Seasonal and interannual variation in juvenile salmonids and associated fish assemblage in open waters of the lower Columbia River estuary

The transition between freshwater and marine environments is associated with high mortality for juvenile anadromous salmonids, yet little is known about this critical period in many large rivers. To address this deficiency, we investigated the estuarine ecology of juvenile salmonids and their associated fish assemblage in open-water habitats of the lower Columbia River estuary during spring of 2007–10. For coho (Oncorhynchus kisutch), sockeye (O. nerka), chum (O. keta), and yearling (age 1.0) Chinook (O. tshawytscha) salmon, and steelhead (O. mykiss), we observed a consistent seasonal pattern characterized by extremely low abundances in mid-April, maximum abundances in May, and near absence by late June. Subyearling (age 0.0) Chinook salmon were most abundant in late June. Although we observed interannual variation in the presence, abundance, and size of juvenile salmonids, no single year was exceptional across all species-and-age classes. We estimated that >90% of juvenile Chinook and coho salmon and steelhead were of hatchery origin, a rate higher than previously reported. In contrast to juvenile salmonids, the abundance and composition of the greater estuarine fish assemblage, of which juvenile salmon were minor members, were extremely variable and likely responding to dynamic physical conditions in the estuary. Comparisons with studies conducted 3 decades earlier suggest striking changes in the estuarine fish assemblage—changes that have unknown but potentially important consequences for juvenile salmon in the Columbia River estuary.

Efeitos genéticos e ambientais sobre o perímetro escrotal de animais da raça Caracu

Neste trabalho foram avaliados os efeitos de idade (IDS) e peso aos 15 meses (P15) sobre medidas de perímetro escrotal ao sobreano de 1.892 machos da raça Caracu e estimada a herdabilidade desta característica. Utilizaram-se dois modelos de análise: em um dos modelos, foram incluídos o efeito de grupo de contemporâneos (GC) e, como covariável, a idade ao sobreano (efeitos linear e quadrático); e, no outro, o efeito de GC e, como covariável, o peso ao sobreano (efeitos linear e quadrático). A idade não teve efeito significativo no perímetro escrotal, o que está relacionado à homogeneidade dos animais nos grupos de contemporâneos, enquanto os efeitos linear e quadrático de P15 foram significativos sobre o perímetro escrotal, indicando grande influência do peso sobre a variação desta característica. A herdabilidade do perímetro escrotal foi estimada pelo método Bayesiano utilizando-se um modelo animal. O modelo incluiu os efeitos de GC e P15 (linear e quadrático) e os efeitos genéticos aditivo direto e residual. O valor médio estimado de herdabilidade do PE ao sobreano foi 0,38 e comprova que esta característica pode ser utilizada como critério de seleção para precocidade sexual em programas de melhoramento genético de animais da raça Caracu.

Genetic parameters and environmental effects on temperament score and reproductive traits of Nellore cattle

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Genetic associations between flight speed and growth traits in Nellore cattle

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Correlações genéticas entre escores visuais e características reprodutivas em bovinos Nelore usando inferência bayesiana

O objetivo deste trabalho foi estimar a herdabilidade e as correlações genéticas entre escores visuais e características reprodutivas de animais da raça Nelore. As características avaliadas foram: precocidade, musculatura, e escores de conformação à desmama (PD, MD e CD, respectivamente) e ao sobreano (PS, MS e CS, respectivamente); idade ao primeiro parto (IPP); e perímetro escrotal (PE). Foram utilizadas informações de 66.244 animais, nascidos entre 1990 e 2006. Os parâmetros genéticos foram estimados em análises bicaracterísticas, com inferência bayesiana. Foi utilizado um modelo linear para IPP e PE, e um modelo não linear (threshold) para os escores visuais. As herdabilidades estimadas foram: CD, 0,19±0,02; PD, 0,23±0,02; MD, 0,20±0,02; CS, 0,26±0,01; PS, 0,33±0,02; MS, 0,32±0,02; IPP, 0,16±0,03; e PE, 0,36±0,02. As correlações genéticas estimadas entre os escores visuais e IPP foram negativas, de -0,18±0,03 a -0,29±0,02. Correlações genéticas positivas foram obtidas entre os escores visuais e o PE, de 0,19±0,01 a 0,31±0,01. A seleção de animais com os maiores escores visuais, principalmente ao sobreano, permite melhorar o desempenho reprodutivo dos rebanhos

Genetic analysis of visual scores and their relationships to mature female weight in Nellore breed

