Avaliação espectral de solos desenvolvidos em uma toposseqüência de diabásio e folhelho da região de Piracicaba, SP

Este trabalho teve como objetivo estudar as alterações de solosdesenvolvidos numa toposseqüência composta por diabásio e folhelho (Piracicaba, SP), e sua relação com os dados espectrais. Ocorrem na toposseqüência os solos Latossolo Roxo (LR), Latossolo Vermelho-Escuro (LE), Podzólico Vermelho-Escuro (PE), Litossolo (Li) e Aluvial (Al) dos quais foram coletadas amostras a três profundidades. Foram obtidos dados de reflectância bidirecional dessas amostras em laboratório com espectrorradiômetro na faixa de 350 a 2.500 nm. As alterações da reflectância das amostras de solo das camadas superficiais e subsuperficiais foram relacionadas às diferenças nos teores de matéria orgânica e argila, que foram parâmetros importantes na caracterização espectral dos solos. Ao longo da toposseqüência, ocorreram alterações nas características dos solos, principalmente nos teores de ferro e silte e na mineralogia, que influenciaram nos dados espectrais. Os solos desenvolvidos de diabásio apresentaram altos teores de ferro, o que refletiu em concavidades mais acentuadas nas curvas espectrais em 850 nm, e intensidades de reflectância menores, ao contrário dos solos desenvolvidos de folhelho. A reflectância do PE apresentou-se mais intensa do que o LR e LE. Os solos menos intemperizados Li e Al apresentaram intensidades de reflectância mais elevadas que os mais intemperizados, LR e LE.

Resposta espectral de solos em razão do ângulo de visada, da umidade e da rugosidade superficial

Este trabalho teve por objetivo avaliar as variações do fator de refletância bidirecional (FRB) de três séries de solo (McAllister, Stronghold e Epitaph) da microbacia experimental de Walnut Gulch (Arizona, EUA) em razão do ângulo de visada, da rugosidade superficial e do teor de umidade. Foram consideradas as faixas espectrais do visível e do infravermelho próximo e médio presentes no sensor TM, e os resultados foram expressos em termos de FRB em relação à resposta no Nadir (FRB relativo). O anisotropismo variou de solo para solo e foi maior nas menores faixas espectrais, nos ângulos de visada maiores localizados na direção do retroespalhamento, nos ângulos solar-zenitais maiores, e na condição de solo seco. No solo Epitaph (único solo submetido ao estudo de rugosidade) o anisotropismo foi também maior na superfície mais rugosa. Entretanto, uma melhor diferenciação entre as superfícies lisa e rugosa do solo Epitaph foi obtida na direção do espalhamento da energia refletida. Diferenças na escala e nos métodos de obtenção dos dados são apontadas como causas do realce do comportamento anisotrópico dos dados obtidos em condições de laboratório, em comparação com os dados de campo.

Membrane mu poly(A) signal and 3' flanking sequences function as a transcription terminator for immunoglobulin-encoding genes.

Developmentally regulated mechanisms involving alternative RNA splicing and/or polyadenylation, as well as transcription termination, are implicated in controlling the levels of secreted mu (mu s), membrane mu (mu m) and delta immunoglobulin (Ig) heavy chain mRNAs during B cell differentiation (mu gene encodes the mu heavy chain). Using expression vectors constructed with genomic DNA segments composed of the mu m polyadenylation signal region, we analyzed poly(A) site utilization and termination of transcription in stably transfected myeloma cells and in murine fibroblast L cells. We found that the gene segment containing the mu m poly(A) signals, along with 536 bp of downstream flanking sequence, acted as a transcription terminator in both myeloma cells and L cell fibroblasts. Neither a 141-bp DNA fragment (which directed efficient polyadenylation at the mu m site), nor the 536-bp flanking nucleotide sequence alone, were sufficient to obtain a similar regulation. This shows that the mu m poly(A) region plays a central role in controlling developmentally regulated transcription termination by blocking downstream delta gene expression. Because this gene segment exhibited the same RNA processing and termination activities in fibroblasts, it appears that these processes are not tissue-specific.

Identificação de impurezas e misturas em pó de café por meio de comportamento espectral e análise de imagens digitais

Para eliminar divergências na interpretação dos resultados e agilizar os atuais métodos de detecção de fraudes em café torrado e moído, foi estabelecido um método baseado na análise por imagem e fundamentado no princípio de que diferentes materiais de origem orgânica, como o pó de café, podem apresentar reflectâncias distintas em diferentes comprimentos de onda do espectro eletromagnético. Partiu-se da hipótese de que o pó de café adulterado, quando submetido a uma fonte artificial de iluminação, apresenta uma reflectância, nos canais vermelho (R), verde (G) e azul (B), diferente em relação à do pó de café não-adulterado. Após as etapas de limpeza, secagem e homogeneização, foram geradas imagens multiespectrais das amostras de café, por meio de uma lupa acoplada a uma câmara CCD (Charge Coupled Device). A quantificação das impurezas na amostra foi obtida utilizando-se curvas de calibração entre a área relativa obtida pela classificação supervisionada de imagens e a porcentagem de impurezas presentes nas amostras. Esse novo método permite agilidade da resposta, ausência de subjetividade nos resultados e não-destruição das amostras analisadas, e assegura um patamar mínimo de detecção de 95% das impurezas do produto.

