Introducing the biogeographic species pool

The species pool concept has played a central role in the development of ecological theory for at least 60 yr. Surprisingly, there is little consensus as to how one should define the species pool, and consequently, no systematic approach exists. Because the definition of the species pool is essential to infer the processes that shape ecological communities, there is a strong incentive to develop an ecologically realistic definition of the species pool based on repeatable and transparent analytical approaches. Recently, several methodological tools have become available to summarize repeated patterns in the geographic distribution of species, phylogenetic clades and taxonomically broad lineages. Here, we present three analytical approaches that can be used to define what we term 'the biogeographic species pool': distance-based clustering analysis, network modularity analysis, and assemblage dispersion fields. The biogeographic species pool defines the pool of potential community members in a broad sense and represents a first step towards a standardized definition of the species pool for the purpose of comparative ecological, evolutionary and biogeographic studies. © 2013 The Authors.

Levantamento de sarcofagídeos(Diptera) do Brasil incluindo a caracterização molecular de Peckia (Pattonella) intermutans (Walker)

Pós-graduação em Biologia Geral e Aplicada - IBB

Variabilidade espacial e correlações entre atributos de solo e produtividade na agricultura de precisão

Pós-graduação em Agronomia (Energia na Agricultura) - FCA

Estudo de polimorfismo do cromossomo x na população da região sudeste do Brasil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Etnobotânica de sistemas agrícolas de pequena produção na região da Serra da Mantiqueira

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Variabilidade genética e química entre e dentro de populações de Casearia sylvestris Sw. (Salicaceae) no estado de São Paulo

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Produção de folhas, óleo essencial e anatomia foliar quantitativa de Lippia alba (Mill.) N.E.Br. (Verbenaceae) em diferentes níveis de sombreamento e épocas de colheita

Pós-graduação em Agronomia (Horticultura) - FCA

Análise espacial e temporal de atributos do solo e da produtividade das culturas visando manejo específico em áreas agrícolas

Pós-graduação em Agronomia (Produção Vegetal) - FCAV

Foraminifera, thecamoebians and palynomorphs as hydrodynamic indicators in Araguari Estuary, Amazonian Coast, Amapá State - Brazil

O regime de macromaré e a pororoca controlam a dinâmica estuarina do Araguari, na qual é muito diferente dos modelos tradicionais dos estuários sob este regime de maré. Objetivando estabelecer zonas estuarinas no Araguari com base em assembléias de foraminíferos, tecamebas, palinomorfos e parâmetros físico-químicos, foram estabelecidas dezesseis estações amostrais ao longo do estuário. A turbidez e a temperatura foram os parâmetros ambientais que permitiram determinar gradiente estuarino. Dezoito espécies de foraminíferos, dez espécies de tecamebas e quatorze espécies de palinomorfos foram identificadas. A análise de agrupamento em modo-R mostrou a existência de assembléias de foraminíferos e quatro de palinomorfos. A análise em CCA demonstrou que a turbidez e a matéria orgânica como os parâmetros de maior influência na distribuição dos foraminíferos tecamebas no Araguari. A análise de agrupamento em Modo-Q usando todos os dados formou quarto grupos de estações que sugerem a existência de três zonas estuarinas: Zona I - composta por tecamebas e palinomorfos continentais; Zona II - compostas por foraminíferos de manguezal, acritacos e todas as assembléias de palinomorfos; e Zona III - composta por foraminíferos de manguezal e estuarinos e por todas as assembléias de palinomorfos.

Cattle-Derived Microsatellite Markers to Study the Water Buffalo Genome

Microsatellites are well-known DNA markers used in a variety of studies such as genome mapping, genetic diversity analysis, genetic conservation and phylogenetic studies. Although microsatellites are important markers, their development and characterization demands extensive time and high cost. Thus, before new markers are developed for a particular species, it is worthwhile to test the available markers from related species. In the present study, we evaluate cattle-derived microsatellite markers for genetic studies of water buffalo. Eighty-five percents of a total of 120 microsatellite markers were optimized using buffalo DNA (Bubalus bubalis). The results showed in this paper were also deposited in the National Center for Biological Information database (NCBI) (ProbeDB and UniSTS) for use in population genetic studies of buffalo by the scientific community. The use of heterologous primers significantly reduces the cost of developing specific markers for buffalo, providing a useful short cut for the genetic population analysis and gene mapping studies.

A mathematical approach to simulate spatio-temporal patterns of an insect-pest, the corn rootworm Diabrotica speciosa (Coleoptera: Chrysomelidae) in intercropping systems

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Avaliação de genótipos de cártamo quanto ao desempenho agronômico, divergência genética e produtividade da água

Pós-graduação em Agronomia (Agricultura) - FCA

Non-hematopoietic PAR-2 is essential for matriptase-driven pre-malignant progression and potentiation of ras-mediated squamous cell carcinogenesis

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Long-term clinical evaluation of the color stability and stainability of acrylic resin denture teeth

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Male-specific contributions to the Brazilian population of Espirito Santo

Y chromosome markers have been widely studied due to their various applications in the fields of forensic and evolutionary genetics. In this study, 35 Y-SNPs and 17 Y-STRs were genotyped in 253 males from the State of Espirito Santo, Brazil. A total of 18 haplogroups and 243 haplotypes were detected; the haplogroup and haplotype diversities were 0.7794 and 0.9997, respectively. Genetic distance analysis using the Y-STR data showed no statistically significant differences between Espirito Santo and other admixed populations from Brazil. The classification of paternal lineages based on haplogroups showed a predominant European contribution (85.88 %), followed by African (11.37 %) and Amerindian (2.75 %) contributions.