MarA-mediated transcriptional repression of the rob promoter

The Escherichia coli transcriptional regulator MarA affects functions that include antibiotic resistance, persistence, and survival. MarA functions as an activator or repressor of transcription utilizing similar degenerate DNA sequences (marboxes) with three different binding site configurations with respect to the RNA polymerase-binding sites. We demonstrate that MarA down-regulates rob transcripts both in vivo and in vitro via a MarA-binding site within the rob promoter that is positioned between the -10 and -35 hexamers. As for the hdeA and purA promoters, which are repressed by MarA, the rob marbox is also in the "backward" orientation. Protein-DNA interactions show that SoxS and Rob, like MarA, bind the same marbox in the rob promoter. Electrophoretic mobility shift analyses with a MarA-specific antibody demonstrate that MarA and RNA polymerase form a ternary complex with the rob promoter DNA. Transcription experiments in vitro and potassium permanganate footprinting analysis show that MarA affects the RNA polymerase-mediated closed to open complex formation at the rob promoter.

The Escherichia coli transcriptional regulator MarA directly represses transcription of purA and hdeA

The Escherichia coli MarA protein mediates a response to multiple environmental stresses through the activation or repression in vivo of a large number of chromosomal genes. Transcriptional activation for a number of these genes has been shown to occur via direct interaction of MarA with a 20-bp degenerate asymmetric "marbox" sequence. It was not known whether repression by MarA was also direct. We found that purified MarA was sufficient in vitro to repress transcription of both purA and hdeA. Transcription and electrophoretic mobility shift experiments in vitro using mutant promoters suggested that the marbox involved in the repression overlapped the -35 promoter motif and was in the "backward" orientation. This organization contrasts with that of the class II promoters activated by MarA, in which the marbox also overlaps the -35 motif but is in the "forward" orientation. We conclude that MarA, a member of the AraC/XylS family, can act directly as a repressor or an activator, depending on the position and orientation of the marbox within a promoter.

Distribución de los recursos pesqueros de mayor abundancia a fines del invierno 1998. Crucero BIC Humboldt y BIC Jose Olaya Balandra 9808-09 de Paita a Tacna

Describe la distribución de abundancia de diversos recursos pelágicos y demersales: anchoveta (Engraulis ringens), sardina (Sardinops sagax), jurel (Trachurus picturatus murphyi), caballa (Scomber japonicus peruanus), samasa (Anchoa nasus), Vinciguerria lucetia, falso volador (Prionotus stephanophrys), bagre (Galeichthys peruvianus), pez cinta (Trichiurus lepturus) y múnida (Pleuroncodes monodon). Como plataformas de muestreo en el Cr. 9808-09, se utilizaron: para la zona Paita al Callao: el BIC Humboldt y la lancha IMARPE IV; y para la zona Los Palos (Tacna) al Callao, el BIC José Olaya Balandra y la lancha IMARPE V. Para la distribución de abundancia se utilizaron las ecosondas científicas SIMRAD EK 500 con frecuencias de 38 y 120 kHz de ambos buques, en un rango de detección de 3,5 a 400 m de profundidad, distribuidos en nueve capas de integración. Para el muestreo acústico se utilizó una grilla sistemática paralela con una separación de 12 mn entre cada transecto; se realizaron en total 352 laces de pesca. Las áreas de distribución de cada recurso se determinaron mediante un programa de software de interpolación de datos.

Aspectos biológicos pesqueros de los recursos pelágicos durante el crucero BIC Humboldt y BIC Jose Olaya Balandra 9808-09 entre los palos (Tacna) y Callao

Informe de los resultados de los análisis biológico-pesqueros realizados a las capturas efectuadas por el BIC José Olaya Balandra y la LP IMARPE V, durante el Crucero de Evaluación de Recursos Pelágicos 9808-09, del 20 de agosto al 18 de setiembre 1998, entre la frontera sur y el Callao. Se realizaron 160 lances de comprobación entre ambas embarcaciones. Se obtuvo una captura total de 7.682,6 kg, constituidas por anchoveta (Engraulis ringens) 8,8%; jurel (Trachurus picturatus) 0,1%; caballa (Scomber japonicus) 0,1%. Entre otras especies capturadas tenemos al falso volador (Prionotus stephanophrys) 35,5%; Vinciguerria lucetia 12,1%; samasa (Anchoa nasus) 7,1% y múnida (Pleuroncodes monodon) 10,9%.

Biomasas de las principales especies recursos pesqueros durante el verano 1999. Crucero BIC Jose Olaya Balandra 9902-03, de Tumbes a Tacna

Se describe la biomasa de los principales recursos encontrados durante este crucero de evaluación hidroacústica: anchoveta, sardina, jurel, caballa, samasa, vinciguerria, falso volador, bagre, pez cinta, entre otros.

Distribución de los recursos pesqueros de mayor abundancia en verano 1999. Crucero BIC Jose Olaya Balandra 9902-03, de Tumbes a Tacna

Describe la distribución de los recursos pesqueros: anchoveta (Engraulis ringens), sardina (Sardinops sagax), jurel (Trachurus picturatus murphyi), caballa (Scomber japonicus), samasa (Anchoa nasus), vinciguerria (Vinciguerria lucetia), falso volador (Prionotus stephanophrys), bagre (Galeichthys peruvianus), pota (Dosidicus gigas), múnida (Pleuroncodes monodon) y pez cinta (Trichiurus lepturus), que por su abundancia fueron considerados en esta evaluación. Para la prospección marina de Punta Zorritos (Tumbes) a Morro Sama (Tacna) se utilizó al BIC José Olaya Balandra y para los muestreos costeros a la LP IMARPE V, entre los días 10 de febrero y 1° de abril de 1999. Para la determinación de la distribución se utilizó la ecosonda científica SIMRAD EK 500 de 38 y 120 kHz, en un rango de detección de 2,5 a 250 m de profundidad. Para el muestreo acústico se utilizó una grilla sistemática paralela con una separación de 15 mn entre cada transecto; se realizaron en total 336 lances de pesca para muestreos acústicos y biológicos. Las áreas de distribución de cada especie se determinaron mediante un programa de software de interpolación de datos.