Computational framework to integrate the effect of antigen recognition on disease epidemiology outcome: multi-scale approach

Human Leukocyte Antigen (HLA) plays an important role, in presenting foreign pathogens to our immune system, there by eliciting early immune responses. HLA genes are highly polymorphic, giving rise to diverse antigen presentation capability. An important factor contributing to enormous variations in individual responses to diseases is differences in their HLA profiles. The heterogeneity in allele specific disease responses decides the overall disease epidemiological outcome. Here we propose an agent based computational framework, capable of incorporating allele specific information, to analyze disease epidemiology. This framework assumes a SIR model to estimate average disease transmission and recovery rate. Using epitope prediction tool, it performs sequence based epitope detection for a given the pathogenic genome and derives an allele specific disease susceptibility index depending on the epitope detection efficiency. The allele specific disease transmission rate, that follows, is then fed to the agent based epidemiology model, to analyze the disease outcome. The methodology presented here has a potential use in understanding how a disease spreads and effective measures to control the disease.

Green Nanosilver as Reinforcing Eco-Friendly Additive to Epoxy Coating for Augmented Anticorrosive and Antimicrobial Behavior

Epoxy resin GY250 representing diglycidyl ethers of bisphenol-A (DGEBA) was reinforced with 1, 3 and 5 wt % of surface functionalized silver nanoparticles (F-AgNPs) which were synthesized using Couroupita guianensis leaves extract with a view of augmenting the corrosion control property of the epoxy resin and also imparting antimicrobial activity to epoxy coatings on mild steel. Corrosion resistance of the coatings was evaluated by EIS, potentiodynamic polarization studies and cross scratch tests. AFM, SEM, HRTEM and EDX were utilized to investigate the surface topography, morphology and elemental composition of the coatings on MS specimens. Results showed that the corrosion resistance, hardness and T-g of the DGEBA/F-AgNPs coatings increased at 1 wt % of F-AgNPs. The DGEBA/F-AgNPs coatings also offered manifold antimicrobial protection to the MS surfaces by inhibiting the growth of biofilm forming bacteria like P. aeruginosa, B. subtilis, the most common human pathogen E. coli and the most virulent human pathogenic yeast C. albicans.

The descriptive epidemiology of congenital and acquired cryptorchidism in a UK infant cohort.

INTRODUCTION: Recent studies in other European countries suggest that the prevalence of congenital cryptorchidism continues to increase. This study aimed to explore the prevalence and natural history of congenital cryptorchidism in a UK centre. METHODS: Between October 2001 and July 2008, 784 male infants were born in the prospective Cambridge Baby Growth Study. 742 infants were examined by trained research nurses at birth; testicular position was assessed using standard techniques. Follow-up assessments were completed at ages 3, 12, 18 and 24 months in 615, 462, 393 and 326 infants, respectively. RESULTS: The prevalence of cryptorchidism at birth was 5.9% (95% CI 4.4% to 7.9%). Congenital cryptorchidism was associated with earlier gestational age (p<0.001), lower birth weight (p<0.001), birth length (p<0.001) and shorter penile length at birth (p<0.0001) compared with other infants, but normal size after age 3 months. The prevalence of cryptorchidism declined to 2.4% at 3 months, but unexpectedly rose again to 6.7% at 12 months as a result of new cases. The cumulative incidence of "acquired cryptorchidism" by age 24 months was 7.0% and these cases had shorter penile length during infancy than other infants (p = 0.003). CONCLUSIONS: The prevalence of congenital cryptorchidism was higher than earlier estimates in UK populations. Furthermore, this study for the first time describes acquired cryptorchidism or "ascending testis" as a common entity in male infants, which is possibly associated with reduced early postnatal androgen activity.

Potencial escénico de la Reserva Natural Cerro Datanli-El Diablo en Jinotega, con fines eco turisticos

El estudio fue realizado en la RN Cerro Datanlí- El Diablo, Jinotega. El objetivo principal fue identificar sitios con potencial belleza escénica aun no considerados para la ejecución de actividades ecoturísticas que tiendan a mejorar la calidad de vida de sus pobladores locales a partir de la visita de turistas y nacionales. Los mejores atractivos naturales e infraestructura existente se homogenizaron mediante la consulta a lugareños y a través de la observación personal . La metodología se desarrolló en tres etapas: (1) Recolección de la información secundaria, selección y ubicación de la zona de estudio y de contactos (MARENA, PAGJINO, Líderes locales). (2) Giras de campo para llevar a cabo: el DRP auxiliado con tres herramientas participativas; la identificación de 22 sitios con potencial ecoturístico, 3 problemas principales que limitan su desarrollo, recorridos por 7 senderos ecológicos que facilitó la identificación de 17 sitios posibles como miradores de paisajes diversos y 5 sitios donde se pueden observar y escuchar cantar aves exóticas como el Quetzal; aplicación de encuestas a los pobladores locales (niños y jóvenes ambientalistas, mujeres y productores) con el fin de conocer su participación en actividades de protección, conservación y manejo de los recursos naturales. (3) Elaborar los mapas de los senderos a través del programa Arc View 3.2, se ubicaron los principales atractivos, propuestas de cambios en los recorridos basados en pendientes del terreno, análisis de visibilidad de miradores ysegún los atractivos principales en los sendero. La información facilitó incluir el diseño de un modelo de infraestructura en los senderos (gradas, miradores y puentes) para el tráfico de visitantes y la elaboración de tres propuestas de paquetes turísticos que contienen información básica de los recursos naturales existentes en la reserva natural.