Caracterização espectral de Paspalum notatum em diferentes níveis de adubação nitrogenada

As propriedades espectrais da vegetação podem ser utilizadas para o monitoramento das condições de crescimento da vegetação ao longo do ano, assim como a estimativa da produtividade das espécies, por meio de técnicas de sensoriamento remoto. Para tanto, é necessário, primeiramente, caracterizar espectralmente as espécies que compõem a vegetação de um ecossistema. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a reflectância do Paspalum notatum Flügge var. notatum crescendo em diferentes níveis de adubação nitrogenada. Foi realizado um experimento de campo na Estação Experimental Agronômica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul (30º5'22'' S e 51º39'8'' W), utilizando-se um espectrorradiômetro portátil, em parcelas de P. notatum adubadas com 0, 200 e 400 kg ha-1 de N. A resposta espectral do P. notatum foi alterada pelas variações na quantidade de biomassa do dossel, provocadas por diferenças nos níveis de adubação nitrogenada. Os aumentos na quantidade de biomassa provocaram diminuição da reflectância na porção visível do espectro e aumento na porção infravermelho, o que mostra que a análise da reflectância é um bom indicador das mudanças que ocorrem em um dossel.

Low environmental impact bleaching sequences for attaining high brightness level with eucalyptus SPP pulp

The alternatives used for minimizing the usage of chlorine dioxide in bleaching sequences included a hot acid hydrolysis (Ahot) stage, the use of hot chlorine dioxide (Dhot) and ozone stages at medium consistency and high consistency (Zmc and Zhc), in addition to stages with atmospheric hydrogen peroxide (P) and pressurized hydrogen peroxide (PO). The results were interpreted based on the cost of the chemical products, bleaching process yields and on minimizing the environmental impact of the bleaching process. In spite of some process restrictions, high ISO brightness levels were kept around 90 % brightness. Additionally, the inclusion of stages like acid hydrolysis, pressurized peroxide and ozone in the bleaching sequences provided an increase in operating flexibility, aimed at reducing environmental impact (ECF Light). The Dhot(EOP)D(PO) sequence presented lower operating cost for ISO brightness above 92 %. However, this kind of sequence was not allowed for closing the wastewater circuit, even partially. For ISO brightness level around 91%, the AhotZhcDP sequence presented a lower operating cost than the others

Modelling Bone Mineral Density in Swiss Breast Cancer Patients Treated with Letrozole, Tamoxifen and Sequences of Letrozole and Tamoxifen in the BIG 1-98 Study (SAKK 21/07).

Background: Bone health is a concern when treating early stage breast cancer patients with adjuvant aromatase inhibitors. Early detection of patients (pts) at risk of osteoporosis and fractures may be helpful for starting preventive therapies and selecting the most appropriate endocrine therapy schedule. We present statistical models describing the evolution of lumbar and hip bone mineral density (BMD) in pts treated with tamoxifen (T), letrozole (L) and sequences of T and L. Methods: Available dual-energy x-ray absorptiometry exams (DXA) of pts treated in trial BIG 1-98 were retrospectively collected from Swiss centers. Treatment arms: A) T for 5 years, B) L for 5 years, C) 2 years of T followed by 3 years of L and, D) 2 years of L followed by 3 years of T. Pts without DXA were used as a control for detecting selection biases. Patients randomized to arm A were subsequently allowed an unplanned switch from T to L. Allowing for variations between DXA machines and centres, two repeated measures models, using a covariance structure that allow for different times between DXA, were used to estimate changes in hip and lumbar BMD (g/cm2) from trial randomization. Prospectively defined covariates, considered as fixed effects in the multivariable models in an intention to treat analysis, at the time of trial randomization were: age, height, weight, hysterectomy, race, known osteoporosis, tobacco use, prior bone fracture, prior hormone replacement therapy (HRT), bisphosphonate use and previous neo-/adjuvant chemotherapy (ChT). Similarly, the T-scores for lumbar and hip BMD measurements were modeled using a per-protocol approach (allowing for treatment switch in arm A), specifically studying the effect of each therapy upon T-score percentage. Results: A total of 247 out of 546 pts had between 1 and 5 DXA; a total of 576 DXA were collected. Number of DXA measurements per arm were; arm A 133, B 137, C 141 and D 135. The median follow-up time was 5.8 years. Significant factors positively correlated with lumbar and hip BMD in the multivariate analysis were weight, previous HRT use, neo-/adjuvant ChT, hysterectomy and height. Significant negatively correlated factors in the models were osteoporosis, treatment arm (B/C/D vs. A), time since endocrine therapy start, age and smoking (current vs. never).Modeling the T-score percentage, differences from T to L were -4.199% (p = 0.036) and -4.907% (p = 0.025) for the hip and lumbar measurements respectively, before any treatment switch occurred. Conclusions: Our statistical models describe the lumbar and hip BMD evolution for pts treated with L and/or T. The results of both localisations confirm that, contrary to expectation, the sequential schedules do not seem less detrimental for the BMD than L monotherapy. The estimated difference in BMD T-score percent is at least 4% from T to L.

