Método convencional e "bootstrap" para estimar o número de observações na determinação dos parâmetros da função K(Θ)

A variabilidade natural do solo dificulta a obtenção de valores que representem adequadamente as propriedades do solo em determinada área. O conhecimento do número mínimo de observações, que devem ser realizadas para representar, com um erro aceitável, uma propriedade ou característica do solo, é fundamental para que os resultados experimentais possam ser aplicados com segurança. No presente trabalho, comparou-se o método convencional (teste-t) com o método "bootstrap", com vistas em estimar o número de observações necessárias para calcular os parâmetros que caracterizam a relação entre a condutividade hidráulica e o teor de água do solo, determinada pelo método do perfil instantâneo. Realizou-se um experimento de drenagem num Latossolo Vermelho-Amarelo em Piracicaba (SP), numa parcela experimental com 45 pontos de observação distanciados de 1 m entre si. Observaram-se a umidade (com TDR) e o potencial mátrico (com tensiômetros) durante três semanas de redistribuição da água. Após processamento dos dados, o conjunto de valores mostrou uma distribuição não-normal, fazendo-se necessária a eliminação de "outliers" para a aplicação do método convencional, normalizando a distribuição. Assim, o uso do método tradicional só é recomendado após a confirmação da pertinência da eliminação dos "outliers". Ambos os métodos de análise requerem grande número de repetições, reafirmando que determinações da função condutividade hidráulica com poucas repetições não podem ser extrapoladas para áreas maiores.

Intervalo de confiança "bootstrap" como ferramenta para classificar raças do nematóide de cisto da soja

Estimativas "bootstrap" da média aritmética dos genótipos de soja 'Pickett', 'Peking', PI88788 e PI90763 e os intervalos de confiança obtidos pela teoria normal e através da distribuição "bootstrap" deste estimador, como o percentil "bootstrap" e o BCa, correção para o viés e aceleração, do parâmetro de diferenciação da cultivar padrão de suscetibilidade Lee são utilizados para classificar raças do nematóide de cisto da soja. Os intervalos de confiança obtidos a partir da distribuição "bootstrap" apresentaram menor amplitude e foram muito similares, dessa forma, o limite inferior do intervalo de confiança percentil "bootstrap" foi tomado como nível de referência nas distribuições "bootstrap" do estimador da média aritmética dos genótipos diferenciadores, permitindo estimar a probabilidade empírica de uma reação positiva ou negativa, e, conseqüentemente, identificar a raça mais provável sob determinado teste.

Desigualdades sociodemográficas e suas conseqüências sobre o peso do recém-nascido

OBJETIVO: Analisar as desigualdades sociodemográficas, na assistência pré-natal e ao parto e suas conseqüências sobre o peso ao nascer. MÉTODOS: Estudo realizado em amostra de 10.072 puérperas atendidas em maternidades públicas, conveniadas com o Sistema Único de Saúde, e particulares do Município do Rio de Janeiro, no período de 1999-2001. Para verificar a associação entre peso ao nascer e características maternas, sociodemográficas, biológicas e da assistência pré-natal (índice de Kotelchuck modificado), realizaram-se regressões lineares múltiplas, estratificando as puérperas segundo nível de instrução. Foi utilizada a técnica de bootstrap com intervalos de confiança acurados para as estimativas dos efeitos. RESULTADOS: Na análise bivariada, para quase todas as variáveis estudadas, as médias de peso ao nascer foram menores entre as mães de escolaridade mais baixa. Na análise da regressão múltipla para o grupo de baixa escolaridade, o peso ao nascer associou-se diretamente com o índice de Kotelchuck modificado e a idade gestacional, e inversamente com as variáveis cor da pele preta, hábito de fumar e a experiência de filhos prematuros anteriores. Idade materna e paridade tiveram comportamentos distintos nos extremos e na faixa central dos dados. No grupo de maior escolaridade somente a paridade, a idade gestacional e o índice de Kotelchuck modificado foram significativos e se associaram diretamente com o peso ao nascer. Verificou-se o papel protetor da assistência pré-natal, assim como o efeito negativo do hábito de fumar independente do nível de escolaridade das mães. CONCLUSÕES: As variáveis que explicaram o peso ao nascer dos neonatos de mães com elevada escolaridade foram de natureza biológica, em contraste com os determinantes sociais encontrados no grupo de baixa escolaridade.