Dados de 79.884 animais da raça Nelore foram utilizados para estimar parâmetros genéticos e avaliar as relações entre os escores de conformação, precocidade e musculatura obtidos à desmama e ao sobreano e o peso das fêmeas à idade adulta. Utilizou-se o método da máxima verossimilhança restrita, em análise multicaracterísticas, com modelo que incluiu os efeitos genéticos aditivos direto e residual, como aleatórios, e os efeitos fixos de grupo de contemporâneos e, como covariáveis, a idade do animal à pesagem e a idade da mãe ao parto (exceto para o peso das fêmeas à idade adulta). Os grupos contemporâneos à desmama foram definidos pelas variáveis: sexo, rebanho, ano e mês de nascimento, grupo de manejo ao nascimento e à desmama. Na definição de grupo contemporâneo ao sobreano também foi incluída a variável grupo de manejo ao sobreano. Para o peso das fêmeas à idade adulta, o grupo de contemporâneos foi composto por rebanho, ano de nascimento, grupo de manejo ao sobreano, ano e estação da pesagem. Os efeitos genético materno e de ambiente permanente materno também foram incluídos no modelo para análise dos escores de conformação, precocidade e musculatura à desmama. As estimativas de herdabilidade direta obtidas foram 0,18 ± 0,02 para o escore de conformação; 0,21 ± 0,01 para o escore de precocidade; 0,22 ± 0,01 para o escore de musculatura à desmama e 0,24 ± 0,01 para o escore de conformação; 0,27 ± 0,01 para o escore de precocidade; e 0,26 ± 0,01 para o escore de musculatura ao sobreano e 0,42 ± 0,02 para o peso das fêmeas à idade adulta. As correlações genéticas estimadas entre os escores visuais medidos à desmama e ao sobreano foram positivas, variando de média a alta magnitude (0,56 ± 0,03 a 0,85 ± 0,01). Por outro lado, as correlações genéticas estimadas entre os escores visuais e o peso das fêmeas à idade adulta foram positivas e moderadas, variando de 0,21 ± 0,03 a 0,35 ± 0,03. Os resultados obtidos indicam que a seleção de animais com maiores escores visuais, principalmente ao sobreano, deve promover aumento do peso das fêmeas à idade adulta.

Herdabilidades para ganho de peso da desmama ao sobreano e perímetro escrotal ao sobreano e tendências genética e fenotípica para ganho de peso da desmama ao sobreano em bovinos Nelore-Angus

Com o objetivo de estimar herdabilidades para ganho de peso médio diário da desmama ao sobreano (GMDDS) e para perímetro escrotal ao sobreano (PES) e tendências genética e fenotípica para GMDDS, foram utilizados 47.668 registros de peso e de ganho de peso de uma população multirracial Nelore-Angus, coletados entre 1991 e 2001 em diversas regiões do Brasil. Os dados foram analisados pelo método REML e as estimativas das (co)variâncias foram obtidas por meio de um modelo animal, no qual foram considerados fixos os efeitos da composição racial do animal (obtida pela concatenação do percentual da raça Nelore do próprio animal, de seu pai e de sua mãe) e do grupo de contemporâneos pós-desmama (animais nascidos no mesmo rebanho, ano, época e pertencentes ao mesmo sexo e grupo de manejo) e, como aleatórios, os efeitos genético aditivo direto e residual. A herdabilidade para PES foi estimada utlizando-se o mesmo modelo, acrescido dos efeitos fixos do peso e da idade do animal ao sobreano (covariáveis). As médias para idade nas pesagens foram 215 e 528 dias para a desmama e o sobreano, respectivamente. A herdabilidade estimada para GMDDS foi 0,44 ± 0,02 e para PES, 0,22 ± 0,08. A tendência genética anual predita para GMDDS foi decrescente até 1996 e crescente a partir desse período. A tendência fenotípica anual foi de 9,4 g/dia/ano.

Efeitos ambientais e genéticos sobre escores visuais e ganho em peso ao sobreano de bovinos brangus

This research aimed at studying the effects of age of the cow at calving (IVP), age of the animal at yearling (IDS), the direct additive genetic (AD) and maternal (AM) effects and individual heterozygosity (HI) on visual scores of conformation (CS), early finishing (PS) and muscling (MS) at postweaning and average daily gain from weaning to yearling (GDS) of cattle used to originate the Brangus breed. There were analyzed records on 24 531, 21 166, 24 006 and 25 419 for CS, PS, MS and GDS, respectively, of animals born from 1986 to 2002 belonging to livestock files of Gensys Consultores Associados S/C Ltda. The analyses were performed by the least square method using mathematical models that included contemporary group as class variable and IVP, IDS, AD, AM and HI as covariates. IVP showed linear and quadratic effects (p<0.01) on GDS and linear (p<0.01) on PS, while the quadratic effect of IDS was not significant for PS and GDS. AD and AM were significant (p<0.01) only for PS and MS scores, respectively. All the traits were significantly (p<0.01) influenced by HI. The environmental and genetic effects were important sources of variation for the studied traits and should be taken into account when comparison of animals and selection were performed.

