Fast training of self organizing maps for the visual exploration of molecular compounds

Visual exploration of scientific data in life science area is a growing research field due to the large amount of available data. The Kohonen’s Self Organizing Map (SOM) is a widely used tool for visualization of multidimensional data. In this paper we present a fast learning algorithm for SOMs that uses a simulated annealing method to adapt the learning parameters. The algorithm has been adopted in a data analysis framework for the generation of similarity maps. Such maps provide an effective tool for the visual exploration of large and multi-dimensional input spaces. The approach has been applied to data generated during the High Throughput Screening of molecular compounds; the generated maps allow a visual exploration of molecules with similar topological properties. The experimental analysis on real world data from the National Cancer Institute shows the speed up of the proposed SOM training process in comparison to a traditional approach. The resulting visual landscape groups molecules with similar chemical properties in densely connected regions.

Effect of patient age on management decisions in breast cancer: consensus from a national consultation

This qualitative study investigated the attitudes, perceptions, and practices of breast cancer specialists with reference to the effect of patient age on management decisions in breast cancer, and attempted to identify national consensus on this issue. One hundred thirty-three relevant specialists, including 75 surgeons and 43 oncologists, participated in a virtual consultation using e-mailed questionnaires and open-ended discussion documents, culminating in the development of proposed consensus statements sent to participants for validation. A strong consensus was seen in favor of incorporating minimum standards of diagnostic services, treatment, and care for older patients with breast cancer into relevant national guidance, endorsed by professional bodies. Similarly, an overwhelming majority of participants agreed that simple, evidence-based protocols or guidelines on standardizing assessment of biological and chronological age should be produced by the National Institute for Health and Clinical Excellence and the Scottish Medicines Consortium, developed in collaboration with specialist oncogeriatricians, and endorsed by professional bodies. A further recommendation that all breast cancer patient treatment and diagnostic procedures be undertaken in light of up-to-date, relevant scientific data met with majority support. This study was successful in gauging national specialist opinion regarding the effect of patient age on management decisions in breast cancer in the U.K.

Fontes de proteína e carboidratos para cães e gatos

O mercado de alimentos para cães e gatos absorve importante quantidade de proteínas e carboidratos, apesar disso poucos estudos existem sobre digestibilidade e energia metabolizável destes ingredientes. Arroz e milho têm sido considerados as melhores fontes de amido, mas demonstra-se que o sorgo é igualmente bem digerido por cães. Na interpretação dos estudos, deve-se distinguir os que empregaram farinhas ou amidos purificados dos que empregaram ingredientes moídos, como utilizado na fabricação de alimentos para animais de companhia. Além de sua digestibilidade e valor energético, amidos interferem na glicemia de cães, o que torna interessante se empregar, para animais em condições específicas, fontes de carboidrato que levem à menores respostas de glicose e insulina. Devido a elevada necessidade de proteína, ingredientes protéicos são importantes nas formulações. Proteínas de origem animal apresentam maior variação em composição química, qualidade e digestibilidade que as de origem vegetal. Farinhas de origem animal podem apresentar excesso de matéria mineral, limitando sua inclusão na fórmula, enquanto derivados protéicos vegetais apresentam diversos fatores anti-nutricionais que devem ser inativados durante seu processamento. Demonstra-se que proteínas vegetais apresentam boa digestibilidade e energia metabolizável para cães e gatos, sendo sua inclusão interessante para reduzir a matéria mineral da dieta, controlar o excesso de bases do alimento e manter adequada a digestibilidade do produto, neste sentido soja micronizada e o farelo de glúten de milho 60% se destacam em digestibilidade e teor de energia metabolizável. A farinha de vísceras de frango, dentre as proteínas de origem animal secas demonstra-se como a de melhor digestibilidade e energia metabolizável.