Evaluación de sobrevivencia e incremento de seis especies forestales maderables en plantaciones de la finca Eco forestal, San Juan del Sur, Rivas. 2010

Esta investigación tiene como objetivo evaluar la sobrevivencia y el incremento de seis especies forestales: Caoba del Pacífico (Swietenia humilis. Zucc.), Pochote (Pachira quinata (Jacq.) Alverson), Roble ( Tabebuia rosea(Bertol) DC.), Teca (Tectona grandis L.F.), Caoba Africana (Khaya senegalensis (Desr.) A. Juss) y Ñambar (Dalbergia retusa Hemsl). La plantación se encuentra establecida en la finca Eco forestal, San Juan del Sur, Rivas. Se inventariaron 62 parcelas de 20m x 20m (400 m²), estas parcelas tienen un área útil de 225m², las plantas están establecidas con un distanciamiento de 2.5m x 2.5m entre planta, cada parcela contiene 64 árboles y la parcela útil contiene 36 árboles, el inventario se aplicó a la parcela útil. Las variables evaluadas fueron diámetro, altura total y sobrevivencia. La sobrevivencia general de la plantación fue 76% (entre las edades de 5 a 11 años). La especie que presentó mayor porcentaje de sobrevivencia fue Caoba africana (Khaya enegalensis(Desr) con 87% y la especie que presentó menor porcentaje de sobrevivencia fue el Pochote (Pachira quinata (Jacq.)con 66.59%. El mayor incremento medio anual en diámetro lo obtuvo la especie Caoba africana (Khaya senegalensis (Desr)) con 1.6 cm/año, mientras que el Ñambar (Dalbergiaretus a Hemsl.) presentó el menor incremento medio anual en diámetro con 0.82 cm/año. Los valores en incremento medio en altura total por especie la Teca (Tectona grandis L.F.)presentó el mayor valor con 1.11 m/año, debido a que es una especie de rápido crecimiento y el espaciamiento fue ideal para dicho incremento, mientras que el Ñambar (Dalbergia retusa Hemsl.) presentó el menor incremento medio anual en altura con 0.64 m/año

Preservação ambiental, um discurso de todos da Eco 92 à Rio + 20

Coletânea de discursos e debates realizados no âmbito da Câmara dos Deputados sobre diferentes temas relacionados ao meio ambiente.

Key business factors for eco-innovation: an overview of recent firm-level empirical studies

[EN] The increasing interest in eco-innovation or environmental innovation as a strategy not only to address the serious global environmental problems but also as a source of competitive advantages for companies and for the emergence of new business areas, leads us to try to identify the different factors that act as determinants of its development and adoption at the micro level.

Investigations of certain eco-physiological characteristics of the broad and long-pincered crayfish in connection with their interspecific relationships. [Translation from: Lietuvas TSR Mokslu Akademijos Darbai, C Serija 2(40), 279-286, 1966.]

The results are described of eco-physiological investigations of the broad-pincered (Astacus astacus L.J.) crayfish and the long-pincered (Astacus astacus Esch.) crayfish, conducted in 1963—64 in the Institute of Zoology and Parasitology of the Academy of Science of the Lithuanian SSR, for the purpose of studying the interspecific relationship of these two species. In the course of the investigation were determined: the influence of the temperature of the environment on the consumption of oxygen by full grown individuals of both species and on the respiratory movements of the scaphognathites, the threshold temperatures and the saturation of the water by oxygen, the diel activity in the winter period.

Uma abordagem integrativa do conceito de Eco-eficiência: elementos para a concepção de Sistemas de Gestão de Resíduos Sólidos Industriais em Arranjos Produtivos Locais Têxtil-Vestuário

