53 resultados para Biblioteca de cDNA

em Scielo Saúde Pública - SP


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Solano-violeta (Solanum violaefolium) é uma planta ornamental rasteira usada para cobrir solos de áreas sombreadas. Um vírus que induz manchas anelares nas folhas desta planta, tentativamente designado Solanum violaefolium ringspot virus - SvRSV, transmitido pelo ácaro Brevipalpus phoenicis (Acari: Tenuipalpidae) foi encontrado em Piracicaba, SP. Trata-se de um vírus baciliforme que se assemelha a outros vírus do tipo citoplasmático transmitidos por Brevipalpus sp. Este trabalho teve como objetivo relatar propriedades biológicas e estabelecer uma caracterização molecular parcial do SvRSV. O vírus pode ser transmitido mecanicamente a várias outras espécies botânicas, causando lesões localizadas. Entre as espécies avaliadas, Datura stramonium mostrou-se a melhor hospedeira experimental. Observou-se também a manifestação de sintomas nestas plantas após infestação das mesmas por B. obovatus previamente alimentado em lesões de SvRSV, confirmando esta outra espécie de ácaro como vetor do vírus. Suas propriedades físicas in vitro foram: temperatura de inativação 40-45 ºC; ponto final de diluição 10-3-10-4; longevidade in vitro 12 dias. Em secções ultrafinas, as partículas do SvRSV mostraram-se levemente mais delgadas e mais longas que as de outros vírus do mesmo grupo. A partir do dsRNA do SvRSV foi construída uma biblioteca de cDNA e foram identificadas duas possíveis regiões codificadoras das proteínas de movimento e replicase viral. Baseado nestas regiões foram desenhados "primers" para amplificação do RNA do SvRSV por RT-PCR. Sondas baseadas nas seqüências obtidas hibridizaram com ss- e dsRNA de D. stramonium infectadas pelo vírus. Ensaios preliminares de RT-PCR e hibridização não resultaram em reação com o vírus da leprose dos citros, tipo citoplasmático (CiLV-C).

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O presente artigo investiga e cataloga a biblioteca particular do cônego da Sé da Bahia, Manoel José de Freitas Baptista Mascarenhas (Manoel Dendê Bus). O inventário do referido padre traz a lista de 176 obras arroladas pelo livreiro e impressor José Paulo Franco Lima em 1836. A partir desta lista foi possível identificar e reconstruir um catálogo de uma biblioteca privada formada na Bahia entre o fim do período colonial e a Regência.

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Foi feita avaliação do uso de periódicos técnico-científicos da Biblioteca da Faculdade de Saúde Pública da Universidade de São Paulo (FSP/ USP), por um período de seis meses, em 1973/74, com a finalidade de verificar as tendências de interesse de seus usuários. Para a avaliação foi considerado o total de empréstimos realizados no período, sendo desprezados os dados de consulta local e do uso do periódico feito por meio de fotocópias de artigos. O número de consulentes matriculados no período era, em média, de 801, sendo 11,7% pertencentes ao corpo docente da FSP; 40,6% ao discente e 47,5% referentes a consulentes externos. O levantamento foi programado para medir os periódicos circulados considerando as seguintes variáveis: tipo de aquisição; categoria de consulentes; ano da publicação; língua em que o periódico foi publicado e assunto do periódico. Foi medido também o grau de freqüência da circulação, usando-se o método de Bradford. A análise dos resultados mostrou que a circulação foi de 36,5% do total de títulos da coleção (1.530); a zona de concentração dos títulos circulados foi muito baixa, com 3,6% do total de títulos da coleção. Quanto às demais variáveis, verificou-se que 68,3% da circulação coube a periódicos adquiridos por compra; 82,5% a periódicos dos 5 anos mais recentes (1969-1973); 61,2% a periódicos em língua inglesa; 72,5% foi a demanda por parte do corpo docente.

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Considering the scarcity of defined antigens, actually useful and reliable for use in the field studies, we propose an alternative method for selection of cDNA clones with potential use in the diagnosis of schistosomiasis. Human antibodies specific to a protein fraction of 31/32 kDa (Sm31/32), dissociated from immune complexes, are used for screening of clones from an adult worm cDNA library. Partial sequencing of five clones, selected through this strategy, showed to be related to Schistosoma mansoni: two were identified as homologous to heat shock protein 70, one to glutathione S-transferase, one to homeodomain protein, and one to a previously described EST (expressed sequence tag) of S. mansoni. This last clone was the most consistently reactive during the screening process with the anti-Sm31/32 antibodies dissociated from the immune complexes. The complete sequence of this clone was obtained and the translation data yielded only one ORF (open reading frame) that code for a protein with 57 amino acids. Based on this amino acid sequence two peptides were chemically synthesized and evaluated separately against a pool of serum samples from schistosomiasis patients and non-schistosomiasis individuals. Both peptides showed strong reactivity only against the positive pool, suggesting that these peptides may be useful as antigens for the diagnosis of schistosomiasis mansoni.

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We have initiated a gene discovery program in Schistosoma mansoni based on the technique of Expressed Sequence Tags (ESTs), i.e. partial sequences of cDNAs obtained from single passes in automatic DNA sequencers. ESTs can be used to identify genese onf the basis of their homology whith sequences from other species deposited in DNA or protein databases. Trasncripts with sequences without matches in teh databases may represent novel parasite-specific genes. This approach has shown to be very efficient and in less than two years a broad range of novel genes has already been ascertained, more than doubling the number of known S. mansoni genes.