Medidas da dinâmica respiratória em crianças de quatro a dez anos

TEMA: medidas da dinâmica respiratória são freqüentemente utilizadas na clínica fonoaudiológica, mas poucos são os dados científicos destas na população infantil. OBJETIVO: estudar a dinâmica respiratória entre crianças que respiram pelo modo nasal. MÉTODO: o estudo foi realizado com uma amostra aleatória estratificada de 106 crianças respiradoras nasais de escolas da cidade de Marília / SP, entre quatro e dez anos de ambos os sexos. Foram realizadas as medidas de capacidade vital (CV), nas posições em pé e sentada, com e sem oclusão nasal; de tempo máximo de fonação (TMF) de vogais e consoantes sustentadas, além de fala em seqüência com a contagem de números. RESULTADOS: a medida média da CV na posição em pé com e sem oclusão nasal foi 1515,56 ml e 1538,67 ml respectivamente e na posição sentada, 1524 ml e 1539,15 ml respectivamente; o TMF das vogais em segundos foi: /a/ = 8,32 , /i/ = 8,61 e /u/ 8,42; o de consoantes foi: /s/ = 6,64 e /z/ = 7,65 e o de seqüência de números foi de 7,76 segundos. Resultados: observou-se que o tempo médio destas medidas aumentou progressivamente conforme as faixas etárias. Tanto para o TMF das vogais como, para o das consoantes, houve diferença estatística significante (p < 0,05) nas idades mais distantes, ou seja, entre quatro e dez anos, quatro e nove, e quatro e oito anos. em faixas etárias consecutivas não houve diferença estatística significante nos valores de CV. Houve forte associação entre a CV e o crescimento físico da criança. CONCLUSÃO: esse estudo mostrou medidas de dinâmica respiratória em crianças que podem ser úteis no diagnóstico e terapia fonoaudiológica. Outras pesquisas deveriam ser desenvolvidas para adicionais informações sobre o assunto.

Cholesterol reduction and lack of genotoxic or toxic effects in mice after repeated 21-day oral intake of lemongrass (Cymbopogon citratus) essential oil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Genetic variability in natural populations of Zeyheria montana mart. from the Brazilian Cerrado

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Piranha Attacks on Humans in Southeast Brazil: Epidemiology, Natural History, and Clinical Treatment, with Description of a Bite Outbreak

There are many tales describing ferocious schools of piranha attacking humans, but there are few scientific data supporting such behavior. The very few documented instances of humans attacked and eaten by piranha schools include 3 that occurred after death by other causes (eg, heart failure and drowning). These predaceous fishes, however, do occasionally injure bathers and swimmers in lakes and rivers. The characteristic profile of most injuries is a single bite per victim, generally related to the fish defending its brood. This paper describes an outbreak of piranha bites in a dammed river portion in southeast Brazil. The outbreak was caused by the speckled piranha, Serrasalmus spilopleura, a widespread species which benefits from the growing tendency of damming rivers all over Brazil. This article focuses on the epidemiological and clinical aspects of the injuries, as well as on piranha biology, to gain a better understanding of the natural history of bite outbreaks.

Efeitos citotóxicos de diferentes materiais dentários sobre células de linhagem odontoblástica

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análise dos fotoiniciadores presentes em resinas compostas em função da cor

Pós-graduação em Ciências Odontológicas - FOAR

Resposta de celúlas odontoblastóides MDPC-23 irradiadas com LED de 630nm

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Avaliação da aplicabilidade de sistema computacional de visualização de imagens aéreas de alta resolução em tempo real e multitemporal à degradação do rio Corumbataí

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Avaliação dos processos de trabalho dos centros de material e esterização dos hospitais públicos acreditados do estado de São Paulo: um estudo de caso

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Sobrevivência em microcosmo e em campo solarizado de fitopatógenos submetidos à fermentação acelerada de diferentes matériais orgânicos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Comparação da força de ruptura de alimentos teste entre três diferentes esquemas oclusais para próteses totais

Pós-graduação em Reabilitação Oral - FOAR

Impactos de atividades de exploração de petróleo e gás natural sobre a comunicação acústica de Mysticeti (ordem Cetacea): uma revisão

Acoustic communication is essential in mammals and has three main functions: acquisition of information about the environment, intraspecific communication and detection of predators and prey. Studies indicate that the introduction of sounds produced by anthropogenic activities such as military exercises, use of sonar and activities related to the extraction of oil and natural gas can cause interference in cetacean communication. Recently, the discovery of pre-salt tends to increase these activities. After a decade since the launch date of IBAMA`s licensing and before the imminent increase in exploration activities in Brazil, it is essential to conduct studies to monitor closely the impact of this type of activity on the marine ecosystem. Thus, this study aims to identify potential impacts that the process of oil and natural gas exploration and production might have on the communication of baleen whales. Data from literature on bioacoustics and ecology of these animals were linked with technical-scientific data regarding this type of activity. 310 documents related to the topic were analyzed. Among them only 81 documents are of academic origin, and the others mostly action plans and reports from government agencies. 80% of the documents do not have any species as a focus, and in the remaining 20%, 17% were focused on the Greenland Whale (Balaena mysticetus) and 22% on the gray whale (Eschrichtius robustus). The main impacts identified in this study were the increased frequency and amplitude of vocalization, reduction or cessation of more elaborate songs and masking problems