Purification and characterization of the human Rad51 protein, an analogue of E. coli RecA.

In bacteria, genetic recombination is catalysed by RecA protein, the product of the recA gene. A human gene that shares homology with Escherichia coli recA (and its yeast homologue RAD51) has been cloned from a testis cDNA library, and its 37 kDa product (hRad51) purified to homogeneity. The human Rad51 protein binds to single- and double-stranded DNA and exhibits DNA-dependent ATPase activity. Using a topological assay, we demonstrate that hRad51 underwinds duplex DNA, in a reaction dependent upon the presence of ATP or its non-hydrolysable analogue ATP gamma S. Complexes formed with single- and double-stranded DNA have been observed by electron microscopy following negative staining. With nicked duplex DNA, hRad51 forms helical nucleoprotein filaments which exhibit the striated appearance characteristic of RecA or yeast Rad51 filaments. Contour length measurements indicate that the DNA is underwound and extended within the nucleoprotein complex. In contrast to yeast Rad51 protein, human Rad51 forms filaments with single-stranded DNA in the presence of ATP/ATP gamma S. These resemble the inactive form of the RecA filament which is observed in the absence of a nucleotide cofactor.

The major genetic determinants of HIV-1 control affect HLA class I peptide presentation.

Infectious and inflammatory diseases have repeatedly shown strong genetic associations within the major histocompatibility complex (MHC); however, the basis for these associations remains elusive. To define host genetic effects on the outcome of a chronic viral infection, we performed genome-wide association analysis in a multiethnic cohort of HIV-1 controllers and progressors, and we analyzed the effects of individual amino acids within the classical human leukocyte antigen (HLA) proteins. We identified >300 genome-wide significant single-nucleotide polymorphisms (SNPs) within the MHC and none elsewhere. Specific amino acids in the HLA-B peptide binding groove, as well as an independent HLA-C effect, explain the SNP associations and reconcile both protective and risk HLA alleles. These results implicate the nature of the HLA-viral peptide interaction as the major factor modulating durable control of HIV infection.

Caracterización morfométrica y aspectos filogenéticos de cepas de rotíferos del grupo Brachionus plicatilis (rotifera: brachionidae) utilizados en la acuicultura peruana

En la actualidad, los acuicultores del mundo tienen la necesidad de disponer de cepas de rotíferos debidamente determinadas y caracterizadas, para poder optimizar el cultivo en masa de estos y evitar las posibles mortalidades repentinas en los sistemas de cultivo. En este contexto, es necesario también identificar las cepas peruanas e introducidas que están vienen siendo utilizadas para acuicultura en el Perú. Por lo que en el presente trabajo se realizó la caracterización morfométrica de las cepas peruanas, Tumbes (TP), Puerto Viejo 2 (PVL2), Ventanilla (VL) y de 2 cepas introducidas cepa FONDEPES (CF) y Universidad Agraria "La Molina" (CA). EI estudio morfométrico se realizó con rotíferos de la misma cohorte, los cuales fueron cultivados bajo el diseño del jardín común. Como cepas patrón se utilizaron 3 cepas de las especies de rotíferos del complejo Brachionus plicatilis (Brachionus plicatilis s. s. (cepa L 1), B. rotundiformis (cepa SS2) y B. ibericus (cepa SM2). La caracterización morfométrica se realizó mediante el análisis discriminante por pasos, utilizando para ello 9 caracteres morfométricos, y como confirmación se realizaron 6 análisis de varianza entre las proporciones de los caracteres medidos.

