Índice de dissincronia ventricular: comparação com a fração de ejeção bidimensional e tridimensional

FUNDAMENTO: O acoplamento eletromecânico (sincronia) do ventrículo esquerdo (VE) tem importância na análise da performance sistólica, especialmente para a indicação da terapia de ressincronização cardíaca em pacientes com ICC avançada. OBJETIVO: Comparar a sincronia do VE analisada com ecocardiograma (eco) tridimensional (3D) em tempo real com medidas de FEVE obtidas com ECO 2D e 3D. MÉTODOS: Estudo prospectivo de 92 indivíduos (56 homens, 47±10 anos), 60 com anatomia cardíaca (eco) e ECG normais (Grupo N), 32 com cardiomiopatia dilatada (Grupo CMD). Com o emprego do ECO 3D foram aferidos FEVE, volumes e índice de dissincronia (ID)% para 16 segmentos do VE; com o ECO 2D foram medidos FEVE (método de Simpson) e volumes sistólico e diastólico do VE. Análise estatística: coeficiente de correlação (Pearson), 95% IC, teste de regressão linear, teste de Bland & Altman, p<0,05. RESULTADOS: O ID% variou de 0,2900 a 28,1000 (5,2014±6,3281), a FEVE 3D variou de 0,17 a 0,81 (0,52±0,17); a FEVE 2D variou de 0,3 a 0,69 (0,49±0,11). A correlação entre ID e FEVE 3D foi (r): -0,7432, p<0,0001, IC: -0,8227 a -0,6350, a relação linear entre ID (x) e FEVE 3D (y) foi y = 19,8124 + (-27,9578) x , p<0,0001. A correlação entre ID e FEVE 2D foi (r): -0,7012, p<0,0001, IC: -0,7923 a -0,5797. CONCLUSÃO: Nesta casuística foi observada boa correlação negativa entre o acoplamento sistólico tridimensional eletromecânico do VE e a FEVE medida ao ecocardiograma (3D e 2D).

EFECTO DE LA TERAPIA FOTODINAMICA SOBRE EL MICROAMBIENTE TUMORAL COMO ESTRATEGIA ANTINEOPLASICA: VALORACION DE LA RESPUESTA INTEGRAL EN MODELOS DE CULTIVO TRIDIMENSIONAL.

