950 resultados para Otthera, Johann von, b. 1479 or 80,


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von Siegfried Eichbaum. Mit vielen Bildern von Trutz v. Arnim

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von B. S. Ingemann. Aus dem Dän. von C. Jakobsen

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Von B. Farwick

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Von B. Wiemeyer

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Vorbesitzer: Johann von Neufville; Hans Daniel de Hafe

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The susceptibility of most Bacillus anthracis strains to β-lactam antibiotics is intriguing considering that the B. anthracis genome harbors two β-lactamase genes, bla1 and bla2, and closely-related species, Bacillus cereus and Bacillus thuringiensis, typically produce β-lactamases. This work demonstrates that B. anthracis bla expression is affected by two genes, sigP and rsp, predicted to encode an extracytoplasmic function sigma factor and an antisigma factor, respectively. Deletion of the sigP/rsp locus abolished bla expression in a penicillin-resistant clinical isolate and had no effect on bla expression in a prototypical penicillin-susceptible strain. Complementation with sigP/rsp from the penicillin-resistant strain, but not the penicillin-susceptible strain, conferred β-lactamase activity upon both mutants. These results are attributed to a nucleotide deletion near the 5' end of rsp in the penicillin-resistant strain that is predicted to result in a nonfunctional protein. B. cereus and B. thuringiensis sigP and rsp homologues are required for inducible penicillin resistance in those species. Expression of the B. cereus or B. thuringiensis sigP and rsp genes in a B. anthracis sigP/rsp-null mutant confers resistance to β-lactam antibiotics, suggesting that while B. anthracis contains the genes necessary for sensing β-lactam antibiotics, the B. anthracis sigP/rsp gene products are insufficient for bla induction. ^ Because alternative sigma factors recognize unique promoter sequence, direct targets can be elucidated by comparing transcriptional profiling results with an in silico search using the sigma factor binding sequence. Potential σP -10 and -35 promoter elements were identified upstream from bla1 bla2 and sigP. Results obtained from searching the B. anthracis genome with the conserved sequences were evaluated against transcriptional profiling results comparing B. anthracis 32 and an isogenic sigP/rsp -null strain. Results from these analyses indicate that while the absence of the sigP gene significantly affects the transcript levels of 16 genes, only bla1, bla2 and sigP are directly regulated by σP. The genomes of B. cereus and B. thuringiensis strains were also analyzed for the potential σP binding elements. The sequence was located upstream from the sigP and bla genes, and previously unidentified genes predicted to encode a penicillin-binding protein (PBP) and a D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, indicating that the σ P regulon in these species responds to cell-wall stress caused by β-lactam antibiotics. ^ β-lactam antibiotics prevent attachment of new peptidoglycan to the cell wall by blocking the active site of PBPs. A B. cereus and B. thuringiensis pbp-encoding gene located near bla1 contains a potential σP recognition sequence upstream from the annotated translational start. Deletion of this gene abolished β-lactam resistance in both strains. Mutations in the active site of the PBP were detrimental to β-lactam resistance in B. cereus, but not B. thuringiensis, indicating that the transpeptidase activity is only important in B. cereus. I also found that transcript levels of the PBP-encoding gene are not significantly affected by the presence of β-lactam antibiotic. Based on these data I hypothesize that the gene product acts a sensor of β-lactam antibiotic. ^

