DETERMINATION OF VIRAL TROPISM BY GENOTYPING AND PHENOTYPING ASSAYS IN BRAZILIAN HIV-1-INFECTED PATIENTS

The clinical application of CCR5 antagonists involves first determining the coreceptor usage by the infecting viral strain. Bioinformatics programs that predict coreceptor usage could provide an alternative method to screen candidates for treatment with CCR5 antagonists, particularly in countries with limited financial resources. Thus, the present study aims to identify the best approach using bioinformatics tools for determining HIV-1 coreceptor usage in clinical practice. Proviral DNA sequences and Trofile results from 99 HIV-1-infected subjects under clinical monitoring were analyzed in this study. Based on the Trofile results, the viral variants present were 81.1% R5, 21.4% R5X4 and 1.8% X4. Determination of tropism using a Geno2pheno[coreceptor] analysis with a false positive rate of 10% gave the most suitable performance in this sampling: the R5 and X4 strains were found at frequencies of 78.5% and 28.4%, respectively, and there was 78.6% concordance between the phenotypic and genotypic results. Further studies are needed to clarify how genetic diversity amongst virus strains affects bioinformatics-driven approaches for determining tropism. Although this strategy could be useful for screening patients in developing countries, some limitations remain that restrict the wider application of coreceptor usage tests in clinical practice.

Eimeria curvata n. sp.(Apicomplexa: Eimeriidae) in Columbina talpacoti and Scardafella squammata (Aves: Columbidae) from Brazil

Eimeria curvata is a new coccidian described in the doves Columbina talpacoti and Scardafella squammata from western of the State of São Paulo, Brazil. The oocysts are ovoid to ellipsoid, 18.3 (17-19) µm x 15.5 (15-17) µm, with a shape index of 1.2 (1.1-1.3). The wall is colorless, smooth and double-layered. A polar granule is present, but there is no micropyle or oocyst residuum. The sporocysts are elongate, 12.3 (11.5-13) µm x 5.8 (5.5-6) µm with a curved anterior portion and a smooth, thin, single-layered wall. The Stieda body is protuberant and nipple-like; there is no substieda body. The sporozoites lie head-to-tail in the sporocyst and contain a large refractile body at the extremities. The sporocyst residuum contains small granules uniformly distributed in the middle of the sporocyst. The prevalence of E. curvata n. sp. was 17.4% and 12.8% in C. talpacoti and S. squammata, respectively.

Glandular areas associated with the male genitalia in Triatoma rubrofasciata (Triatominae, Reduviidae, Hemiptera) and other Reduviidae

In this paper, glandular areas associated with the phallus in Triatoma rubrofasciata are described and illustrated for the first time. The glandular areas lie in the membrane surrounding the articulatory apparatus. In order to unambiguously define the locality of the respective glandular areas, some features of the pygophore-phallus connection are redescribed. A possible functional context of the gland secretions is discussed. A preliminary study of several other Reduviidae implies that the described glandular areas occur in a wider range of taxa in this group.

Reflexões de estudantes de enfermagem sobre morte e o morrer

Trata-se da apresentação da primeira fase de uma pesquisa sobre as representações de estudantes de enfermagem sobre a morte e o morrer. A mesma tem caráter exploratório e foi realizada junto a estudantes do primeiro ano do curso de graduação em Enfermagem da Universidade Federal de São Paulo. Teve por objetivos conhecer as impressões dos estudantes acerca do assunto "morte e o morrer" e subsidiar a segunda fase da pesquisa. Foi realizada por meio de uma dinâmica com uma questão norteadora, junto ao programa da disciplina curricular Psicologia Aplicada à Saúde. Para interpretação dos dados foi utilizado o método da Análise de Conteúdo, obtendo as seguintes categorias: medo da morte; conceitos; atitude diante da morte e o morrer; crença enquanto elemento interveniente.

A morte e o morrer segundo representações de estudantes de enfermagem

Trata-se de um estudo qualitativo, cujo objetivo foi conhecer as representações das estudantes do curso de graduação em Enfermagem da Universidade Federal de São Paulo, sobre as questões que envolvem a morte e o morrer. Os sujeitos foram 40 estudantes do sexo masculino e feminino que freqüentavam a 2.ª, 3.ª e 4.ª séries do curso de graduação em Enfermagem. Como metodologia, foram utilizadas as premissas das Representações Sociais, usando a técnica de entrevista com duas questões norteadoras não estruturadas. Os resultados deste estudo foram organizados e dispostos em uma árvore máxima, tendo como núcleo central da representação o evento morte e como representações periféricas mais importantes: conceitos, medo da morte e relacionamento aluno-paciente.