El carcinoma colorrectal es una de las neoplasias más comunes y es la segunda causa de muerte por cáncer luego del cáncer de pulmón. La principal causa de muerte de los individuos que padecen esta enfermedad es la metástasis hepática. La angiogénesis está asociada con la progresión y metástasis de dicho cáncer, afectando la supervivencia del paciente, y ocasionando la mayoría de las muertes. El crecimiento de nuevos vasos sanguíneos en relación al crecimiento tumoral, es un proceso complejo. En 1971, Judat Folkman postuló la hipótesis: “el crecimiento tumoral es angiogénesis dependiente y que la inhibición de la angiogénesis podría ser terapéutica”. La Terapia fotodinámica es una modalidad terapéutica que utiliza compuestos fotosensibilizadores (FSs) que se acumulan en tejidos tumorales y una vez excitados por la luz actúan mediante 3 mecanismos principales: muerte directa de la célula tumoral; daño de la vasculatura tumoral; y respuesta inmunológica. La inhibición del proceso angiogénico presenta claras ventajas debido a la casi inexistencia, en individuos adultos, de neovascularización en condiciones fisiológicas normales. El desarrollo de ambientes celulares de arquitectura tridimensional es clave para simular las condiciones que gobiernan en el microambiente tumoral ya que las interacciones célula - célula juegan un papel clave en eventos fisiológicos tal como la angiogénesis. Por lo tanto, postulamos que el impacto de la TFD sobre los componentes del ambiente tumoral permitirá modular el proceso angiogénico como estrategia antitumoral. Los objetivos planteados son: I) Investigar la susceptibilidad individual de las de células endoteliales y tumorales a la TFD en la expresión y alteración de moléculas relevantes en angiogénesis. II) Examinar la respuesta de “células endoteliales fotosensibilizadas” al estímulo tumoral para comprender la regulación del proceso angiogénico 2D y 3D. III) Examinar la respuesta a la TFD vascular y TFD tumoral, determinando la eficacia de la doble terapéutica en revertir el proceso de angiogénesis 2D y 3D. IV) Investigar la capacidad estimulante de las “células tumorales fotosensibilizadas” de inducir angiogénesis en modelos in vivo. Para cumplir con los objetivos se propone evaluar: a) La expresión de factores proangiogénicos, moléculas de adhesión, invasividad y migración de células microendoteliales humanas y de adenocarcinoma de colon, comparando modelos de monocultivos 2D y 3D. b) La capacidad de las células tumorales, con diferente malignidad, de promover en las células endoteliales tratadas con TFD estímulos de: proliferación, migración, formación de tubos y quimiotáxis. c) La capacidad de la TFD en modular la respuesta parácrina que participa en la progresión tumoral. d) La implicancia en la respuesta a la TFD de factores de crecimiento y receptores celulares por siRNA o anticuerpos bloqueantes. e) La respuesta angiogénica in vivo mediante el uso de implantes de matrigel con células tumorales o sobrenadantes tratados con TFD. Este trabajo aportará conocimientos sobre el dialogo tumor-endotelio y la susceptibilidad de ese estímulo a la TFD. Además, se determinarán blancos terapéuticos que incrementen su efectividad en relación al proceso angiogénico. Las interacciones entre las células tumorales y endoteliales son relevantes en la angiogénesis tumoral. Por ello, nuevas y más eficientes terapéuticas involucran estrategias combinadas que se dirigen hacia las células tumorales y su entorno, el cual está compuesto por células endoteliales, perivasculares, y matriz extracelular. El abordaje de esta problemática de manera integrada hace suponer encontrar una solución más específica al tratamiento del cáncer. Se espera, según los resultados obtenidos, poder optimizar y/o modular la intervención terapéutica de la acción fotodinámica sobre blancos moleculares del proceso angiogénico.

Lipschitz harmonic capacity and Bilipschitz images of cantor sets

For bilipschitz images of Cantor sets in Rd we estimate the Lipschitz harmonic capacity and show this capacity is invariant under bilipschitz homeomorphisms.

Interfície tridimensional EGP TV digital

En este proyecto se presenta una aplicación capaz de recibir la televisión digital y representar la información que contiene en un entorno de producción de gráficos tridimensionales. Esto conlleva recoger y procesar el flujo de transporte para más de un servicio, procesar las diferentes tablas de información, implementar mecanismos para representar la información audiovisual en un entorno tridimensional y construir una interfaz de usuario con los datos recogidos.

Images in clinical urology. Nail of glans penis.

A 56-year-old man presented with a "nail" growing at the base of his glans penis. The tumor was locally excised, and microscopic examination revealed papillomatosis and hyperkeratosis of the malpighian epithelium, with a strong inflammatory reaction of the chorion and signs of local microinvasion, as well as the presence of well-differentiated squamous epithelial cells. The surgical margins were negative. The differential diagnosis was made between a benign papillomatous proliferation and verrucous carcinoma.

Development of a tool for the construction of "ground truth" for complex color images with text

Aquesta memoria resumeix el treball de final de carrera d’Enginyeria Superior d’Informàtica. Explicarà les principals raons que han motivat el projecte així com exemples que il·lustren l’aplicació resultant. En aquest cas el software intentarà resoldre la actual necessitat que hi ha de tenir dades de Ground Truth per als algoritmes de segmentació de text per imatges de color complexes. Tots els procesos seran explicats en els diferents capítols partint de la definició del problema, la planificació, els requeriments i el disseny fins a completar la il·lustració dels resultats del programa i les dades de Ground Truth resultants.