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Approximately 2.0 x 10 cDNA clones of an Schistosoma mansoni lgt11 cDNA library were screened in duplicate with serum from infected mice corresponding to distinct phases of infection. A cDNA clone (7/1) was isolated and recognized only by seven week serum. The clone was subcloned in pGEX-2T and Western-blot studies showed a specific antigenic expression confirming that only serum from the chronic phase is capable of recognizing this antigen. Dot-hybridization with RNA from different developmental phases of the parasite showed that the corresponding 7/1 RNA is expressed in all phases of parasite development in vertebrate hosts

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We describe a streamlined reverse transcription-polymerase chain reaction methodology for constructing full-length cDNA libraries of trypanosomatids on the basis of conserved sequences located at the 5' and 3'ends of trans-spliced mRNAs. The amplified cDNA corresponded to full-length messengers and was amenable to in vitro expression. Fractionated libraries could be rapidly constructed in a plasmid vector by the TA cloning method (Invitrogen). We believe this is useful when there are concerns over the use of restriction enzymes and phage technology as well as in cases where expression of proteins in their native conformation is desired.

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Cytochrome p450s (cyp450s) are a family of structurally related proteins, with diverse functions, including steroid synthesis and breakdown of toxins. This paper reports the full-length sequence of a novel cyp450 gene, the first to be isolated from the tropical freshwater snail Biomphalaria glabrata, an important intermediate host of Schistosoma mansoni. The nucleotide sequence is 2291 bp with a predicted amino acid sequence of 584aa. The sequence demonstrates conserved cyp450 structural motifs, but is sufficiently different from previously reported cyp450 sequences to be given a new classification, CYP320A1. Initially identified as down-regulated in partially resistant snails in response to S. mansoni infection, amplification of this gene using RT-PCR in both totally resistant or susceptible snail lines when exposed to infection, and all tissues examined, suggests ubiquitous expression. Characterization of the first cyp450 from B. glabrata is significant in understanding the evolution of these metabolically important proteins.

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The number of sequences generated by genome projects has increased exponentially, but gene characterization has not followed at the same rate. Sequencing and analysis of full-length cDNAs is an important step in gene characterization that has been used nowadays by several research groups. In this work, we have selected Schistosoma mansoni clones for full-length sequencing, using an algorithm that investigates the presence of the initial methionine in the parasite sequence based on the positions of alignment start between two sequences. BLAST searches to produce such alignments have been performed using parasite expressed sequence tags produced by Minas Gerais Genome Network against sequences from the database Eukaryotic Cluster of Orthologous Groups (KOG). This procedure has allowed the selection of clones representing 398 proteins which have not been deposited as S. mansoni complete CDS in any public database. Dedicated sequencing of 96 of such clones with reads from both 5' and 3' ends has been performed. These reads have been assembled using PHRAP, resulting in the production of 33 full-length sequences that represent novel S. mansoni proteins. These results shall contribute to construct a more complete view of the biology of this important parasite.

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Trata-se de uma pesquisa que envolveu a exploração dos 36 periódicos que compõem o repositório Educ@ com vistas ao levantamento das publicações que enfocam os temas educação a distância - EAD - e tecnologias da informação e da comunicação - TIC. Excluídos três periódicos que se voltam exclusivamente para a divulgação de estudos relacionados aos temas desse levantamento, foram evidenciados 824 artigos. Os dados tabulados permitiram identificar uma mudança no foco dos estudos encontrados, que discutiam a informática educativa e passaram a investigar o uso/apropriação das TIC e a formação de professores para e por meio da EAD. A partir de 2008, a quantidade de artigos publicados por ano em cada periódico triplicou, sinalizando um aumento do interesse dos pesquisadores por investigações sobre os temas explorados.

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Grandes alterações estão sendo implementadas nos procedimentos de produção, transmissão e uso do conhecimento, dissociando-os dos suportes tradicionais, como livros impressos, periódicos e jornais. Publicações eletrônicas têm oferecido outros suportes e possibilidades de acesso, requerendo que bibliotecas revejam seus procedimentos atuais de gerenciamento, incluindo esses novos suportes. Por outro lado, a relevância da informação deve ser considerada no planejamento, administração e desenvolvimento dos países. Na América Latina e Caribe, esses instrumentos estão cada vez mais presentes, apesar das dificuldades econômicas e sociais existentes. Conseqüentemente, os profissionais responsáveis pelo gerenciamento de bibliotecas deverão se concentrar nessa situação, preparando-se adequadamente para as novas possibilidades de acesso à informação

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As modificações tecnológicas e as recentes concepções de gerenciamento de recursos de informação têm causado uma quebra no paradigma dos modelos tradicionais de bibliotecas. O conceito de biblioteca virtual se apresenta como uma alternativa para ampliar as condições de busca, disponibilidade e recuperação de informações de maneira globalizada, qualitativa, pertinente e racional, aliando o acesso local ao acesso remoto, com base nas redes de telecomunicação disponíveis. Embora o conceito de biblioteca virtual esteja ainda em construção, um cuidadoso planejamento deve ser elaborado, tendo em vista a transição do modelo tradicional de bibliotecas para o modelo de biblioteca virtual. Alguns passos desta avaliação são apresentados, em especial para bibliotecas especializadas, bem como algumas experiências já em funcionamento em países do Primeiro Mundo. Novos papéis são também exigidos para os profissionais bibliotecários e para o pessoal da biblioteca, visando a um reposicionamento de atitudes e atividades.