Spatial distribution and socioeconomic context of tuberculosis in Rio de Janeiro, Brazil

OBJECTIVE To analyze the spatial distribution of risk for tuberculosis and its socioeconomic determinants in the city of Rio de Janeiro, Brazil.METHODS An ecological study on the association between the mean incidence rate of tuberculosis from 2004 to 2006 and socioeconomic indicators of the Censo Demográfico (Demographic Census) of 2000. The unit of analysis was the home district registered in the Sistema de Informação de Agravos de Notificação (Notifiable Diseases Information System) of Rio de Janeiro, Southeastern Brazil. The rates were standardized by sex and age group, and smoothed by the empirical Bayes method. Spatial autocorrelation was evaluated by Moran’s I. Multiple linear regression models were studied and the appropriateness of incorporating the spatial component in modeling was evaluated.RESULTS We observed a higher risk of the disease in some neighborhoods of the port and north regions, as well as a high incidence in the slums of Rocinha and Vidigal, in the south region, and Cidade de Deus, in the west. The final model identified a positive association for the variables: percentage of permanent private households in which the head of the house earns three to five minimum wages; percentage of individual residents in the neighborhood; and percentage of people living in homes with more than two people per bedroom.CONCLUSIONS The spatial analysis identified areas of risk of tuberculosis incidence in the neighborhoods of the city of Rio de Janeiro and also found spatial dependence for the incidence of tuberculosis and some socioeconomic variables. However, the inclusion of the space component in the final model was not required during the modeling process.

Spatial distribution of leprosy in areas of risk in Vitoria, State of Espirito Santo, Brazil, 2005 to 2009

Introduction Leprosy remains a relevant public health issue in Brazil. The objective of this study was to analyze the spatial distribution of new cases of leprosy and to detect areas with higher risks of disease in the City of Vitória. Methods The study was ecologically based on the spatial distribution of leprosy in the City of Vitória, State of Espírito Santo between 2005 and 2009. The data sources used came from the available records of the State Health Secretary of Espírito Santo. A global and local empirical Bayesian method was used in the spatial analysis to produce a leprosy risk estimation, and the fluctuation effect was smoothed from the detection coefficients. Results The study used thematic maps to illustrate that leprosy is distributed heterogeneously between the neighborhoods and that it is possible to identify areas with high risk of disease. The Pearson correlation coefficient of 0.926 (p = 0.001) for the Local Method indicated highly correlated coefficients. The Moran index was calculated to evaluate correlations between the incidences of adjoining districts. Conclusions We identified the spatial contexts in which there were the highest incidence rates of leprosy in Vitória during the studied period. The results contribute to the knowledge of the spatial distribution of leprosy in the City of Vitória, which can help establish more cost-effective control strategies because they indicate specific regions and priority planning activities that can interfere with the transmission chain.

Diversidade de Arctiinae (Lepidoptera, Arctiidae) em área alterada em Altamira, Amazônia Oriental, Pará, Brasil

Este trabalho avaliou a fauna de Arctiinae em Altamira, Pará, numa área com forte ação antrópica, por meio de armadilhas luminosas, com capturas de duas noites a cada fase de lua nova por mês, no período de dezembro de 2007 a novembro de 2008. Na avaliação foram utilizados os parâmetros: riqueza, abundância, constância, índices de diversidade e uniformidade de Shannon (H’ e E’) e Brillouin (H e E), dominância de Berger-Parker (BP). As estimativas de riqueza foram feitas através dos procedimentos não paramétricos, “Bootstrap”, “Chao 1”, “Chao 2”, “Jackknife 1”, “Jackknife 2” e “Michaelis-Mentem”. Foram capturados 420 espécimes pertencentes a 64 táxons de Arctiinae, sendo 19 espécies registradas pela primeira vez no estado do Pará. Os valores dos parâmetros analisados para todo o período foram: H’= 4,69, E’= 0,781, H= 4,37, E= 0,732 e BP= 0,183. Durante o período menos chuvoso (junho-novembro) foram encontrados os valores mais significativos para todos os parâmetros analisados. No período mais chuvoso (dezembro-maio) foram encontrados os mais significativos percentuais de similaridade entre os meses. Os estimadores previram o encontro de mais espécies, entre 18,7% a 60,9%.