A identificação e avaliação das vulnerabilidades e potencialidades socioambientais e socioecológicas, ao considerar as múltiplas realidades de ecossistemas, territórios e lugares, podem revelar novos caminhos, ações coletivas, solidárias, bem como auxiliar na tomada de decisão estratégica em sistemas de gestão de resíduos sólidos. Tal perspectiva, qualificaria princípios e conceitos metodológicos e técnicos, como aqueles direcionados a responder aos problemas que surgem da interação Humanidade-Sociedade-Natureza, com vistas à sustentabilidade. A Eco-eficiência, ao final do século XX, apresentou-se como solução para os problemas ambientais corporativos. Idealizada para ser aplicada em um empresas isolada, evoluiu para uma categoria central da Ecologia Industrial, ganhou contornos de Princípio e Filosofia para a Gestão Ambiental Empresarial, passando a orientar a geopolítica das nações no trato das questões ambientais supranacionais e políticas públicas das nações. A recente Política Nacional de Resíduos Sólidos apresenta a Eco-eficiência como um de seus princípios que deverão orientar gestores públicos e privados na elaboração de seus sistemas de gestão de resíduos sólidos. Devido aos impactos sociais, ambientais e ecológicos resultantes da geração e destinação inadequada dos resíduos sólidos, estes sistemas de gestão apresentam interfaces com outras políticas e sistemas de gestão públicos e privados nacionais. Estas interações conferem ao sistema de gestão de resíduos sólidos um caráter complexo, aberto, dinâmico e inclusivo, no qual o conceito de Eco-eficiência, baseado na alocação de recursos naturais, pode ser ressignificado em um outro nível de realidade, o nível coletivo, apresentando-se, como um conceito potencial voltado para a criação de recursos. Para corroborar esta hipótese apresenta-se uma abordagem integrativa com base na perspectiva socioecológica e no pensamento e metodologia transdisciplinar, na qual o conceito será contextualizado, problematizado e complexificado em seis níveis de realidade: Nível Genus-Global, Nível Político, Nível Acadêmico, Nível do Ecossistema, Território e Lugares, Nível Operacional e Nível Coletivo. Considera-se nesta abordagem os Arranjos Produtivos (indústrias e a Cadeia de Reciclagem), Arranjos Sociais (Comunidade localizadas e áreas de risco e precárias), Ecossistemas e Territórios, como Teia de Lugares, como Unidade Transdisciplinar perceptiva, cognitiva e analítica. A aplicação desta metodologia no Arranjo Produtivo Local Têxtil- Vestuário de Petrópolis, localizado na Região Serrana Fluminense, que se insere em um Ecossistema de Montanha, permitiu revelar outro Arranjo, invisível ao sistema de gestão público. Neste Arranjo de Retalhos e Estopas, cerca de 240 mulheres, residentes em comunidades precárias e de risco, beneficiam os resíduos sólidos gerados pelas indústrias do arranjo formal, conhecidos como retalhos, com os quais fabricam estopas. Conclui-se que esta abordagem integrativa, como proposta de ressignificação do conceito de Eco-eficiência, permitiu revelar, não somente uma nova realidade conceitual para a sua adoção e prática, como novos aspectos e variáveis para a construção de sistemas de gestão de resíduos sólidos industriais que tenham por foco a inclusão social, produtiva, cientifica e tecnológica de novos atores e recursos ao sistema.

Estimativa de espessura do concreto utilizando o método do eco - impacto

Nesta pesquisa utilizou-se um equipamento experimental que utiliza o método do eco-impacto produzido no Laboratório de Ensaios Físicos do Instituto Politécnico do Rio de Janeiro (UERJ/IPRJ), para estimar a espessuras de placas de concreto através da propagação de ondas de tensão geradas por um impacto. Para determinação dessa espessura, foram investigados vários mecanismos de estruturação do protótipo do equipamento com objetivo de se obter a melhor leitura possível, por meio das literaturas existentes. Entre parâmetros avaliados no estudo, estava o modelo de sensor a ser utilizado, o tipo de impactor, a precisão relacionada à aquisição de dados e o tratamento do mesmo, a distância entre o ponto de impacto e o transdutor (sensor), e o local de teste. Os resultados experimentais concordam com as previsões teóricas e revelam que este método é eficiente para análise de estrutura de concreto. A análise da espessura e resposta em frequência de um novo protótipo desenvolvido e os testes realizados possibilitou um erro médio de espessura real para amostras sem agregados de 0,39% e para as amostras com agregados com de 0,64%. Esses resultados apontam que o equipamento produzido tem potencial e que o mesmo pode ser utilizado para avaliação de estrutura de concreto.

Long-Term Epidemiology of Streptococcus pneumoniae Serogroup 6 in a Region of Southern Europe with Special Reference to Serotype 6E

Streptococcus pneumoniae serotype 6E has recently been described, but its long-term epidemiology is not well known. From 1981-2013, 704 serogroup 6 clinical isolates were obtained in Gipuzkoa, Basque Country, Spain. All invasive and one in four non-invasive isolates were included. Overall, 75, 97, 51 and 45 serotypes 6A, 6B, 6C and 6E isolates, respectively, were detected. No serotype 6D isolates were identified. The prevalence of serotypes 6E and 6B, but not that of serotypes 6A and 6C, declined after the introduction of pneumococcal conjugate vaccines. Serotype 6E isolates showed the highest resistance rate. Most serotype 6E isolates were ST90.

Shrimp disease management using bioactive marine secondary metabolites: an eco-friendly approach

Vibriosis caused by opportunistic and secondary bacterial pathogens is still a serious disease problem in aquaculture of the black tiger shrimp Penaeus monodon. Attempts were made for controlling shrimp bacterial disease using Marine Secondary Metabolites (MSMs). Findings indicated that the MSMs of seaweed Ulva fasciata and Dendrilla nigra are effective for controlling shrimp bacterial pathogens.