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- Resumen La hipótesis que anima esta tesis doctoral es que algunas de las características del entorno urbano, en particular las que describen la accesibilidad de su red de espacio público, podrían estar relacionadas con la proporción de viajes a pie o reparto modal, que tiene cada zona o barrio de Madrid. Uno de los puntos de partida de dicha hipótesis que el entorno urbano tiene una mayor influencia sobre los viaje a pie que en sobre otros modos de transporte, por ejemplo que en los viajes de bicicleta o en transporte público; y es que parece razonable suponer que estos últimos van a estar más condicionadas por ejemplo por la disponibilidad de vías ciclistas, en el primer caso, o por la existencia de un servicio fiable y de calidad, en el segundo. Otra de las motivaciones del trabajo es que la investigación en este campo de la accesibilidad del espacio público, en concreto la denominada “Space Syntax”, ha probado en repetidas ocasiones la influencia de la red de espacio público en cómo se distribuye la intensidad del tráfico peatonal por la trama urbana, pero no se han encontrado referencias de la influencia de dicho elemento sobre el reparto modal. De acuerdo con la hipótesis y con otros trabajos anteriores se propone una metodología basada en el análisis empírico y cuantitativo. Su objetivo es comprobar si la red de espacio público, independientemente de otras variables como los usos del suelo, incluso de las variables de ajenas entorno no construido, como las socioeconómicas, está o no relacionada estadísticamente con la proporción de peatones viajes en las zonas urbanas. Las técnicas estadísticas se utilizan para comprobar sistemáticamente la asociación de las variables del entorno urbano, denominadas variables independientes, con el porcentaje de viajes a pie, la variable dependiente. En términos generales, la metodología es similar a la usada en otros trabajos en este campo como los de CERVERÓ y KOCKLEMAN (1997), CERVERÓ y DUNCAN (2003), o para los que se utilizan principalmente en la revisión general de TRB (2005) o, más recientemente, en ZEGRAS (2006) o CHATMAN (2009). Otras opciones metodológicas, como los métodos de preferencias declaradas (ver LOUVIERE, HENSHER y SWAIT, 2000) o el análisis basado en agentes (PENN & TURNER, 2004) fueron descartados, debido a una serie de razones, demasiado extensas para ser descritas aquí. El caso de estudio utilizado es la zona metropolitana de Madrid, abarcándola hasta la M-50, es decir en su mayor parte, con un tamaño aproximado de 31x34 Km y una población de 4.132.820 habitantes (aproximadamente el 80% de la población de la región). Las principales fuentes de datos son la Encuesta Domiciliaria de Movilidad de 2004 (EDM04), del Consorcio Regional de Transportes de Madrid que es la última disponible (muestra: > 35.000 familias,> 95.000 personas), y un modelo espacial del área metropolitana, integrando el modelo para calcular los índices de Space Syntax y un Sistema de Información Geográfica (SIG). La unidad de análisis, en este caso las unidades espaciales, son las zonas de transporte (con una población media de 7.063 personas) y los barrios (con una población media de 26.466 personas). Las variables del entorno urbano son claramente el centro del estudio. Un total de 20 índices (de 21) se seleccionan de entre los más relevantes encontrados en la revisión de la producción científica en este campo siendo que, al mismo tiempo, fueran accesibles. Nueve de ellos se utilizan para describir las características de los usos del suelo, mientras que otros once se usan para describir la red de espacios públicos. Estos últimos incluyen las variables de accesibilidad configuracional, que son, como se desprende de su título, el centro del estudio propuesto. La accesibilidad configuracional es un tipo especial de accesibilidad que se basa en la configuración de la trama urbana, según esta fue definida por HILLIER (1996), el autor de referencia dentro de esta línea de investigación de Space Syntax. Además se incluyen otras variables de la red de espacio público más habituales en los estudios de movilidad, y que aquí se denominan características geométricas de los elementos de la red, tales como su longitud, tipo de intersección, conectividad, etc. Por último se incluye además una variable socioeconómica, es decir ajena al entorno urbano, para evaluar la influencia de los factores externos, pues son varios los que pueden tener un impacto en la decisión de caminar (edad, género, nivel de estudios, ingresos, tasa de motorización, etc.). La asociación entre las variables se han establecido usando análisis de correlación (bivariante) y modelos de análisis multivariante. Las primeras se calculan entre por pares entre cada una de las 21 variables independientes y la dependiente, el porcentaje de viajes a pie. En cuanto a los segundos, se han realizado tres tipos de estudios: modelo multivariante general lineal, modelo multivariante general curvilíneo y análisis discriminante. Todos ellos son capaces de generar modelos de asociación entre diversas variables, pudiéndose de esta manera evaluar con bastante precisión en qué medida cada modelo reproduce el comportamiento de la variable dependiente, y además, el peso o influencia de cada variable en el modelo respecto a las otras. Los resultados fundamentales del estudio se expresan en dos modelos finales alternativos, que demuestran tener una significativa asociación con el porcentaje de viajes a pie (R2 = 0,6789, p <0,0001), al explicar las dos terceras partes de su variabilidad. En ellos, y en general en todo el estudio realizado, se da una influencia constante de tres índices en particular, que quedan como los principales. Dos de ellos, de acuerdo con muchos de los estudios previos, corresponden a la densidad y la mezcla de usos del suelo. Pero lo más novedoso de los resultados obtenidos es que el tercero es una medida de la accesibilidad de la red de espacio público, algo de lo que no haba referencias hasta ahora. Pero, ¿cuál es la definición precisa y el peso relativo de cada uno en el modelo, es decir, en la variable independiente? El de mayor peso en la mayor parte de los análisis realizados es el índice de densidad total (n º residentes + n º puestos de trabajo + n º alumnos / Ha). Es decir, una densidad no sólo de población, sino que incluye algunas de las actividades más importantes que pueden darse una zona para generar movilidad a pie. El segundo que mayor peso adquiere, llegando a ser el primero en alguno de los análisis estadísticos efecturados, es el índice de accesibuilidad configuracional denominado integración de radio 5. Se trata de una medida de la accesibilidad de la zona, de su centralidad, a la escala de, más un menor, un distrito o comarca. En cuanto al