Conversive Hidden non-Markovian models

Magdeburg, Univ., Fak. für Informatik, Diss., 2012

Entwicklung von Frontend Single Page Webapplikationen mit dem modularen JavaScript-Framework AngularJS

[s.c.]

A study of the diurnal squirrels, Sciurinae, of the Indian and Indochinese subregions [by] Joseph Curtis Moore and George H. H. Tate.

v.48(1965)

Comparasion of polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE), immuno-electron microscopy (IEM) and enzyme immunoassay (EIA) for the rapid diagnosis of rotavirus infection in children

Detection of rotavirus RNA by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) proved to be a highly sensitive and rapid diagnostic test. A comparison of this assay with immuno-electron microscopy (IEM) and enzyme immunoassay (EIA) in 245 faeces from children with gastroenteritis revealed complete agreement between the three assays in 238 (97.14%) samples. Among 75 samples positive in at least one of the three assays, negative results were observed in 5 (6.48%) by PAGE, in 6 (6.76%) by EIA and in none by IEM. Silver staining greatly increased the sensitivity of the PAGE assay. We conclude that although IEM remains the most sensitive and rapid rotavirus diagnostic assay, the PAGE technique has many advantages in its favour, including the non-requirement of expensive equipment, the use of only chemically defined reagents and the capacity to distinguish virus subgroup and variants and to detect non-crossreactive rotaviruses which are missed in serological assays.

Modeling sequencing errors by combining Hidden Markov models.

Among the largest resources for biological sequence data is the large amount of expressed sequence tags (ESTs) available in public and proprietary databases. ESTs provide information on transcripts but for technical reasons they often contain sequencing errors. Therefore, when analyzing EST sequences computationally, such errors must be taken into account. Earlier attempts to model error prone coding regions have shown good performance in detecting and predicting these while correcting sequencing errors using codon usage frequencies. In the research presented here, we improve the detection of translation start and stop sites by integrating a more complex mRNA model with codon usage bias based error correction into one hidden Markov model (HMM), thus generalizing this error correction approach to more complex HMMs. We show that our method maintains the performance in detecting coding sequences.

Titelbildbeitrag - Bilaterale subkapsuläre Urinome: Ungewöhnliche Ursache einer Page-Niere mit Nierenversagen

Die Page-Niere ist eine relativ seltene, meist reversible Form der sekundären Hypertonie. Im Gegensatz zum Goldblatt-Mechanismus wird der hyperreninämische Hochdruck durch eine Ischämie der Nierenrinde als Folge einer Kompression des Nierenparenchyms durch einen subkapsulären oder perirenalen Prozess, meistens durch Hämatome, verursacht. Seit den anfänglichen Experimenten von Page im Jahr 1939 wurden über 100 Fälle dieses Zustands in der Literatur beschrieben (Dopson SJ et al. Am J Kidney Dis 2009; 54: 334-339). Soweit uns bekannt ist, wurden nur zwei davon durch Urinome verursacht (Patel MR et al. Urology 1984; 23: 585-587; Matlaga BR et al. J Urol 2002; 168: 672). Im 1. Fall musste ein größerer chirurgischer Eingriff (d. h. Nephrektomie) durchgeführt werden, während der 2. Patient mittels retrograder Pyelografie und Setzen eines Harnleiterkatheters behandelt wurde. Hier stellen wir den ungewöhnlichen Fall einer Page-Niere infolge eines beidseitigen subkapsulären Urinoms und akutem Nierenversagen als Komplikation vor. Die Ultraschall- (US) und computertomografischen (CT) Befunde werden beschrieben, wobei auf die sonografisch gesteuerte perkutane Behandlung besonders eingegangen wird.