Tortugas marinas durante el 2010 en Pisco, Perú

Durante el 2010, se capturó 55 ejemplares de tortuga verde Chelonia mydas en La Aguada (13°51’S y 76°15’W) al sureste de la bahía de Paracas; el número promedio de tortugas capturadas por kilómetro de red tendida fue 3,08±2,5; el tamaño promedio de la LCC fue 60,3±10,5cm; el 78% de los ejemplares presentaron el patrón 5c, 4d, 4i y 11d, 11i, para los escudos centrales, costales y marginales, respectivamente. La TSM donde se capturaron varió entre 15,2 y 20,9 °C, la mayor ocurrencia de tortugas se registró de 18,5 a 20 °C. Los epibiontes más representativos fueron Platylepas hexastylos (56,8%), Conchoderma virgatum (26,9%) y Chelonibia testudinaria (13,3%); la ocurrencia de los ítems alimenticios: Clorophyta (78%), Rhodophyta (30%), Cnidaria (43%), Crustacea (43%), Polichaeta (17%), Mollusca (17%), arena (26%) y plástico (17%); el 72% de las tortugas presentaron cobertura algal, de las cuales el 65% fue el alga verde Enteromorpha sp.

The meiosis-specific recombinase hDmc1 forms ring structures and interacts with hRad51.

Eukaryotic cells encode two homologs of Escherichia coli RecA protein, Rad51 and Dmc1, which are required for meiotic recombination. Rad51, like E.coli RecA, forms helical nucleoprotein filaments that promote joint molecule and heteroduplex DNA formation. Electron microscopy reveals that the human meiosis-specific recombinase Dmc1 forms ring structures that bind single-stranded (ss) and double-stranded (ds) DNA. The protein binds preferentially to ssDNA tails and gaps in duplex DNA. hDmc1-ssDNA complexes exhibit an irregular, often compacted structure, and promote strand-transfer reactions with homologous duplex DNA. hDmc1 binds duplex DNA with reduced affinity to form nucleoprotein complexes. In contrast to helical RecA/Rad51 filaments, however, Dmc1 filaments are composed of a linear array of stacked protein rings. Consistent with the requirement for two recombinases in meiotic recombination, hDmc1 interacts directly with hRad51.

Safe and effective variability-a criterion for dose individualization.

BACKGROUND: : A primary goal of clinical pharmacology is to understand the factors that determine the dose-effect relationship and to use this knowledge to individualize drug dose. METHODS: : A principle-based criterion is proposed for deciding among alternative individualization methods. RESULTS: : Safe and effective variability defines the maximum acceptable population variability in drug concentration around the population average. CONCLUSIONS: : A decision on whether patient covariates alone are sufficient, or whether therapeutic drug monitoring in combination with target concentration intervention is needed, can be made by comparing the remaining population variability after a particular dosing method with the safe and effective variability.

Rutas cinematográficas hacia la imagen platónica de la caverna

El objetivo de este artículo es demostrar la posibilidad de llegar también a la imagen platónica de l caverna desde el cine. En este sentido se puede hablar de referencias explícitas como en el caso de El conformista de B. Bertolucci o Shadowlands de R. Attenborough, si se tienen presentes las Crónicas de Narnia de C. S. Lewis- o The Picture of Dorian Gray -si se tiene presenta la novela de Oscar Wilde-, pero, en otras ocasiones, pese a que la influencia platónica no pueda ser demostrada, por ejemplo en The Truman Show, A Room with a View o Brideshead Revisited, podemos servirnos perfectamente de estas películas para guiar al público contemporáneo hacia aquella imagen platónica, ya que el mismo platón demuestra que se trata de una imagen aplicable y, en primer lugar, a su filosofía idealista.

Cinema Roads to the Platonic Image of the Cave

The aim of this article is to prove the real possibility of travelling intellectually to the Platonic image of the cave from different films. In this sense, one can speak of explicit references as in The Conformist by B. Bertolucci or in Shadowlands by R. Attenborough -if one bears in mind the Chronicles of Narnia by C. S. Lewis- or The Picture of Dorian Gray ¿if one bears in mind the well-known O. Wilde¿s novel-, but, on other occasions, although the Platonic influence cannot be proved, for instance in The Truman Show, A Room with a View or Brideshead Revisited, one can perfectly think of these films in order to guide the contemporary audiences to that Platonic image, since Plato himself affirms that it deals with an image which can be easily applied and, in first place, to his idealistic philosophy.

