920 resultados para ISSR-PCR
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本文运用PCR技术,分别从烟草和B. amyloliquefaciens的基因组DNA中扩增出了TA29基因5'区调控顺序、Barnase和Barstar基因,克隆后进行序列分析,表明其核苷酸顺序与文献报道的一致,然后进行了初步的融合基因的构建。另外,凝胶滞后实验表明,水稻花粉(含绒毡层组织)细胞核中某种蛋白因子能够与TA29基因5'区调控顺序发生特异的结合。本文还对TA29基因5'区调控顺序及Barnase和Barstar基因的潜在应用价值和存在的问题进行了讨论。
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本文采用溶菌酶法、CTAB法、微波法及CTAB+微波法等4种方法进行Frankia菌Cp11基因组DNA的提取。结果表明四种方式均可行,但以CTAB法及微波法最为有效。提取方法与REP-PCR带型间关系的研究表明,方法上的差异不会影响到REP-PCR带型的变化。对14株Frankia菌株作REP-PCR分析,并对之进行比较分类,证明REP-PCR方法不但能实现菌株间的差异鉴别,还能有效地进行Frankia菌的分类。这一结果与DNA同源相关性所得的分类结果具有良好的相关性。选用20个随机引物,对分自2个分类接种群的8株Frankia纯培养的总DNA进行随机扩增。其中引物OPW15和OPW16能扩增得到较为稳定的RAPD图谱。扩增产物分子量大都分布在0.5-4Kb之间。从稳定的RAPD扩增图谱看,Frankia菌间存在有丰富的遗传多样性;在选定适当引物情况下,能依据共同带型将Frankia菌化归为同一分类接种群。
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本文应用重复基因外回纹序列rep-PCR方法直接扩增长日山三种不同赤杨和云南不同地区早冬瓜根瘤内的Frankia菌基因,所获得的REP指纹图谱揭示Frankia菌具有丰富的基因多样性。研究结果表明Frankia菌多样性随地域,海拔,坡问不同而变:多样性指数与自然选抒)玉力大小成正相关:自然选择压力是产生和保持Frankia菌基因多样性的重要因子。同时发现Frankia菌基因型与地域有紧密关系:所观察的云南各地区中,感染高黎贡山旱冬瓜的Frankia菌基因多样性最为丰富。推测与高黎贡山旱冬瓜共生的Frankia可能作为种储备库,为其它地区的寄主植物提供了祖先菌株。在对长白山三种赤杨(东北赤杨,西伯利亚赤杨和色赤杨)根瘤内几百游殆菌基因多样性考察过程中发现,Frankia菌基因类型与寄主赤杨种型关系密切。同时海拔对感染东北赤杨的Frankia菌基因多样性也有一定影响。感染西伯利亚赤杨和色赤杨的Frankia菌享有相同的基因型,可能有较近的亲缘关系。
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青杨作为一个本土树种,能较好的适应潮湿和寒冷的环境,对中国西部的人工造林有着重要的参考价值。在本实验中,选取7个中国西南地区分布的自然群体,用ISSR(inter-simple sequence repeats)作为分子标记研究其遗传多样性水平和遗传结构。通过筛选的8个ISSR引物,获得了158条清晰可重复的DNA条带,其中有156条具有多样性(占98.7%)。平均的Nei’s遗传多样性(h)为0.331;遗传分化系数(GST)为0.477,这表明有47.7%的遗传多样性发生在群体间。这种高水平的分化可能是由于当地复杂多变的地形和气候特点阻碍了基因流而引起的。此外在这7个青杨群体中,遗传距离和地理距离并未体现出有显著相关性(r=0.3122, P>0.05)。联合遗传距离和地理距离分析,鉴定出两处低水平基因交流的地区, 探讨其遗传障碍形成原因。 As a native species to China, Populus cathayana Rehd is well-adapted to the wet and cold environments where it occurs. It is considered to be an important reforestation species in western China. In the present study, we surveyed the level of genetic variation and the pattern of genetic structure in seven natural populations of P. cathayana, originating from the southeastern Qinghai-Tibetan Plateau of China, by using ISSR (inter-simple sequence repeats) markers. Based on eight primers, 158 clear and reproducible DNA fragments were generated, of which 156 (98.7%) were polymorphic. The average value of Nei's gene diversity (h) equaled 0.331. The coefficient of genetic differentiation (GST) equaled 0.477, which means that 47.7% of the total molecular variance existed among populations. Such a high level of divergence present among populations may be caused by the complex topography and variable climatic conditions present in the southeastern Qinghai-Tibetan Plateau which effectively restrict gene flow. Moreover, there is a lack of significant association between genetic and geographical distances (r=0.3122, P>0.05) in the populations of P. cathayana. The application of a novel method, which combines geographical coordinates and genetic differentiation to detect barriers for gene flow, allowed us to identify two zones of lowered gene flow.
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本文采用溶菌酶法、CTAB法、微波(MW)法及CTAB+MW法等4种方法提取Frankia菌CpIl基因组DNA。结果表明四种方式均可满足试验要求,其中以CTAB法及微波法最为有效。在比较提取方法与PCR带型间的关系中,发现提取上的差异不影响PCR带型的变化。