Análise espectral e temporal da cultura do café em imagens Landsat

A definição da resposta espectral da cultura do café é uma das etapas na identificação de lavouras cafeeiras em imagens de satélites de sensoriamento remoto, para fins de mapeamento e estimativa de área plantada. O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial das imagens adquiridas pelos satélites da série Landsat, no mapeamento da cultura do café para a previsão de safras. Foi feita uma análise temporal do comportamento espectral de lavouras de café-formação e café-produção por meio de imagens livres de nuvens adquiridas nos anos de 1999 e 2001. Também foi analisado o comportamento espectral das classes pastagem e mata, que compõem os alvos de maior ocupação na área de estudo. As imagens do período seco foram mais eficientes no mapeamento de lavouras de café-formação e café-produção. As imagens da banda 4 dos dois sensores apresentaram melhor diferenciação espectral entre café e os demais alvos da cena. A reflectância do café-produção apresentou grande variabilidade entre lavouras, que pode ser atribuída à idade, espaçamento de plantas, cultivar, indicando a necessidade de trabalho em campo para a correta identificação das lavouras de café nas imagens Landsat.

Numerous potentially functional but non-genic conserved sequences on human chromosome 21.

The use of comparative genomics to infer genome function relies on the understanding of how different components of the genome change over evolutionary time. The aim of such comparative analysis is to identify conserved, functionally transcribed sequences such as protein-coding genes and non-coding RNA genes, and other functional sequences such as regulatory regions, as well as other genomic features. Here, we have compared the entire human chromosome 21 with syntenic regions of the mouse genome, and have identified a large number of conserved blocks of unknown function. Although previous studies have made similar observations, it is unknown whether these conserved sequences are genes or not. Here we present an extensive experimental and computational analysis of human chromosome 21 in an effort to assign function to sequences conserved between human chromosome 21 (ref. 8) and the syntenic mouse regions. Our data support the presence of a large number of potentially functional non-genic sequences, probably regulatory and structural. The integration of the properties of the conserved components of human chromosome 21 to the rapidly accumulating functional data for this chromosome will improve considerably our understanding of the role of sequence conservation in mammalian genomes.

Interpolating and sampling sequences in finite Riemann surfaces

We provide a description of the interpolating and sampling sequences on a space of holomorphic functions on a finite Riemann surface, where a uniform growth restriction is imposed on the holomorphic functions.

Análise discriminante dos solos por meio da resposta espectral no nível terrestre

O objetivo deste trabalho foi desenvolver e avaliar um método para discriminação das classes de solos a partir de suas respostas espectrais, utilizando-se um sensor em laboratório. Os dados espectrais foram utilizados no desenvolvimento de modelos estatísticos para discriminar as classes de solos de uma área no sudoeste do Estado de São Paulo. Equações discriminantes foram desenvolvidas para as 18 classes. A resposta espectral foi obtida em amostras da porção superficial e da porção subsuperficial dos solos da área de estudo, num total de 370 amostras. As amostras foram coletadas em 185 ha, com uma tradagem por ha. Os resultados demonstraram que as classes de solos podem ser individualizadas e distinguidas pela análise discriminante. A análise registrou índices de acerto acima de 80% de determinação da classe de solo avaliada. O acerto global foi de 90,71% quando se utilizaram todas as classes para a geração dos modelos, e 93,44% quando se utilizaram as dez classes com maior número de indivíduos. O teste estatístico simulado mostrou-se eficiente na análise discriminante, com taxa média de acerto acima de 91%, com erro global de 8,8%. A análise demonstrou redução na qualidade do modelo quando aplicado para um subconjunto de 20% das amostras, com erro global de 33,9%. O método auxilia na discriminação de classes de solos pela sua reflectância, devido às interações físicas com a energia eletromagnética.