Détectabilité extra-fovéale sur des images anatomiques

Contexte¦- Les métastases hépatiques hypovasculaires sont parfois difficile à détecter car très polymorphiques et fréquemment irrégulières. Leurs contrastes sur CT scan hépatique sont souvent faibles.¦- Lors d'un diagnostic, le radiologue ne fixe pas sa vision fovéale sur chaque pixel de l'image. Les expériences de psychophysique avec eye-tracker montrent en effet que le radiologue se concentre sur quelques points spécifiques de l'image appelés fixations. Dans ce travail, nous nous intéresserons aux capacités de détection de l'oeil lorsque l'observateur effectue une saccade entre deux points de fixation. Plus particulièrement, nous nous intéresserons à caractériser les capacités de l'oeil à détecter les signaux se trouvant en dehors de sa vision fovéale, dans ce qu'on appelle, la vision périphérique.¦Objectifs¦- Caractériser l'effet de l'excentricité de la vision sur la détectabilité des contrastes dans le cas de métastases hépatiques hypovasculaires.¦- Récolter des données expérimentales en vue de créer un modèle mathématique qui permettra, à terme, de qualifier le système d'imagerie.¦- → objectifs du TM en soit :¦o prendre en main l'eyetracker¦o traduire une problématique médicale en une expérience scientifique reproductible, quantifiable et qualifiable.¦Méthode¦Nous effectuons une expérience 2AFC (2 Alternative Forced-Choice experiment) afin d'estimer la détectabilité du signal. Pour cela, nous forcerons l'observateur à maintenir son point de fixation à un endroit défini et vérifié par l'eye-tracker. La position del'excentricité du signal tumoral généré sur une coupe de CT hépatique sera le paramètre varié. L'observateur se verra présenté tour à tour deux coupes de CT hépatique, l'une comportant le signal tumoral standardisé et l'autre ne comportant pas le signal. L'observateur devra déterminer quelle image contient la pathologie avec la plus grande probabilité.¦- Cette expérience est un modèle simplifié de la réalité. En effet, le radiologue ne fixe pas un seul point lors de sa recherche mais effectue un "scanpath". Une seconde expérience, dite en free search sera effectuée dans la mesure du temps à disposition. Lors de cette expérience, le signal standardisé sera connu de l'observateur et il n'y aura plus de point de fixation forcée. L'eyetracker suivra le scanpath effectué par l'oeil de l'observateur lors de la recherche du signal sur une coupe de CT scan hépatique. L'intérêt de cette expérience réside dans l'observation de la corrélation entre les saccades et la découverte du signal. Elle permet aussi de vérifier les résultats obtenus lors de la première expérience.¦Résultats escomptés¦- Exp1 : Quantifier l'importance de l'excentricité en radiologie et aider à améliorer la performance de recherche.¦- Exp 2 : tester la validité des résultats obtenus par la première expérience.¦Plus value escomptée¦- Récolte de données pour créer un modèle mathématique capable de déterminer la qualité de l'image radiologique.¦- Possibilité d'extension à la recherche dans les trois dimensions du CT scan hépatique.

Central and Cortical Gray Mater Segmentation of Magnetic Resonance Images of the Fetal Brain