Abundância, Composição e Diversidade de Arctiinae (Lepidoptera, Arctiidae) em um fragmento de floresta na Amazônia Oriental em Altamira, PA, Brasil

Este estudo avaliou a fauna de Arctiinae em um fragmento de floresta primária em Altamira, Pará, na Amazônia Oriental brasileira. As mariposas foram amostradas durante dois anos (de agosto de 2007 a julho de 2009), com auxílio de armadilha luminosa. Foram medidos os seguintes parâmetros: riqueza, abundância, constância, índices de diversidade e uniformidade de Shannon (H' e E') e de Brillouin (H e E) e o índice de dominância de Berger-Parker (BP). As estimativas de riqueza, foram efetuadas através dos procedimentos não paramétricos, "Bootstrap", "Chao 1", "Chao 2", "Jackknife 1", "Jackknife2" e "Michaelis-Mentem". Foram capturados 466 exemplares pertencentes a 78 espécies de Arctiinae, das quais 12 são novos registros para o Estado. Os valores dos parâmetros analisados para todo o período foram: H'= 3,08, E'= 0,708, H= 2,86, E= 0,705 e BP= 0,294. As comunidades dos meses menos chuvosos foram mais diversas. Os estimadores previram o encontro de 17 a 253 espécies a mais.

Arctiinae (Lepidoptera, Arctiidae) ocorrentes em uma área de pastagem na Amazônia Oriental em Altamira, Pará, Brasil

O presente estudo avaliou a fauna de Arctiinae numa área de pastagem na Amazônia Oriental em Altamira-Pará, por meio de armadilha luminosa, com duas capturas mensais noturnas a cada fase da lua nova, no período de dezembro de 2008 a novembro de 2010. Foram avaliados os seguintes parâmetros: riqueza, abundância, dominância, constância, índices de diversidade e uniformidade de Shannon (H' e E') e Brillouin (H e E), dominância de Berger-Parker (BP). As estimativas de riqueza foram feitas através dos procedimentos não paramétricos, "Bootstrap", "Chao1", "Chao2", "Jackknife1", "Jackknife2", e "Michaelis-Mentem". Foram capturados 910 exemplares pertencentes a 85 espécies de Arctiinae. Os valores dos parâmetros analisados para o período total foram: H'= 2,58, E'= 0,581, H= 2,45, E= 0,576 e BP= 0,433. Para os anos, tanto a riqueza quanto a abundância foi maior em 2009-2010. A diversidade e uniformidade de Shannon e Brillouin foram maiores para o ano de 2008-2009. Os estimadores previram um aumento entre 18,8% e 85,9 % na riqueza de espécies.

InsCor: um método simples e acurado para avaliação do risco em cirurgia cardíaca

FUNDAMENTO: Escores de risco apresentam dificuldades para obter o mesmo desempenho em diferentes populações. OBJETIVO: Criar um modelo simples e acurado para avaliação do risco nos pacientes operados de doença coronariana e/ou valvar no Instituto do Coração da Universidade de São Paulo (InCor-HCFMUSP). MÉTODOS: Entre 2007 e 2009, 3.000 pacientes foram operados consecutivamente de doença coronariana e/ou valvar no InCor-HCFMUSP. Desse registro, dados de 2/3 dos pacientes foram utilizados para desenvolvimento do modelo (técnica de bootstrap) e de 1/3 para validação interna do modelo. O desempenho do modelo (InsCor) foi comparado aos complexos 2000 Bernstein-Parsonnet (2000BP) e EuroSCORE (ES). RESULTADOS: Apenas 10 variáveis foram selecionadas: Idade > 70 anos; sexo feminino; cirurgia de revascularização coronariana + valva; infarto de miocárdio < 90 dias; reoperação; tratamento cirúrgico da valva aórtica; tratamento cirúrgico da valva tricúspide; creatinina < 2mg/dL; fração de ejeção < 30%; e eventos. O teste de Hosmer Lemeshow para o InsCor foi de 0,184, indicando uma excelente calibração. A área abaixo da curva ROC foi de 0,79 para o InsCor, 0,81 para o ES e 0,82 para o 2000BP, confirmando que os modelos são bons e similares na discriminação. CONCLUSÕES: O InsCor e o ES tiveram melhor desempenho que o 2000BP em todas as fases da validação; pórem o novo modelo, além de se identificar com os fatores de risco locais, é mais simples e objetivo para a predição de mortalidade nos pacientes operados de doença coronariana e/ou valvar no InCor-HCFMUSP.