Gerenciamento de resíduos químicos e águas servidas no laboratório de isótopos estáveis do CENA/USP

A system for disposal and recovery of the main effluents and chemical waist from isotope separation plants and enriched compounds-15N and 34S production has been carried out at the Stable Isotope Laboratory (LIE) of the CENA/USP. Around four hundred thousand liters of effluents has been recovered yearly. Among the recovered chemical wastes, the more relevant are: ammonia; brome; ammonium and sodium sulfate; sodium hydroxide; sulfur dioxide; and hydrochloric acid. Chemical wastes containg recoverable heavy metals (Ag, Cr and Cu) and solvents (methanol, ethanol and acetone) are processed and recovered. Gaseous emissions, mainly H2S are used for recovery of heavy metals solutions. The minimization of the residues waters, as well the reduction of electric energy consume was established using a water deionization system. A cost/effect balance of the process is reported.

Óxido misto de ítrio-alumínio dopado com Eu(III)

In this work, we report the synthesis and the photoluminescence features of Eu(III)-doped yttrium-aluminium oxide obtained by non-hydrolytic sol-gel routes. After heating the powders above 600 ºC the XRD patterns show the presence of the Y4Al2O9 (YAM) and Y3Al5O12 (YAG) phases. At 800 and at 1500 ºC the PL spectra display the Eu(III) lines characteristic of the YAM monoclinic phase. The 5D0->7F2 transition is favored relatively to the 5D0->7F1 lines. However, at 1100 ºC the cubic YAG is the preferential phase and the 5D0->7F1 transition dominates the spectrum. The Eu(III) ions lie in a centrosymmetrical site. The different solvents used in the sol-gel synthesis also change the relative proportion between these two phases. This is monitored analyzing the modifications in the relative intensity between the 5D0->7F2 and the 5D0->7F1 transitions.

Gas-phase solvolysis type reactions of SiCl3+ cations

Gas-phase SiCl3+ ions undergo sequential solvolysis type reactions with water, methanol, ammonia, methylamine and propylene. Studies carried out in a Fourier Transform mass spectrometer reveal that these reactions are facile at 10-8 Torr and give rise to substituted chlorosilyl cations. Ab initio and DFT calculations reveal that these reactions proceed by addition of the silyl cation to the oxygen or nitrogen lone pair followed by a 1,3-H migration in the transition state. These transition states are calculated to lie below the energy of the reactants. By comparison, hydrolysis of gaseous CCl3+ is calculated to involve a substantial positive energy barrier.

Hydrozoa e Scyphozoa existentes no instituto paulista de oceanografia

Continuing the inventory of the Coelenterate Fauna of the Brazilian coast, 23 species of Hydrozoa and a Scyphomedusa are recorded from different points of the coast aproximately between 22º and 24º lat. S. Of these, 14 species were already known from other points of the coast and the remaining 10 were unknown from this latitude. Two species are here listed as new, they are: Halocordyle fragHis and Calicella gabriellae. 1. - Halocordyle fragilis, Stechow's (1923) correction of the generic name Pennaria has been followed, shows remarkable distinctive specific characters such as: alternate distribution of the cladii which do not lie all in the same plane, they are inserted at random on the hydrocaulus with a tendency towards a spiral dexiotropic distribution, sparse distribution of the pedicels which are alternate and not all located on the same side of the hydrocladium, and, finally, the long, wiry aspect of the colony which is as brittle as light glass. This characteristics are not sufficient, to my belief, to establish a new genus, since the polyps and the gonophores are entirely of the Halocordyle type, but they confer upon the species a very peculiar habitus. 2. - Calicella gabriellae forms erect hydrocauli which are extremely soft and flexuose, with hydrothecate and intermediate internodes. The thecae are deep, cylindrical, with a conical base, there are 10-12 long and narrow opercular valves. The gonangia are small, conical, with a short distal digitiform process. The included sporosac exhibits maturing ova. Dynamena heteroclonta described by Jarvis (1922) as a new species, is here considered as a new form of the very variable species Dynamena quadridentata. Schizotricha billardi nom. nov., is specifically separated from Sch. diaphana (Heller) to which it had been identified up to know. The Brazilian colonies agree with the French Somaliland specimens described by Billard (1904) and they are reunited in a new species named after the French worker. The main difference, between the two mentioned species are: shape and size of the gonothecae, of the thecae and of the nematophores. A description is given of all the species not previously recorded from the Brazilian coast as well as biological observations on Olindias sambaquiensis whose shoals during winter months are very large and may entangle partially the fishermen's nets. Its feeding and swimming habits are described and the species proves to be an excellent laboratory animal both for class and research purposes, for it easily endures long transportation (even up to 12 hours during summer months) as well as unoxygenized acquaria and nevertheless greadily feeds on any animal food.

