Protein-DNA associations in a gender-specific gene of Schistosoma mansoni: characterization by UV cross-linking, DNase I footprinting and band shift assays

Protein extracts obtained from male and female shistosomes were incubated with a gender-specific gene, F-10, transcribed only in adult females and encoding a major egg-shell protein. The protein/DNA interaction was measured using the band shift, DNase-I-footprinting and UV cross-linking techniques. The results showed a clear band shift when a 302 bp restriction fragment containing the 3'end of the gene was incubated with either female or male proteins. This fragment also contained a putative steroid hormone regulatory element (HRE). In contrast, only the male proteins produced a shift with the 495 bp fragment corresponding to the middle region of the gene. DNase I footprinting showed that proteins from males and females interacted with the F-10 gene by binding to multiple adjacent sites along the DNA, thus generatingrelatively long protected fragments of approximately 100 bp. This result suggested that the adjacent binding of several moles of proteins occured at the 5'end of the gene. UV cross-linking between schistosome proteins and a 21 bp synthetic oligonucleotide the F-10 HRE, evidence proteins having MWS of 30,45 and 65 kDNA. These proteins are presumably involved in the regulation of transcription of the F-10 gene.

Componentes principais das características de carcaças de bovinos anelorados e fontes de variação em lesões

Objetivou-se levantar e avaliar os componentes principais das características de carcaças de bovinos anelorados e fontes de variação em lesões. Utilizou-se um banco de dados com informações de 15.002 carcaças de bovinos anelorados. As variáveis levantadas foram peso da carcaça quente, conformação da carcaça, escore de gordura subcutânea, condição sexual, número de dentes incisivos, lesões e distância percorrida da propriedade rural ao abatedouro. Também foi considerado o sistema de terminação dos bovinos por meio da comunicação pessoal do técnico responsável pelo rebanho. Para entender o relacionamento das variáveis descritas, utilizaram-se a correlação dos componentes principais e as variáveis originais, os planos fatoriais, o círculo unitário, a análise de cluster e testes não-paramétricos. O escore de gordura subcutânea, a condição sexual, o peso da carcaça quente, o número de dentes e a propriedade rural, compuseram 68,26% da variação total. A conformação das carcaças e o sistema de terminação explicaram uma baixa parcela da variabilidade. As variáveis: propriedade rural (distância percorrida), número de dentes incisivos, sistema de terminação e escore de gordura subcutânea, influenciaram o número de carcaças com lesões. A condição sexual, o peso da carcaça quente e a conformação da carcaça não alteraram a proporção de carcaças com lesões.

Sequencing and identification of expressed Schistosoma mansoni genes by random selection of cDNA clones from a directional library

We have initiated a gene discovery program in Schistosoma mansoni based on the technique of Expressed Sequence Tags (ESTs), i.e. partial sequences of cDNAs obtained from single passes in automatic DNA sequencers. ESTs can be used to identify genese onf the basis of their homology whith sequences from other species deposited in DNA or protein databases. Trasncripts with sequences without matches in teh databases may represent novel parasite-specific genes. This approach has shown to be very efficient and in less than two years a broad range of novel genes has already been ascertained, more than doubling the number of known S. mansoni genes.