Species richness and community structure of arboreal spider assemblages in fragments of three vegetational types at Banhado Grande wet plain, Gravataí River, Rio Grande do Sul, Brazil

The taxonomic composition, observed and estimated species richness, and patterns of community structure of arboreal spider assemblages in eleven sites surrounding the "Banhado Grande" wet plain in the state of Rio Grande do Sul, Brazil, are presented. These sites represent three different vegetational types: hillside (four sites), riparian (five sites) and flooded forests (two sites). The spiders were captured by beating on foliage and "aerial litter". A sample was defined as the result of beating on twenty bushes, tree branches or "aerial litter" clusters, which roughly corresponds to one-hour search effort per sample. Fifty five samples (five per site) were obtained, resulting in an observed richness of 212 species present as adult or identifiable juveniles. The total richness for all samples was estimated to be between 250 (Bootstrap) to 354 species (Jackknife 2). Confidence intervals of both sample and individual-based rarefaction curves for each vegetation type clearly indicated that flooded forest is the poorest vegetation type with respect to spider species richness, with hillside and riparian forests having a similar number of species. The percentage complementarity between the eleven sites indicated that all sites contain a distinct set of species, irrespective of their vegetation types. Nevertheless, the spider assemblages in riparian and hillside forests are more similar with respect to each other than when compared to flooded forest. Both cluster and nonmetric multidimensional scaling analyses showed no strong correspondence between the spider arboreal fauna and the three vegetation types. Moreover, a Mantel test revealed no significant association between species composition and geographic distance among sites.

Dípteros ectoparasitas (Insecta, Diptera) em morcegos (Chiroptera, Mammalia) na Reserva Biológica das Perobas Paraná, Brasil

Streblidae e Nycteribiidae são encontradas exclusivamente em associação com morcegos. Este trabalho teve como objetivo investigar a diversidade de insetos ectoparasitas encontrados em morcegos da Reserva Biológica das Perobas, Estado do Paraná, Brasil. O trabalho foi realizado nos meses de maio, junho e agosto de 2008 e fevereiro, março e abril de 2009. Para a captura dos morcegos, foram utilizadas 32 redes-de-neblina, totalizando esforço de captura de 43.520m².h. A coleta de ectoparasitas foi feita manualmente ou com auxílio de pinça reta de ponta fina. Os espécimes foram conservados em álcool 70% e identificados com auxílio de microscópio estereoscópico. Os dados foram analisados por meio do estimador não paramétrico Bootstrap e estatística descritiva. As espécies de ectoparasitas identificadas foram: Aspidoptera falcata Wenzel, 1976, Megistopoda proxima (Séguy, 1926), Megistopoda aranea (Coquillett, 1899), Paratrichobius longicrus (Miranda Ribeiro, 1907), Trichobius tiptoni Wenzel, 1976 e Basilia quadrosae Graciolli & Moura, 2005. A curva de riqueza estimada indicou tendência à ocorrência de outras espécies de ectoparasitas na unidade de conservação, haja vista que não foi alcançada a assíntota horizontal. Os dados obtidos corroboram com os verificados em outras regiões do Brasil e contribuem com as informações sobre a diversidade do grupo no bioma Mata Atlântica do noroeste do Paraná.

Bird community in an Araucaria forest fragment in relation to changes in the surrounding landscape in Southern Brazil

The dynamics of the bird community in a small forest fragment was evaluated along seven years in relation to changes in the surrounding landscape. The study area is an Araucaria forest fragment in Southern Brazil (state of Paraná). The sampling period covered the years 1988 through 1994 and the mark-release-recapture method was utilized. The landscape analysis was based on Landsat TM images, and changes in exotic tree plantations, native forest, open areas (agriculture, pasture, bare soil, and abandoned field), and "capoeira"(native vegetation < 2 m) were quantified. The relationship between landscape changes and changes in abundance diversity of forest birds, open-area birds, forest-edge birds, and bamboo specialists was evaluated. Richness estimates were run for each year studied. The richness recorded in the study area comprised 96 species. The richness estimates were 114, 118 and 110 species for Chao 1, Jackknife 1 and Bootstrap, respectively. The bird community varied in species richness, abundance and diversity from year to year. As for species diversity, 1991, 1993 and 1994 were significantly different from the other years. Changes in the landscape contributed to the increase in abundance and richness for the groups of forest, open-area and bamboo-specialist species. An important factor discussed was the effect of the flowering of "taquara" (Poaceae), which contributed significantly to increasing richness of bamboo seed eaters, mainly in 1992 and 1993. In general, the results showed that landscape changes affected the dynamics and structure of the bird community of this forest fragment over time, and proved to have an important role in conservation of the avian community in areas of intensive forestry and agricultural activities.