Desempenho das Amostras do Canal Cervical e do Fundo de Saco no Diagnóstico da Neoplasia do Colo Uterino

Objetivos: comparar o desempenho das amostras do canal cervical e fundo de saco vaginal para o exame colpocitológico no diagnóstico da neoplasia do colo uterino. Métodos: foram constituídos três grupos seqüenciais: grupo 1) 10.048 mulheres com amostras da ectocérvice e fundo de saco, utilizando espátula de Ayre; grupo 2) 3.847 mulheres com amostras da ectocérvice, fundo de saco e canal cervical, utilizando espátula de Ayre e escova cytobrush; grupo 3) 4.059 mulheres com amostras da ectocérvice e canal cervical, utilizando espátula de Ayre e escova cytobrush. A metodologia estatística utilizou análise de variância (ANOVA) e comparação de proporções. Resultados: os percentuais de exames alterados dos grupos 2 (2,6%) e 3 (2,4%), incluindo todas as lesões escamosas e glandulares, foram significativamente maiores que no grupo 1 (2%). Os percentuais de diagnóstico da lesão intra-epitelial escamosa de baixo grau (LIE-BG) não foram estatisticamente diferentes entre os três grupos (1,27; 1,25 e 1,07%). Por outro lado, os percentuais de diagnóstico da lesão intra-epitelial escamosa de alto grau (LIE-AG) foram significativamente maiores nos grupos 2 (0,81%) e 3 (0,77%) do que no grupo 1 (0,54%). A diferença entre os percentuais dos grupos 2 e 3 não foi estatisticamente significante. Conclusões: a amostra do canal cervical melhora o desempenho do exame colpocitológico para o diagnóstico da lesão intra-epitelial escamosa de alto grau, ao passo que a amostra de fundo de saco não interfere significativamente nos percentuais de diagnóstico das lesões intra-epiteliais.

Tipagem e estado físico de papilomavírus humano por hibridização in situ em lesões intra-epiteliais do colo uterino

OBJETIVO: realizar estudo molecular (hibridização in situ) de pacientes com lesões intra-epiteliais do colo uterino, visando investigar a freqüência e o estado físico do papilomavírus humano (HPV). MÉTODOS: cortes histológicos de biopsias do colo uterino de 84 pacientes foram avaliados pela hibridização in situ, com sonda de amplo espectro, que permite identificação dos HPVs dos tipos 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 42, 45 e 56, e com sondas específicas para HPV dos tipos 6, 11, 16, 18, 31 e 33. Os padrões físicos de marcação do DNA dos HPV encontrados foram: epissomal, quando todo o núcleo ficou corado pela biotina (marrom); integrado, onde se visualizaram um ou dois pontos marrons no núcleo hibridizado, ou misto, com a associação dos dois padrões anteriores. Das 84 pacientes avaliadas, 31 (36,9%) tinham lesões intra-epiteliais de baixo grau (LIE-BG) e 53 (63,1%) tinham lesões intra-epiteliais de alto grau (LIE-AG) ao exame histológico. Para a análise estatística foi empregado o teste exato de Fisher. RESULTADOS: do total dos casos, 46 (54,7%) foram positivos para DNA de HPV pela sonda de amplo espectro. Na tipagem dos vírus, o HPV-16 foi mais freqüente nas LIE-AG, com 12 casos - 22,6% (p<0,05). As freqüências dos outros tipos de HPV não foram diferentes entre os casos com LIE-BG e LIE-AG. Na avaliação do estado físico do DNA de HPV, os percentuais de padrões epissomais (mais comum nas LIE-BG) e integrados não foram diferentes entre os dois grupos. Houve predomínio do tipo misto nas LIE-AG em relação às LIE-BG: 26,4% e 3,2%, respectivamente (p<0,01). O estado físico do DNA do HPV, integrado ao da célula hospedeira, foi mais freqüente nos casos mais graves. CONCLUSÕES: o HPV-16 foi o mais freqüente nas LIE-AG. As freqüências dos outros tipos de HPV não foram diferentes quando se compararam os casos com LIE-BG e LIE-AG. O estado físico do DNA do HPV, integrado ao da célula hospedeira, foi mais freqüente nos casos mais graves.

A expressão da proteína p16 e herpes simples vírus tipo 2 em lesões pré-neoplásicas e neoplásicas do colo do útero