tercero, obtiene una importancia bastante menor que los anteriores, y es que representa la mezcla de usos. En concreto es una medida del equilibrio entre los comercios especializados de venta al por menor y el número de residentes (n º de tiendas especializadas en alimentación, bebidas y tabaco / n º de habitantes). Por lo tanto, estos resultados confirman buena parte de los de estudios anteriores, especialmente los relativas a los usos del suelo, pero al mismo tiempo, apuntan a que la red de espacio público podría tener una influir mayor de la comprobada hasta ahora en la proporción de peatones sobre el resto de modos de transportes. Las razones de por qué esto puede ser así, se discuten ampliamente en las conclusiones. Finalmente se puede precisar que dicha conclusión principal se refiere a viajes de una sola etapa (no multimodales) que se dan en los barrios y zonas del área metropolitana de Madrid. Por supuesto, esta conclusión tiene en la actualidad, una validez limitada, ya que es el resultado de un solo caso — Abstract The research hypothesis for this Ph.D. Thesis is that some characteristics of the built environment, particularly those describing the accessibility of the public space network, could be associated with the proportion of pedestrians in all trips (modal split), found in the different parts of a city. The underlying idea is that walking trips are more sensitive to built environment than those by other transport modes, such as for example those by bicycle or by public transport, which could be more conditioned by, e.g. infrastructure availability or service frequency and quality. On the other hand, it has to be noted that the previously research on this field, in particular within Space Syntax’s where this study can be referred, have tested similar hypothesis using pedestrian volumes as the dependent variable, but never against modal split. According to such hypothesis, research methodology is based primarily on empirical quantitative analysis, and it is meant to be able to assess whether public space network, no matter other built environment and non-built environment variables, could have a relationship with the proportion of pedestrian trips in urban areas. Statistical techniques are used to check the association of independent variables with the percentage of walking in all trips, the dependent one. Broadly speaking this methodology is similar to that of previous studies in the field such as CERVERO&KOCKLEMAN (1997), CERVERO & DUNCAN (2003), or to those used mainly in the general review of T.R.B. (2005) or, more recently in ZEGRAS (2006) or CHATMAN (2009). Other methodological options such as stated choice methods (see LOUVIERE, HENSHER & SWAIT, 2000) or agent based analysis (PENN & TURNER, 2004), were discarded, due to a number of reasons, too long to be described here. The case study is not the entire Madrid’s metropolitan area, but almost (4.132.820 inhabitants, about 80% of region´s population). Main data sources are the Regional Mobility Home Based Survey 2004 (EDM04), which is the last available (sample: >35.000 families, > 95.000 individuals), and a spatial model of the metropolitan area, developed using Space Syntax and G.I.S. techniques. The analysis unit, in this case spatial units, are both transport zones (mean population = 7.063) and neighborhoods (mean population = 26.466). The variables of the built environment are clearly the core of the study. A total of 20 (out of 21) are selected from among those found in the literature while, at the same time, being accessible. Nine out of them are used to describe land use characteristics while another eleven describe the network of public spaces. Latter ones include configurational accessibility or Space Syntax variables. This is a particular sort of accessibility related with the concept of configuration, by HILLIER (1996), one of the main authors of Space Syntax, But it also include more customary variables used in mobility research to describe the urban design or spatial structure (here public space network), which here are called geometric characteristics of the such as its length, type of intersection, conectivity, density, etc. Finally a single socioeconomic variable was included in order to assess the influence non built environment factors that also may have an impact on walking (age, income, motorization rate, etc.). The association among variables is worked out using bi-variate correlation analysis and multivariate-analysis. Correlations are calculated among the 21 independent variables and the dependent one, the percentage of walking trips. Then, three types of multi-variate studies are run: general linear, curvilinear and discriminant multi-variate analysis. The latter are fully capable of generating complex association models among several variables, assessing quite precisely to what extent each model reproduces the behavior of the dependent variable, and also the weight or influence of each variable in the model. This study’s results show a consistent influence of three particular indexes in the two final alternative models of the multi-variate study (best, R2=0,6789, p<0,0000). Not surprisingly, two of them correspond to density and mix of land uses. But perhaps more interesting is that the third one is a measure of the accessibility of the public space network, a variable less important in the literature up to now. Additional precisions about them and their relative weight could also be of some interest. The density index is not only about population but includes most important activities in an area (nº residents + nº jobs+ nº students/Ha). The configurational index (radius 5 integration) is a measure of the accessibility of the area, i.e. centrality, at the scale of, more a less, a district. Regarding the mix of land uses index, this one is a measure of the balance between retail, in fact local basic retail, and the number of residents (nº of convenience shops / nº of residents). Referring to their weights, configurational index (radius 5 integration) gets the higher standardized coefficient of the final equation. However, in the final equations, there are a higher number of indexes coming from the density or land use mix categories than from public space network enter. Therefore, these findings seem to support part of the field’s knowledge, especially those concerning land uses, but at the same time they seem to bring in the idea that the configuration of the urban grid could have an influence in the proportion of walkers (as a part of total trips on any transport mode) that do single journey trips in the neighborhoods of Madrid, Spain. Of course this conclusion has, at present, a limited validity since it’s the result of a single case. The reasons of why this can be so, are discussed in the last part of the thesis.