Motivation. The study of human brain development in itsearly stage is today possible thanks to in vivo fetalmagnetic resonance imaging (MRI) techniques. Aquantitative analysis of fetal cortical surfacerepresents a new approach which can be used as a markerof the cerebral maturation (as gyration) and also forstudying central nervous system pathologies [1]. However,this quantitative approach is a major challenge forseveral reasons. First, movement of the fetus inside theamniotic cavity requires very fast MRI sequences tominimize motion artifacts, resulting in a poor spatialresolution and/or lower SNR. Second, due to the ongoingmyelination and cortical maturation, the appearance ofthe developing brain differs very much from thehomogenous tissue types found in adults. Third, due tolow resolution, fetal MR images considerably suffer ofpartial volume (PV) effect, sometimes in large areas.Today extensive efforts are made to deal with thereconstruction of high resolution 3D fetal volumes[2,3,4] to cope with intra-volume motion and low SNR.However, few studies exist related to the automatedsegmentation of MR fetal imaging. [5] and [6] work on thesegmentation of specific areas of the fetal brain such asposterior fossa, brainstem or germinal matrix. Firstattempt for automated brain tissue segmentation has beenpresented in [7] and in our previous work [8]. Bothmethods apply the Expectation-Maximization Markov RandomField (EM-MRF) framework but contrary to [7] we do notneed from any anatomical atlas prior. Data set &Methods. Prenatal MR imaging was performed with a 1-Tsystem (GE Medical Systems, Milwaukee) using single shotfast spin echo (ssFSE) sequences (TR 7000 ms, TE 180 ms,FOV 40 x 40 cm, slice thickness 5.4mm, in plane spatialresolution 1.09mm). Each fetus has 6 axial volumes(around 15 slices per volume), each of them acquired inabout 1 min. Each volume is shifted by 1 mm with respectto the previous one. Gestational age (GA) ranges from 29to 32 weeks. Mother is under sedation. Each volume ismanually segmented to extract fetal brain fromsurrounding maternal tissues. Then, in-homogeneityintensity correction is performed using [9] and linearintensity normalization is performed to have intensityvalues that range from 0 to 255. Note that due tointra-tissue variability of developing brain someintensity variability still remains. For each fetus, ahigh spatial resolution image of isotropic voxel size of1.09 mm is created applying [2] and using B-splines forthe scattered data interpolation [10] (see Fig. 1). Then,basal ganglia (BS) segmentation is performed on thissuper reconstructed volume. Active contour framework witha Level Set (LS) implementation is used. Our LS follows aslightly different formulation from well-known Chan-Vese[11] formulation. In our case, the LS evolves forcing themean of the inside of the curve to be the mean intensityof basal ganglia. Moreover, we add local spatial priorthrough a probabilistic map created by fitting anellipsoid onto the basal ganglia region. Some userinteraction is needed to set the mean intensity of BG(green dots in Fig. 2) and the initial fitting points forthe probabilistic prior map (blue points in Fig. 2). Oncebasal ganglia are removed from the image, brain tissuesegmentation is performed as described in [8]. Results.The case study presented here has 29 weeks of GA. Thehigh resolution reconstructed volume is presented in Fig.1. The steps of BG segmentation are shown in Fig. 2.Overlap in comparison with manual segmentation isquantified by the Dice similarity index (DSI) equal to0.829 (values above 0.7 are considered a very goodagreement). Such BG segmentation has been applied on 3other subjects ranging for 29 to 32 GA and the DSI hasbeen of 0.856, 0.794 and 0.785. Our segmentation of theinner (red and blue contours) and outer cortical surface(green contour) is presented in Fig. 3. Finally, torefine the results we include our WM segmentation in theFreesurfer software [12] and some manual corrections toobtain Fig.4. Discussion. Precise cortical surfaceextraction of fetal brain is needed for quantitativestudies of early human brain development. Our workcombines the well known statistical classificationframework with the active contour segmentation forcentral gray mater extraction. A main advantage of thepresented procedure for fetal brain surface extraction isthat we do not include any spatial prior coming fromanatomical atlases. The results presented here arepreliminary but promising. Our efforts are now in testingsuch approach on a wider range of gestational ages thatwe will include in the final version of this work andstudying as well its generalization to different scannersand different type of MRI sequences. References. [1]Guibaud, Prenatal Diagnosis 29(4) (2009). [2] Rousseau,Acad. Rad. 13(9), 2006, [3] Jiang, IEEE TMI 2007. [4]Warfield IADB, MICCAI 2009. [5] Claude, IEEE Trans. Bio.Eng. 51(4) (2004). [6] Habas, MICCAI (Pt. 1) 2008. [7]Bertelsen, ISMRM 2009 [8] Bach Cuadra, IADB, MICCAI 2009.[9] Styner, IEEE TMI 19(39 (2000). [10] Lee, IEEE Trans.Visual. And Comp. Graph. 3(3), 1997, [11] Chan, IEEETrans. Img. Proc, 10(2), 2001 [12] Freesurfer,http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu.