Parâmetros genéticos de características de carcaça e de crescimento de bovinos da raça Nelore

The objectives of this study were to estimate genetic parameters involving yearling weight (Ps), carcass weight (Pc), hip height (Ag) and the scores of conformation (C), precocity (P) and musculature (M) and carcass yield (Rd) and finishing score (Ac) in Nellore cattle in order to define criteria for selection in this breed. The data of the 20 732 animals were obtained from Agrope-cuária Jacarezinho, SP. Data were analyzed by restricted maximum likelihood using animal model multi-trait analysis, which included fixed effects of contemporary groups (animals born at the same month and slaughtered on the same day) and the covariate age at slaughter (linear) for carcass traits, and contemporary groups (animals of the same farm, age, sex and management group at weaning and yearling) and yearling age (linear) for growth and as random, the additive effects and residual effects. Estimates ranged from 0.13 (Ac and Rd) to 0.36 (Ag) for heritability and from -0.59 ± 0.62 (Rd with Ac) to 0.71 ± 0.17 (Pc with C) for genetic correlations. Selection for Pc, C, P, M, Ag or Ps may be efficient because their heritability estimates are of magnitude moderate. Selection for Ps and C can favor heavier Pc, considering their positive and high genetic correlation.

Métodos para avaliação do temperamento de bovinos: estimação de parâmetros genéticos e relações com o desempenho

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Interação genótipo-ambiente para peso ao sobreano na raça Canchim

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Reaction norms for the study of genotype-environment interaction for growth and indicator traits of sexual precocity in Nellore cattle

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Genetic associations between flight speed and growth traits in Nellore cattle

The aim of the present study was to estimate genetic parameters for flight speed and its association with growth traits in Nellore beef cattle. The flight speed (FS) of 7,402 yearling animals was measured, using a device composed of a pair of photoelectric cells. Time interval data (s) were converted to speed (m/s) and faster animals were regarded as more reactive. The growth traits analyzed were weaning weight (WW), ADG from weaning to yearling age, and yearling scrotal circumference (SC). The (co)variance components were estimated using REML in a multitrait analysis applying an animal model. The model included random direct additive genetic and residual effects, fixed effects of contemporary groups, age of dam (classes), and age of animal as covariable. For WW, the model also included maternal genetic and permanent environmental random effects. The direct heritability estimate for FS was 0.26 +/- 0.05 and direct heritability estimates for WW, SC, and ADG were 0.30 +/- 0.01, 0.48 +/- 0.02, and 0.19 +/- 0.01, respectively. Estimates of the genetic correlation between FS and the growth traits were -0.12 +/- 0.07 (WW), -0.13 +/- 0.08 (ADG), and -0.11 +/- 0.07 (SC). Although the values were low, these correlations showed that animals with better temperaments (slower FS) tended to present better performance. It is possible to infer that long-term selection for weight and scrotal circumference can promote a positive genetic response in the temperament of animals. Nevertheless, to obtain faster genetic progress in temperament, it would be necessary to perform direct selection for such trait. Flight speed is an easily measured indicator of temperament and can be included as a selection criterion in breeding programs for Nellore cattle.

Genetic parameters and relationships of heifer pregnancy and age at first calving with weight gain, yearling and mature weight in Nelore cattle

The objectives of the current study were to investigate the additive genetic associations between heifer pregnancy at 16 months of age (HP16) and age at first calving (AFC) with weight gain from birth to weaning (WG), yearling weight (YW) and mature weight (MW), in order to verify the possibility of using the traits measured directly in females as selection criteria for the genetic improvement of sexual precocity in Nelore cattle. (Co)variance components were estimated by Bayesian inference using a linear animal model for AFC, WG, YW and MW and a nonlinear (threshold) animal model for HP16. The posterior means of direct heritability estimates were: 0.45 +/- 0.02; 0.10 +/- 0.01; 023 +/- 0.02; 0.36 +/- 0.01 and 0.39 +/- 0.04, for HP16, AFC, WG, YW and MW, respectively. Maternal heritability estimate for WG was 0.07 +/- 0.01. Genetic correlations estimated between HP16 and WG, YW and MW were 0.19 +/- 0.04; 0.25 +/- 0.06 and 0.14 +/- 0.05, respectively. The genetic correlations of AFC with WG, YW and MW were low to moderate and negative, with values of -0.18 +/- 0.06; -0.22 +/- 0.05 and -0.12 +/- 0.05, respectively. The high heritability estimated for HP16 suggests that this trait seem to be a better selection criterion for females sexual precocity than AFC. Long-term selection for animals that are heavier at young ages tends to improve the heifers sexual precocity evaluated by HP16 or AFC. Predicted breeding values for HP16 can be used to select bulls and it can lead to an improvement in sexual precocity. The inclusion of HP16 in a selection index will result in small or no response for females mature weight. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.

Genotype x environment interaction for age at first calving, scrotal circumference, and yearling weight in Nellore cattle using reaction norms in multitrait random regression models

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)