Comparação entre mapas de solos obtidos por sensoriamento remoto espectral e pelo método convencional

O meio científico carece de métodos que efetivem a utilização da espectroradiometria em mapeamentos de solos. O objetivo deste trabalho foi comparar o uso do sensoriamento remoto espectral com o método convencional, na obtenção de mapas de solos. Utilizando o mapa planialtimétrico como base, trinta pontos de amostragem foram demarcados na área de estudo. As amostras foram coletadas a 0-20, 40-60 e 80-100 cm de profundidade em cada ponto, todos georreferenciados, totalizando noventa amostras nas quais foram feitas as análises químicas, físicas e radiométricas. Os dados radiométricos foram obtidos em laboratório usando o espectrorradiômetro IRIS, na faixa de 400-2.500 nm. Pela análise e interpretação dos dados espectrais juntamente com as curvas de nível, obteve-se um mapa espectral detalhado de solos. Na mesma área foi obtido um mapa de solos detalhado pelo método convencional. Foram identificadas quatro classes de solos em ambos os mapas, com boa correlação, demonstrando que os dados espectrais podem ser utilizados como instrumento no mapeamento de solos. A utilização conjunta dos dados de sensoriamento remoto espectral, curvas de nível e trabalho de campo permite a obtenção do mapa detalhado de solos.

To differentiate complementary mri sequences to standard protocol in detecting degenerative inflammatory lumbar spine lesions

Purpose: To compare the additional informations obtainedwith axial and sagittal T2 weighted with fat saturation(T2FS) and T1 weighted with Gadolinium iv sequenceswith fat saturation (T1FSGd) to detect degenerativeinflammatory lumbar spine lesions.Materials and Methods: Our retrospective study included73 patients (365 lumbar levels) with lumbar spinedegenerative disease (25 males, 48 females, mean age56 years). MRI protocol was performed with T1 and T2weighted sagittal and T2 weighted axial sequences(standard protocol), axial and sagittal T2FS and T1FSGd.Images were independently analyzed by two musculoskeletalradiologists and a neurosurgeon. Two groups ofsequences were analyzed: standard + T2FS sequences(group 1), standard + T1FSGd sequences (group 2).Degenerative inflammatory lumbar spine lesions werenoted at each level in: anterior column (vertebralendplate), spinal canal (epidural and peri-radicular fat)and posterior column (facet joint with capsular recessand subchondral bone).Results: Degenerative inflammatory lesions were present in18% (66/365) of levels in group 1, and 48% (175/365) oflevels in group 2. In details, lesions were noted in group 1 and2 respectively:-in 44 and 66 levels for anterior column,-in22 and 131 levels for posterior column,-in 0 and 36 levelsfor spinal canal. All these differences were statisticallysignificant. Intra and Interobserver agreements were good.Conclusion: The T1FSGd sequence is more sensitive thanT2FS to show the degenerative inflammatory lumbar spinelesions, especially in spinal canal and posterior column.

Phylogenetics of Olea (Oleaceae) based on plastid and nuclear ribosomal DNA sequences: tertiary climatic shifts and lineage differentiation times.

BACKGROUND AND AIMS: The genus Olea (Oleaceae) includes approx. 40 taxa of evergreen shrubs and trees classified in three subgenera, Olea, Paniculatae and Tetrapilus, the first of which has two sections (Olea and Ligustroides). Olive trees (the O. europaea complex) have been the subject of intensive research, whereas little is known about the phylogenetic relationships among the other species. To clarify the biogeographical history of this group, a molecular analysis of Olea and related genera of Oleaceae is thus necessary. METHODS: A phylogeny was built of Olea and related genera based on sequences of the nuclear ribosomal internal transcribed spacer-1 and four plastid regions. Lineage divergence and the evolution of abaxial peltate scales, the latter character linked to drought adaptation, were dated using a Bayesian method. KEY RESULTS: Olea is polyphyletic, with O. ambrensis and subgenus Tetrapilus not sharing a most recent common ancestor with the main Olea clade. Partial incongruence between nuclear and plastid phylogenetic reconstructions suggests a reticulation process in the evolution of subgenus Olea. Estimates of divergence times for major groups of Olea during the Tertiary were obtained. CONCLUSIONS: This study indicates the necessity of revising current taxonomic boundaries in Olea. The results also suggest that main lines of evolution were promoted by major Tertiary climatic shifts: (1) the split between subgenera Olea and Paniculatae appears to have taken place at the Miocene-Oligocene boundary; (2) the separation of sections Ligustroides and Olea may have occurred during the Early Miocene following the Mi-1 glaciation; and (3) the diversification within these sections (and the origin of dense abaxial indumentum in section Olea) was concomitant with the aridification of Africa in the Late Miocene.