OBJETIVO: demonstrar a expressão de biomarcadores, detectados por técnicas de imunohistoquímica, em tecidos sadios, lesões pré-neoplásicas e neoplásicas do colo do útero. MÉTODOS: para avaliação da reatividade imunohistoquímica de tecidos do colo do útero ao p16 e ao herpes simples vírus tipo 2 (HSV-2), foram avaliadas 187 amostras de lesões intra-epiteliais de baixo grau (LIE-BG) e lesões intra-epiteliais de alto grau (LIE-AG) e carcinoma do colo do útero, e comparadas com grupo de pacientes sem lesões no colo uterino. A análise estatística foi realizada pelo teste do chi2 para tendências. O nível de significância foi de alfa=0,05. RESULTADOS: foi avaliada a reatividade ao p16 com a seguinte distribuição: grupo sem lesão no colo do útero: 56% (24/43), LIE-BG: 92% (43/47), LIE-AG: 94% (43/46) e câncer: 98% (46/47) (p<0,001, tendência linear). Com relação ao HSV-2: grupo sem lesão no colo do útero: 27% (12/45), LIE-BG: 58% (22/38), LIE-AG: 78% (35/45) e câncer: 59% (29/49) (p<0,001, tendência linear). Foi observado aumento na proporção de reatividade para os dois marcadores entre os grupos controle, LIE-BG, LIE-AG e câncer do colo do útero (p<0,001). Não houve diferença significativa, quando comparamos apenas os grupos LIE-BG e LIE-AG entre si. CONCLUSÕES: FOI VErificado um aumento progressivo nas taxas de reatividade aos marcadores de imunohistoquímica estudados, com a severidade das lesões.

Padronização de parâmetros eletrocardiográficos de cães da raça Golden Retriever clinicamente sadios

A distrofia muscular de Duchenne (DMD) em humanos é uma alteração neuromuscular hereditária, de caráter recessivo, ligada ao cromossomo X e causada pela ausência ou disfunção da distrofina. Clinicamente, caracteriza-se por grave alteração na musculatura esquelética, resultando em morte precoce do indivíduo acometido. Em cães da raça Golden Retriever, a mutação que leva à distrofia muscular ocorre espontaneamente e a extensa homologia entre a patogênese da DMD e da distrofia muscular do Golden Retriever permite qualificar o cão como o principal substituto de humanos nos testes clínicos de novas terapias. O miocárdio deficiente em distrofina é mais vulnerável à sobrecarga de pressão e os pacientes com DMD podem desenvolver cardiomiopatia dilatada, hipertensão arterial e o eletrocardiograma pode se apresentar distintamente anormal. No presente estudo, foram avaliados exames eletrocardiográficos de 38 cães da raça Golden Retriever clinicamente sadios (20 animais de até 12 meses de idade e 18 animais entre 12 e 36 meses de idade), com a finalidade de se obter parâmetros para a padronização do eletrocardiograma nessa referida raça, o que futuramente poderá servir de referência na identificação de cães portadores ou afetados pela distrofia muscular. Os valores eletrocardiográficos obtidos encontraram-se dentro dos valores de normalidade e referência para as diferentes raças de cães; e as variáveis peso e idade alteraram significativamente a freqüência cardíaca e a amplitude do complexo QRS.

Female gametophyte development in Adesmia latifolia (Spreng.) Vog. (Leguminosae - Papilionoideae)

The female gametophyte has a monosporic origin and a Polygonum type development. The female gametophyte growth consumes a large part of the neighboring nucellar cells and, in the micropylar region, part of the nucellar epidermis and internal integument. The mature gametophyte is composed of only four cells due to the ephemeral characteristic of the antipodals. The synergids are pear-shaped cells with the formation of filiform apparatus. Their nuclei lie in the micropylar region and large vacuoles in the chalazal region, while the egg cell presents an opposite polarization. The central cell accumulates starch grains and the two polar nuclei approach the egg. Occasional development of two gametophytes was recorded. The closest to the micropyle develops fully, while the chalazal one remained in the tetranucleated stage. The embryological characters of A. latifolia are compared with those of other taxa within the Leguminosae, and the reproductive importance of multiple gametophyte formation for this species was discussed.

A direct contact between astrocyte and vitreous body is possible in the rabbit eye due to discontinuities in the basement membrane of the retinal inner limiting membrane

Different from most mammalian species, the optic nerve of the rabbit eye is initially formed inside the retina where myelination of the axons of the ganglion cells starts and vascularization occurs. Astrocytes are confined to these regions. The aforementioned nerve fibers known as medullated nerve fibers form two bundles that may be identified with the naked eye. The blood vessels run on the inner surface of these nerve fiber bundles (epivascularization) and, accordingly, the accompanying astrocytes lie mostly facing the vitreous body from which they are separated only by the inner limiting membrane of the retina. The arrangement of the astrocytes around blood vessels leads to the formation of structures known as glial tufts. Fragments (N = 3) or whole pieces (N = 3) of the medullated nerve fiber region of three-month-old male rabbits (Orictolagus cuniculus) were fixed in glutaraldehyde followed by osmium tetroxide, and their thin sections were examined with a transmission electron microscope. Randomly located discontinuities (up to a few micrometers long) of the basement membrane of the inner limiting membrane of the retina were observed in the glial tufts. As a consequence, a direct contact between the astrocyte plasma membrane and vitreous elements was demonstrated, making possible functional interactions such as macromolecular exchanges between this glial cell type and the components of the vitreous body.