menant directement à la formation des produits. Une seconde structure de la molécule d’eau pontante est également observée, soit une configuration de type « Zündel » (H5O2+) impliquant l’accepteur de proton (l’ion carboxylate) qui semble agir comme un cul-de-sac pour la réaction de transfert de proton.

Secundus tomus Concionum de tempore : quae ab initio Quadragesimae usque ad quartam eius dominicam haberi solent /

Mode of access: Internet.

Supplementum Mercurii gallobelgici in quo breuiter commemorantur ea quae ab initio ... Europa gesta sunt /

Mode of access: Internet.

Mercurii Gallobelgici siue Rerum in Gallia & Belgio potissimum ; Ungaria quoque, Transyluania, Turcia, Polonia Germania, Italia, Hispania, Anglia, alijsque Europae regnis & prouincijs ab anni 1594 mense iulio usque ad annum 1596 gestarum ... ; tomus tertius ... cum appendice ab initio anni 1596 ... /

Mode of access: Internet.

Apparatus ad annales criticos rerum graecarum inde ab initio olympiadum iphiti usque ad olympiadem coroeb. CCXXX. sive inde ab anno DCCCLXXXIIII. ante Chr. nat. usque ad annum CXXXXIIII. post Christ. nat.

Gel.

Tomus primus [-secundus] Chronicon D. Iohannis Naucleri ... : compraehendentium res memorabiles seculorum omnium ac gentium, ab initio mu[n]di vsq[ue] ad annum Christi nati MCCCCC ... : cum appendice noua rerum interim gestarum, videlicet ab initio anni 1500, vsque ad septembrem praesentis 1564 ...

CCBE S. XVI,

Benedicti papae XIV. Bullarium. In quo continentur constitutiones, epistolae, aliaque edita ab initio pontificatus usque ad annum MDCCXLVI.

Mode of access: Internet.

Historia Iohannis de Cermenate, notarii mediolanensis, de situ Ambrosianae urbis et cultoribus ipsius et circumstantium locorum ab initio et per tempora successive et gestis imp. Henrici VII.

No. 154 of 500 copies.

Sacrae Rotae Romanae decisionum recentiorum partis XIX tomus secundus : complectens Decisiones selectas ab initio anni 1673 ad totum 1683 ...

Mode of access: Internet.

Relativity, the electron theory, and gravitation,

Mode of access: Internet.