Genetic diversity of environmental Aspergillus flavus strains in the state of São Paulo, Brazil by random amplified polymorphic DNA

Aspergillus flavus is a very important toxigenic fungus that produces aflatoxins, a group of extremely toxic substances to man and animals. Toxigenic fungi can grow in feed crops, such as maize, peanuts, and soybeans, being thus of high concern for public health. There are toxigenic and non-toxigenic A. flavus variants, but the necessary conditions for expressing the toxigenic potential are not fully understood. Therefore, we have studied total-DNA polymorphism from toxigenic and non toxigenic A. flavus strains isolated from maize crops and soil at two geographic locations, 300 km apart, in the Southeast region of Brazil. Total DNA from each A. flavus isolate was extracted and subjected to polymerase chain reaction amplification with five randomic primers through the RAPD (random amplified polymorphic DNA) technique. Phenetic and cladistic analyses of the data, based on bootstrap analyses, led us to conclude that RAPD was not suitable to discriminate toxigenic from non toxigenic strains. But the present results support the use of RAPD for strain characterization, especially for preliminary evaluation over extensive collections.

Echovirus 30 associated with cases of aseptic meningitis in state of Pará, Northern Brazil

Investigation of the aetiology of viral meningitis in Brazil is most often restricted to cases that occur in the Southern and Southeastern Regions; therefore, the purpose of this study is to describe the viral meningitis cases that occurred in state of Pará, Northern Brazil, from January 2005-December 2006. The detection of enterovirus (EV) in cerebrospinal fluid was performed using cell culture techniques, RT-PCR, nested PCR and nucleotide sequencing. The ages of the 91 patients ranged from < one year old to > 60 years old (median age 15.90 years). Fever (87.1%), headache (77.0%), vomiting (61.5%) and stiffness (61.5%) were the most frequent symptoms. Of 91 samples analyzed, 18 (19.8%) were positive for EV. Twelve were detected only by RT- PCR followed by nested PCR, whereas six were found by both cell culture and RT-PCR. From the last group, five were sequenced and classified as echovirus 30 (Echo 30). Phylogenetic analyses revealed that Echo 30 detected in Northern Brazil clustered within a unique group with a bootstrap value of 100% and could constitute a new subgroup (4c) according to the phylogenetic tree described by Oberste et al. (1999). This study described the first molecular characterization of Echo 30 in Brazil and this will certainly contribute to future molecular analyses involving strains detected in other regions of Brazil.

Phylogenetic analysis of Biomphalaria tenagophila (Orbigny, 1835) (Mollusca: Gastropoda)

Mitochondrial DNA of Biomphalaria tenagophila, a mollusc intermediate host of Schistosoma mansoni in Brazil, was sequenced and characterised. The genome size found for B. tenagophila was 13,722 bp and contained 13 messenger RNAs, 22 transfer RNAs (tRNA) and two ribosomal RNAs (rRNA). In addition to sequencing, the mitochondrial DNA (mtDNA) genome organization of B. tenagophila was analysed based on its content and localization of both coding and non-coding regions, regions of gene overlap and tRNA nucleotide sequences. Sequences of protein, rRNA 12S and rRNA 16S nucleotides as well as gene organization were compared between B. tenagophila and Biomphalaria glabrata, as the latter is the most important S. mansoni intermediate host in Brazil. Differences between such species were observed regarding rRNA composition. The complete sequence of the B. tenagophila mitochondrial genome was deposited in GenBank (accession EF433576). Furthermore, phylogenetic relationships were estimated among 28 mollusc species, which had their complete mitochondrial genome deposited in GenBank, using the neighbour-joining method, maximum parsimony and maximum likelihood bootstrap. B. tenagophila was positioned at a branch close to B. glabrata and Pulmonata molluscs, collectively comprising a paraphyletic group, contrary to Opistobranchia, which was positioned at a single branch and constituted a monophyletic group.