Rutes cinematogràfiques vers la imatge platònica de la caverna

L'objectiu d'aquest article és demostrar la possibilitat d'arribar també a la imatge platònica de la caverna des del cinema. En aquest sentit es pot parlar de referències explícites, com en el cas de El conformista de B. Bertolucci, o Shadowlands -si es tenen presents les Cròniques de Nàrnia de C. S. Lewis- o The Picture of Dorian Gray -si es té present la novel·la d'Oscar Wilde-, però, en d'altres ocasions, tot i que la influència platònica no pugui ser demostrada, per exemple a The Truman Show, A Room with a View o Brideshead Revisited, podem emprar perfectament aquestes pel·lícules per menar el públic contemporani vers aquella imatge platònica, ja que el mateix Plató demostra que es tracta d¿una imatge aplicable i, en primer lloc, a la seva filosofia idealista.

The Escherichia coli RuvB branch migration protein forms double hexameric rings around DNA.

The RuvB protein is induced in Escherichia coli as part of the SOS response to DNA damage. It is required for genetic recombination and the postreplication repair of DNA. In vitro, the RuvB protein promotes the branch migration of Holliday junctions and has a DNA helicase activity in reactions that require ATP hydrolysis. We have used electron microscopy, image analysis, and three-dimensional reconstruction to show that the RuvB protein, in the presence of ATP, forms a dodecamer on double-stranded DNA in which two stacked hexameric rings encircle the DNA and are oriented in opposite directions with D6 symmetry. Although helicases are ubiquitous and essential for many aspects of DNA repair, replication, and transcription, three-dimensional reconstruction of a helicase has not yet been reported, to our knowledge. The structural arrangement that is seen may be common to other helicases, such as the simian virus 40 large tumor antigen.

Calidez maternal y problemas de ajuste interno y extremo de los preadolescentes: mediación via seguridad emocional

Podeu consultar les jornades completes a: http://hdl.handle.net/2445/46286

Complex formation by the human RAD51C and XRCC3 recombination repair proteins.

In vertebrates, the RAD51 protein is required for genetic recombination, DNA repair, and cellular proliferation. Five paralogs of RAD51, known as RAD51B, RAD51C, RAD51D, XRCC2, and XRCC3, have been identified and also shown to be required for recombination and genome stability. At the present time, however, very little is known about their biochemical properties or precise biological functions. As a first step toward understanding the roles of the RAD51 paralogs in recombination, the human RAD51C and XRCC3 proteins were overexpressed and purified from baculovirus-infected insect cells. The two proteins copurify as a complex, a property that reflects their endogenous association observed in HeLa cells. Purified RAD51C--XRCC3 complex binds single-stranded, but not duplex DNA, to form protein--DNA networks that have been visualized by electron microscopy.

Identificación de mega‑ambientes para potenciar el uso de genotipos superiores de arroz en Panamá

El objetivo de este trabajo fue evaluar tres métodos para identificar mega‑ambientes, para optimizar el uso del potencial genético de los cultivares de arroz, durante el proceso de selección, y para hacer recomendaciones sobre siembras comerciales en Panamá. Los datos experimentales fueron obtenidos de los ensayos de productividad de cultivares precoces realizados entre 2006 y 2008. Para lograr la estratificación de los ambientes y definir los mega‑ambientes, se utilizaron los métodos del genotipo vencedor mediante el modelo AMMI1, el modelo biplot GGE y el de conglomerado por el método de Ward, complementado con el biplot GGE. Los tres métodos utilizados identificaron dos mega‑ambientes, donde los cultivares sobresalientes fueron Fedearroz 473 e Idiap 145‑05. Hubo una coincidencia de 100% en el agrupamiento del conglomerado x el biplot GGE, mientras que entre conglomerado x AMMI1 y biplot GGE x AMMI1 fue de 95,2%. El genotipo más estable, en ambos mega‑ambientes, fue el cultivar Idiap 145‑05, lo que indica capacidad de adaptación amplia y específica. La capacidad adaptativa de los genotipos superiores y no las condiciones agroclimáticas de las localidades evaluadas fue responsable de la definición de los mega‑ambientes.