Semi-supervised segmentation of ultrasound images based on patch representation and continuous min cut.

Ultrasound segmentation is a challenging problem due to the inherent speckle and some artifacts like shadows, attenuation and signal dropout. Existing methods need to include strong priors like shape priors or analytical intensity models to succeed in the segmentation. However, such priors tend to limit these methods to a specific target or imaging settings, and they are not always applicable to pathological cases. This work introduces a semi-supervised segmentation framework for ultrasound imaging that alleviates the limitation of fully automatic segmentation, that is, it is applicable to any kind of target and imaging settings. Our methodology uses a graph of image patches to represent the ultrasound image and user-assisted initialization with labels, which acts as soft priors. The segmentation problem is formulated as a continuous minimum cut problem and solved with an efficient optimization algorithm. We validate our segmentation framework on clinical ultrasound imaging (prostate, fetus, and tumors of the liver and eye). We obtain high similarity agreement with the ground truth provided by medical expert delineations in all applications (94% DICE values in average) and the proposed algorithm performs favorably with the literature.

Extent of Hypoattenuation On CT Angiography Source Images In Basilar Artery Occlusion: Prognostic Accuracy Of Posterior Circulation ASPECTS And The Pons-midbrain Score In The Basilar Artery International Cooperation Study

Background: The posterior circulation Acute Stroke Prognosis Early CT Score (pc-ASPECTS) and the combined Pons-midbrain score quantify the extent of early ischemic changes in the posterior circulation. We compared the prognostic accuracy of both scores if applied to CT angiography (CTA) source images (CTA-SI) of patients in the Basilar Artery International Cooperation Study (BASICS).Methods: BASICS was a prospective, observational, multi-centre, registry of consecutive patients who presented with acute symptomatic basilar artery occlusion (BAO). Functional outcome was assessed at 1 month. We applied pc-ASPECTS and the combined Pons-midbrain score to CTA-SI by 3-reader-consensus. Readers were blinded to clinical data. We performed multivariable logistic regression analysis, adjusting for thrombolysis, baseline NIHSS score and age, and used the output to derive ROC curves to compare the ability of both scores to discriminate patients with favourable (modified Rankin Scale [mRS] scores 0-3) from patients with unfavourable (mRS scores 4-6) functional outcome.Results: We reviewed CTAs of 158 patients (64% men, mean age 65 _ 15 years, median NIHSS score 25 [0-38], median GCS score 7 [3-15], median onset-to-CTA time 234 minutes [11-7380]). At 1 month, 40 (25%) patients had a favourable outcome, 49 (31%) had an unfavourable outcome (mRS score 4-5) and 69 (44%) were deceased. Both techniques of assessing CTA-SI hypoattenuation in the posterior circulation showed equally good discriminative value in predicting final outcome (C-statistics; area under ROC curve 0.74 versus 0.75, respectively; p_0.37). Pc-ASPECTS dichotomized at _6 versus _6 was an independent predictor of favourable functional outcome (RR _ 2.2; CI95 1.1-4.7; p _ 0.034).Conclusion: Compared to the combined Pons-midbrain score, the pc-ASPECTS score has similar prognostic accuracy to identify patients with a favourable functional outcome in BASICS. Dichotomized pc-ASPECTS (_6 versus _6) is an independent predictor of favourable functional outcome in this population. Author Disclosures: V. Puetz: None. A. Khomenko: None. M.D. Hill: None. I. Dzialowski: None. P. Michel: None. C. Weimar: None. C.A.C. Wijman: None. H. Mattle: None. K. Muir: None. T. Pfefferkorn: None. D. Tanne: None. S. Engelter: None. K. Szabo: None. A. Algra: None. A.M. Demchuk: None. W.J. Schonewille: None.