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Marca tip. de los editores en 2i10r (Kristeller. It.B., 238)

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Peer reviewed

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Recently, TAP42 was isolated as a high copy suppressor of sit4−, a yeast phosphatase related to protein phosphatase 2A (PP2A). TAP42 is related to the murine α4 protein, which was discovered independently by its association with Ig-α in the B cell receptor complex. Herein we show that a glutathione S-transferase (GST)–α4 fusion protein bound the catalytic subunit (C) of human PP2A from monomeric or multimeric preparations of PP2A in a “pull-down” assay. In an overlay assay, the GST–α4 protein bound to the phosphorylated and unphosphorylated forms of C that were separated in two-dimensional gels and immobilized on filters. The results show direct and exclusive binding of α4 to C. This is unusual because all known regulatory B subunits, or tumor virus antigens, bind stably only to the AC dimer of PP2A. The α4–C form of PP2A had an increased activity ratio compared with the AC form of PP2A when myelin basic protein phosphorylated by mitogen-activated protein kinase and phosphorylase a were used as substrates. Recombinant α4 cleaved from GST was phosphorylated by p56lck tyrosine kinase and protein kinase C. A FLAG-tagged α4 expressed in COS7 cells was recovered as a protein containing phosphoserine and coimmunoprecipitated with the C but not the A subunit of PP2A. Treatment of cells with rapamycin prevented the association of PP2A with FLAG-α4. The results reveal a novel heterodimer α4–C form of PP2A that may be involved in rapamycin-sensitive signaling pathways in mammalian cells.

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We describe a method to design dominant-negative proteins (D-N) to the basic helix–loop–helix–leucine zipper (B-HLHZip) family of sequence-specific DNA binding transcription factors. The D-Ns specifically heterodimerize with the B-HLHZip dimerization domain of the transcription factors and abolish DNA binding in an equimolar competition. Thermal denaturation studies indicate that a heterodimer between a Myc B-HLHZip domain and a D-N consisting of a 12-amino acid sequence appended onto the Max dimerization domain (A-Max) is −6.3 kcal⋅mol−1 more stable than the Myc:Max heterodimer. One molar equivalent of A-Max can totally abolish the DNA binding activity of a Myc:Max heterodimer. This acidic extension also has been appended onto the dimerization domain of the B-HLHZip protein Mitf, a member of the transcription factor enhancer binding subfamily, to produce A-Mitf. The heterodimer between A-Mitf and the B-HLHZip domain of Mitf is −3.7 kcal⋅mol−1 more stable than the Mitf homodimer. Cell culture studies show that A-Mitf can inhibit Mitf-dependent transactivation both in acidic extension and in a dimerization-dependent manner. A-Max can inhibit Myc-dependent foci formation twice as well as the Max dimerization domain (HLHZip). This strategy of producing D-Ns may be applicable to other B-HLHZip or B-HLH proteins because it provides a method to inhibit the DNA binding of these transcription factors in a dimerization-specific manner.